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Package matrix provides a variety of alignment scoring matrices for sequence alignment.
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var ( // # // # This matrix was created by Todd Lowe 12/10/92 // # // # Probabilities rounded to nearest integer // # // # Lowest score = -4, Highest score = 5 // # // A T G C // A 5 -4 -4 -4 // T -4 5 -4 -4 // G -4 -4 5 -4 // C -4 -4 -4 5 // NUC_4 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0}, {0, 5, -4, -4, -4}, {0, -4, 5, -4, -4}, {0, -4, -4, 5, -4}, {0, -4, -4, -4, 5}, } // # // # This matrix was created by Todd Lowe 12/10/92 // # // # Uses ambiguous nucleotide codes, probabilities rounded to // # nearest integer // # // # Lowest score = -4, Highest score = 5 // # // A T G C S W R Y K M B V H D N // A 5 -4 -4 -4 -4 1 1 -4 -4 1 -4 -1 -1 -1 -2 // T -4 5 -4 -4 -4 1 -4 1 1 -4 -1 -4 -1 -1 -2 // G -4 -4 5 -4 1 -4 1 -4 1 -4 -1 -1 -4 -1 -2 // C -4 -4 -4 5 1 -4 -4 1 -4 1 -1 -1 -1 -4 -2 // S -4 -4 1 1 -1 -4 -2 -2 -2 -2 -1 -1 -3 -3 -1 // W 1 1 -4 -4 -4 -1 -2 -2 -2 -2 -3 -3 -1 -1 -1 // R 1 -4 1 -4 -2 -2 -1 -4 -2 -2 -3 -1 -3 -1 -1 // Y -4 1 -4 1 -2 -2 -4 -1 -2 -2 -1 -3 -1 -3 -1 // K -4 1 1 -4 -2 -2 -2 -2 -1 -4 -1 -3 -3 -1 -1 // M 1 -4 -4 1 -2 -2 -2 -2 -4 -1 -3 -1 -1 -3 -1 // B -4 -1 -1 -1 -1 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -2 -2 -1 // V -1 -4 -1 -1 -1 -3 -1 -3 -3 -1 -2 -1 -2 -2 -1 // H -1 -1 -4 -1 -3 -1 -3 -1 -3 -1 -2 -2 -1 -2 -1 // D -1 -1 -1 -4 -3 -1 -1 -3 -1 -3 -2 -2 -2 -1 -1 // N -2 -2 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 // NUC_4_4 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 5, -4, 1, -4, 1, -4, -1, -4, 1, -4, -1, -4, -1, -4, -2}, {0, -4, 5, 1, -4, -4, 1, -1, -4, -4, 1, -1, -4, -4, -1, -2}, {0, 1, 1, -1, -4, -2, -2, -1, -4, -2, -2, -1, -4, -3, -3, -1}, {0, -4, -4, -4, 5, 1, 1, -1, -4, -4, -4, -4, 1, -1, -1, -2}, {0, 1, -4, -2, 1, -1, -2, -1, -4, -2, -4, -3, -2, -1, -3, -1}, {0, -4, 1, -2, 1, -2, -1, -1, -4, -4, -2, -3, -2, -3, -1, -1}, {0, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -4, -3, -3, -2, -3, -2, -2, -1}, {0, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, 5, 1, 1, -1, 1, -1, -1, -2}, {0, 1, -4, -2, -4, -2, -4, -3, 1, -1, -2, -1, -2, -1, -3, -1}, {0, -4, 1, -2, -4, -4, -2, -3, 1, -2, -1, -1, -2, -3, -1, -1}, {0, -1, -1, -1, -4, -3, -3, -2, -1, -1, -1, -1, -3, -2, -2, -1}, {0, -4, -4, -4, 1, -2, -2, -3, 1, -2, -2, -3, -1, -1, -1, -1}, {0, -1, -4, -3, -1, -1, -3, -2, -1, -1, -3, -2, -1, -1, -2, -1}, {0, -4, -1, -3, -1, -3, -1, -2, -1, -3, -1, -2, -1, -2, -1, -1}, {0, -2, -2, -1, -2, -1, -1, -1, -2, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1}, } // #Date: Wed, 18 Sep 91 17:36:51 EDT // #From: altschul@ray.nlm.nih.gov (Stephen Altschul) // #To: gish@ray.nlm.nih.gov // #Subject: Vanilla-flavored PAM-250 // # // # substitution scores for B, Z, X, and * were obtained with "pam" version 1.0.5 // # // A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * // A 2 -2 0 0 -2 0 0 1 -1 -1 -2 -1 -1 -4 1 1 1 -6 -3 0 0 0 0 -8 // R -2 6 0 -1 -4 1 -1 -3 2 -2 -3 3 0 -4 0 0 -1 2 -4 -2 -1 0 -1 -8 // N 0 0 2 2 -4 1 1 0 2 -2 -3 1 -2 -4 -1 1 0 -4 -2 -2 2 1 0 -8 // D 0 -1 2 4 -5 2 3 1 1 -2 -4 0 -3 -6 -1 0 0 -7 -4 -2 3 3 -1 -8 // C -2 -4 -4 -5 12 -5 -5 -3 -3 -2 -6 -5 -5 -4 -3 0 -2 -8 0 -2 -4 -5 -3 -8 // Q 0 1 1 2 -5 4 2 -1 3 -2 -2 1 -1 -5 0 -1 -1 -5 -4 -2 1 3 -1 -8 // E 0 -1 1 3 -5 2 4 0 1 -2 -3 0 -2 -5 -1 0 0 -7 -4 -2 3 3 -1 -8 // G 1 -3 0 1 -3 -1 0 5 -2 -3 -4 -2 -3 -5 -1 1 0 -7 -5 -1 0 0 -1 -8 // H -1 2 2 1 -3 3 1 -2 6 -2 -2 0 -2 -2 0 -1 -1 -3 0 -2 1 2 -1 -8 // I -1 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -3 -2 5 2 -2 2 1 -2 -1 0 -5 -1 4 -2 -2 -1 -8 // L -2 -3 -3 -4 -6 -2 -3 -4 -2 2 6 -3 4 2 -3 -3 -2 -2 -1 2 -3 -3 -1 -8 // K -1 3 1 0 -5 1 0 -2 0 -2 -3 5 0 -5 -1 0 0 -3 -4 -2 1 0 -1 -8 // M -1 0 -2 -3 -5 -1 -2 -3 -2 2 4 0 6 0 -2 -2 -1 -4 -2 2 -2 -2 -1 -8 // F -4 -4 -4 -6 -4 -5 -5 -5 -2 1 2 -5 0 9 -5 -3 -3 0 7 -1 -4 -5 -2 -8 // P 1 0 -1 -1 -3 0 -1 -1 0 -2 -3 -1 -2 -5 6 1 0 -6 -5 -1 -1 0 -1 -8 // S 1 0 1 0 0 -1 0 1 -1 -1 -3 0 -2 -3 1 2 1 -2 -3 -1 0 0 0 -8 // T 1 -1 0 0 -2 -1 0 0 -1 0 -2 0 -1 -3 0 1 3 -5 -3 0 0 -1 0 -8 // W -6 2 -4 -7 -8 -5 -7 -7 -3 -5 -2 -3 -4 0 -6 -2 -5 17 0 -6 -5 -6 -4 -8 // Y -3 -4 -2 -4 0 -4 -4 -5 0 -1 -1 -4 -2 7 -5 -3 -3 0 10 -2 -3 -4 -2 -8 // V 0 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -1 -2 4 2 -2 2 -1 -1 -1 0 -6 -2 4 -2 -2 -1 -8 // B 0 -1 2 3 -4 1 3 0 1 -2 -3 1 -2 -4 -1 0 0 -5 -3 -2 3 2 -1 -8 // Z 0 0 1 3 -5 3 3 0 2 -2 -3 0 -2 -5 0 0 -1 -6 -4 -2 2 3 -1 -8 // X 0 -1 0 -1 -3 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 0 -4 -2 -1 -1 -1 -1 -8 // * -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 1 // DAYHOFF = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 2, 0, -2, 0, 0, -4, 1, -1, -1, 0, -1, -2, -1, 0, 1, 0, -2, 1, 1, 0, -6, 0, -3, 0, -8}, {0, 0, 3, -4, 3, 3, -4, 0, 1, -2, 0, 1, -3, -2, 2, -1, 1, -1, 0, 0, -2, -5, -1, -3, 2, -8}, {0, -2, -4, 12, -5, -5, -4, -3, -3, -2, 0, -5, -6, -5, -4, -3, -5, -4, 0, -2, -2, -8, -3, 0, -5, -8}, {0, 0, 3, -5, 4, 3, -6, 1, 1, -2, 0, 0, -4, -3, 2, -1, 2, -1, 0, 0, -2, -7, -1, -4, 3, -8}, {0, 0, 3, -5, 3, 4, -5, 0, 1, -2, 0, 0, -3, -2, 1, -1, 2, -1, 0, 0, -2, -7, -1, -4, 3, -8}, {0, -4, -4, -4, -6, -5, 9, -5, -2, 1, 0, -5, 2, 0, -4, -5, -5, -4, -3, -3, -1, 0, -2, 7, -5, -8}, {0, 1, 0, -3, 1, 0, -5, 5, -2, -3, 0, -2, -4, -3, 0, -1, -1, -3, 1, 0, -1, -7, -1, -5, 0, -8}, {0, -1, 1, -3, 1, 1, -2, -2, 6, -2, 0, 0, -2, -2, 2, 0, 3, 2, -1, -1, -2, -3, -1, 0, 2, -8}, {0, -1, -2, -2, -2, -2, 1, -3, -2, 5, 0, -2, 2, 2, -2, -2, -2, -2, -1, 0, 4, -5, -1, -1, -2, -8}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, -1, 1, -5, 0, 0, -5, -2, 0, -2, 0, 5, -3, 0, 1, -1, 1, 3, 0, 0, -2, -3, -1, -4, 0, -8}, {0, -2, -3, -6, -4, -3, 2, -4, -2, 2, 0, -3, 6, 4, -3, -3, -2, -3, -3, -2, 2, -2, -1, -1, -3, -8}, {0, -1, -2, -5, -3, -2, 0, -3, -2, 2, 0, 0, 4, 6, -2, -2, -1, 0, -2, -1, 2, -4, -1, -2, -2, -8}, {0, 0, 2, -4, 2, 1, -4, 0, 2, -2, 0, 1, -3, -2, 2, -1, 1, 0, 1, 0, -2, -4, 0, -2, 1, -8}, {0, 1, -1, -3, -1, -1, -5, -1, 0, -2, 0, -1, -3, -2, -1, 6, 0, 0, 1, 0, -1, -6, -1, -5, 0, -8}, {0, 0, 1, -5, 2, 2, -5, -1, 3, -2, 0, 1, -2, -1, 1, 0, 4, 1, -1, -1, -2, -5, -1, -4, 3, -8}, {0, -2, -1, -4, -1, -1, -4, -3, 2, -2, 0, 3, -3, 0, 0, 0, 1, 6, 0, -1, -2, 2, -1, -4, 0, -8}, {0, 1, 0, 0, 0, 0, -3, 1, -1, -1, 0, 0, -3, -2, 1, 1, -1, 0, 2, 1, -1, -2, 0, -3, 0, -8}, {0, 1, 0, -2, 0, 0, -3, 0, -1, 0, 0, 0, -2, -1, 0, 0, -1, -1, 1, 3, 0, -5, 0, -3, -1, -8}, {0, 0, -2, -2, -2, -2, -1, -1, -2, 4, 0, -2, 2, 2, -2, -1, -2, -2, -1, 0, 4, -6, -1, -2, -2, -8}, {0, -6, -5, -8, -7, -7, 0, -7, -3, -5, 0, -3, -2, -4, -4, -6, -5, 2, -2, -5, -6, 17, -4, 0, -6, -8}, {0, 0, -1, -3, -1, -1, -2, -1, -1, -1, 0, -1, -1, -1, 0, -1, -1, -1, 0, 0, -1, -4, -1, -2, -1, -8}, {0, -3, -3, 0, -4, -4, 7, -5, 0, -1, 0, -4, -1, -2, -2, -5, -4, -4, -3, -3, -2, 0, -2, 10, -4, -8}, {0, 0, 2, -5, 3, 3, -5, 0, 2, -2, 0, 0, -3, -2, 1, 0, 3, 0, 0, -1, -2, -6, -1, -4, 3, -8}, {0, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, 0, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, 1}, } // # PAM 250 matrix recommended by Gonnet, Cohen & Benner // # Science June 5, 1992. // # Values rounded to nearest integer // C S T P A G N D E Q H R K M I L V F Y W X * // C 12 0 0 -3 0 -2 -2 -3 -3 -2 -1 -2 -3 -1 -1 -2 0 -1 0 -1 -3 -8 // S 0 2 2 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 -1 -2 -2 -1 -3 -2 -3 0 -8 // T 0 2 2 0 1 -1 0 0 0 0 0 0 0 -1 -1 -1 0 -2 -2 -4 0 -8 // P -3 0 0 8 0 -2 -1 -1 0 0 -1 -1 -1 -2 -3 -2 -2 -4 -3 -5 -1 -8 // A 0 1 1 0 2 0 0 0 0 0 -1 -1 0 -1 -1 -1 0 -2 -2 -4 0 -8 // G -2 0 -1 -2 0 7 0 0 -1 -1 -1 -1 -1 -4 -4 -4 -3 -5 -4 -4 -1 -8 // N -2 1 0 -1 0 0 4 2 1 1 1 0 1 -2 -3 -3 -2 -3 -1 -4 0 -8 // D -3 0 0 -1 0 0 2 5 3 1 0 0 0 -3 -4 -4 -3 -4 -3 -5 -1 -8 // E -3 0 0 0 0 -1 1 3 4 2 0 0 1 -2 -3 -3 -2 -4 -3 -4 -1 -8 // Q -2 0 0 0 0 -1 1 1 2 3 1 2 2 -1 -2 -2 -2 -3 -2 -3 -1 -8 // H -1 0 0 -1 -1 -1 1 0 0 1 6 1 1 -1 -2 -2 -2 0 2 -1 -1 -8 // R -2 0 0 -1 -1 -1 0 0 0 2 1 5 3 -2 -2 -2 -2 -3 -2 -2 -1 -8 // K -3 0 0 -1 0 -1 1 0 1 2 1 3 3 -1 -2 -2 -2 -3 -2 -4 -1 -8 // M -1 -1 -1 -2 -1 -4 -2 -3 -2 -1 -1 -2 -1 4 2 3 2 2 0 -1 -1 -8 // I -1 -2 -1 -3 -1 -4 -3 -4 -3 -2 -2 -2 -2 2 4 3 3 1 -1 -2 -1 -8 // L -2 -2 -1 -2 -1 -4 -3 -4 -3 -2 -2 -2 -2 3 3 4 2 2 0 -1 -1 -8 // V 0 -1 0 -2 0 -3 -2 -3 -2 -2 -2 -2 -2 2 3 2 3 0 -1 -3 -1 -8 // F -1 -3 -2 -4 -2 -5 -3 -4 -4 -3 0 -3 -3 2 1 2 0 7 5 4 -2 -8 // Y 0 -2 -2 -3 -2 -4 -1 -3 -3 -2 2 -2 -2 0 -1 0 -1 5 8 4 -2 -8 // W -1 -3 -4 -5 -4 -4 -4 -5 -4 -3 -1 -2 -4 -1 -2 -1 -3 4 4 14 -4 -8 // X -3 0 0 -1 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -4 -1 -8 // * -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 1 // GONNET = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 2, 0, 0, 0, 0, -2, 0, -1, -1, 0, 0, -1, -1, 0, 0, 0, -1, 1, 1, 0, -4, 0, -2, 0, -8}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 0, 0, 12, -3, -3, -1, -2, -1, -1, 0, -3, -2, -1, -2, -3, -2, -2, 0, 0, 0, -1, -3, 0, 0, -8}, {0, 0, 0, -3, 5, 3, -4, 0, 0, -4, 0, 0, -4, -3, 2, -1, 1, 0, 0, 0, -3, -5, -1, -3, 0, -8}, {0, 0, 0, -3, 3, 4, -4, -1, 0, -3, 0, 1, -3, -2, 1, 0, 2, 0, 0, 0, -2, -4, -1, -3, 0, -8}, {0, -2, 0, -1, -4, -4, 7, -5, 0, 1, 0, -3, 2, 2, -3, -4, -3, -3, -3, -2, 0, 4, -2, 5, 0, -8}, {0, 0, 0, -2, 0, -1, -5, 7, -1, -4, 0, -1, -4, -4, 0, 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-1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 // D -1 -1 -1 -1 1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 // C -1 -1 -1 -1 -1 1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 // Q -1 -1 -1 -1 -1 -1 1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 // Z -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 // E -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 // G -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 // H -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 // I -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 // L -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 // K -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 // M -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 // F -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 // P -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 // S -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 // T -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 1 -1 -1 -1 -1 -1 // W -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 1 -1 -1 -1 -1 // Y -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 1 -1 -1 -1 // V -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 1 -1 -1 // X -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 0 -1 // * -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 0 // MATCH = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, 0, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1}, {0, -1, 1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, 0, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1}, {0, -1, -1, 1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, 0, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1}, {0, -1, -1, -1, 1, -1, -1, -1, -1, -1, 0, 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-1, 0, -1, -1, -1, 1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1}, {0, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, 0, -1, -1, -1, -1, 1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1}, {0, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, 0, -1, -1, -1, -1, -1, 1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1}, {0, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, 0, -1, -1, -1, -1, -1, -1, 1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1}, {0, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, 0, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, 1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1}, {0, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, 0, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, 1, -1, -1, -1, -1, -1, -1}, {0, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, 0, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, 1, -1, -1, -1, -1, -1}, {0, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, 0, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, 1, -1, -1, -1, -1}, {0, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, 0, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, 0, -1, -1, -1}, {0, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, 0, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, 1, -1, -1}, {0, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, 0, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, 1, -1}, {0, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, 0, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, 0}, } // # Matrix made by matblas from blosum100_3.iij // # * column uses minimum score // # BLOSUM Clustered Scoring Matrix in 1/3 Bit Units // # Blocks Database = /data/blocks_5.0/blocks.dat // # Cluster Percentage: >= 100 // # Entropy = 1.4516, Expected = -1.0948 // A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * // A 8 -3 -4 -5 -2 -2 -3 -1 -4 -4 -4 -2 -3 -5 -2 1 -1 -6 -5 -2 -4 -2 -2 -10 // R -3 10 -2 -5 -8 0 -2 -6 -1 -7 -6 3 -4 -6 -5 -3 -3 -7 -5 -6 -4 -1 -3 -10 // N -4 -2 11 1 -5 -1 -2 -2 0 -7 -7 -1 -5 -7 -5 0 -1 -8 -5 -7 5 -2 -3 -10 // D -5 -5 1 10 -8 -2 2 -4 -3 -8 -8 -3 -8 -8 -5 -2 -4 -10 -7 -8 6 0 -4 -10 // C -2 -8 -5 -8 14 -7 -9 -7 -8 -3 -5 -8 -4 -4 -8 -3 -3 -7 -6 -3 -7 -8 -5 -10 // Q -2 0 -1 -2 -7 11 2 -5 1 -6 -5 2 -2 -6 -4 -2 -3 -5 -4 -5 -2 5 -2 -10 // E -3 -2 -2 2 -9 2 10 -6 -2 -7 -7 0 -5 -8 -4 -2 -3 -8 -7 -5 0 7 -3 -10 // G -1 -6 -2 -4 -7 -5 -6 9 -6 -9 -8 -5 -7 -8 -6 -2 -5 -7 -8 -8 -3 -5 -4 -10 // H -4 -1 0 -3 -8 1 -2 -6 13 -7 -6 -3 -5 -4 -5 -3 -4 -5 1 -7 -2 -1 -4 -10 // I -4 -7 -7 -8 -3 -6 -7 -9 -7 8 2 -6 1 -2 -7 -5 -3 -6 -4 4 -8 -7 -3 -10 // L -4 -6 -7 -8 -5 -5 -7 -8 -6 2 8 -6 3 0 -7 -6 -4 -5 -4 0 -8 -6 -3 -10 // K -2 3 -1 -3 -8 2 0 -5 -3 -6 -6 10 -4 -6 -3 -2 -3 -8 -5 -5 -2 0 -3 -10 // M -3 -4 -5 -8 -4 -2 -5 -7 -5 1 3 -4 12 -1 -5 -4 -2 -4 -5 0 -7 -4 -3 -10 // F -5 -6 -7 -8 -4 -6 -8 -8 -4 -2 0 -6 -1 11 -7 -5 -5 0 4 -3 -7 -7 -4 -10 // P -2 -5 -5 -5 -8 -4 -4 -6 -5 -7 -7 -3 -5 -7 12 -3 -4 -8 -7 -6 -5 -4 -4 -10 // S 1 -3 0 -2 -3 -2 -2 -2 -3 -5 -6 -2 -4 -5 -3 9 2 -7 -5 -4 -1 -2 -2 -10 // T -1 -3 -1 -4 -3 -3 -3 -5 -4 -3 -4 -3 -2 -5 -4 2 9 -7 -5 -1 -2 -3 -2 -10 // W -6 -7 -8 -10 -7 -5 -8 -7 -5 -6 -5 -8 -4 0 -8 -7 -7 17 2 -5 -9 -7 -6 -10 // Y -5 -5 -5 -7 -6 -4 -7 -8 1 -4 -4 -5 -5 4 -7 -5 -5 2 12 -5 -6 -6 -4 -10 // V -2 -6 -7 -8 -3 -5 -5 -8 -7 4 0 -5 0 -3 -6 -4 -1 -5 -5 8 -7 -5 -3 -10 // B -4 -4 5 6 -7 -2 0 -3 -2 -8 -8 -2 -7 -7 -5 -1 -2 -9 -6 -7 6 0 -4 -10 // Z -2 -1 -2 0 -8 5 7 -5 -1 -7 -6 0 -4 -7 -4 -2 -3 -7 -6 -5 0 6 -2 -10 // X -2 -3 -3 -4 -5 -2 -3 -4 -4 -3 -3 -3 -3 -4 -4 -2 -2 -6 -4 -3 -4 -2 -3 -10 // * -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 1 // BLOSUM100 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 8, -4, -2, -5, -3, -5, -1, -4, -4, 0, -2, -4, -3, -4, -2, -2, -3, 1, -1, -2, -6, -2, -5, -2, -10}, {0, -4, 6, -7, 6, 0, -7, -3, -2, -8, 0, -2, -8, -7, 5, -5, -2, -4, -1, -2, -7, -9, -4, -6, 0, -10}, {0, -2, -7, 14, -8, -9, -4, -7, -8, -3, 0, -8, -5, -4, -5, -8, -7, -8, -3, -3, -3, -7, -5, -6, -8, -10}, {0, -5, 6, -8, 10, 2, -8, -4, -3, -8, 0, -3, -8, -8, 1, -5, -2, -5, -2, -4, -8, -10, -4, -7, 0, -10}, {0, -3, 0, -9, 2, 10, -8, -6, -2, -7, 0, 0, -7, -5, -2, -4, 2, -2, -2, -3, -5, -8, -3, -7, 7, -10}, {0, -5, -7, -4, -8, -8, 11, -8, -4, -2, 0, -6, 0, -1, -7, -7, -6, -6, -5, -5, -3, 0, -4, 4, -7, -10}, {0, -1, -3, -7, -4, -6, -8, 9, -6, -9, 0, -5, -8, -7, -2, -6, -5, -6, -2, -5, -8, -7, -4, -8, -5, -10}, {0, -4, -2, -8, -3, -2, -4, -6, 13, -7, 0, -3, -6, -5, 0, -5, 1, -1, -3, -4, -7, -5, -4, 1, -1, -10}, {0, -4, -8, -3, -8, -7, -2, -9, -7, 8, 0, -6, 2, 1, -7, -7, -6, -7, -5, -3, 4, -6, -3, -4, -7, -10}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, -2, -2, -8, -3, 0, -6, -5, -3, -6, 0, 10, -6, -4, -1, -3, 2, 3, -2, -3, -5, -8, -3, -5, 0, -10}, {0, -4, -8, -5, -8, -7, 0, -8, -6, 2, 0, -6, 8, 3, -7, -7, -5, -6, -6, -4, 0, -5, -3, -4, -6, -10}, {0, -3, -7, -4, -8, -5, -1, -7, -5, 1, 0, -4, 3, 12, -5, -5, -2, -4, -4, -2, 0, -4, -3, -5, -4, -10}, {0, -4, 5, -5, 1, -2, -7, -2, 0, -7, 0, -1, -7, -5, 11, -5, -1, -2, 0, -1, -7, -8, -3, -5, -2, -10}, {0, -2, -5, -8, -5, -4, -7, -6, -5, -7, 0, -3, -7, -5, -5, 12, -4, -5, -3, -4, -6, -8, -4, -7, -4, -10}, {0, -2, -2, -7, -2, 2, -6, -5, 1, -6, 0, 2, -5, -2, -1, -4, 11, 0, -2, -3, -5, -5, -2, -4, 5, -10}, {0, -3, -4, -8, -5, -2, -6, -6, -1, -7, 0, 3, -6, -4, -2, -5, 0, 10, -3, -3, -6, -7, -3, -5, -1, -10}, {0, 1, -1, -3, -2, -2, -5, -2, -3, -5, 0, -2, -6, -4, 0, -3, -2, -3, 9, 2, -4, -7, -2, -5, -2, -10}, {0, -1, -2, -3, -4, -3, -5, -5, -4, -3, 0, -3, -4, -2, -1, -4, -3, -3, 2, 9, -1, -7, -2, -5, -3, -10}, {0, -2, -7, -3, -8, -5, -3, -8, -7, 4, 0, -5, 0, 0, -7, -6, -5, -6, -4, -1, 8, -5, -3, -5, -5, -10}, {0, -6, -9, -7, -10, -8, 0, -7, -5, -6, 0, -8, -5, -4, -8, -8, -5, -7, -7, -7, -5, 17, -6, 2, -7, -10}, {0, -2, -4, -5, -4, -3, -4, -4, -4, -3, 0, -3, -3, -3, -3, -4, -2, -3, -2, -2, -3, -6, -3, -4, -2, -10}, {0, -5, -6, -6, -7, -7, 4, -8, 1, -4, 0, -5, -4, -5, -5, -7, -4, -5, -5, -5, -5, 2, -4, 12, -6, -10}, {0, -2, 0, -8, 0, 7, -7, -5, -1, -7, 0, 0, -6, -4, -2, -4, 5, -1, -2, -3, -5, -7, -2, -6, 6, -10}, {0, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, 0, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, 1}, } // # Matrix made by matblas from blosum30.iij // # * column uses minimum score // # BLOSUM Clustered Scoring Matrix in 1/5 Bit Units // # Blocks Database = /data/blocks_5.0/blocks.dat // # Cluster Percentage: >= 30 // # Entropy = 0.1424, Expected = -0.1074 // A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * // A 4 -1 0 0 -3 1 0 0 -2 0 -1 0 1 -2 -1 1 1 -5 -4 1 0 0 0 -7 // R -1 8 -2 -1 -2 3 -1 -2 -1 -3 -2 1 0 -1 -1 -1 -3 0 0 -1 -2 0 -1 -7 // N 0 -2 8 1 -1 -1 -1 0 -1 0 -2 0 0 -1 -3 0 1 -7 -4 -2 4 -1 0 -7 // D 0 -1 1 9 -3 -1 1 -1 -2 -4 -1 0 -3 -5 -1 0 -1 -4 -1 -2 5 0 -1 -7 // C -3 -2 -1 -3 17 -2 1 -4 -5 -2 0 -3 -2 -3 -3 -2 -2 -2 -6 -2 -2 0 -2 -7 // Q 1 3 -1 -1 -2 8 2 -2 0 -2 -2 0 -1 -3 0 -1 0 -1 -1 -3 -1 4 0 -7 // E 0 -1 -1 1 1 2 6 -2 0 -3 -1 2 -1 -4 1 0 -2 -1 -2 -3 0 5 -1 -7 // G 0 -2 0 -1 -4 -2 -2 8 -3 -1 -2 -1 -2 -3 -1 0 -2 1 -3 -3 0 -2 -1 -7 // H -2 -1 -1 -2 -5 0 0 -3 14 -2 -1 -2 2 -3 1 -1 -2 -5 0 -3 -2 0 -1 -7 // I 0 -3 0 -4 -2 -2 -3 -1 -2 6 2 -2 1 0 -3 -1 0 -3 -1 4 -2 -3 0 -7 // L -1 -2 -2 -1 0 -2 -1 -2 -1 2 4 -2 2 2 -3 -2 0 -2 3 1 -1 -1 0 -7 // K 0 1 0 0 -3 0 2 -1 -2 -2 -2 4 2 -1 1 0 -1 -2 -1 -2 0 1 0 -7 // M 1 0 0 -3 -2 -1 -1 -2 2 1 2 2 6 -2 -4 -2 0 -3 -1 0 -2 -1 0 -7 // F -2 -1 -1 -5 -3 -3 -4 -3 -3 0 2 -1 -2 10 -4 -1 -2 1 3 1 -3 -4 -1 -7 // P -1 -1 -3 -1 -3 0 1 -1 1 -3 -3 1 -4 -4 11 -1 0 -3 -2 -4 -2 0 -1 -7 // S 1 -1 0 0 -2 -1 0 0 -1 -1 -2 0 -2 -1 -1 4 2 -3 -2 -1 0 -1 0 -7 // T 1 -3 1 -1 -2 0 -2 -2 -2 0 0 -1 0 -2 0 2 5 -5 -1 1 0 -1 0 -7 // W -5 0 -7 -4 -2 -1 -1 1 -5 -3 -2 -2 -3 1 -3 -3 -5 20 5 -3 -5 -1 -2 -7 // Y -4 0 -4 -1 -6 -1 -2 -3 0 -1 3 -1 -1 3 -2 -2 -1 5 9 1 -3 -2 -1 -7 // V 1 -1 -2 -2 -2 -3 -3 -3 -3 4 1 -2 0 1 -4 -1 1 -3 1 5 -2 -3 0 -7 // B 0 -2 4 5 -2 -1 0 0 -2 -2 -1 0 -2 -3 -2 0 0 -5 -3 -2 5 0 -1 -7 // Z 0 0 -1 0 0 4 5 -2 0 -3 -1 1 -1 -4 0 -1 -1 -1 -2 -3 0 4 0 -7 // X 0 -1 0 -1 -2 0 -1 -1 -1 0 0 0 0 -1 -1 0 0 -2 -1 0 -1 0 -1 -7 // * -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 1 // BLOSUM30 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 4, 0, -3, 0, 0, -2, 0, -2, 0, 0, 0, -1, 1, 0, -1, 1, -1, 1, 1, 1, -5, 0, -4, 0, -7}, {0, 0, 5, -2, 5, 0, -3, 0, -2, -2, 0, 0, -1, -2, 4, -2, -1, -2, 0, 0, -2, -5, -1, -3, 0, -7}, {0, -3, -2, 17, -3, 1, -3, -4, -5, -2, 0, -3, 0, -2, -1, -3, -2, -2, -2, -2, -2, -2, -2, -6, 0, -7}, {0, 0, 5, -3, 9, 1, -5, -1, -2, -4, 0, 0, -1, -3, 1, -1, -1, -1, 0, -1, -2, -4, -1, -1, 0, -7}, {0, 0, 0, 1, 1, 6, -4, -2, 0, -3, 0, 2, -1, -1, -1, 1, 2, -1, 0, -2, -3, -1, -1, -2, 5, -7}, {0, -2, -3, -3, -5, -4, 10, -3, -3, 0, 0, -1, 2, -2, -1, -4, -3, -1, -1, -2, 1, 1, -1, 3, -4, -7}, {0, 0, 0, -4, -1, -2, -3, 8, -3, -1, 0, -1, -2, -2, 0, -1, -2, -2, 0, -2, -3, 1, -1, -3, -2, -7}, {0, -2, -2, -5, -2, 0, -3, -3, 14, -2, 0, -2, -1, 2, -1, 1, 0, -1, -1, -2, -3, -5, -1, 0, 0, -7}, {0, 0, -2, -2, -4, -3, 0, -1, -2, 6, 0, -2, 2, 1, 0, -3, -2, -3, -1, 0, 4, -3, 0, -1, -3, -7}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 0, 0, -3, 0, 2, -1, -1, -2, -2, 0, 4, -2, 2, 0, 1, 0, 1, 0, -1, -2, -2, 0, -1, 1, -7}, {0, -1, -1, 0, -1, -1, 2, -2, -1, 2, 0, -2, 4, 2, -2, -3, -2, -2, -2, 0, 1, -2, 0, 3, -1, -7}, {0, 1, -2, -2, -3, -1, -2, -2, 2, 1, 0, 2, 2, 6, 0, -4, -1, 0, -2, 0, 0, -3, 0, -1, -1, -7}, {0, 0, 4, -1, 1, -1, -1, 0, -1, 0, 0, 0, -2, 0, 8, -3, -1, -2, 0, 1, -2, -7, 0, -4, -1, -7}, {0, -1, -2, -3, -1, 1, -4, -1, 1, -3, 0, 1, -3, -4, -3, 11, 0, -1, -1, 0, -4, -3, -1, -2, 0, -7}, {0, 1, -1, -2, -1, 2, -3, -2, 0, -2, 0, 0, -2, -1, -1, 0, 8, 3, -1, 0, -3, -1, 0, -1, 4, -7}, {0, -1, -2, -2, -1, -1, -1, -2, -1, -3, 0, 1, -2, 0, -2, -1, 3, 8, -1, -3, -1, 0, -1, 0, 0, -7}, {0, 1, 0, -2, 0, 0, -1, 0, -1, -1, 0, 0, -2, -2, 0, -1, -1, -1, 4, 2, -1, -3, 0, -2, -1, -7}, {0, 1, 0, -2, -1, -2, -2, -2, -2, 0, 0, -1, 0, 0, 1, 0, 0, -3, 2, 5, 1, -5, 0, -1, -1, -7}, {0, 1, -2, -2, -2, -3, 1, -3, -3, 4, 0, -2, 1, 0, -2, -4, -3, -1, -1, 1, 5, -3, 0, 1, -3, -7}, {0, -5, -5, -2, -4, -1, 1, 1, -5, -3, 0, -2, -2, -3, -7, -3, -1, 0, -3, -5, -3, 20, -2, 5, -1, -7}, {0, 0, -1, -2, -1, -1, -1, -1, -1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, -1, 0, -1, 0, 0, 0, -2, -1, -1, 0, -7}, {0, -4, -3, -6, -1, -2, 3, -3, 0, -1, 0, -1, 3, -1, -4, -2, -1, 0, -2, -1, 1, 5, -1, 9, -2, -7}, {0, 0, 0, 0, 0, 5, -4, -2, 0, -3, 0, 1, -1, -1, -1, 0, 4, 0, -1, -1, -3, -1, 0, -2, 4, -7}, {0, -7, -7, -7, -7, -7, -7, -7, -7, -7, 0, -7, -7, -7, -7, -7, -7, -7, -7, -7, -7, -7, -7, -7, -7, 1}, } // # Matrix made by matblas from blosum35.iij // # * column uses minimum score // # BLOSUM Clustered Scoring Matrix in 1/4 Bit Units // # Blocks Database = /data/blocks_5.0/blocks.dat // # Cluster Percentage: >= 35 // # Entropy = 0.2111, Expected = -0.1550 // A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * // A 5 -1 -1 -1 -2 0 -1 0 -2 -1 -2 0 0 -2 -2 1 0 -2 -1 0 -1 -1 0 -5 // R -1 8 -1 -1 -3 2 -1 -2 -1 -3 -2 2 0 -1 -2 -1 -2 0 0 -1 -1 0 -1 -5 // N -1 -1 7 1 -1 1 -1 1 1 -1 -2 0 -1 -1 -2 0 0 -2 -2 -2 4 0 0 -5 // D -1 -1 1 8 -3 -1 2 -2 0 -3 -2 -1 -3 -3 -1 -1 -1 -3 -2 -2 5 1 -1 -5 // C -2 -3 -1 -3 15 -3 -1 -3 -4 -4 -2 -2 -4 -4 -4 -3 -1 -5 -5 -2 -2 -2 -2 -5 // Q 0 2 1 -1 -3 7 2 -2 -1 -2 -2 0 -1 -4 0 0 0 -1 0 -3 0 4 -1 -5 // E -1 -1 -1 2 -1 2 6 -2 -1 -3 -1 1 -2 -3 0 0 -1 -1 -1 -2 0 5 -1 -5 // G 0 -2 1 -2 -3 -2 -2 7 -2 -3 -3 -1 -1 -3 -2 1 -2 -1 -2 -3 0 -2 -1 -5 // H -2 -1 1 0 -4 -1 -1 -2 12 -3 -2 -2 1 -3 -1 -1 -2 -4 0 -4 0 -1 -1 -5 // I -1 -3 -1 -3 -4 -2 -3 -3 -3 5 2 -2 1 1 -1 -2 -1 -1 0 4 -2 -3 0 -5 // L -2 -2 -2 -2 -2 -2 -1 -3 -2 2 5 -2 3 2 -3 -2 0 0 0 2 -2 -2 0 -5 // K 0 2 0 -1 -2 0 1 -1 -2 -2 -2 5 0 -1 0 0 0 0 -1 -2 0 1 0 -5 // M 0 0 -1 -3 -4 -1 -2 -1 1 1 3 0 6 0 -3 -1 0 1 0 1 -2 -2 0 -5 // F -2 -1 -1 -3 -4 -4 -3 -3 -3 1 2 -1 0 8 -4 -1 -1 1 3 1 -2 -3 -1 -5 // P -2 -2 -2 -1 -4 0 0 -2 -1 -1 -3 0 -3 -4 10 -2 0 -4 -3 -3 -1 0 -1 -5 // S 1 -1 0 -1 -3 0 0 1 -1 -2 -2 0 -1 -1 -2 4 2 -2 -1 -1 0 0 0 -5 // T 0 -2 0 -1 -1 0 -1 -2 -2 -1 0 0 0 -1 0 2 5 -2 -2 1 -1 -1 0 -5 // W -2 0 -2 -3 -5 -1 -1 -1 -4 -1 0 0 1 1 -4 -2 -2 16 3 -2 -3 -1 -1 -5 // Y -1 0 -2 -2 -5 0 -1 -2 0 0 0 -1 0 3 -3 -1 -2 3 8 0 -2 -1 -1 -5 // V 0 -1 -2 -2 -2 -3 -2 -3 -4 4 2 -2 1 1 -3 -1 1 -2 0 5 -2 -2 0 -5 // B -1 -1 4 5 -2 0 0 0 0 -2 -2 0 -2 -2 -1 0 -1 -3 -2 -2 5 0 -1 -5 // Z -1 0 0 1 -2 4 5 -2 -1 -3 -2 1 -2 -3 0 0 -1 -1 -1 -2 0 4 0 -5 // X 0 -1 0 -1 -2 -1 -1 -1 -1 0 0 0 0 -1 -1 0 0 -1 -1 0 -1 0 -1 -5 // * -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 1 // BLOSUM35 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 5, -1, -2, -1, -1, -2, 0, -2, -1, 0, 0, -2, 0, -1, -2, 0, -1, 1, 0, 0, -2, 0, -1, -1, -5}, {0, -1, 5, -2, 5, 0, -2, 0, 0, -2, 0, 0, -2, -2, 4, -1, 0, -1, 0, -1, -2, -3, -1, -2, 0, -5}, {0, -2, -2, 15, -3, -1, -4, -3, -4, -4, 0, -2, -2, -4, -1, -4, -3, -3, -3, -1, -2, -5, -2, -5, -2, -5}, {0, -1, 5, -3, 8, 2, -3, -2, 0, -3, 0, -1, -2, -3, 1, -1, -1, -1, -1, -1, -2, -3, -1, -2, 1, -5}, {0, -1, 0, -1, 2, 6, -3, -2, -1, -3, 0, 1, -1, -2, -1, 0, 2, -1, 0, -1, -2, -1, -1, -1, 5, -5}, {0, -2, -2, -4, -3, -3, 8, -3, -3, 1, 0, -1, 2, 0, -1, -4, -4, -1, -1, -1, 1, 1, -1, 3, -3, -5}, {0, 0, 0, -3, -2, -2, -3, 7, -2, -3, 0, -1, -3, -1, 1, -2, -2, -2, 1, -2, -3, -1, -1, -2, -2, -5}, {0, -2, 0, -4, 0, -1, -3, -2, 12, -3, 0, -2, -2, 1, 1, -1, -1, -1, -1, -2, -4, -4, -1, 0, -1, -5}, {0, -1, -2, -4, -3, -3, 1, -3, -3, 5, 0, -2, 2, 1, -1, -1, -2, -3, -2, -1, 4, -1, 0, 0, -3, -5}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 0, 0, -2, -1, 1, -1, -1, -2, -2, 0, 5, -2, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, -2, 0, 0, -1, 1, -5}, {0, -2, -2, -2, -2, -1, 2, -3, -2, 2, 0, -2, 5, 3, -2, -3, -2, -2, -2, 0, 2, 0, 0, 0, -2, -5}, {0, 0, -2, -4, -3, -2, 0, -1, 1, 1, 0, 0, 3, 6, -1, -3, -1, 0, -1, 0, 1, 1, 0, 0, -2, -5}, {0, -1, 4, -1, 1, -1, -1, 1, 1, -1, 0, 0, -2, -1, 7, -2, 1, -1, 0, 0, -2, -2, 0, -2, 0, -5}, {0, -2, -1, -4, -1, 0, -4, -2, -1, -1, 0, 0, -3, -3, -2, 10, 0, -2, -2, 0, -3, -4, -1, -3, 0, -5}, {0, 0, 0, -3, -1, 2, -4, -2, -1, -2, 0, 0, -2, -1, 1, 0, 7, 2, 0, 0, -3, -1, -1, 0, 4, -5}, {0, -1, -1, -3, -1, -1, -1, -2, -1, -3, 0, 2, -2, 0, -1, -2, 2, 8, -1, -2, -1, 0, -1, 0, 0, -5}, {0, 1, 0, -3, -1, 0, -1, 1, -1, -2, 0, 0, -2, -1, 0, -2, 0, -1, 4, 2, -1, -2, 0, -1, 0, -5}, {0, 0, -1, -1, -1, -1, -1, -2, -2, -1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, -2, 2, 5, 1, -2, 0, -2, -1, -5}, {0, 0, -2, -2, -2, -2, 1, -3, -4, 4, 0, -2, 2, 1, -2, -3, -3, -1, -1, 1, 5, -2, 0, 0, -2, -5}, {0, -2, -3, -5, -3, -1, 1, -1, -4, -1, 0, 0, 0, 1, -2, -4, -1, 0, -2, -2, -2, 16, -1, 3, -1, -5}, {0, 0, -1, -2, -1, -1, -1, -1, -1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, -1, -1, -1, 0, 0, 0, -1, -1, -1, 0, -5}, {0, -1, -2, -5, -2, -1, 3, -2, 0, 0, 0, -1, 0, 0, -2, -3, 0, 0, -1, -2, 0, 3, -1, 8, -1, -5}, {0, -1, 0, -2, 1, 5, -3, -2, -1, -3, 0, 1, -2, -2, 0, 0, 4, 0, 0, -1, -2, -1, 0, -1, 4, -5}, {0, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, 0, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, 1}, } // # Matrix made by matblas from blosum40.iij // # * column uses minimum score // # BLOSUM Clustered Scoring Matrix in 1/4 Bit Units // # Blocks Database = /data/blocks_5.0/blocks.dat // # Cluster Percentage: >= 40 // # Entropy = 0.2851, Expected = -0.2090 // A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * // A 5 -2 -1 -1 -2 0 -1 1 -2 -1 -2 -1 -1 -3 -2 1 0 -3 -2 0 -1 -1 0 -6 // R -2 9 0 -1 -3 2 -1 -3 0 -3 -2 3 -1 -2 -3 -1 -2 -2 -1 -2 -1 0 -1 -6 // N -1 0 8 2 -2 1 -1 0 1 -2 -3 0 -2 -3 -2 1 0 -4 -2 -3 4 0 -1 -6 // D -1 -1 2 9 -2 -1 2 -2 0 -4 -3 0 -3 -4 -2 0 -1 -5 -3 -3 6 1 -1 -6 // C -2 -3 -2 -2 16 -4 -2 -3 -4 -4 -2 -3 -3 -2 -5 -1 -1 -6 -4 -2 -2 -3 -2 -6 // Q 0 2 1 -1 -4 8 2 -2 0 -3 -2 1 -1 -4 -2 1 -1 -1 -1 -3 0 4 -1 -6 // E -1 -1 -1 2 -2 2 7 -3 0 -4 -2 1 -2 -3 0 0 -1 -2 -2 -3 1 5 -1 -6 // G 1 -3 0 -2 -3 -2 -3 8 -2 -4 -4 -2 -2 -3 -1 0 -2 -2 -3 -4 -1 -2 -1 -6 // H -2 0 1 0 -4 0 0 -2 13 -3 -2 -1 1 -2 -2 -1 -2 -5 2 -4 0 0 -1 -6 // I -1 -3 -2 -4 -4 -3 -4 -4 -3 6 2 -3 1 1 -2 -2 -1 -3 0 4 -3 -4 -1 -6 // L -2 -2 -3 -3 -2 -2 -2 -4 -2 2 6 -2 3 2 -4 -3 -1 -1 0 2 -3 -2 -1 -6 // K -1 3 0 0 -3 1 1 -2 -1 -3 -2 6 -1 -3 -1 0 0 -2 -1 -2 0 1 -1 -6 // M -1 -1 -2 -3 -3 -1 -2 -2 1 1 3 -1 7 0 -2 -2 -1 -2 1 1 -3 -2 0 -6 // F -3 -2 -3 -4 -2 -4 -3 -3 -2 1 2 -3 0 9 -4 -2 -1 1 4 0 -3 -4 -1 -6 // P -2 -3 -2 -2 -5 -2 0 -1 -2 -2 -4 -1 -2 -4 11 -1 0 -4 -3 -3 -2 -1 -2 -6 // S 1 -1 1 0 -1 1 0 0 -1 -2 -3 0 -2 -2 -1 5 2 -5 -2 -1 0 0 0 -6 // T 0 -2 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 0 -1 -1 0 2 6 -4 -1 1 0 -1 0 -6 // W -3 -2 -4 -5 -6 -1 -2 -2 -5 -3 -1 -2 -2 1 -4 -5 -4 19 3 -3 -4 -2 -2 -6 // Y -2 -1 -2 -3 -4 -1 -2 -3 2 0 0 -1 1 4 -3 -2 -1 3 9 -1 -3 -2 -1 -6 // V 0 -2 -3 -3 -2 -3 -3 -4 -4 4 2 -2 1 0 -3 -1 1 -3 -1 5 -3 -3 -1 -6 // B -1 -1 4 6 -2 0 1 -1 0 -3 -3 0 -3 -3 -2 0 0 -4 -3 -3 5 2 -1 -6 // Z -1 0 0 1 -3 4 5 -2 0 -4 -2 1 -2 -4 -1 0 -1 -2 -2 -3 2 5 -1 -6 // X 0 -1 -1 -1 -2 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 0 -1 -2 0 0 -2 -1 -1 -1 -1 -1 -6 // * -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 1 // BLOSUM40 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 5, -1, -2, -1, -1, -3, 1, -2, -1, 0, -1, -2, -1, -1, -2, 0, -2, 1, 0, 0, -3, 0, -2, -1, -6}, {0, -1, 5, -2, 6, 1, -3, -1, 0, -3, 0, 0, -3, -3, 4, -2, 0, -1, 0, 0, -3, -4, -1, -3, 2, -6}, {0, -2, -2, 16, -2, -2, -2, -3, -4, -4, 0, -3, -2, -3, -2, -5, -4, -3, -1, -1, -2, -6, -2, -4, -3, -6}, {0, -1, 6, -2, 9, 2, -4, -2, 0, -4, 0, 0, -3, -3, 2, -2, -1, -1, 0, -1, -3, -5, -1, -3, 1, -6}, {0, -1, 1, -2, 2, 7, -3, -3, 0, -4, 0, 1, -2, -2, -1, 0, 2, -1, 0, -1, -3, -2, -1, -2, 5, -6}, {0, -3, -3, -2, -4, -3, 9, -3, -2, 1, 0, -3, 2, 0, -3, -4, -4, -2, -2, -1, 0, 1, -1, 4, -4, -6}, {0, 1, -1, -3, -2, -3, -3, 8, -2, -4, 0, -2, -4, -2, 0, -1, -2, -3, 0, -2, -4, -2, -1, -3, -2, -6}, {0, -2, 0, -4, 0, 0, -2, -2, 13, -3, 0, -1, -2, 1, 1, -2, 0, 0, -1, -2, -4, -5, -1, 2, 0, -6}, {0, -1, -3, -4, -4, -4, 1, -4, -3, 6, 0, -3, 2, 1, -2, -2, -3, -3, -2, -1, 4, -3, -1, 0, -4, -6}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, -1, 0, -3, 0, 1, -3, -2, -1, -3, 0, 6, -2, -1, 0, -1, 1, 3, 0, 0, -2, -2, -1, -1, 1, -6}, {0, -2, -3, -2, -3, -2, 2, -4, -2, 2, 0, -2, 6, 3, -3, -4, -2, -2, -3, -1, 2, -1, -1, 0, -2, -6}, {0, -1, -3, -3, -3, -2, 0, -2, 1, 1, 0, -1, 3, 7, -2, -2, -1, -1, -2, -1, 1, -2, 0, 1, -2, -6}, {0, -1, 4, -2, 2, -1, -3, 0, 1, -2, 0, 0, -3, -2, 8, -2, 1, 0, 1, 0, -3, -4, -1, -2, 0, -6}, {0, -2, -2, -5, -2, 0, -4, -1, -2, -2, 0, -1, -4, -2, -2, 11, -2, -3, -1, 0, -3, -4, -2, -3, -1, -6}, {0, 0, 0, -4, -1, 2, -4, -2, 0, -3, 0, 1, -2, -1, 1, -2, 8, 2, 1, -1, -3, -1, -1, -1, 4, -6}, {0, -2, -1, -3, -1, -1, -2, -3, 0, -3, 0, 3, -2, -1, 0, -3, 2, 9, -1, -2, -2, -2, -1, -1, 0, -6}, {0, 1, 0, -1, 0, 0, -2, 0, -1, -2, 0, 0, -3, -2, 1, -1, 1, -1, 5, 2, -1, -5, 0, -2, 0, -6}, {0, 0, 0, -1, -1, -1, -1, -2, -2, -1, 0, 0, -1, -1, 0, 0, -1, -2, 2, 6, 1, -4, 0, -1, -1, -6}, {0, 0, -3, -2, -3, -3, 0, -4, -4, 4, 0, -2, 2, 1, -3, -3, -3, -2, -1, 1, 5, -3, -1, -1, -3, -6}, {0, -3, -4, -6, -5, -2, 1, -2, -5, -3, 0, -2, -1, -2, -4, -4, -1, -2, -5, -4, -3, 19, -2, 3, -2, -6}, {0, 0, -1, -2, -1, -1, -1, -1, -1, -1, 0, -1, -1, 0, -1, -2, -1, -1, 0, 0, -1, -2, -1, -1, -1, -6}, {0, -2, -3, -4, -3, -2, 4, -3, 2, 0, 0, -1, 0, 1, -2, -3, -1, -1, -2, -1, -1, 3, -1, 9, -2, -6}, {0, -1, 2, -3, 1, 5, -4, -2, 0, -4, 0, 1, -2, -2, 0, -1, 4, 0, 0, -1, -3, -2, -1, -2, 5, -6}, {0, -6, -6, -6, -6, -6, -6, -6, -6, -6, 0, -6, -6, -6, -6, -6, -6, -6, -6, -6, -6, -6, -6, -6, -6, 1}, } // # Matrix made by matblas from blosum45.iij // # * column uses minimum score // # BLOSUM Clustered Scoring Matrix in 1/3 Bit Units // # Blocks Database = /data/blocks_5.0/blocks.dat // # Cluster Percentage: >= 45 // # Entropy = 0.3795, Expected = -0.2789 // A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * // A 5 -2 -1 -2 -1 -1 -1 0 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 1 0 -2 -2 0 -1 -1 0 -5 // R -2 7 0 -1 -3 1 0 -2 0 -3 -2 3 -1 -2 -2 -1 -1 -2 -1 -2 -1 0 -1 -5 // N -1 0 6 2 -2 0 0 0 1 -2 -3 0 -2 -2 -2 1 0 -4 -2 -3 4 0 -1 -5 // D -2 -1 2 7 -3 0 2 -1 0 -4 -3 0 -3 -4 -1 0 -1 -4 -2 -3 5 1 -1 -5 // C -1 -3 -2 -3 12 -3 -3 -3 -3 -3 -2 -3 -2 -2 -4 -1 -1 -5 -3 -1 -2 -3 -2 -5 // Q -1 1 0 0 -3 6 2 -2 1 -2 -2 1 0 -4 -1 0 -1 -2 -1 -3 0 4 -1 -5 // E -1 0 0 2 -3 2 6 -2 0 -3 -2 1 -2 -3 0 0 -1 -3 -2 -3 1 4 -1 -5 // G 0 -2 0 -1 -3 -2 -2 7 -2 -4 -3 -2 -2 -3 -2 0 -2 -2 -3 -3 -1 -2 -1 -5 // H -2 0 1 0 -3 1 0 -2 10 -3 -2 -1 0 -2 -2 -1 -2 -3 2 -3 0 0 -1 -5 // I -1 -3 -2 -4 -3 -2 -3 -4 -3 5 2 -3 2 0 -2 -2 -1 -2 0 3 -3 -3 -1 -5 // L -1 -2 -3 -3 -2 -2 -2 -3 -2 2 5 -3 2 1 -3 -3 -1 -2 0 1 -3 -2 -1 -5 // K -1 3 0 0 -3 1 1 -2 -1 -3 -3 5 -1 -3 -1 -1 -1 -2 -1 -2 0 1 -1 -5 // M -1 -1 -2 -3 -2 0 -2 -2 0 2 2 -1 6 0 -2 -2 -1 -2 0 1 -2 -1 -1 -5 // F -2 -2 -2 -4 -2 -4 -3 -3 -2 0 1 -3 0 8 -3 -2 -1 1 3 0 -3 -3 -1 -5 // P -1 -2 -2 -1 -4 -1 0 -2 -2 -2 -3 -1 -2 -3 9 -1 -1 -3 -3 -3 -2 -1 -1 -5 // S 1 -1 1 0 -1 0 0 0 -1 -2 -3 -1 -2 -2 -1 4 2 -4 -2 -1 0 0 0 -5 // T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -1 -1 2 5 -3 -1 0 0 -1 0 -5 // W -2 -2 -4 -4 -5 -2 -3 -2 -3 -2 -2 -2 -2 1 -3 -4 -3 15 3 -3 -4 -2 -2 -5 // Y -2 -1 -2 -2 -3 -1 -2 -3 2 0 0 -1 0 3 -3 -2 -1 3 8 -1 -2 -2 -1 -5 // V 0 -2 -3 -3 -1 -3 -3 -3 -3 3 1 -2 1 0 -3 -1 0 -3 -1 5 -3 -3 -1 -5 // B -1 -1 4 5 -2 0 1 -1 0 -3 -3 0 -2 -3 -2 0 0 -4 -2 -3 4 2 -1 -5 // Z -1 0 0 1 -3 4 4 -2 0 -3 -2 1 -1 -3 -1 0 -1 -2 -2 -3 2 4 -1 -5 // X 0 -1 -1 -1 -2 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 0 0 -2 -1 -1 -1 -1 -1 -5 // * -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 1 // BLOSUM45 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 5, -1, -1, -2, -1, -2, 0, -2, -1, 0, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -2, 1, 0, 0, -2, 0, -2, -1, -5}, {0, -1, 4, -2, 5, 1, -3, -1, 0, -3, 0, 0, -3, -2, 4, -2, 0, -1, 0, 0, -3, -4, -1, -2, 2, -5}, {0, -1, -2, 12, -3, -3, -2, -3, -3, -3, 0, -3, -2, -2, -2, -4, -3, -3, -1, -1, -1, -5, -2, -3, -3, -5}, {0, -2, 5, -3, 7, 2, -4, -1, 0, -4, 0, 0, -3, -3, 2, -1, 0, -1, 0, -1, -3, -4, -1, -2, 1, -5}, {0, -1, 1, -3, 2, 6, -3, -2, 0, -3, 0, 1, -2, -2, 0, 0, 2, 0, 0, -1, -3, -3, -1, -2, 4, -5}, {0, -2, -3, -2, -4, -3, 8, -3, -2, 0, 0, -3, 1, 0, -2, -3, -4, -2, -2, -1, 0, 1, -1, 3, -3, -5}, {0, 0, -1, -3, -1, -2, -3, 7, -2, -4, 0, -2, -3, -2, 0, -2, -2, -2, 0, -2, -3, -2, -1, -3, -2, -5}, {0, -2, 0, -3, 0, 0, -2, -2, 10, -3, 0, -1, -2, 0, 1, -2, 1, 0, -1, -2, -3, -3, -1, 2, 0, -5}, {0, -1, -3, -3, -4, -3, 0, -4, -3, 5, 0, -3, 2, 2, -2, -2, -2, -3, -2, -1, 3, -2, -1, 0, -3, -5}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, -1, 0, -3, 0, 1, -3, -2, -1, -3, 0, 5, -3, -1, 0, -1, 1, 3, -1, -1, -2, -2, -1, -1, 1, -5}, {0, -1, -3, -2, -3, -2, 1, -3, -2, 2, 0, -3, 5, 2, -3, -3, -2, -2, -3, -1, 1, -2, -1, 0, -2, -5}, {0, -1, -2, -2, -3, -2, 0, -2, 0, 2, 0, -1, 2, 6, -2, -2, 0, -1, -2, -1, 1, -2, -1, 0, -1, -5}, {0, -1, 4, -2, 2, 0, -2, 0, 1, -2, 0, 0, -3, -2, 6, -2, 0, 0, 1, 0, -3, -4, -1, -2, 0, -5}, {0, -1, -2, -4, -1, 0, -3, -2, -2, -2, 0, -1, -3, -2, -2, 9, -1, -2, -1, -1, -3, -3, -1, -3, -1, -5}, {0, -1, 0, -3, 0, 2, -4, -2, 1, -2, 0, 1, -2, 0, 0, -1, 6, 1, 0, -1, -3, -2, -1, -1, 4, -5}, {0, -2, -1, -3, -1, 0, -2, -2, 0, -3, 0, 3, -2, -1, 0, -2, 1, 7, -1, -1, -2, -2, -1, -1, 0, -5}, {0, 1, 0, -1, 0, 0, -2, 0, -1, -2, 0, -1, -3, -2, 1, -1, 0, -1, 4, 2, -1, -4, 0, -2, 0, -5}, {0, 0, 0, -1, -1, -1, -1, -2, -2, -1, 0, -1, -1, -1, 0, -1, -1, -1, 2, 5, 0, -3, 0, -1, -1, -5}, {0, 0, -3, -1, -3, -3, 0, -3, -3, 3, 0, -2, 1, 1, -3, -3, -3, -2, -1, 0, 5, -3, -1, -1, -3, -5}, {0, -2, -4, -5, -4, -3, 1, -2, -3, -2, 0, -2, -2, -2, -4, -3, -2, -2, -4, -3, -3, 15, -2, 3, -2, -5}, {0, 0, -1, -2, -1, -1, -1, -1, -1, -1, 0, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, 0, 0, -1, -2, -1, -1, -1, -5}, {0, -2, -2, -3, -2, -2, 3, -3, 2, 0, 0, -1, 0, 0, -2, -3, -1, -1, -2, -1, -1, 3, -1, 8, -2, -5}, {0, -1, 2, -3, 1, 4, -3, -2, 0, -3, 0, 1, -2, -1, 0, -1, 4, 0, 0, -1, -3, -2, -1, -2, 4, -5}, {0, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, 0, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, 1}, } // # Matrix made by matblas from blosum50.iij // # * column uses minimum score // # BLOSUM Clustered Scoring Matrix in 1/3 Bit Units // # Blocks Database = /data/blocks_5.0/blocks.dat // # Cluster Percentage: >= 50 // # Entropy = 0.4808, Expected = -0.3573 // A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * // A 5 -2 -1 -2 -1 -1 -1 0 -2 -1 -2 -1 -1 -3 -1 1 0 -3 -2 0 -2 -1 -1 -5 // R -2 7 -1 -2 -4 1 0 -3 0 -4 -3 3 -2 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -3 -1 0 -1 -5 // N -1 -1 7 2 -2 0 0 0 1 -3 -4 0 -2 -4 -2 1 0 -4 -2 -3 4 0 -1 -5 // D -2 -2 2 8 -4 0 2 -1 -1 -4 -4 -1 -4 -5 -1 0 -1 -5 -3 -4 5 1 -1 -5 // C -1 -4 -2 -4 13 -3 -3 -3 -3 -2 -2 -3 -2 -2 -4 -1 -1 -5 -3 -1 -3 -3 -2 -5 // Q -1 1 0 0 -3 7 2 -2 1 -3 -2 2 0 -4 -1 0 -1 -1 -1 -3 0 4 -1 -5 // E -1 0 0 2 -3 2 6 -3 0 -4 -3 1 -2 -3 -1 -1 -1 -3 -2 -3 1 5 -1 -5 // G 0 -3 0 -1 -3 -2 -3 8 -2 -4 -4 -2 -3 -4 -2 0 -2 -3 -3 -4 -1 -2 -2 -5 // H -2 0 1 -1 -3 1 0 -2 10 -4 -3 0 -1 -1 -2 -1 -2 -3 2 -4 0 0 -1 -5 // I -1 -4 -3 -4 -2 -3 -4 -4 -4 5 2 -3 2 0 -3 -3 -1 -3 -1 4 -4 -3 -1 -5 // L -2 -3 -4 -4 -2 -2 -3 -4 -3 2 5 -3 3 1 -4 -3 -1 -2 -1 1 -4 -3 -1 -5 // K -1 3 0 -1 -3 2 1 -2 0 -3 -3 6 -2 -4 -1 0 -1 -3 -2 -3 0 1 -1 -5 // M -1 -2 -2 -4 -2 0 -2 -3 -1 2 3 -2 7 0 -3 -2 -1 -1 0 1 -3 -1 -1 -5 // F -3 -3 -4 -5 -2 -4 -3 -4 -1 0 1 -4 0 8 -4 -3 -2 1 4 -1 -4 -4 -2 -5 // P -1 -3 -2 -1 -4 -1 -1 -2 -2 -3 -4 -1 -3 -4 10 -1 -1 -4 -3 -3 -2 -1 -2 -5 // S 1 -1 1 0 -1 0 -1 0 -1 -3 -3 0 -2 -3 -1 5 2 -4 -2 -2 0 0 -1 -5 // T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 2 5 -3 -2 0 0 -1 0 -5 // W -3 -3 -4 -5 -5 -1 -3 -3 -3 -3 -2 -3 -1 1 -4 -4 -3 15 2 -3 -5 -2 -3 -5 // Y -2 -1 -2 -3 -3 -1 -2 -3 2 -1 -1 -2 0 4 -3 -2 -2 2 8 -1 -3 -2 -1 -5 // V 0 -3 -3 -4 -1 -3 -3 -4 -4 4 1 -3 1 -1 -3 -2 0 -3 -1 5 -4 -3 -1 -5 // B -2 -1 4 5 -3 0 1 -1 0 -4 -4 0 -3 -4 -2 0 0 -5 -3 -4 5 2 -1 -5 // Z -1 0 0 1 -3 4 5 -2 0 -3 -3 1 -1 -4 -1 0 -1 -2 -2 -3 2 5 -1 -5 // X -1 -1 -1 -1 -2 -1 -1 -2 -1 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 0 -3 -1 -1 -1 -1 -1 -5 // * -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 1 // BLOSUM50 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 5, -2, -1, -2, -1, -3, 0, -2, -1, 0, -1, -2, -1, -1, -1, -1, -2, 1, 0, 0, -3, -1, -2, -1, -5}, {0, -2, 5, -3, 5, 1, -4, -1, 0, -4, 0, 0, -4, -3, 4, -2, 0, -1, 0, 0, -4, -5, -1, -3, 2, -5}, {0, -1, -3, 13, -4, -3, -2, -3, -3, -2, 0, -3, -2, -2, -2, -4, -3, -4, -1, -1, -1, -5, -2, -3, -3, -5}, {0, -2, 5, -4, 8, 2, -5, -1, -1, -4, 0, -1, -4, -4, 2, -1, 0, -2, 0, -1, -4, -5, -1, -3, 1, -5}, {0, -1, 1, -3, 2, 6, -3, -3, 0, -4, 0, 1, -3, -2, 0, -1, 2, 0, -1, -1, -3, -3, -1, -2, 5, -5}, {0, -3, -4, -2, -5, -3, 8, -4, -1, 0, 0, -4, 1, 0, -4, -4, -4, -3, -3, -2, -1, 1, -2, 4, -4, -5}, {0, 0, -1, -3, -1, -3, -4, 8, -2, -4, 0, -2, -4, -3, 0, -2, -2, -3, 0, -2, -4, -3, -2, -3, -2, -5}, {0, -2, 0, -3, -1, 0, -1, -2, 10, -4, 0, 0, -3, -1, 1, -2, 1, 0, -1, -2, -4, -3, -1, 2, 0, -5}, {0, -1, -4, -2, -4, -4, 0, -4, -4, 5, 0, -3, 2, 2, -3, -3, -3, -4, -3, -1, 4, -3, -1, -1, -3, -5}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, -1, 0, -3, -1, 1, -4, -2, 0, -3, 0, 6, -3, -2, 0, -1, 2, 3, 0, -1, -3, -3, -1, -2, 1, -5}, {0, -2, -4, -2, -4, -3, 1, -4, -3, 2, 0, -3, 5, 3, -4, -4, -2, -3, -3, -1, 1, -2, -1, -1, -3, -5}, {0, -1, -3, -2, -4, -2, 0, -3, -1, 2, 0, -2, 3, 7, -2, -3, 0, -2, -2, -1, 1, -1, -1, 0, -1, -5}, {0, -1, 4, -2, 2, 0, -4, 0, 1, -3, 0, 0, -4, -2, 7, -2, 0, -1, 1, 0, -3, -4, -1, -2, 0, -5}, {0, -1, -2, -4, -1, -1, -4, -2, -2, -3, 0, -1, -4, -3, -2, 10, -1, -3, -1, -1, -3, -4, -2, -3, -1, -5}, {0, -1, 0, -3, 0, 2, -4, -2, 1, -3, 0, 2, -2, 0, 0, -1, 7, 1, 0, -1, -3, -1, -1, -1, 4, -5}, {0, -2, -1, -4, -2, 0, -3, -3, 0, -4, 0, 3, -3, -2, -1, -3, 1, 7, -1, -1, -3, -3, -1, -1, 0, -5}, {0, 1, 0, -1, 0, -1, -3, 0, -1, -3, 0, 0, -3, -2, 1, -1, 0, -1, 5, 2, -2, -4, -1, -2, 0, -5}, {0, 0, 0, -1, -1, -1, -2, -2, -2, -1, 0, -1, -1, -1, 0, -1, -1, -1, 2, 5, 0, -3, 0, -2, -1, -5}, {0, 0, -4, -1, -4, -3, -1, -4, -4, 4, 0, -3, 1, 1, -3, -3, -3, -3, -2, 0, 5, -3, -1, -1, -3, -5}, {0, -3, -5, -5, -5, -3, 1, -3, -3, -3, 0, -3, -2, -1, -4, -4, -1, -3, -4, -3, -3, 15, -3, 2, -2, -5}, {0, -1, -1, -2, -1, -1, -2, -2, -1, -1, 0, -1, -1, -1, -1, -2, -1, -1, -1, 0, -1, -3, -1, -1, -1, -5}, {0, -2, -3, -3, -3, -2, 4, -3, 2, -1, 0, -2, -1, 0, -2, -3, -1, -1, -2, -2, -1, 2, -1, 8, -2, -5}, {0, -1, 2, -3, 1, 5, -4, -2, 0, -3, 0, 1, -3, -1, 0, -1, 4, 0, 0, -1, -3, -2, -1, -2, 5, -5}, {0, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, 0, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, 1}, } // # Matrix made by matblas from blosum55.iij // # * column uses minimum score // # BLOSUM Clustered Scoring Matrix in 1/3 Bit Units // # Blocks Database = /data/blocks_5.0/blocks.dat // # Cluster Percentage: >= 55 // # Entropy = 0.5637, Expected = -0.4179 // A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * // A 5 -2 -2 -2 0 -1 -1 0 -2 -2 -2 -1 -1 -3 -1 2 0 -4 -2 0 -2 -1 -1 -5 // R -2 8 -1 -2 -4 1 0 -3 0 -4 -3 3 -2 -3 -3 -1 -1 -3 -2 -3 -1 0 -1 -5 // N -2 -1 8 2 -3 0 0 0 1 -4 -4 0 -3 -4 -2 1 0 -5 -2 -4 4 0 -1 -5 // D -2 -2 2 8 -4 0 2 -2 -1 -4 -5 -1 -4 -5 -2 0 -1 -5 -3 -4 5 1 -2 -5 // C 0 -4 -3 -4 13 -4 -4 -3 -4 -2 -2 -4 -2 -3 -3 -1 -1 -4 -3 -1 -4 -4 -2 -5 // Q -1 1 0 0 -4 7 2 -2 1 -4 -3 2 0 -4 -1 0 -1 -2 -1 -3 0 4 -1 -5 // E -1 0 0 2 -4 2 7 -3 -1 -4 -4 1 -3 -4 -1 0 -1 -3 -2 -3 1 5 -1 -5 // G 0 -3 0 -2 -3 -2 -3 8 -2 -5 -5 -2 -3 -4 -3 0 -2 -3 -4 -4 -1 -3 -2 -5 // H -2 0 1 -1 -4 1 -1 -2 11 -4 -3 0 -2 -1 -3 -1 -2 -3 2 -4 0 0 -1 -5 // I -2 -4 -4 -4 -2 -4 -4 -5 -4 6 2 -4 2 0 -3 -3 -1 -3 -1 4 -4 -4 -1 -5 // L -2 -3 -4 -5 -2 -3 -4 -5 -3 2 6 -3 3 1 -4 -3 -2 -3 -1 1 -4 -3 -1 -5 // K -1 3 0 -1 -4 2 1 -2 0 -4 -3 6 -2 -4 -1 0 -1 -4 -2 -3 0 1 -1 -5 // M -1 -2 -3 -4 -2 0 -3 -3 -2 2 3 -2 8 0 -3 -2 -1 -2 -1 1 -3 -2 -1 -5 // F -3 -3 -4 -5 -3 -4 -4 -4 -1 0 1 -4 0 9 -5 -3 -3 2 4 -1 -5 -4 -2 -5 // P -1 -3 -2 -2 -3 -1 -1 -3 -3 -3 -4 -1 -3 -5 10 -1 -1 -5 -4 -3 -2 -1 -2 -5 // S 2 -1 1 0 -1 0 0 0 -1 -3 -3 0 -2 -3 -1 5 2 -4 -2 -2 0 0 -1 -5 // T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -2 -1 -1 -3 -1 2 6 -3 -2 0 -1 -1 -1 -5 // W -4 -3 -5 -5 -4 -2 -3 -3 -3 -3 -3 -4 -2 2 -5 -4 -3 15 3 -4 -5 -3 -3 -5 // Y -2 -2 -2 -3 -3 -1 -2 -4 2 -1 -1 -2 -1 4 -4 -2 -2 3 9 -2 -3 -2 -1 -5 // V 0 -3 -4 -4 -1 -3 -3 -4 -4 4 1 -3 1 -1 -3 -2 0 -4 -2 5 -4 -3 -1 -5 // B -2 -1 4 5 -4 0 1 -1 0 -4 -4 0 -3 -5 -2 0 -1 -5 -3 -4 5 2 -1 -5 // Z -1 0 0 1 -4 4 5 -3 0 -4 -3 1 -2 -4 -1 0 -1 -3 -2 -3 2 5 -1 -5 // X -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -2 -1 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -3 -1 -1 -1 -1 -1 -5 // * -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 1 // BLOSUM55 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 5, -2, 0, -2, -1, -3, 0, -2, -2, 0, -1, -2, -1, -2, -1, -1, -2, 2, 0, 0, -4, -1, -2, -1, -5}, {0, -2, 5, -4, 5, 1, -5, -1, 0, -4, 0, 0, -4, -3, 4, -2, 0, -1, 0, -1, -4, -5, -1, -3, 2, -5}, {0, 0, -4, 13, -4, -4, -3, -3, -4, -2, 0, -4, -2, -2, -3, -3, -4, -4, -1, -1, -1, -4, -2, -3, -4, -5}, {0, -2, 5, -4, 8, 2, -5, -2, -1, -4, 0, -1, -5, -4, 2, -2, 0, -2, 0, -1, -4, -5, -2, -3, 1, -5}, {0, -1, 1, -4, 2, 7, -4, -3, -1, -4, 0, 1, -4, -3, 0, -1, 2, 0, 0, -1, -3, -3, -1, -2, 5, -5}, {0, -3, -5, -3, -5, -4, 9, -4, -1, 0, 0, -4, 1, 0, -4, -5, -4, -3, -3, -3, -1, 2, -2, 4, -4, -5}, {0, 0, -1, -3, -2, -3, -4, 8, -2, -5, 0, -2, -5, -3, 0, -3, -2, -3, 0, -2, -4, -3, -2, -4, -3, -5}, {0, -2, 0, -4, -1, -1, -1, -2, 11, -4, 0, 0, -3, -2, 1, -3, 1, 0, -1, -2, -4, -3, -1, 2, 0, -5}, {0, -2, -4, -2, -4, -4, 0, -5, -4, 6, 0, -4, 2, 2, -4, -3, -4, -4, -3, -1, 4, -3, -1, -1, -4, -5}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, -1, 0, -4, -1, 1, -4, -2, 0, -4, 0, 6, -3, -2, 0, -1, 2, 3, 0, -1, -3, -4, -1, -2, 1, -5}, {0, -2, -4, -2, -5, -4, 1, -5, -3, 2, 0, -3, 6, 3, -4, -4, -3, -3, -3, -2, 1, -3, -1, -1, -3, -5}, {0, -1, -3, -2, -4, -3, 0, -3, -2, 2, 0, -2, 3, 8, -3, -3, 0, -2, -2, -1, 1, -2, -1, -1, -2, -5}, {0, -2, 4, -3, 2, 0, -4, 0, 1, -4, 0, 0, -4, -3, 8, -2, 0, -1, 1, 0, -4, -5, -1, -2, 0, -5}, {0, -1, -2, -3, -2, -1, -5, -3, -3, -3, 0, -1, -4, -3, -2, 10, -1, -3, -1, -1, -3, -5, -2, -4, -1, -5}, {0, -1, 0, -4, 0, 2, -4, -2, 1, -4, 0, 2, -3, 0, 0, -1, 7, 1, 0, -1, -3, -2, -1, -1, 4, -5}, {0, -2, -1, -4, -2, 0, -3, -3, 0, -4, 0, 3, -3, -2, -1, -3, 1, 8, -1, -1, -3, -3, -1, -2, 0, -5}, {0, 2, 0, -1, 0, 0, -3, 0, -1, -3, 0, 0, -3, -2, 1, -1, 0, -1, 5, 2, -2, -4, -1, -2, 0, -5}, {0, 0, -1, -1, -1, -1, -3, -2, -2, -1, 0, -1, -2, -1, 0, -1, -1, -1, 2, 6, 0, -3, -1, -2, -1, -5}, {0, 0, -4, -1, -4, -3, -1, -4, -4, 4, 0, -3, 1, 1, -4, -3, -3, -3, -2, 0, 5, -4, -1, -2, -3, -5}, {0, -4, -5, -4, -5, -3, 2, -3, -3, -3, 0, -4, -3, -2, -5, -5, -2, -3, -4, -3, -4, 15, -3, 3, -3, -5}, {0, -1, -1, -2, -2, -1, -2, -2, -1, -1, 0, -1, -1, -1, -1, -2, -1, -1, -1, -1, -1, -3, -1, -1, -1, -5}, {0, -2, -3, -3, -3, -2, 4, -4, 2, -1, 0, -2, -1, -1, -2, -4, -1, -2, -2, -2, -2, 3, -1, 9, -2, -5}, {0, -1, 2, -4, 1, 5, -4, -3, 0, -4, 0, 1, -3, -2, 0, -1, 4, 0, 0, -1, -3, -3, -1, -2, 5, -5}, {0, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, 0, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, 1}, } // # Matrix made by matblas from blosum60.iij // # * column uses minimum score // # BLOSUM Clustered Scoring Matrix in 1/2 Bit Units // # Blocks Database = /data/blocks_5.0/blocks.dat // # Cluster Percentage: >= 60 // # Entropy = 0.6603, Expected = -0.4917 // A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * // A 4 -1 -1 -2 0 -1 -1 0 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 1 0 -3 -2 0 -2 -1 0 -4 // R -1 5 0 -1 -3 1 0 -2 0 -3 -2 2 -1 -3 -2 -1 -1 -3 -2 -2 -1 0 -1 -4 // N -1 0 6 1 -2 0 0 0 1 -3 -3 0 -2 -3 -2 1 0 -4 -2 -3 3 0 -1 -4 // D -2 -1 1 6 -3 0 2 -1 -1 -3 -3 -1 -3 -3 -1 0 -1 -4 -3 -3 4 1 -1 -4 // C 0 -3 -2 -3 9 -3 -3 -2 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1 -3 -3 -2 -4 // Q -1 1 0 0 -3 5 2 -2 1 -3 -2 1 0 -3 -1 0 -1 -2 -1 -2 0 3 -1 -4 // E -1 0 0 2 -3 2 5 -2 0 -3 -3 1 -2 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2 1 4 -1 -4 // G 0 -2 0 -1 -2 -2 -2 6 -2 -3 -4 -1 -2 -3 -2 0 -2 -2 -3 -3 -1 -2 -1 -4 // H -2 0 1 -1 -3 1 0 -2 7 -3 -3 -1 -1 -1 -2 -1 -2 -2 2 -3 0 0 -1 -4 // I -1 -3 -3 -3 -1 -3 -3 -3 -3 4 2 -3 1 0 -3 -2 -1 -2 -1 3 -3 -3 -1 -4 // L -1 -2 -3 -3 -1 -2 -3 -4 -3 2 4 -2 2 0 -3 -2 -1 -2 -1 1 -3 -2 -1 -4 // K -1 2 0 -1 -3 1 1 -1 -1 -3 -2 4 -1 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2 0 1 -1 -4 // M -1 -1 -2 -3 -1 0 -2 -2 -1 1 2 -1 5 0 -2 -1 -1 -1 -1 1 -3 -1 -1 -4 // F -2 -3 -3 -3 -2 -3 -3 -3 -1 0 0 -3 0 6 -4 -2 -2 1 3 -1 -3 -3 -1 -4 // P -1 -2 -2 -1 -3 -1 -1 -2 -2 -3 -3 -1 -2 -4 7 -1 -1 -4 -3 -2 -2 -1 -2 -4 // S 1 -1 1 0 -1 0 0 0 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 4 1 -3 -2 -2 0 0 0 -4 // T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 1 4 -2 -2 0 0 -1 0 -4 // W -3 -3 -4 -4 -2 -2 -3 -2 -2 -2 -2 -3 -1 1 -4 -3 -2 10 2 -3 -4 -2 -2 -4 // Y -2 -2 -2 -3 -2 -1 -2 -3 2 -1 -1 -2 -1 3 -3 -2 -2 2 6 -1 -2 -2 -1 -4 // V 0 -2 -3 -3 -1 -2 -2 -3 -3 3 1 -2 1 -1 -2 -2 0 -3 -1 4 -3 -2 -1 -4 // B -2 -1 3 4 -3 0 1 -1 0 -3 -3 0 -3 -3 -2 0 0 -4 -2 -3 4 1 -1 -4 // Z -1 0 0 1 -3 3 4 -2 0 -3 -2 1 -1 -3 -1 0 -1 -2 -2 -2 1 3 -1 -4 // X 0 -1 -1 -1 -2 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -2 0 0 -2 -1 -1 -1 -1 -1 -4 // * -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 1 // BLOSUM60 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 4, -2, 0, -2, -1, -2, 0, -2, -1, 0, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, 1, 0, 0, -3, 0, -2, -1, -4}, {0, -2, 4, -3, 4, 1, -3, -1, 0, -3, 0, 0, -3, -3, 3, -2, 0, -1, 0, 0, -3, -4, -1, -2, 1, -4}, {0, 0, -3, 9, -3, -3, -2, -2, -3, -1, 0, -3, -1, -1, -2, -3, -3, -3, -1, -1, -1, -2, -2, -2, -3, -4}, {0, -2, 4, -3, 6, 2, -3, -1, -1, -3, 0, -1, -3, -3, 1, -1, 0, -1, 0, -1, -3, -4, -1, -3, 1, -4}, {0, -1, 1, -3, 2, 5, -3, -2, 0, -3, 0, 1, -3, -2, 0, -1, 2, 0, 0, -1, -2, -3, -1, -2, 4, -4}, {0, -2, -3, -2, -3, -3, 6, -3, -1, 0, 0, -3, 0, 0, -3, -4, -3, -3, -2, -2, -1, 1, -1, 3, -3, -4}, {0, 0, -1, -2, -1, -2, -3, 6, -2, -3, 0, -1, -4, -2, 0, -2, -2, -2, 0, -2, -3, -2, -1, -3, -2, -4}, {0, -2, 0, -3, -1, 0, -1, -2, 7, -3, 0, -1, -3, -1, 1, -2, 1, 0, -1, -2, -3, -2, -1, 2, 0, -4}, {0, -1, -3, -1, -3, -3, 0, -3, -3, 4, 0, -3, 2, 1, -3, -3, -3, -3, -2, -1, 3, -2, -1, -1, -3, -4}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, -1, 0, -3, -1, 1, -3, -1, -1, -3, 0, 4, -2, -1, 0, -1, 1, 2, 0, -1, -2, -3, -1, -2, 1, -4}, {0, -1, -3, -1, -3, -3, 0, -4, -3, 2, 0, -2, 4, 2, -3, -3, -2, -2, -2, -1, 1, -2, -1, -1, -2, -4}, {0, -1, -3, -1, -3, -2, 0, -2, -1, 1, 0, -1, 2, 5, -2, -2, 0, -1, -1, -1, 1, -1, -1, -1, -1, -4}, {0, -1, 3, -2, 1, 0, -3, 0, 1, -3, 0, 0, -3, -2, 6, -2, 0, 0, 1, 0, -3, -4, -1, -2, 0, -4}, {0, -1, -2, -3, -1, -1, -4, -2, -2, -3, 0, -1, -3, -2, -2, 7, -1, -2, -1, -1, -2, -4, -2, -3, -1, -4}, {0, -1, 0, -3, 0, 2, -3, -2, 1, -3, 0, 1, -2, 0, 0, -1, 5, 1, 0, -1, -2, -2, -1, -1, 3, -4}, {0, -1, -1, -3, -1, 0, -3, -2, 0, -3, 0, 2, -2, -1, 0, -2, 1, 5, -1, -1, -2, -3, -1, -2, 0, -4}, {0, 1, 0, -1, 0, 0, -2, 0, -1, -2, 0, 0, -2, -1, 1, -1, 0, -1, 4, 1, -2, -3, 0, -2, 0, -4}, {0, 0, 0, -1, -1, -1, -2, -2, -2, -1, 0, -1, -1, -1, 0, -1, -1, -1, 1, 4, 0, -2, 0, -2, -1, -4}, {0, 0, -3, -1, -3, -2, -1, -3, -3, 3, 0, -2, 1, 1, -3, -2, -2, -2, -2, 0, 4, -3, -1, -1, -2, -4}, {0, -3, -4, -2, -4, -3, 1, -2, -2, -2, 0, -3, -2, -1, -4, -4, -2, -3, -3, -2, -3, 10, -2, 2, -2, -4}, {0, 0, -1, -2, -1, -1, -1, -1, -1, -1, 0, -1, -1, -1, -1, -2, -1, -1, 0, 0, -1, -2, -1, -1, -1, -4}, {0, -2, -2, -2, -3, -2, 3, -3, 2, -1, 0, -2, -1, -1, -2, -3, -1, -2, -2, -2, -1, 2, -1, 6, -2, -4}, {0, -1, 1, -3, 1, 4, -3, -2, 0, -3, 0, 1, -2, -1, 0, -1, 3, 0, 0, -1, -2, -2, -1, -2, 3, -4}, {0, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, 0, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, 1}, } // # Matrix made by matblas from blosum62.iij // # * column uses minimum score // # BLOSUM Clustered Scoring Matrix in 1/2 Bit Units // # Blocks Database = /data/blocks_5.0/blocks.dat // # Cluster Percentage: >= 62 // # Entropy = 0.6979, Expected = -0.5209 // A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * // A 4 -1 -2 -2 0 -1 -1 0 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 1 0 -3 -2 0 -2 -1 0 -4 // R -1 5 0 -2 -3 1 0 -2 0 -3 -2 2 -1 -3 -2 -1 -1 -3 -2 -3 -1 0 -1 -4 // N -2 0 6 1 -3 0 0 0 1 -3 -3 0 -2 -3 -2 1 0 -4 -2 -3 3 0 -1 -4 // D -2 -2 1 6 -3 0 2 -1 -1 -3 -4 -1 -3 -3 -1 0 -1 -4 -3 -3 4 1 -1 -4 // C 0 -3 -3 -3 9 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1 -3 -3 -2 -4 // Q -1 1 0 0 -3 5 2 -2 0 -3 -2 1 0 -3 -1 0 -1 -2 -1 -2 0 3 -1 -4 // E -1 0 0 2 -4 2 5 -2 0 -3 -3 1 -2 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2 1 4 -1 -4 // G 0 -2 0 -1 -3 -2 -2 6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2 0 -2 -2 -3 -3 -1 -2 -1 -4 // H -2 0 1 -1 -3 0 0 -2 8 -3 -3 -1 -2 -1 -2 -1 -2 -2 2 -3 0 0 -1 -4 // I -1 -3 -3 -3 -1 -3 -3 -4 -3 4 2 -3 1 0 -3 -2 -1 -3 -1 3 -3 -3 -1 -4 // L -1 -2 -3 -4 -1 -2 -3 -4 -3 2 4 -2 2 0 -3 -2 -1 -2 -1 1 -4 -3 -1 -4 // K -1 2 0 -1 -3 1 1 -2 -1 -3 -2 5 -1 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2 0 1 -1 -4 // M -1 -1 -2 -3 -1 0 -2 -3 -2 1 2 -1 5 0 -2 -1 -1 -1 -1 1 -3 -1 -1 -4 // F -2 -3 -3 -3 -2 -3 -3 -3 -1 0 0 -3 0 6 -4 -2 -2 1 3 -1 -3 -3 -1 -4 // P -1 -2 -2 -1 -3 -1 -1 -2 -2 -3 -3 -1 -2 -4 7 -1 -1 -4 -3 -2 -2 -1 -2 -4 // S 1 -1 1 0 -1 0 0 0 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 4 1 -3 -2 -2 0 0 0 -4 // T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 1 5 -2 -2 0 -1 -1 0 -4 // W -3 -3 -4 -4 -2 -2 -3 -2 -2 -3 -2 -3 -1 1 -4 -3 -2 11 2 -3 -4 -3 -2 -4 // Y -2 -2 -2 -3 -2 -1 -2 -3 2 -1 -1 -2 -1 3 -3 -2 -2 2 7 -1 -3 -2 -1 -4 // V 0 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -3 -3 3 1 -2 1 -1 -2 -2 0 -3 -1 4 -3 -2 -1 -4 // B -2 -1 3 4 -3 0 1 -1 0 -3 -4 0 -3 -3 -2 0 -1 -4 -3 -3 4 1 -1 -4 // Z -1 0 0 1 -3 3 4 -2 0 -3 -3 1 -1 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2 1 4 -1 -4 // X 0 -1 -1 -1 -2 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -2 0 0 -2 -1 -1 -1 -1 -1 -4 // * -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 1 // BLOSUM62 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 4, -2, 0, -2, -1, -2, 0, -2, -1, 0, -1, -1, -1, -2, -1, -1, -1, 1, 0, 0, -3, 0, -2, -1, -4}, {0, -2, 4, -3, 4, 1, -3, -1, 0, -3, 0, 0, -4, -3, 3, -2, 0, -1, 0, -1, -3, -4, -1, -3, 1, -4}, {0, 0, -3, 9, -3, -4, -2, -3, -3, -1, 0, -3, -1, -1, -3, -3, -3, -3, -1, -1, -1, -2, -2, -2, -3, -4}, {0, -2, 4, -3, 6, 2, -3, -1, -1, -3, 0, -1, -4, -3, 1, -1, 0, -2, 0, -1, -3, -4, -1, -3, 1, -4}, {0, -1, 1, -4, 2, 5, -3, -2, 0, -3, 0, 1, -3, -2, 0, -1, 2, 0, 0, -1, -2, -3, -1, -2, 4, -4}, {0, -2, -3, -2, -3, -3, 6, -3, -1, 0, 0, -3, 0, 0, -3, -4, -3, -3, -2, -2, -1, 1, -1, 3, -3, -4}, {0, 0, -1, -3, -1, -2, -3, 6, -2, -4, 0, -2, -4, -3, 0, -2, -2, -2, 0, -2, -3, -2, -1, -3, -2, -4}, {0, -2, 0, -3, -1, 0, -1, -2, 8, -3, 0, -1, -3, -2, 1, -2, 0, 0, -1, -2, -3, -2, -1, 2, 0, -4}, {0, -1, -3, -1, -3, -3, 0, -4, -3, 4, 0, -3, 2, 1, -3, -3, -3, -3, -2, -1, 3, -3, -1, -1, -3, -4}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, -1, 0, -3, -1, 1, -3, -2, -1, -3, 0, 5, -2, -1, 0, -1, 1, 2, 0, -1, -2, -3, -1, -2, 1, -4}, {0, -1, -4, -1, -4, -3, 0, -4, -3, 2, 0, -2, 4, 2, -3, -3, -2, -2, -2, -1, 1, -2, -1, -1, -3, -4}, {0, -1, -3, -1, -3, -2, 0, -3, -2, 1, 0, -1, 2, 5, -2, -2, 0, -1, -1, -1, 1, -1, -1, -1, -1, -4}, {0, -2, 3, -3, 1, 0, -3, 0, 1, -3, 0, 0, -3, -2, 6, -2, 0, 0, 1, 0, -3, -4, -1, -2, 0, -4}, {0, -1, -2, -3, -1, -1, -4, -2, -2, -3, 0, -1, -3, -2, -2, 7, -1, -2, -1, -1, -2, -4, -2, -3, -1, -4}, {0, -1, 0, -3, 0, 2, -3, -2, 0, -3, 0, 1, -2, 0, 0, -1, 5, 1, 0, -1, -2, -2, -1, -1, 3, -4}, {0, -1, -1, -3, -2, 0, -3, -2, 0, -3, 0, 2, -2, -1, 0, -2, 1, 5, -1, -1, -3, -3, -1, -2, 0, -4}, {0, 1, 0, -1, 0, 0, -2, 0, -1, -2, 0, 0, -2, -1, 1, -1, 0, -1, 4, 1, -2, -3, 0, -2, 0, -4}, {0, 0, -1, -1, -1, -1, -2, -2, -2, -1, 0, -1, -1, -1, 0, -1, -1, -1, 1, 5, 0, -2, 0, -2, -1, -4}, {0, 0, -3, -1, -3, -2, -1, -3, -3, 3, 0, -2, 1, 1, -3, -2, -2, -3, -2, 0, 4, -3, -1, -1, -2, -4}, {0, -3, -4, -2, -4, -3, 1, -2, -2, -3, 0, -3, -2, -1, -4, -4, -2, -3, -3, -2, -3, 11, -2, 2, -3, -4}, {0, 0, -1, -2, -1, -1, -1, -1, -1, -1, 0, -1, -1, -1, -1, -2, -1, -1, 0, 0, -1, -2, -1, -1, -1, -4}, {0, -2, -3, -2, -3, -2, 3, -3, 2, -1, 0, -2, -1, -1, -2, -3, -1, -2, -2, -2, -1, 2, -1, 7, -2, -4}, {0, -1, 1, -3, 1, 4, -3, -2, 0, -3, 0, 1, -3, -1, 0, -1, 3, 0, 0, -1, -2, -3, -1, -2, 4, -4}, {0, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, 0, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, 1}, } // # Matrix made by matblas from blosum65.iij // # * column uses minimum score // # BLOSUM Clustered Scoring Matrix in 1/2 Bit Units // # Blocks Database = /data/blocks_5.0/blocks.dat // # Cluster Percentage: >= 65 // # Entropy = 0.7576, Expected = -0.5675 // A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * // A 4 -1 -2 -2 0 -1 -1 0 -2 -1 -2 -1 -1 -2 -1 1 0 -3 -2 0 -2 -1 -1 -5 // R -1 6 0 -2 -4 1 0 -2 0 -3 -2 2 -2 -3 -2 -1 -1 -3 -2 -3 -1 0 -1 -5 // N -2 0 6 1 -3 0 0 -1 1 -3 -4 0 -2 -3 -2 1 0 -4 -2 -3 3 0 -1 -5 // D -2 -2 1 6 -4 0 2 -1 -1 -3 -4 -1 -3 -4 -2 0 -1 -5 -3 -3 4 1 -1 -5 // C 0 -4 -3 -4 9 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -2 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1 -3 -4 -2 -5 // Q -1 1 0 0 -3 6 2 -2 1 -3 -2 1 0 -3 -1 0 -1 -2 -2 -2 0 3 -1 -5 // E -1 0 0 2 -4 2 5 -2 0 -3 -3 1 -2 -3 -1 0 -1 -3 -2 -3 1 4 -1 -5 // G 0 -2 -1 -1 -3 -2 -2 6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2 0 -2 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -5 // H -2 0 1 -1 -3 1 0 -2 8 -3 -3 -1 -2 -1 -2 -1 -2 -2 2 -3 0 0 -1 -5 // I -1 -3 -3 -3 -1 -3 -3 -4 -3 4 2 -3 1 0 -3 -2 -1 -2 -1 3 -3 -3 -1 -5 // L -2 -2 -4 -4 -1 -2 -3 -4 -3 2 4 -3 2 0 -3 -3 -1 -2 -1 1 -4 -3 -1 -5 // K -1 2 0 -1 -3 1 1 -2 -1 -3 -3 5 -2 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2 0 1 -1 -5 // M -1 -2 -2 -3 -2 0 -2 -3 -2 1 2 -2 6 0 -3 -2 -1 -2 -1 1 -3 -2 -1 -5 // F -2 -3 -3 -4 -2 -3 -3 -3 -1 0 0 -3 0 6 -4 -2 -2 1 3 -1 -3 -3 -2 -5 // P -1 -2 -2 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -3 -3 -1 -3 -4 8 -1 -1 -4 -3 -2 -2 -1 -2 -5 // S 1 -1 1 0 -1 0 0 0 -1 -2 -3 0 -2 -2 -1 4 1 -3 -2 -2 0 0 -1 -5 // T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 1 5 -3 -2 0 -1 -1 -1 -5 // W -3 -3 -4 -5 -2 -2 -3 -3 -2 -2 -2 -3 -2 1 -4 -3 -3 10 2 -3 -4 -3 -2 -5 // Y -2 -2 -2 -3 -2 -2 -2 -3 2 -1 -1 -2 -1 3 -3 -2 -2 2 7 -1 -3 -2 -1 -5 // V 0 -3 -3 -3 -1 -2 -3 -3 -3 3 1 -2 1 -1 -2 -2 0 -3 -1 4 -3 -2 -1 -5 // B -2 -1 3 4 -3 0 1 -1 0 -3 -4 0 -3 -3 -2 0 -1 -4 -3 -3 4 1 -1 -5 // Z -1 0 0 1 -4 3 4 -2 0 -3 -3 1 -2 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2 1 4 -1 -5 // X -1 -1 -1 -1 -2 -1 -1 -2 -1 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -2 -1 -1 -1 -1 -1 -5 // * -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 1 // BLOSUM65 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 4, -2, 0, -2, -1, -2, 0, -2, -1, 0, -1, -2, -1, -2, -1, -1, -1, 1, 0, 0, -3, -1, -2, -1, -5}, {0, -2, 4, -3, 4, 1, -3, -1, 0, -3, 0, 0, -4, -3, 3, -2, 0, -1, 0, -1, -3, -4, -1, -3, 1, -5}, {0, 0, -3, 9, -4, -4, -2, -3, -3, -1, 0, -3, -1, -2, -3, -3, -3, -4, -1, -1, -1, -2, -2, -2, -4, -5}, {0, -2, 4, -4, 6, 2, -4, -1, -1, -3, 0, -1, -4, -3, 1, -2, 0, -2, 0, -1, -3, -5, -1, -3, 1, -5}, {0, -1, 1, -4, 2, 5, -3, -2, 0, -3, 0, 1, -3, -2, 0, -1, 2, 0, 0, -1, -3, -3, -1, -2, 4, -5}, {0, -2, -3, -2, -4, -3, 6, -3, -1, 0, 0, -3, 0, 0, -3, -4, -3, -3, -2, -2, -1, 1, -2, 3, -3, -5}, {0, 0, -1, -3, -1, -2, -3, 6, -2, -4, 0, -2, -4, -3, -1, -2, -2, -2, 0, -2, -3, -3, -2, -3, -2, -5}, {0, -2, 0, -3, -1, 0, -1, -2, 8, -3, 0, -1, -3, -2, 1, -2, 1, 0, -1, -2, -3, -2, -1, 2, 0, -5}, {0, -1, -3, -1, -3, -3, 0, -4, -3, 4, 0, -3, 2, 1, -3, -3, -3, -3, -2, -1, 3, -2, -1, -1, -3, -5}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, -1, 0, -3, -1, 1, -3, -2, -1, -3, 0, 5, -3, -2, 0, -1, 1, 2, 0, -1, -2, -3, -1, -2, 1, -5}, {0, -2, -4, -1, -4, -3, 0, -4, -3, 2, 0, -3, 4, 2, -4, -3, -2, -2, -3, -1, 1, -2, -1, -1, -3, -5}, {0, -1, -3, -2, -3, -2, 0, -3, -2, 1, 0, -2, 2, 6, -2, -3, 0, -2, -2, -1, 1, -2, -1, -1, -2, -5}, {0, -2, 3, -3, 1, 0, -3, -1, 1, -3, 0, 0, -4, -2, 6, -2, 0, 0, 1, 0, -3, -4, -1, -2, 0, -5}, {0, -1, -2, -3, -2, -1, -4, -2, -2, -3, 0, -1, -3, -3, -2, 8, -1, -2, -1, -1, -2, -4, -2, -3, -1, -5}, {0, -1, 0, -3, 0, 2, -3, -2, 1, -3, 0, 1, -2, 0, 0, -1, 6, 1, 0, -1, -2, -2, -1, -2, 3, -5}, {0, -1, -1, -4, -2, 0, -3, -2, 0, -3, 0, 2, -2, -2, 0, -2, 1, 6, -1, -1, -3, -3, -1, -2, 0, -5}, {0, 1, 0, -1, 0, 0, -2, 0, -1, -2, 0, 0, -3, -2, 1, -1, 0, -1, 4, 1, -2, -3, -1, -2, 0, -5}, {0, 0, -1, -1, -1, -1, -2, -2, -2, -1, 0, -1, -1, -1, 0, -1, -1, -1, 1, 5, 0, -3, -1, -2, -1, -5}, {0, 0, -3, -1, -3, -3, -1, -3, -3, 3, 0, -2, 1, 1, -3, -2, -2, -3, -2, 0, 4, -3, -1, -1, -2, -5}, {0, -3, -4, -2, -5, -3, 1, -3, -2, -2, 0, -3, -2, -2, -4, -4, -2, -3, -3, -3, -3, 10, -2, 2, -3, -5}, {0, -1, -1, -2, -1, -1, -2, -2, -1, -1, 0, -1, -1, -1, -1, -2, -1, -1, -1, -1, -1, -2, -1, -1, -1, -5}, {0, -2, -3, -2, -3, -2, 3, -3, 2, -1, 0, -2, -1, -1, -2, -3, -2, -2, -2, -2, -1, 2, -1, 7, -2, -5}, {0, -1, 1, -4, 1, 4, -3, -2, 0, -3, 0, 1, -3, -2, 0, -1, 3, 0, 0, -1, -2, -3, -1, -2, 4, -5}, {0, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, 0, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, 1}, } // # Matrix made by matblas from blosum70.iij // # * column uses minimum score // # BLOSUM Clustered Scoring Matrix in 1/2 Bit Units // # Blocks Database = /data/blocks_5.0/blocks.dat // # Cluster Percentage: >= 70 // # Entropy = 0.8391, Expected = -0.6313 // A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * // A 4 -2 -2 -2 -1 -1 -1 0 -2 -2 -2 -1 -1 -2 -1 1 0 -3 -2 0 -2 -1 -1 -5 // R -2 6 -1 -2 -4 1 0 -3 0 -3 -3 2 -2 -3 -2 -1 -1 -3 -2 -3 -1 0 -1 -5 // N -2 -1 6 1 -3 0 0 -1 0 -4 -4 0 -2 -3 -2 0 0 -4 -2 -3 3 0 -1 -5 // D -2 -2 1 6 -4 -1 1 -2 -1 -4 -4 -1 -3 -4 -2 0 -1 -5 -4 -4 4 1 -2 -5 // C -1 -4 -3 -4 9 -3 -4 -3 -4 -1 -2 -4 -2 -2 -3 -1 -1 -3 -3 -1 -4 -4 -2 -5 // Q -1 1 0 -1 -3 6 2 -2 1 -3 -2 1 0 -3 -2 0 -1 -2 -2 -2 0 3 -1 -5 // E -1 0 0 1 -4 2 5 -2 0 -4 -3 1 -2 -4 -1 0 -1 -4 -3 -3 1 4 -1 -5 // G 0 -3 -1 -2 -3 -2 -2 6 -2 -4 -4 -2 -3 -4 -3 -1 -2 -3 -4 -4 -1 -2 -2 -5 // H -2 0 0 -1 -4 1 0 -2 8 -4 -3 -1 -2 -1 -2 -1 -2 -2 2 -3 -1 0 -1 -5 // I -2 -3 -4 -4 -1 -3 -4 -4 -4 4 2 -3 1 0 -3 -3 -1 -3 -1 3 -4 -3 -1 -5 // L -2 -3 -4 -4 -2 -2 -3 -4 -3 2 4 -3 2 0 -3 -3 -2 -2 -1 1 -4 -3 -1 -5 // K -1 2 0 -1 -4 1 1 -2 -1 -3 -3 5 -2 -3 -1 0 -1 -3 -2 -3 -1 1 -1 -5 // M -1 -2 -2 -3 -2 0 -2 -3 -2 1 2 -2 6 0 -3 -2 -1 -2 -1 1 -3 -2 -1 -5 // F -2 -3 -3 -4 -2 -3 -4 -4 -1 0 0 -3 0 6 -4 -3 -2 1 3 -1 -4 -4 -2 -5 // P -1 -2 -2 -2 -3 -2 -1 -3 -2 -3 -3 -1 -3 -4 8 -1 -1 -4 -3 -3 -2 -1 -2 -5 // S 1 -1 0 0 -1 0 0 -1 -1 -3 -3 0 -2 -3 -1 4 1 -3 -2 -2 0 0 -1 -5 // T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -2 -1 -1 -2 -1 1 5 -3 -2 0 -1 -1 -1 -5 // W -3 -3 -4 -5 -3 -2 -4 -3 -2 -3 -2 -3 -2 1 -4 -3 -3 11 2 -3 -4 -3 -3 -5 // Y -2 -2 -2 -4 -3 -2 -3 -4 2 -1 -1 -2 -1 3 -3 -2 -2 2 7 -2 -3 -2 -2 -5 // V 0 -3 -3 -4 -1 -2 -3 -4 -3 3 1 -3 1 -1 -3 -2 0 -3 -2 4 -3 -3 -1 -5 // B -2 -1 3 4 -4 0 1 -1 -1 -4 -4 -1 -3 -4 -2 0 -1 -4 -3 -3 4 0 -1 -5 // Z -1 0 0 1 -4 3 4 -2 0 -3 -3 1 -2 -4 -1 0 -1 -3 -2 -3 0 4 -1 -5 // X -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -2 -1 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -3 -2 -1 -1 -1 -1 -5 // * -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 1 // BLOSUM70 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 4, -2, -1, -2, -1, -2, 0, -2, -2, 0, -1, -2, -1, -2, -1, -1, -2, 1, 0, 0, -3, -1, -2, -1, -5}, {0, -2, 4, -4, 4, 1, -4, -1, -1, -4, 0, -1, -4, -3, 3, -2, 0, -1, 0, -1, -3, -4, -1, -3, 0, -5}, {0, -1, -4, 9, -4, -4, -2, -3, -4, -1, 0, -4, -2, -2, -3, -3, -3, -4, -1, -1, -1, -3, -2, -3, -4, -5}, {0, -2, 4, -4, 6, 1, -4, -2, -1, -4, 0, -1, -4, -3, 1, -2, -1, -2, 0, -1, -4, -5, -2, -4, 1, -5}, {0, -1, 1, -4, 1, 5, -4, -2, 0, -4, 0, 1, -3, -2, 0, -1, 2, 0, 0, -1, -3, -4, -1, -3, 4, -5}, {0, -2, -4, -2, -4, -4, 6, -4, -1, 0, 0, -3, 0, 0, -3, -4, -3, -3, -3, -2, -1, 1, -2, 3, -4, -5}, {0, 0, -1, -3, -2, -2, -4, 6, -2, -4, 0, -2, -4, -3, -1, -3, -2, -3, -1, -2, -4, -3, -2, -4, -2, -5}, {0, -2, -1, -4, -1, 0, -1, -2, 8, -4, 0, -1, -3, -2, 0, -2, 1, 0, -1, -2, -3, -2, -1, 2, 0, -5}, {0, -2, -4, -1, -4, -4, 0, -4, -4, 4, 0, -3, 2, 1, -4, -3, -3, -3, -3, -1, 3, -3, -1, -1, -3, -5}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, -1, -1, -4, -1, 1, -3, -2, -1, -3, 0, 5, -3, -2, 0, -1, 1, 2, 0, -1, -3, -3, -1, -2, 1, -5}, {0, -2, -4, -2, -4, -3, 0, -4, -3, 2, 0, -3, 4, 2, -4, -3, -2, -3, -3, -2, 1, -2, -1, -1, -3, -5}, {0, -1, -3, -2, -3, -2, 0, -3, -2, 1, 0, -2, 2, 6, -2, -3, 0, -2, -2, -1, 1, -2, -1, -1, -2, -5}, {0, -2, 3, -3, 1, 0, -3, -1, 0, -4, 0, 0, -4, -2, 6, -2, 0, -1, 0, 0, -3, -4, -1, -2, 0, -5}, {0, -1, -2, -3, -2, -1, -4, -3, -2, -3, 0, -1, -3, -3, -2, 8, -2, -2, -1, -1, -3, -4, -2, -3, -1, -5}, {0, -1, 0, -3, -1, 2, -3, -2, 1, -3, 0, 1, -2, 0, 0, -2, 6, 1, 0, -1, -2, -2, -1, -2, 3, -5}, {0, -2, -1, -4, -2, 0, -3, -3, 0, -3, 0, 2, -3, -2, -1, -2, 1, 6, -1, -1, -3, -3, -1, -2, 0, -5}, {0, 1, 0, -1, 0, 0, -3, -1, -1, -3, 0, 0, -3, -2, 0, -1, 0, -1, 4, 1, -2, -3, -1, -2, 0, -5}, {0, 0, -1, -1, -1, -1, -2, -2, -2, -1, 0, -1, -2, -1, 0, -1, -1, -1, 1, 5, 0, -3, -1, -2, -1, -5}, {0, 0, -3, -1, -4, -3, -1, -4, -3, 3, 0, -3, 1, 1, -3, -3, -2, -3, -2, 0, 4, -3, -1, -2, -3, -5}, {0, -3, -4, -3, -5, -4, 1, -3, -2, -3, 0, -3, -2, -2, -4, -4, -2, -3, -3, -3, -3, 11, -3, 2, -3, -5}, {0, -1, -1, -2, -2, -1, -2, -2, -1, -1, 0, -1, -1, -1, -1, -2, -1, -1, -1, -1, -1, -3, -1, -2, -1, -5}, {0, -2, -3, -3, -4, -3, 3, -4, 2, -1, 0, -2, -1, -1, -2, -3, -2, -2, -2, -2, -2, 2, -2, 7, -2, -5}, {0, -1, 0, -4, 1, 4, -4, -2, 0, -3, 0, 1, -3, -2, 0, -1, 3, 0, 0, -1, -3, -3, -1, -2, 4, -5}, {0, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, 0, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, 1}, } // # Matrix made by matblas from blosum75.iij // # * column uses minimum score // # BLOSUM Clustered Scoring Matrix in 1/2 Bit Units // # Blocks Database = /data/blocks_5.0/blocks.dat // # Cluster Percentage: >= 75 // # Entropy = 0.9077, Expected = -0.6845 // A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * // A 4 -2 -2 -2 -1 -1 -1 0 -2 -2 -2 -1 -1 -3 -1 1 0 -3 -2 0 -2 -1 -1 -5 // R -2 6 -1 -2 -4 1 0 -3 0 -3 -3 2 -2 -3 -2 -1 -1 -3 -2 -3 -1 0 -1 -5 // N -2 -1 6 1 -3 0 -1 -1 0 -4 -4 0 -3 -4 -3 0 0 -4 -3 -3 3 0 -1 -5 // D -2 -2 1 6 -4 -1 1 -2 -1 -4 -4 -1 -4 -4 -2 -1 -1 -5 -4 -4 4 1 -2 -5 // C -1 -4 -3 -4 9 -3 -5 -3 -4 -1 -2 -4 -2 -2 -4 -1 -1 -3 -3 -1 -4 -4 -2 -5 // Q -1 1 0 -1 -3 6 2 -2 1 -3 -3 1 0 -4 -2 0 -1 -2 -2 -2 0 3 -1 -5 // E -1 0 -1 1 -5 2 5 -3 0 -4 -4 1 -2 -4 -1 0 -1 -4 -3 -3 1 4 -1 -5 // G 0 -3 -1 -2 -3 -2 -3 6 -2 -5 -4 -2 -3 -4 -3 -1 -2 -3 -4 -4 -1 -2 -2 -5 // H -2 0 0 -1 -4 1 0 -2 8 -4 -3 -1 -2 -2 -2 -1 -2 -2 2 -4 -1 0 -1 -5 // I -2 -3 -4 -4 -1 -3 -4 -5 -4 4 1 -3 1 0 -3 -3 -1 -3 -2 3 -4 -4 -2 -5 // L -2 -3 -4 -4 -2 -3 -4 -4 -3 1 4 -3 2 0 -3 -3 -2 -2 -1 1 -4 -3 -1 -5 // K -1 2 0 -1 -4 1 1 -2 -1 -3 -3 5 -2 -4 -1 0 -1 -4 -2 -3 -1 1 -1 -5 // M -1 -2 -3 -4 -2 0 -2 -3 -2 1 2 -2 6 0 -3 -2 -1 -2 -2 1 -3 -2 -1 -5 // F -3 -3 -4 -4 -2 -4 -4 -4 -2 0 0 -4 0 6 -4 -3 -2 1 3 -1 -4 -4 -2 -5 // P -1 -2 -3 -2 -4 -2 -1 -3 -2 -3 -3 -1 -3 -4 8 -1 -1 -5 -4 -3 -2 -2 -2 -5 // S 1 -1 0 -1 -1 0 0 -1 -1 -3 -3 0 -2 -3 -1 5 1 -3 -2 -2 0 0 -1 -5 // T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -2 -1 -1 -2 -1 1 5 -3 -2 0 -1 -1 -1 -5 // W -3 -3 -4 -5 -3 -2 -4 -3 -2 -3 -2 -4 -2 1 -5 -3 -3 11 2 -3 -5 -3 -3 -5 // Y -2 -2 -3 -4 -3 -2 -3 -4 2 -2 -1 -2 -2 3 -4 -2 -2 2 7 -2 -3 -3 -2 -5 // V 0 -3 -3 -4 -1 -2 -3 -4 -4 3 1 -3 1 -1 -3 -2 0 -3 -2 4 -4 -3 -1 -5 // B -2 -1 3 4 -4 0 1 -1 -1 -4 -4 -1 -3 -4 -2 0 -1 -5 -3 -4 4 0 -2 -5 // Z -1 0 0 1 -4 3 4 -2 0 -4 -3 1 -2 -4 -2 0 -1 -3 -3 -3 0 4 -1 -5 // X -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -2 -1 -2 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -3 -2 -1 -2 -1 -1 -5 // * -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 1 // BLOSUM75 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 4, -2, -1, -2, -1, -3, 0, -2, -2, 0, -1, -2, -1, -2, -1, -1, -2, 1, 0, 0, -3, -1, -2, -1, -5}, {0, -2, 4, -4, 4, 1, -4, -1, -1, -4, 0, -1, -4, -3, 3, -2, 0, -1, 0, -1, -4, -5, -2, -3, 0, -5}, {0, -1, -4, 9, -4, -5, -2, -3, -4, -1, 0, -4, -2, -2, -3, -4, -3, -4, -1, -1, -1, -3, -2, -3, -4, -5}, {0, -2, 4, -4, 6, 1, -4, -2, -1, -4, 0, -1, -4, -4, 1, -2, -1, -2, -1, -1, -4, -5, -2, -4, 1, -5}, {0, -1, 1, -5, 1, 5, -4, -3, 0, -4, 0, 1, -4, -2, -1, -1, 2, 0, 0, -1, -3, -4, -1, -3, 4, -5}, {0, -3, -4, -2, -4, -4, 6, -4, -2, 0, 0, -4, 0, 0, -4, -4, -4, -3, -3, -2, -1, 1, -2, 3, -4, -5}, {0, 0, -1, -3, -2, -3, -4, 6, -2, -5, 0, -2, -4, -3, -1, -3, -2, -3, -1, -2, -4, -3, -2, -4, -2, -5}, {0, -2, -1, -4, -1, 0, -2, -2, 8, -4, 0, -1, -3, -2, 0, -2, 1, 0, -1, -2, -4, -2, -1, 2, 0, -5}, {0, -2, -4, -1, -4, -4, 0, -5, -4, 4, 0, -3, 1, 1, -4, -3, -3, -3, -3, -1, 3, -3, -2, -2, -4, -5}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, -1, -1, -4, -1, 1, -4, -2, -1, -3, 0, 5, -3, -2, 0, -1, 1, 2, 0, -1, -3, -4, -1, -2, 1, -5}, {0, -2, -4, -2, -4, -4, 0, -4, -3, 1, 0, -3, 4, 2, -4, -3, -3, -3, -3, -2, 1, -2, -1, -1, -3, -5}, {0, -1, -3, -2, -4, -2, 0, -3, -2, 1, 0, -2, 2, 6, -3, -3, 0, -2, -2, -1, 1, -2, -1, -2, -2, -5}, {0, -2, 3, -3, 1, -1, -4, -1, 0, -4, 0, 0, -4, -3, 6, -3, 0, -1, 0, 0, -3, -4, -1, -3, 0, -5}, {0, -1, -2, -4, -2, -1, -4, -3, -2, -3, 0, -1, -3, -3, -3, 8, -2, -2, -1, -1, -3, -5, -2, -4, -2, -5}, {0, -1, 0, -3, -1, 2, -4, -2, 1, -3, 0, 1, -3, 0, 0, -2, 6, 1, 0, -1, -2, -2, -1, -2, 3, -5}, {0, -2, -1, -4, -2, 0, -3, -3, 0, -3, 0, 2, -3, -2, -1, -2, 1, 6, -1, -1, -3, -3, -1, -2, 0, -5}, {0, 1, 0, -1, -1, 0, -3, -1, -1, -3, 0, 0, -3, -2, 0, -1, 0, -1, 5, 1, -2, -3, -1, -2, 0, -5}, {0, 0, -1, -1, -1, -1, -2, -2, -2, -1, 0, -1, -2, -1, 0, -1, -1, -1, 1, 5, 0, -3, -1, -2, -1, -5}, {0, 0, -4, -1, -4, -3, -1, -4, -4, 3, 0, -3, 1, 1, -3, -3, -2, -3, -2, 0, 4, -3, -1, -2, -3, -5}, {0, -3, -5, -3, -5, -4, 1, -3, -2, -3, 0, -4, -2, -2, -4, -5, -2, -3, -3, -3, -3, 11, -3, 2, -3, -5}, {0, -1, -2, -2, -2, -1, -2, -2, -1, -2, 0, -1, -1, -1, -1, -2, -1, -1, -1, -1, -1, -3, -1, -2, -1, -5}, {0, -2, -3, -3, -4, -3, 3, -4, 2, -2, 0, -2, -1, -2, -3, -4, -2, -2, -2, -2, -2, 2, -2, 7, -3, -5}, {0, -1, 0, -4, 1, 4, -4, -2, 0, -4, 0, 1, -3, -2, 0, -2, 3, 0, 0, -1, -3, -3, -1, -3, 4, -5}, {0, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, 0, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, 1}, } // # Matrix made by matblas from blosum80_3.iij // # * column uses minimum score // # BLOSUM Clustered Scoring Matrix in 1/3 Bit Units // # Blocks Database = /data/blocks_5.0/blocks.dat // # Cluster Percentage: >= 80 // # Entropy = 0.9868, Expected = -0.7442 // A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * // A 7 -3 -3 -3 -1 -2 -2 0 -3 -3 -3 -1 -2 -4 -1 2 0 -5 -4 -1 -3 -2 -1 -8 // R -3 9 -1 -3 -6 1 -1 -4 0 -5 -4 3 -3 -5 -3 -2 -2 -5 -4 -4 -2 0 -2 -8 // N -3 -1 9 2 -5 0 -1 -1 1 -6 -6 0 -4 -6 -4 1 0 -7 -4 -5 5 -1 -2 -8 // D -3 -3 2 10 -7 -1 2 -3 -2 -7 -7 -2 -6 -6 -3 -1 -2 -8 -6 -6 6 1 -3 -8 // C -1 -6 -5 -7 13 -5 -7 -6 -7 -2 -3 -6 -3 -4 -6 -2 -2 -5 -5 -2 -6 -7 -4 -8 // Q -2 1 0 -1 -5 9 3 -4 1 -5 -4 2 -1 -5 -3 -1 -1 -4 -3 -4 -1 5 -2 -8 // E -2 -1 -1 2 -7 3 8 -4 0 -6 -6 1 -4 -6 -2 -1 -2 -6 -5 -4 1 6 -2 -8 // G 0 -4 -1 -3 -6 -4 -4 9 -4 -7 -7 -3 -5 -6 -5 -1 -3 -6 -6 -6 -2 -4 -3 -8 // H -3 0 1 -2 -7 1 0 -4 12 -6 -5 -1 -4 -2 -4 -2 -3 -4 3 -5 -1 0 -2 -8 // I -3 -5 -6 -7 -2 -5 -6 -7 -6 7 2 -5 2 -1 -5 -4 -2 -5 -3 4 -6 -6 -2 -8 // L -3 -4 -6 -7 -3 -4 -6 -7 -5 2 6 -4 3 0 -5 -4 -3 -4 -2 1 -7 -5 -2 -8 // K -1 3 0 -2 -6 2 1 -3 -1 -5 -4 8 -3 -5 -2 -1 -1 -6 -4 -4 -1 1 -2 -8 // M -2 -3 -4 -6 -3 -1 -4 -5 -4 2 3 -3 9 0 -4 -3 -1 -3 -3 1 -5 -3 -2 -8 // F -4 -5 -6 -6 -4 -5 -6 -6 -2 -1 0 -5 0 10 -6 -4 -4 0 4 -2 -6 -6 -3 -8 // P -1 -3 -4 -3 -6 -3 -2 -5 -4 -5 -5 -2 -4 -6 12 -2 -3 -7 -6 -4 -4 -2 -3 -8 // S 2 -2 1 -1 -2 -1 -1 -1 -2 -4 -4 -1 -3 -4 -2 7 2 -6 -3 -3 0 -1 -1 -8 // T 0 -2 0 -2 -2 -1 -2 -3 -3 -2 -3 -1 -1 -4 -3 2 8 -5 -3 0 -1 -2 -1 -8 // W -5 -5 -7 -8 -5 -4 -6 -6 -4 -5 -4 -6 -3 0 -7 -6 -5 16 3 -5 -8 -5 -5 -8 // Y -4 -4 -4 -6 -5 -3 -5 -6 3 -3 -2 -4 -3 4 -6 -3 -3 3 11 -3 -5 -4 -3 -8 // V -1 -4 -5 -6 -2 -4 -4 -6 -5 4 1 -4 1 -2 -4 -3 0 -5 -3 7 -6 -4 -2 -8 // B -3 -2 5 6 -6 -1 1 -2 -1 -6 -7 -1 -5 -6 -4 0 -1 -8 -5 -6 6 0 -3 -8 // Z -2 0 -1 1 -7 5 6 -4 0 -6 -5 1 -3 -6 -2 -1 -2 -5 -4 -4 0 6 -1 -8 // X -1 -2 -2 -3 -4 -2 -2 -3 -2 -2 -2 -2 -2 -3 -3 -1 -1 -5 -3 -2 -3 -1 -2 -8 // * -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 1 // BLOSUM80 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 7, -3, -1, -3, -2, -4, 0, -3, -3, 0, -1, -3, -2, -3, -1, -2, -3, 2, 0, -1, -5, -1, -4, -2, -8}, {0, -3, 6, -6, 6, 1, -6, -2, -1, -6, 0, -1, -7, -5, 5, -4, -1, -2, 0, -1, -6, -8, -3, -5, 0, -8}, {0, -1, -6, 13, -7, -7, -4, -6, -7, -2, 0, -6, -3, -3, -5, -6, -5, -6, -2, -2, -2, -5, -4, -5, -7, -8}, {0, -3, 6, -7, 10, 2, -6, -3, -2, -7, 0, -2, -7, -6, 2, -3, -1, -3, -1, -2, -6, -8, -3, -6, 1, -8}, {0, -2, 1, -7, 2, 8, -6, -4, 0, -6, 0, 1, -6, -4, -1, -2, 3, -1, -1, -2, -4, -6, -2, -5, 6, -8}, {0, -4, -6, -4, -6, -6, 10, -6, -2, -1, 0, -5, 0, 0, -6, -6, -5, -5, -4, -4, -2, 0, -3, 4, -6, -8}, {0, 0, -2, -6, -3, -4, -6, 9, -4, -7, 0, -3, -7, -5, -1, -5, -4, -4, -1, -3, -6, -6, -3, -6, -4, -8}, {0, -3, -1, -7, -2, 0, -2, -4, 12, -6, 0, -1, -5, -4, 1, -4, 1, 0, -2, -3, -5, -4, -2, 3, 0, -8}, {0, -3, -6, -2, -7, -6, -1, -7, -6, 7, 0, -5, 2, 2, -6, -5, -5, -5, -4, -2, 4, -5, -2, -3, -6, -8}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, -1, -1, -6, -2, 1, -5, -3, -1, -5, 0, 8, -4, -3, 0, -2, 2, 3, -1, -1, -4, -6, -2, -4, 1, -8}, {0, -3, -7, -3, -7, -6, 0, -7, -5, 2, 0, -4, 6, 3, -6, -5, -4, -4, -4, -3, 1, -4, -2, -2, -5, -8}, {0, -2, -5, -3, -6, -4, 0, -5, -4, 2, 0, -3, 3, 9, -4, -4, -1, -3, -3, -1, 1, -3, -2, -3, -3, -8}, {0, -3, 5, -5, 2, -1, -6, -1, 1, -6, 0, 0, -6, -4, 9, -4, 0, -1, 1, 0, -5, -7, -2, -4, -1, -8}, {0, -1, -4, -6, -3, -2, -6, -5, -4, -5, 0, -2, -5, -4, -4, 12, -3, -3, -2, -3, -4, -7, -3, -6, -2, -8}, {0, -2, -1, -5, -1, 3, -5, -4, 1, -5, 0, 2, -4, -1, 0, -3, 9, 1, -1, -1, -4, -4, -2, -3, 5, -8}, {0, -3, -2, -6, -3, -1, -5, -4, 0, -5, 0, 3, -4, -3, -1, -3, 1, 9, -2, -2, -4, -5, -2, -4, 0, -8}, {0, 2, 0, -2, -1, -1, -4, -1, -2, -4, 0, -1, -4, -3, 1, -2, -1, -2, 7, 2, -3, -6, -1, -3, -1, -8}, {0, 0, -1, -2, -2, -2, -4, -3, -3, -2, 0, -1, -3, -1, 0, -3, -1, -2, 2, 8, 0, -5, -1, -3, -2, -8}, {0, -1, -6, -2, -6, -4, -2, -6, -5, 4, 0, -4, 1, 1, -5, -4, -4, -4, -3, 0, 7, -5, -2, -3, -4, -8}, {0, -5, -8, -5, -8, -6, 0, -6, -4, -5, 0, -6, -4, -3, -7, -7, -4, -5, -6, -5, -5, 16, -5, 3, -5, -8}, {0, -1, -3, -4, -3, -2, -3, -3, -2, -2, 0, -2, -2, -2, -2, -3, -2, -2, -1, -1, -2, -5, -2, -3, -1, -8}, {0, -4, -5, -5, -6, -5, 4, -6, 3, -3, 0, -4, -2, -3, -4, -6, -3, -4, -3, -3, -3, 3, -3, 11, -4, -8}, {0, -2, 0, -7, 1, 6, -6, -4, 0, -6, 0, 1, -5, -3, -1, -2, 5, 0, -1, -2, -4, -5, -1, -4, 6, -8}, {0, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, 0, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, 1}, } // # Matrix made by matblas from blosum85.iij // # * column uses minimum score // # BLOSUM Clustered Scoring Matrix in 1/2 Bit Units // # Blocks Database = /data/blocks_5.0/blocks.dat // # Cluster Percentage: >= 85 // # Entropy = 1.0805, Expected = -0.8153 // A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * // A 5 -2 -2 -2 -1 -1 -1 0 -2 -2 -2 -1 -2 -3 -1 1 0 -3 -3 -1 -2 -1 -1 -6 // R -2 6 -1 -2 -4 1 -1 -3 0 -4 -3 2 -2 -4 -2 -1 -2 -4 -3 -3 -2 0 -2 -6 // N -2 -1 7 1 -4 0 -1 -1 0 -4 -4 0 -3 -4 -3 0 0 -5 -3 -4 4 -1 -2 -6 // D -2 -2 1 7 -5 -1 1 -2 -2 -5 -5 -1 -4 -4 -2 -1 -2 -6 -4 -4 4 1 -2 -6 // C -1 -4 -4 -5 9 -4 -5 -4 -5 -2 -2 -4 -2 -3 -4 -2 -2 -4 -3 -1 -4 -5 -3 -6 // Q -1 1 0 -1 -4 6 2 -3 1 -4 -3 1 0 -4 -2 -1 -1 -3 -2 -3 -1 4 -1 -6 // E -1 -1 -1 1 -5 2 6 -3 -1 -4 -4 0 -3 -4 -2 -1 -1 -4 -4 -3 0 4 -1 -6 // G 0 -3 -1 -2 -4 -3 -3 6 -3 -5 -5 -2 -4 -4 -3 -1 -2 -4 -5 -4 -1 -3 -2 -6 // H -2 0 0 -2 -5 1 -1 -3 8 -4 -3 -1 -3 -2 -3 -1 -2 -3 2 -4 -1 0 -2 -6 // I -2 -4 -4 -5 -2 -4 -4 -5 -4 5 1 -3 1 -1 -4 -3 -1 -3 -2 3 -5 -4 -2 -6 // L -2 -3 -4 -5 -2 -3 -4 -5 -3 1 4 -3 2 0 -4 -3 -2 -3 -2 0 -5 -4 -2 -6 // K -1 2 0 -1 -4 1 0 -2 -1 -3 -3 6 -2 -4 -2 -1 -1 -5 -3 -3 -1 1 -1 -6 // M -2 -2 -3 -4 -2 0 -3 -4 -3 1 2 -2 7 -1 -3 -2 -1 -2 -2 0 -4 -2 -1 -6 // F -3 -4 -4 -4 -3 -4 -4 -4 -2 -1 0 -4 -1 7 -4 -3 -3 0 3 -1 -4 -4 -2 -6 // P -1 -2 -3 -2 -4 -2 -2 -3 -3 -4 -4 -2 -3 -4 8 -1 -2 -5 -4 -3 -3 -2 -2 -6 // S 1 -1 0 -1 -2 -1 -1 -1 -1 -3 -3 -1 -2 -3 -1 5 1 -4 -2 -2 0 -1 -1 -6 // T 0 -2 0 -2 -2 -1 -1 -2 -2 -1 -2 -1 -1 -3 -2 1 5 -4 -2 0 -1 -1 -1 -6 // W -3 -4 -5 -6 -4 -3 -4 -4 -3 -3 -3 -5 -2 0 -5 -4 -4 11 2 -3 -5 -4 -3 -6 // Y -3 -3 -3 -4 -3 -2 -4 -5 2 -2 -2 -3 -2 3 -4 -2 -2 2 7 -2 -4 -3 -2 -6 // V -1 -3 -4 -4 -1 -3 -3 -4 -4 3 0 -3 0 -1 -3 -2 0 -3 -2 5 -4 -3 -1 -6 // B -2 -2 4 4 -4 -1 0 -1 -1 -5 -5 -1 -4 -4 -3 0 -1 -5 -4 -4 4 0 -2 -6 // Z -1 0 -1 1 -5 4 4 -3 0 -4 -4 1 -2 -4 -2 -1 -1 -4 -3 -3 0 4 -1 -6 // X -1 -2 -2 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -2 -2 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -3 -2 -1 -2 -1 -2 -6 // * -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 1 // BLOSUM85 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 5, -2, -1, -2, -1, -3, 0, -2, -2, 0, -1, -2, -2, -2, -1, -1, -2, 1, 0, -1, -3, -1, -3, -1, -6}, {0, -2, 4, -4, 4, 0, -4, -1, -1, -5, 0, -1, -5, -4, 4, -3, -1, -2, 0, -1, -4, -5, -2, -4, 0, -6}, {0, -1, -4, 9, -5, -5, -3, -4, -5, -2, 0, -4, -2, -2, -4, -4, -4, -4, -2, -2, -1, -4, -3, -3, -5, -6}, {0, -2, 4, -5, 7, 1, -4, -2, -2, -5, 0, -1, -5, -4, 1, -2, -1, -2, -1, -2, -4, -6, -2, -4, 1, -6}, {0, -1, 0, -5, 1, 6, -4, -3, -1, -4, 0, 0, -4, -3, -1, -2, 2, -1, -1, -1, -3, -4, -1, -4, 4, -6}, {0, -3, -4, -3, -4, -4, 7, -4, -2, -1, 0, -4, 0, -1, -4, -4, -4, -4, -3, -3, -1, 0, -2, 3, -4, -6}, {0, 0, -1, -4, -2, -3, -4, 6, -3, -5, 0, -2, -5, -4, -1, -3, -3, -3, -1, -2, -4, -4, -2, -5, -3, -6}, {0, -2, -1, -5, -2, -1, -2, -3, 8, -4, 0, -1, -3, -3, 0, -3, 1, 0, -1, -2, -4, -3, -2, 2, 0, -6}, {0, -2, -5, -2, -5, -4, -1, -5, -4, 5, 0, -3, 1, 1, -4, -4, -4, -4, -3, -1, 3, -3, -2, -2, -4, -6}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, -1, -1, -4, -1, 0, -4, -2, -1, -3, 0, 6, -3, -2, 0, -2, 1, 2, -1, -1, -3, -5, -1, -3, 1, -6}, {0, -2, -5, -2, -5, -4, 0, -5, -3, 1, 0, -3, 4, 2, -4, -4, -3, -3, -3, -2, 0, -3, -2, -2, -4, -6}, {0, -2, -4, -2, -4, -3, -1, -4, -3, 1, 0, -2, 2, 7, -3, -3, 0, -2, -2, -1, 0, -2, -1, -2, -2, -6}, {0, -2, 4, -4, 1, -1, -4, -1, 0, -4, 0, 0, -4, -3, 7, -3, 0, -1, 0, 0, -4, -5, -2, -3, -1, -6}, {0, -1, -3, -4, -2, -2, -4, -3, -3, -4, 0, -2, -4, -3, -3, 8, -2, -2, -1, -2, -3, -5, -2, -4, -2, -6}, {0, -1, -1, -4, -1, 2, -4, -3, 1, -4, 0, 1, -3, 0, 0, -2, 6, 1, -1, -1, -3, -3, -1, -2, 4, -6}, {0, -2, -2, -4, -2, -1, -4, -3, 0, -4, 0, 2, -3, -2, -1, -2, 1, 6, -1, -2, -3, -4, -2, -3, 0, -6}, {0, 1, 0, -2, -1, -1, -3, -1, -1, -3, 0, -1, -3, -2, 0, -1, -1, -1, 5, 1, -2, -4, -1, -2, -1, -6}, {0, 0, -1, -2, -2, -1, -3, -2, -2, -1, 0, -1, -2, -1, 0, -2, -1, -2, 1, 5, 0, -4, -1, -2, -1, -6}, {0, -1, -4, -1, -4, -3, -1, -4, -4, 3, 0, -3, 0, 0, -4, -3, -3, -3, -2, 0, 5, -3, -1, -2, -3, -6}, {0, -3, -5, -4, -6, -4, 0, -4, -3, -3, 0, -5, -3, -2, -5, -5, -3, -4, -4, -4, -3, 11, -3, 2, -4, -6}, {0, -1, -2, -3, -2, -1, -2, -2, -2, -2, 0, -1, -2, -1, -2, -2, -1, -2, -1, -1, -1, -3, -2, -2, -1, -6}, {0, -3, -4, -3, -4, -4, 3, -5, 2, -2, 0, -3, -2, -2, -3, -4, -2, -3, -2, -2, -2, 2, -2, 7, -3, -6}, {0, -1, 0, -5, 1, 4, -4, -3, 0, -4, 0, 1, -4, -2, -1, -2, 4, 0, -1, -1, -3, -4, -1, -3, 4, -6}, {0, -6, -6, -6, -6, -6, -6, -6, -6, -6, 0, -6, -6, -6, -6, -6, -6, -6, -6, -6, -6, -6, -6, -6, -6, 1}, } // # Matrix made by matblas from blosum90.iij // # * column uses minimum score // # BLOSUM Clustered Scoring Matrix in 1/2 Bit Units // # Blocks Database = /data/blocks_5.0/blocks.dat // # Cluster Percentage: >= 90 // # Entropy = 1.1806, Expected = -0.8887 // A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * // A 5 -2 -2 -3 -1 -1 -1 0 -2 -2 -2 -1 -2 -3 -1 1 0 -4 -3 -1 -2 -1 -1 -6 // R -2 6 -1 -3 -5 1 -1 -3 0 -4 -3 2 -2 -4 -3 -1 -2 -4 -3 -3 -2 0 -2 -6 // N -2 -1 7 1 -4 0 -1 -1 0 -4 -4 0 -3 -4 -3 0 0 -5 -3 -4 4 -1 -2 -6 // D -3 -3 1 7 -5 -1 1 -2 -2 -5 -5 -1 -4 -5 -3 -1 -2 -6 -4 -5 4 0 -2 -6 // C -1 -5 -4 -5 9 -4 -6 -4 -5 -2 -2 -4 -2 -3 -4 -2 -2 -4 -4 -2 -4 -5 -3 -6 // Q -1 1 0 -1 -4 7 2 -3 1 -4 -3 1 0 -4 -2 -1 -1 -3 -3 -3 -1 4 -1 -6 // E -1 -1 -1 1 -6 2 6 -3 -1 -4 -4 0 -3 -5 -2 -1 -1 -5 -4 -3 0 4 -2 -6 // G 0 -3 -1 -2 -4 -3 -3 6 -3 -5 -5 -2 -4 -5 -3 -1 -3 -4 -5 -5 -2 -3 -2 -6 // H -2 0 0 -2 -5 1 -1 -3 8 -4 -4 -1 -3 -2 -3 -2 -2 -3 1 -4 -1 0 -2 -6 // I -2 -4 -4 -5 -2 -4 -4 -5 -4 5 1 -4 1 -1 -4 -3 -1 -4 -2 3 -5 -4 -2 -6 // L -2 -3 -4 -5 -2 -3 -4 -5 -4 1 5 -3 2 0 -4 -3 -2 -3 -2 0 -5 -4 -2 -6 // K -1 2 0 -1 -4 1 0 -2 -1 -4 -3 6 -2 -4 -2 -1 -1 -5 -3 -3 -1 1 -1 -6 // M -2 -2 -3 -4 -2 0 -3 -4 -3 1 2 -2 7 -1 -3 -2 -1 -2 -2 0 -4 -2 -1 -6 // F -3 -4 -4 -5 -3 -4 -5 -5 -2 -1 0 -4 -1 7 -4 -3 -3 0 3 -2 -4 -4 -2 -6 // P -1 -3 -3 -3 -4 -2 -2 -3 -3 -4 -4 -2 -3 -4 8 -2 -2 -5 -4 -3 -3 -2 -2 -6 // S 1 -1 0 -1 -2 -1 -1 -1 -2 -3 -3 -1 -2 -3 -2 5 1 -4 -3 -2 0 -1 -1 -6 // T 0 -2 0 -2 -2 -1 -1 -3 -2 -1 -2 -1 -1 -3 -2 1 6 -4 -2 -1 -1 -1 -1 -6 // W -4 -4 -5 -6 -4 -3 -5 -4 -3 -4 -3 -5 -2 0 -5 -4 -4 11 2 -3 -6 -4 -3 -6 // Y -3 -3 -3 -4 -4 -3 -4 -5 1 -2 -2 -3 -2 3 -4 -3 -2 2 8 -3 -4 -3 -2 -6 // V -1 -3 -4 -5 -2 -3 -3 -5 -4 3 0 -3 0 -2 -3 -2 -1 -3 -3 5 -4 -3 -2 -6 // B -2 -2 4 4 -4 -1 0 -2 -1 -5 -5 -1 -4 -4 -3 0 -1 -6 -4 -4 4 0 -2 -6 // Z -1 0 -1 0 -5 4 4 -3 0 -4 -4 1 -2 -4 -2 -1 -1 -4 -3 -3 0 4 -1 -6 // X -1 -2 -2 -2 -3 -1 -2 -2 -2 -2 -2 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -3 -2 -2 -2 -1 -2 -6 // * -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 1 // BLOSUM90 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 5, -2, -1, -3, -1, -3, 0, -2, -2, 0, -1, -2, -2, -2, -1, -1, -2, 1, 0, -1, -4, -1, -3, -1, -6}, {0, -2, 4, -4, 4, 0, -4, -2, -1, -5, 0, -1, -5, -4, 4, -3, -1, -2, 0, -1, -4, -6, -2, -4, 0, -6}, {0, -1, -4, 9, -5, -6, -3, -4, -5, -2, 0, -4, -2, -2, -4, -4, -4, -5, -2, -2, -2, -4, -3, -4, -5, -6}, {0, -3, 4, -5, 7, 1, -5, -2, -2, -5, 0, -1, -5, -4, 1, -3, -1, -3, -1, -2, -5, -6, -2, -4, 0, -6}, {0, -1, 0, -6, 1, 6, -5, -3, -1, -4, 0, 0, -4, -3, -1, -2, 2, -1, -1, -1, -3, -5, -2, -4, 4, -6}, {0, -3, -4, -3, -5, -5, 7, -5, -2, -1, 0, -4, 0, -1, -4, -4, -4, -4, -3, -3, -2, 0, -2, 3, -4, -6}, {0, 0, -2, -4, -2, -3, -5, 6, -3, -5, 0, -2, -5, -4, -1, -3, -3, -3, -1, -3, -5, -4, -2, -5, -3, -6}, {0, -2, -1, -5, -2, -1, -2, -3, 8, -4, 0, -1, -4, -3, 0, -3, 1, 0, -2, -2, -4, -3, -2, 1, 0, -6}, {0, -2, -5, -2, -5, -4, -1, -5, -4, 5, 0, -4, 1, 1, -4, -4, -4, -4, -3, -1, 3, -4, -2, -2, -4, -6}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, -1, -1, -4, -1, 0, -4, -2, -1, -4, 0, 6, -3, -2, 0, -2, 1, 2, -1, -1, -3, -5, -1, -3, 1, -6}, {0, -2, -5, -2, -5, -4, 0, -5, -4, 1, 0, -3, 5, 2, -4, -4, -3, -3, -3, -2, 0, -3, -2, -2, -4, -6}, {0, -2, -4, -2, -4, -3, -1, -4, -3, 1, 0, -2, 2, 7, -3, -3, 0, -2, -2, -1, 0, -2, -1, -2, -2, -6}, {0, -2, 4, -4, 1, -1, -4, -1, 0, -4, 0, 0, -4, -3, 7, -3, 0, -1, 0, 0, -4, -5, -2, -3, -1, -6}, {0, -1, -3, -4, -3, -2, -4, -3, -3, -4, 0, -2, -4, -3, -3, 8, -2, -3, -2, -2, -3, -5, -2, -4, -2, -6}, {0, -1, -1, -4, -1, 2, -4, -3, 1, -4, 0, 1, -3, 0, 0, -2, 7, 1, -1, -1, -3, -3, -1, -3, 4, -6}, {0, -2, -2, -5, -3, -1, -4, -3, 0, -4, 0, 2, -3, -2, -1, -3, 1, 6, -1, -2, -3, -4, -2, -3, 0, -6}, {0, 1, 0, -2, -1, -1, -3, -1, -2, -3, 0, -1, -3, -2, 0, -2, -1, -1, 5, 1, -2, -4, -1, -3, -1, -6}, {0, 0, -1, -2, -2, -1, -3, -3, -2, -1, 0, -1, -2, -1, 0, -2, -1, -2, 1, 6, -1, -4, -1, -2, -1, -6}, {0, -1, -4, -2, -5, -3, -2, -5, -4, 3, 0, -3, 0, 0, -4, -3, -3, -3, -2, -1, 5, -3, -2, -3, -3, -6}, {0, -4, -6, -4, -6, -5, 0, -4, -3, -4, 0, -5, -3, -2, -5, -5, -3, -4, -4, -4, -3, 11, -3, 2, -4, -6}, {0, -1, -2, -3, -2, -2, -2, -2, -2, -2, 0, -1, -2, -1, -2, -2, -1, -2, -1, -1, -2, -3, -2, -2, -1, -6}, {0, -3, -4, -4, -4, -4, 3, -5, 1, -2, 0, -3, -2, -2, -3, -4, -3, -3, -3, -2, -3, 2, -2, 8, -3, -6}, {0, -1, 0, -5, 0, 4, -4, -3, 0, -4, 0, 1, -4, -2, -1, -2, 4, 0, -1, -1, -3, -4, -1, -3, 4, -6}, {0, -6, -6, -6, -6, -6, -6, -6, -6, -6, 0, -6, -6, -6, -6, -6, -6, -6, -6, -6, -6, -6, -6, -6, -6, 1}, } // # Matrix made by matblas from blosumn.iij // # * column uses minimum score // # BLOSUM Clustered Scoring Matrix in 1/2 Bit Units // # Blocks Database = /data/blocks_5.0/blocks.dat // # Cluster Percentage: >= -2 // # Entropy = 1.5172, Expected = -1.1484 // A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * // A 6 -2 -2 -3 -2 -1 -2 -1 -3 -3 -3 -2 -2 -4 -1 1 -1 -4 -4 -1 -3 -2 -1 -7 // R -2 7 -1 -3 -6 0 -2 -4 -1 -5 -4 2 -3 -4 -3 -2 -2 -5 -4 -4 -2 -1 -2 -7 // N -2 -1 7 1 -4 -1 -1 -2 0 -5 -5 -1 -4 -5 -4 0 -1 -6 -4 -4 4 -1 -2 -7 // D -3 -3 1 7 -6 -2 1 -3 -2 -6 -6 -2 -5 -5 -3 -2 -2 -7 -5 -5 4 0 -3 -7 // C -2 -6 -4 -6 9 -5 -7 -5 -6 -2 -3 -5 -3 -3 -5 -2 -2 -5 -4 -2 -5 -6 -4 -7 // Q -1 0 -1 -2 -5 7 1 -4 0 -4 -3 1 -1 -4 -2 -1 -2 -4 -3 -4 -1 4 -2 -7 // E -2 -2 -1 1 -7 1 6 -4 -1 -5 -5 0 -4 -5 -3 -1 -2 -5 -4 -4 0 5 -2 -7 // G -1 -4 -2 -3 -5 -4 -4 6 -4 -6 -6 -3 -5 -5 -4 -1 -3 -5 -6 -5 -2 -4 -3 -7 // H -3 -1 0 -2 -6 0 -1 -4 9 -5 -4 -2 -3 -3 -4 -2 -3 -4 1 -5 -1 -1 -3 -7 // I -3 -5 -5 -6 -2 -4 -5 -6 -5 6 1 -4 1 -1 -5 -4 -2 -4 -3 2 -5 -5 -2 -7 // L -3 -4 -5 -6 -3 -3 -5 -6 -4 1 5 -4 2 0 -5 -4 -3 -4 -3 0 -5 -4 -2 -7 // K -2 2 -1 -2 -5 1 0 -3 -2 -4 -4 6 -2 -4 -2 -1 -2 -6 -4 -4 -1 0 -2 -7 // M -2 -3 -4 -5 -3 -1 -4 -5 -3 1 2 -2 8 -1 -4 -3 -2 -2 -3 0 -5 -3 -2 -7 // F -4 -4 -5 -5 -3 -4 -5 -5 -3 -1 0 -4 -1 7 -5 -4 -3 0 3 -2 -5 -5 -3 -7 // P -1 -3 -4 -3 -5 -2 -3 -4 -4 -5 -5 -2 -4 -5 8 -2 -3 -5 -5 -4 -4 -3 -3 -7 // S 1 -2 0 -2 -2 -1 -1 -1 -2 -4 -4 -1 -3 -4 -2 6 1 -4 -3 -3 -1 -1 -1 -7 // T -1 -2 -1 -2 -2 -2 -2 -3 -3 -2 -3 -2 -2 -3 -3 1 6 -5 -3 -1 -2 -2 -1 -7 // W -4 -5 -6 -7 -5 -4 -5 -5 -4 -4 -4 -6 -2 0 -5 -4 -5 11 1 -3 -6 -4 -4 -7 // Y -4 -4 -4 -5 -4 -3 -4 -6 1 -3 -3 -4 -3 3 -5 -3 -3 1 8 -3 -4 -4 -3 -7 // V -1 -4 -4 -5 -2 -4 -4 -5 -5 2 0 -4 0 -2 -4 -3 -1 -3 -3 5 -5 -4 -2 -7 // B -3 -2 4 4 -5 -1 0 -2 -1 -5 -5 -1 -5 -5 -4 -1 -2 -6 -4 -5 4 1 -2 -7 // Z -2 -1 -1 0 -6 4 5 -4 -1 -5 -4 0 -3 -5 -3 -1 -2 -4 -4 -4 1 4 -2 -7 // X -1 -2 -2 -3 -4 -2 -2 -3 -3 -2 -2 -2 -2 -3 -3 -1 -1 -4 -3 -2 -2 -2 -2 -7 // * -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 1 // BLOSUMN = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 6, -3, -2, -3, -2, -4, -1, -3, -3, 0, -2, -3, -2, -2, -1, -1, -2, 1, -1, -1, -4, -1, -4, -2, -7}, {0, -3, 4, -5, 4, 0, -5, -2, -1, -5, 0, -1, -5, -5, 4, -4, -1, -2, -1, -2, -5, -6, -2, -4, 1, -7}, {0, -2, -5, 9, -6, -7, -3, -5, -6, -2, 0, -5, -3, -3, -4, -5, -5, -6, -2, -2, -2, -5, -4, -4, -6, -7}, {0, -3, 4, -6, 7, 1, -5, -3, -2, -6, 0, -2, -6, -5, 1, -3, -2, -3, -2, -2, -5, -7, -3, -5, 0, -7}, {0, -2, 0, -7, 1, 6, -5, -4, -1, -5, 0, 0, -5, -4, -1, -3, 1, -2, -1, -2, -4, -5, -2, -4, 5, -7}, {0, -4, -5, -3, -5, -5, 7, -5, -3, -1, 0, -4, 0, -1, -5, -5, -4, -4, -4, -3, -2, 0, -3, 3, -5, -7}, {0, -1, -2, -5, -3, -4, -5, 6, -4, -6, 0, -3, -6, -5, -2, -4, -4, -4, -1, -3, -5, -5, -3, -6, -4, -7}, {0, -3, -1, -6, -2, -1, -3, -4, 9, -5, 0, -2, -4, -3, 0, -4, 0, -1, -2, -3, -5, -4, -3, 1, -1, -7}, {0, -3, -5, -2, -6, -5, -1, -6, -5, 6, 0, -4, 1, 1, -5, -5, -4, -5, -4, -2, 2, -4, -2, -3, -5, -7}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, -2, -1, -5, -2, 0, -4, -3, -2, -4, 0, 6, -4, -2, -1, -2, 1, 2, -1, -2, -4, -6, -2, -4, 0, -7}, {0, -3, -5, -3, -6, -5, 0, -6, -4, 1, 0, -4, 5, 2, -5, -5, -3, -4, -4, -3, 0, -4, -2, -3, -4, -7}, {0, -2, -5, -3, -5, -4, -1, -5, -3, 1, 0, -2, 2, 8, -4, -4, -1, -3, -3, -2, 0, -2, -2, -3, -3, -7}, {0, -2, 4, -4, 1, -1, -5, -2, 0, -5, 0, -1, -5, -4, 7, -4, -1, -1, 0, -1, -4, -6, -2, -4, -1, -7}, {0, -1, -4, -5, -3, -3, -5, -4, -4, -5, 0, -2, -5, -4, -4, 8, -2, -3, -2, -3, -4, -5, -3, -5, -3, -7}, {0, -1, -1, -5, -2, 1, -4, -4, 0, -4, 0, 1, -3, -1, -1, -2, 7, 0, -1, -2, -4, -4, -2, -3, 4, -7}, {0, -2, -2, -6, -3, -2, -4, -4, -1, -5, 0, 2, -4, -3, -1, -3, 0, 7, -2, -2, -4, -5, -2, -4, -1, -7}, {0, 1, -1, -2, -2, -1, -4, -1, -2, -4, 0, -1, -4, -3, 0, -2, -1, -2, 6, 1, -3, -4, -1, -3, -1, -7}, {0, -1, -2, -2, -2, -2, -3, -3, -3, -2, 0, -2, -3, -2, -1, -3, -2, -2, 1, 6, -1, -5, -1, -3, -2, -7}, {0, -1, -5, -2, -5, -4, -2, -5, -5, 2, 0, -4, 0, 0, -4, -4, -4, -4, -3, -1, 5, -3, -2, -3, -4, -7}, {0, -4, -6, -5, -7, -5, 0, -5, -4, -4, 0, -6, -4, -2, -6, -5, -4, -5, -4, -5, -3, 11, -4, 1, -4, -7}, {0, -1, -2, -4, -3, -2, -3, -3, -3, -2, 0, -2, -2, -2, -2, -3, -2, -2, -1, -1, -2, -4, -2, -3, -2, -7}, {0, -4, -4, -4, -5, -4, 3, -6, 1, -3, 0, -4, -3, -3, -4, -5, -3, -4, -3, -3, -3, 1, -3, 8, -4, -7}, {0, -2, 1, -6, 0, 5, -5, -4, -1, -5, 0, 0, -4, -3, -1, -3, 4, -1, -1, -2, -4, -4, -2, -4, 4, -7}, {0, -7, -7, -7, -7, -7, -7, -7, -7, -7, 0, -7, -7, -7, -7, -7, -7, -7, -7, -7, -7, -7, -7, -7, -7, 1}, } // # // # This matrix was produced by "pam" Version 1.0.6 [28-Jul-93] // # // # PAM 10 substitution matrix, scale = ln(2)/2 = 0.346574 // # // # Expected score = -8.27, Entropy = 3.43 bits // # // # Lowest score = -23, Highest score = 13 // # // A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * // A 7 -10 -7 -6 -10 -7 -5 -4 -11 -8 -9 -10 -8 -12 -4 -3 -3 -20 -11 -5 -6 -6 -6 -23 // R -10 9 -9 -17 -11 -4 -15 -13 -4 -8 -12 -2 -7 -12 -7 -6 -10 -5 -14 -11 -11 -7 -9 -23 // N -7 -9 9 -1 -17 -7 -5 -6 -2 -8 -10 -4 -15 -12 -9 -2 -5 -11 -7 -12 7 -6 -6 -23 // D -6 -17 -1 8 -21 -6 0 -6 -7 -11 -19 -8 -17 -21 -12 -7 -8 -21 -17 -11 7 -1 -9 -23 // C -10 -11 -17 -21 10 -20 -20 -13 -10 -9 -21 -20 -20 -19 -11 -6 -11 -22 -7 -9 -18 -20 -13 -23 // Q -7 -4 -7 -6 -20 9 -1 -10 -2 -11 -8 -6 -7 -19 -6 -8 -9 -19 -18 -10 -6 7 -8 -23 // E -5 -15 -5 0 -20 -1 8 -7 -9 -8 -13 -7 -10 -20 -9 -7 -9 -23 -11 -10 -1 7 -8 -23 // G -4 -13 -6 -6 -13 -10 -7 7 -13 -17 -14 -10 -12 -12 -10 -4 -10 -21 -20 -9 -6 -8 -8 -23 // H -11 -4 -2 -7 -10 -2 -9 -13 10 -13 -9 -10 -17 -9 -7 -9 -11 -10 -6 -9 -4 -4 -8 -23 // I -8 -8 -8 -11 -9 -11 -8 -17 -13 9 -4 -9 -3 -5 -12 -10 -5 -20 -9 -1 -9 -9 -8 -23 // L -9 -12 -10 -19 -21 -8 -13 -14 -9 -4 7 -11 -2 -5 -10 -12 -10 -9 -10 -5 -12 -10 -9 -23 // K -10 -2 -4 -8 -20 -6 -7 -10 -10 -9 -11 7 -4 -20 -10 -7 -6 -18 -12 -13 -5 -6 -8 -23 // M -8 -7 -15 -17 -20 -7 -10 -12 -17 -3 -2 -4 12 -7 -11 -8 -7 -19 -17 -4 -16 -8 -9 -23 // F -12 -12 -12 -21 -19 -19 -20 -12 -9 -5 -5 -20 -7 9 -13 -9 -12 -7 -1 -12 -14 -20 -12 -23 // P -4 -7 -9 -12 -11 -6 -9 -10 -7 -12 -10 -10 -11 -13 8 -4 -7 -20 -20 -9 -10 -7 -8 -23 // S -3 -6 -2 -7 -6 -8 -7 -4 -9 -10 -12 -7 -8 -9 -4 7 -2 -8 -10 -10 -4 -8 -6 -23 // T -3 -10 -5 -8 -11 -9 -9 -10 -11 -5 -10 -6 -7 -12 -7 -2 8 -19 -9 -6 -6 -9 -7 -23 // W -20 -5 -11 -21 -22 -19 -23 -21 -10 -20 -9 -18 -19 -7 -20 -8 -19 13 -8 -22 -13 -21 -16 -23 // Y -11 -14 -7 -17 -7 -18 -11 -20 -6 -9 -10 -12 -17 -1 -20 -10 -9 -8 10 -10 -9 -13 -11 -23 // V -5 -11 -12 -11 -9 -10 -10 -9 -9 -1 -5 -13 -4 -12 -9 -10 -6 -22 -10 8 -11 -10 -8 -23 // B -6 -11 7 7 -18 -6 -1 -6 -4 -9 -12 -5 -16 -14 -10 -4 -6 -13 -9 -11 7 -3 -8 -23 // Z -6 -7 -6 -1 -20 7 7 -8 -4 -9 -10 -6 -8 -20 -7 -8 -9 -21 -13 -10 -3 7 -8 -23 // X -6 -9 -6 -9 -13 -8 -8 -8 -8 -8 -9 -8 -9 -12 -8 -6 -7 -16 -11 -8 -8 -8 -8 -23 // * -23 -23 -23 -23 -23 -23 -23 -23 -23 -23 -23 -23 -23 -23 -23 -23 -23 -23 -23 -23 -23 -23 -23 1 // PAM10 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 7, -6, -10, -6, -5, -12, -4, -11, -8, 0, -10, -9, -8, -7, -4, -7, -10, -3, -3, -5, -20, -6, -11, -6, -23}, {0, -6, 7, -18, 7, -1, -14, -6, -4, -9, 0, -5, -12, -16, 7, -10, -6, -11, -4, -6, -11, -13, -8, -9, -3, -23}, {0, -10, -18, 10, -21, -20, -19, -13, -10, -9, 0, -20, -21, -20, -17, -11, -20, -11, -6, -11, -9, -22, -13, -7, -20, -23}, {0, -6, 7, -21, 8, 0, -21, -6, -7, -11, 0, -8, -19, -17, -1, -12, -6, -17, -7, -8, -11, -21, -9, -17, -1, -23}, {0, -5, -1, -20, 0, 8, -20, -7, -9, -8, 0, -7, -13, -10, -5, -9, -1, -15, -7, -9, -10, -23, -8, -11, 7, -23}, {0, -12, -14, -19, -21, -20, 9, -12, -9, -5, 0, -20, -5, -7, -12, -13, -19, -12, -9, -12, -12, -7, -12, -1, -20, -23}, {0, -4, -6, -13, -6, -7, -12, 7, -13, -17, 0, -10, -14, -12, -6, -10, -10, -13, -4, -10, -9, -21, -8, -20, -8, -23}, {0, -11, -4, -10, -7, -9, -9, -13, 10, -13, 0, -10, -9, -17, -2, -7, -2, -4, -9, -11, -9, -10, -8, -6, -4, -23}, {0, -8, -9, -9, -11, -8, -5, -17, -13, 9, 0, -9, -4, -3, -8, -12, -11, -8, -10, -5, -1, -20, -8, -9, -9, -23}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, -10, -5, -20, -8, -7, -20, -10, -10, -9, 0, 7, -11, -4, -4, -10, -6, -2, -7, 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-9, -10, -11, -10, -6, 8, -22, -8, -10, -10, -23}, {0, -20, -13, -22, -21, -23, -7, -21, -10, -20, 0, -18, -9, -19, -11, -20, -19, -5, -8, -19, -22, 13, -16, -8, -21, -23}, {0, -6, -8, -13, -9, -8, -12, -8, -8, -8, 0, -8, -9, -9, -6, -8, -8, -9, -6, -7, -8, -16, -8, -11, -8, -23}, {0, -11, -9, -7, -17, -11, -1, -20, -6, -9, 0, -12, -10, -17, -7, -20, -18, -14, -10, -9, -10, -8, -11, 10, -13, -23}, {0, -6, -3, -20, -1, 7, -20, -8, -4, -9, 0, -6, -10, -8, -6, -7, 7, -7, -8, -9, -10, -21, -8, -13, 7, -23}, {0, -23, -23, -23, -23, -23, -23, -23, -23, -23, 0, -23, -23, -23, -23, -23, -23, -23, -23, -23, -23, -23, -23, -23, -23, 1}, } // # // # This matrix was produced by "pam" Version 1.0.6 [28-Jul-93] // # // # PAM 100 substitution matrix, scale = ln(2)/2 = 0.346574 // # // # Expected score = -1.99, Entropy = 1.18 bits // # // # Lowest score = -9, Highest score = 12 // # // A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * // A 4 -3 -1 -1 -3 -2 0 1 -3 -2 -3 -3 -2 -5 1 1 1 -7 -4 0 -1 -1 -1 -9 // R -3 7 -2 -4 -5 1 -3 -5 1 -3 -5 2 -1 -6 -1 -1 -3 1 -6 -4 -3 -1 -2 -9 // N -1 -2 5 3 -5 -1 1 -1 2 -3 -4 1 -4 -5 -2 1 0 -5 -2 -3 4 0 -1 -9 // D -1 -4 3 5 -7 0 4 -1 -1 -4 -6 -1 -5 -8 -3 -1 -2 -9 -6 -4 4 3 -2 -9 // C -3 -5 -5 -7 9 -8 -8 -5 -4 -3 -8 -8 -7 -7 -4 -1 -4 -9 -1 -3 -6 -8 -5 -9 // Q -2 1 -1 0 -8 6 2 -3 3 -4 -2 0 -2 -7 -1 -2 -2 -7 -6 -3 0 5 -2 -9 // E 0 -3 1 4 -8 2 5 -1 -1 -3 -5 -1 -4 -8 -2 -1 -2 -9 -5 -3 3 4 -2 -9 // G 1 -5 -1 -1 -5 -3 -1 5 -4 -5 -6 -3 -4 -6 -2 0 -2 -9 -7 -3 -1 -2 -2 -9 // H -3 1 2 -1 -4 3 -1 -4 7 -4 -3 -2 -4 -3 -1 -2 -3 -4 -1 -3 1 1 -2 -9 // I -2 -3 -3 -4 -3 -4 -3 -5 -4 6 1 -3 1 0 -4 -3 0 -7 -3 3 -3 -3 -2 -9 // L -3 -5 -4 -6 -8 -2 -5 -6 -3 1 6 -4 3 0 -4 -4 -3 -3 -3 0 -5 -4 -3 -9 // K -3 2 1 -1 -8 0 -1 -3 -2 -3 -4 5 0 -7 -3 -1 -1 -6 -6 -4 0 -1 -2 -9 // M -2 -1 -4 -5 -7 -2 -4 -4 -4 1 3 0 9 -1 -4 -3 -1 -6 -5 1 -4 -2 -2 -9 // F -5 -6 -5 -8 -7 -7 -8 -6 -3 0 0 -7 -1 8 -6 -4 -5 -1 4 -3 -6 -7 -4 -9 // P 1 -1 -2 -3 -4 -1 -2 -2 -1 -4 -4 -3 -4 -6 7 0 -1 -7 -7 -3 -3 -1 -2 -9 // S 1 -1 1 -1 -1 -2 -1 0 -2 -3 -4 -1 -3 -4 0 4 2 -3 -4 -2 0 -2 -1 -9 // T 1 -3 0 -2 -4 -2 -2 -2 -3 0 -3 -1 -1 -5 -1 2 5 -7 -4 0 -1 -2 -1 -9 // W -7 1 -5 -9 -9 -7 -9 -9 -4 -7 -3 -6 -6 -1 -7 -3 -7 12 -2 -9 -6 -8 -6 -9 // Y -4 -6 -2 -6 -1 -6 -5 -7 -1 -3 -3 -6 -5 4 -7 -4 -4 -2 9 -4 -4 -6 -4 -9 // V 0 -4 -3 -4 -3 -3 -3 -3 -3 3 0 -4 1 -3 -3 -2 0 -9 -4 5 -4 -3 -2 -9 // B -1 -3 4 4 -6 0 3 -1 1 -3 -5 0 -4 -6 -3 0 -1 -6 -4 -4 4 2 -2 -9 // Z -1 -1 0 3 -8 5 4 -2 1 -3 -4 -1 -2 -7 -1 -2 -2 -8 -6 -3 2 5 -2 -9 // X -1 -2 -1 -2 -5 -2 -2 -2 -2 -2 -3 -2 -2 -4 -2 -1 -1 -6 -4 -2 -2 -2 -2 -9 // * -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 1 // PAM100 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 4, -1, -3, -1, 0, -5, 1, -3, -2, 0, -3, -3, -2, -1, 1, -2, -3, 1, 1, 0, -7, -1, -4, -1, -9}, {0, -1, 4, -6, 4, 3, -6, -1, 1, -3, 0, 0, -5, -4, 4, -3, 0, -3, 0, -1, -4, -6, -2, -4, 2, -9}, {0, -3, -6, 9, -7, -8, -7, -5, -4, -3, 0, -8, -8, -7, -5, -4, -8, -5, -1, -4, -3, -9, -5, -1, -8, -9}, {0, -1, 4, -7, 5, 4, -8, -1, -1, -4, 0, -1, -6, -5, 3, -3, 0, -4, -1, -2, -4, -9, -2, -6, 3, -9}, {0, 0, 3, -8, 4, 5, -8, -1, -1, -3, 0, -1, -5, -4, 1, -2, 2, -3, -1, -2, -3, -9, -2, -5, 4, -9}, {0, -5, -6, -7, -8, -8, 8, -6, -3, 0, 0, -7, 0, -1, -5, -6, -7, -6, -4, -5, -3, -1, -4, 4, -7, -9}, {0, 1, -1, -5, -1, -1, -6, 5, -4, -5, 0, -3, -6, -4, -1, -2, -3, -5, 0, -2, -3, -9, -2, -7, -2, -9}, {0, -3, 1, -4, -1, -1, -3, -4, 7, -4, 0, -2, -3, -4, 2, -1, 3, 1, -2, -3, -3, -4, -2, -1, 1, -9}, {0, -2, -3, -3, -4, -3, 0, -5, -4, 6, 0, -3, 1, 1, -3, -4, -4, -3, -3, 0, 3, -7, -2, -3, -3, -9}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, -3, 0, -8, -1, -1, -7, -3, -2, -3, 0, 5, -4, 0, 1, -3, 0, 2, -1, -1, -4, -6, -2, -6, -1, -9}, {0, -3, -5, -8, -6, -5, 0, -6, -3, 1, 0, -4, 6, 3, -4, -4, -2, -5, -4, -3, 0, -3, -3, -3, -4, -9}, {0, -2, -4, -7, -5, -4, -1, -4, -4, 1, 0, 0, 3, 9, -4, -4, -2, -1, -3, -1, 1, -6, -2, -5, -2, -9}, {0, -1, 4, -5, 3, 1, -5, -1, 2, -3, 0, 1, -4, -4, 5, -2, -1, -2, 1, 0, -3, -5, -1, -2, 0, -9}, {0, 1, -3, -4, -3, -2, -6, -2, -1, -4, 0, -3, -4, -4, -2, 7, -1, -1, 0, -1, -3, -7, -2, -7, -1, -9}, {0, -2, 0, -8, 0, 2, -7, -3, 3, -4, 0, 0, -2, -2, -1, -1, 6, 1, -2, -2, -3, -7, -2, -6, 5, -9}, {0, -3, -3, -5, -4, -3, -6, -5, 1, -3, 0, 2, -5, -1, -2, -1, 1, 7, -1, -3, -4, 1, -2, -6, -1, -9}, {0, 1, 0, -1, -1, -1, -4, 0, -2, -3, 0, -1, -4, -3, 1, 0, -2, -1, 4, 2, -2, -3, -1, -4, -2, -9}, {0, 1, -1, -4, -2, -2, -5, -2, -3, 0, 0, -1, -3, -1, 0, -1, -2, -3, 2, 5, 0, -7, -1, -4, -2, -9}, {0, 0, -4, -3, -4, -3, -3, -3, -3, 3, 0, -4, 0, 1, -3, -3, -3, -4, -2, 0, 5, -9, -2, -4, -3, -9}, {0, -7, -6, -9, -9, -9, -1, -9, -4, -7, 0, -6, -3, -6, -5, -7, -7, 1, -3, -7, -9, 12, -6, -2, -8, -9}, {0, -1, -2, -5, -2, -2, -4, -2, -2, -2, 0, -2, -3, -2, -1, -2, -2, -2, -1, -1, -2, -6, -2, -4, -2, -9}, {0, -4, -4, -1, -6, -5, 4, -7, -1, -3, 0, -6, -3, -5, -2, -7, -6, -6, -4, -4, -4, -2, 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-9 // G 1 -4 0 0 -5 -3 -1 5 -4 -4 -6 -3 -4 -5 -2 0 -2 -8 -7 -2 0 -2 -2 -9 // H -3 1 2 0 -4 3 -1 -4 7 -4 -3 -2 -4 -3 -1 -2 -3 -4 -1 -3 1 1 -2 -9 // I -1 -3 -2 -3 -3 -3 -3 -4 -4 6 1 -3 1 0 -4 -3 0 -7 -2 3 -3 -3 -2 -9 // L -3 -4 -4 -6 -8 -2 -5 -6 -3 1 6 -4 3 0 -4 -4 -3 -3 -3 1 -5 -3 -2 -9 // K -3 2 1 -1 -7 0 -1 -3 -2 -3 -4 5 0 -7 -3 -1 -1 -5 -5 -4 0 -1 -2 -9 // M -2 -1 -3 -5 -7 -1 -3 -4 -4 1 3 0 8 -1 -4 -2 -1 -6 -5 1 -4 -2 -2 -9 // F -4 -5 -4 -7 -6 -6 -7 -5 -3 0 0 -7 -1 8 -6 -4 -4 -1 4 -3 -6 -7 -4 -9 // P 1 -1 -2 -3 -4 0 -2 -2 -1 -4 -4 -3 -4 -6 6 0 -1 -7 -7 -2 -2 -1 -2 -9 // S 1 -1 1 -1 -1 -2 -1 0 -2 -3 -4 -1 -2 -4 0 3 2 -3 -3 -2 0 -1 -1 -9 // T 1 -2 0 -1 -3 -2 -2 -2 -3 0 -3 -1 -1 -4 -1 2 5 -6 -3 0 -1 -2 -1 -9 // W -7 1 -5 -8 -9 -6 -9 -8 -4 -7 -3 -5 -6 -1 -7 -3 -6 12 -2 -8 -6 -7 -5 -9 // Y -4 -5 -2 -5 -1 -6 -5 -7 -1 -2 -3 -5 -5 4 -7 -3 -3 -2 8 -4 -3 -5 -3 -9 // V 0 -4 -3 -4 -3 -3 -3 -2 -3 3 1 -4 1 -3 -2 -2 0 -8 -4 5 -3 -3 -2 -9 // B -1 -2 3 4 -6 0 3 0 1 -3 -5 0 -4 -6 -2 0 -1 -6 -3 -3 4 2 -1 -9 // Z -1 -1 0 3 -7 4 4 -2 1 -3 -3 -1 -2 -7 -1 -1 -2 -7 -5 -3 2 4 -2 -9 // X -1 -2 -1 -2 -4 -1 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -4 -2 -1 -1 -5 -3 -2 -1 -2 -2 -9 // * -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 1 // PAM110 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 3, -1, -3, -1, 0, -4, 1, -3, -1, 0, -3, -3, -2, -1, 1, -1, -3, 1, 1, 0, -7, -1, -4, -1, -9}, {0, -1, 4, -6, 4, 3, -6, 0, 1, -3, 0, 0, -5, -4, 3, -2, 0, -2, 0, -1, -3, -6, -1, -3, 2, -9}, {0, -3, -6, 9, -7, -7, -6, -5, -4, -3, 0, -7, -8, -7, -5, -4, -7, -4, -1, -3, -3, -9, -4, -1, -7, -9}, {0, -1, 4, -7, 5, 4, -7, 0, 0, -3, 0, -1, -6, -5, 2, -3, 1, -4, -1, -1, -4, -8, -2, -5, 3, -9}, {0, 0, 3, -7, 4, 5, -7, -1, -1, -3, 0, -1, -5, -3, 1, -2, 2, -3, -1, -2, -3, -9, -2, -5, 4, -9}, {0, -4, -6, -6, -7, -7, 8, -5, -3, 0, 0, -7, 0, -1, -4, -6, -6, -5, -4, -4, -3, -1, -4, 4, -7, -9}, {0, 1, 0, -5, 0, -1, -5, 5, -4, -4, 0, -3, -6, -4, 0, -2, -3, -4, 0, -2, -2, -8, 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0, -2, -3, 0, -1, -4, -2, 1, 0, -2, -1, 3, 2, -2, -3, -1, -3, -1, -9}, {0, 1, -1, -3, -1, -2, -4, -2, -3, 0, 0, -1, -3, -1, 0, -1, -2, -2, 2, 5, 0, -6, -1, -3, -2, -9}, {0, 0, -3, -3, -4, -3, -3, -2, -3, 3, 0, -4, 1, 1, -3, -2, -3, -4, -2, 0, 5, -8, -2, -4, -3, -9}, {0, -7, -6, -9, -8, -9, -1, -8, -4, -7, 0, -5, -3, -6, -5, -7, -6, 1, -3, -6, -8, 12, -5, -2, -7, -9}, {0, -1, -1, -4, -2, -2, -4, -2, -2, -2, 0, -2, -2, -2, -1, -2, -1, -2, -1, -1, -2, -5, -2, -3, -2, -9}, {0, -4, -3, -1, -5, -5, 4, -7, -1, -2, 0, -5, -3, -5, -2, -7, -6, -5, -3, -3, -4, -2, -3, 8, -5, -9}, {0, -1, 2, -7, 3, 4, -7, -2, 1, -3, 0, -1, -3, -2, 0, -1, 4, -1, -1, -2, -3, -7, -2, -5, 4, -9}, {0, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, 0, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, 1}, } // # // # This matrix was produced by "pam" Version 1.0.6 [28-Jul-93] // # // # PAM 120 substitution matrix, scale = ln(2)/2 = 0.346574 // # // # Expected score = -1.64, Entropy = 0.979 bits // # // # Lowest score = -8, Highest score = 12 // # // A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * // A 3 -3 -1 0 -3 -1 0 1 -3 -1 -3 -2 -2 -4 1 1 1 -7 -4 0 0 -1 -1 -8 // R -3 6 -1 -3 -4 1 -3 -4 1 -2 -4 2 -1 -5 -1 -1 -2 1 -5 -3 -2 -1 -2 -8 // N -1 -1 4 2 -5 0 1 0 2 -2 -4 1 -3 -4 -2 1 0 -4 -2 -3 3 0 -1 -8 // D 0 -3 2 5 -7 1 3 0 0 -3 -5 -1 -4 -7 -3 0 -1 -8 -5 -3 4 3 -2 -8 // C -3 -4 -5 -7 9 -7 -7 -4 -4 -3 -7 -7 -6 -6 -4 0 -3 -8 -1 -3 -6 -7 -4 -8 // Q -1 1 0 1 -7 6 2 -3 3 -3 -2 0 -1 -6 0 -2 -2 -6 -5 -3 0 4 -1 -8 // E 0 -3 1 3 -7 2 5 -1 -1 -3 -4 -1 -3 -7 -2 -1 -2 -8 -5 -3 3 4 -1 -8 // G 1 -4 0 0 -4 -3 -1 5 -4 -4 -5 -3 -4 -5 -2 1 -1 -8 -6 -2 0 -2 -2 -8 // H -3 1 2 0 -4 3 -1 -4 7 -4 -3 -2 -4 -3 -1 -2 -3 -3 -1 -3 1 1 -2 -8 // I -1 -2 -2 -3 -3 -3 -3 -4 -4 6 1 -3 1 0 -3 -2 0 -6 -2 3 -3 -3 -1 -8 // L -3 -4 -4 -5 -7 -2 -4 -5 -3 1 5 -4 3 0 -3 -4 -3 -3 -2 1 -4 -3 -2 -8 // K -2 2 1 -1 -7 0 -1 -3 -2 -3 -4 5 0 -7 -2 -1 -1 -5 -5 -4 0 -1 -2 -8 // M -2 -1 -3 -4 -6 -1 -3 -4 -4 1 3 0 8 -1 -3 -2 -1 -6 -4 1 -4 -2 -2 -8 // F -4 -5 -4 -7 -6 -6 -7 -5 -3 0 0 -7 -1 8 -5 -3 -4 -1 4 -3 -5 -6 -3 -8 // P 1 -1 -2 -3 -4 0 -2 -2 -1 -3 -3 -2 -3 -5 6 1 -1 -7 -6 -2 -2 -1 -2 -8 // S 1 -1 1 0 0 -2 -1 1 -2 -2 -4 -1 -2 -3 1 3 2 -2 -3 -2 0 -1 -1 -8 // T 1 -2 0 -1 -3 -2 -2 -1 -3 0 -3 -1 -1 -4 -1 2 4 -6 -3 0 0 -2 -1 -8 // W -7 1 -4 -8 -8 -6 -8 -8 -3 -6 -3 -5 -6 -1 -7 -2 -6 12 -2 -8 -6 -7 -5 -8 // Y -4 -5 -2 -5 -1 -5 -5 -6 -1 -2 -2 -5 -4 4 -6 -3 -3 -2 8 -3 -3 -5 -3 -8 // V 0 -3 -3 -3 -3 -3 -3 -2 -3 3 1 -4 1 -3 -2 -2 0 -8 -3 5 -3 -3 -1 -8 // B 0 -2 3 4 -6 0 3 0 1 -3 -4 0 -4 -5 -2 0 0 -6 -3 -3 4 2 -1 -8 // Z -1 -1 0 3 -7 4 4 -2 1 -3 -3 -1 -2 -6 -1 -1 -2 -7 -5 -3 2 4 -1 -8 // X -1 -2 -1 -2 -4 -1 -1 -2 -2 -1 -2 -2 -2 -3 -2 -1 -1 -5 -3 -1 -1 -1 -2 -8 // * -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 1 // PAM120 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 3, 0, -3, 0, 0, -4, 1, -3, -1, 0, -2, -3, -2, -1, 1, -1, -3, 1, 1, 0, -7, -1, -4, -1, -8}, {0, 0, 4, -6, 4, 3, -5, 0, 1, -3, 0, 0, -4, -4, 3, -2, 0, -2, 0, 0, -3, -6, -1, -3, 2, -8}, {0, -3, -6, 9, -7, -7, -6, -4, -4, -3, 0, -7, -7, -6, -5, -4, -7, -4, 0, -3, -3, -8, -4, -1, -7, -8}, {0, 0, 4, -7, 5, 3, -7, 0, 0, -3, 0, -1, -5, -4, 2, -3, 1, -3, 0, -1, -3, -8, -2, -5, 3, -8}, {0, 0, 3, -7, 3, 5, -7, -1, -1, -3, 0, -1, -4, -3, 1, -2, 2, -3, -1, -2, -3, -8, -1, -5, 4, -8}, {0, -4, -5, -6, -7, -7, 8, -5, -3, 0, 0, -7, 0, -1, -4, -5, -6, -5, -3, -4, -3, -1, -3, 4, -6, -8}, {0, 1, 0, -4, 0, -1, -5, 5, -4, -4, 0, -3, -5, -4, 0, -2, -3, -4, 1, -1, -2, -8, -2, -6, -2, -8}, {0, -3, 1, -4, 0, -1, -3, -4, 7, -4, 0, -2, -3, -4, 2, -1, 3, 1, -2, -3, -3, -3, -2, -1, 1, -8}, {0, -1, -3, -3, -3, -3, 0, -4, -4, 6, 0, -3, 1, 1, -2, -3, -3, -2, -2, 0, 3, -6, -1, -2, -3, -8}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, -2, 0, -7, -1, -1, -7, -3, -2, -3, 0, 5, -4, 0, 1, -2, 0, 2, -1, -1, -4, -5, -2, -5, -1, -8}, {0, -3, -4, -7, -5, -4, 0, -5, -3, 1, 0, -4, 5, 3, -4, -3, -2, -4, -4, -3, 1, -3, -2, -2, -3, -8}, {0, -2, -4, -6, -4, -3, -1, -4, -4, 1, 0, 0, 3, 8, -3, -3, -1, -1, -2, -1, 1, -6, -2, -4, -2, -8}, {0, -1, 3, -5, 2, 1, -4, 0, 2, -2, 0, 1, -4, -3, 4, -2, 0, -1, 1, 0, -3, -4, -1, -2, 0, -8}, {0, 1, -2, -4, -3, -2, -5, -2, -1, -3, 0, -2, -3, -3, -2, 6, 0, -1, 1, -1, -2, -7, -2, -6, -1, -8}, {0, -1, 0, -7, 1, 2, -6, -3, 3, -3, 0, 0, -2, -1, 0, 0, 6, 1, -2, -2, -3, -6, -1, -5, 4, -8}, {0, -3, -2, -4, -3, -3, -5, -4, 1, -2, 0, 2, -4, -1, -1, -1, 1, 6, -1, -2, -3, 1, -2, -5, -1, -8}, {0, 1, 0, 0, 0, -1, -3, 1, -2, -2, 0, -1, -4, -2, 1, 1, -2, -1, 3, 2, -2, -2, -1, -3, -1, -8}, {0, 1, 0, -3, -1, -2, -4, -1, -3, 0, 0, -1, -3, -1, 0, -1, -2, -2, 2, 4, 0, -6, -1, -3, -2, -8}, {0, 0, -3, -3, -3, -3, -3, -2, -3, 3, 0, -4, 1, 1, -3, -2, -3, -3, -2, 0, 5, -8, -1, -3, -3, -8}, {0, -7, -6, -8, -8, -8, -1, -8, -3, -6, 0, -5, -3, -6, -4, -7, -6, 1, -2, -6, -8, 12, -5, -2, -7, -8}, {0, -1, -1, -4, -2, -1, -3, -2, -2, -1, 0, -2, -2, -2, -1, -2, -1, -2, -1, -1, -1, -5, -2, 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-18 -2 -16 -42 -4 -13 -28 -33 -20 -42 // Q -6 3 -1 4 -33 28 12 -13 13 -16 -11 0 -7 -30 -2 -8 -9 -30 -26 -14 2 21 -6 -42 // E -1 -14 4 17 -33 12 24 -4 -3 -13 -22 -5 -15 -34 -9 -5 -8 -42 -24 -13 13 20 -7 -42 // G 3 -20 -2 -2 -22 -13 -4 25 -18 -20 -26 -15 -19 -26 -9 3 -7 -39 -32 -11 -2 -8 -9 -42 // H -13 4 8 -2 -20 13 -3 -18 35 -19 -13 -8 -19 -13 -5 -9 -13 -17 -3 -15 4 6 -8 -42 // I -6 -12 -12 -16 -14 -16 -13 -20 -19 28 6 -13 7 1 -17 -12 -1 -32 -11 17 -14 -14 -7 -42 // L -14 -20 -18 -27 -37 -11 -22 -26 -13 6 27 -19 13 2 -17 -19 -13 -13 -12 3 -22 -16 -11 -42 // K -12 12 4 -5 -34 0 -5 -15 -8 -13 -19 25 2 -33 -12 -4 -3 -24 -25 -19 0 -3 -8 -42 // M -9 -5 -15 -21 -32 -7 -15 -19 -19 7 13 2 40 -4 -16 -11 -6 -28 -21 5 -18 -11 -8 -42 // F -21 -25 -21 -35 -29 -30 -34 -26 -13 1 2 -33 -4 38 -26 -17 -20 -5 22 -13 -27 -32 -17 -42 // P 3 -4 -8 -13 -18 -2 -9 -9 -5 -17 -17 -12 -16 -26 31 3 -3 -33 -31 -11 -11 -5 -8 -42 // S 6 -4 5 -2 -2 -8 -5 3 -9 -12 -19 -4 -11 -17 3 16 8 -12 -16 -10 1 -6 -3 -42 // T 6 -10 1 -6 -16 -9 -8 -7 -13 -1 -13 -3 -6 -20 -3 8 21 -30 -16 -1 -2 -9 -4 -42 // W -33 4 -22 -39 -42 -30 -42 -39 -17 -32 -13 -24 -28 -5 -33 -12 -30 62 -8 -38 -29 -35 -25 -42 // Y -20 -26 -10 -26 -4 -26 -24 -32 -3 -11 -12 -25 -21 22 -31 -16 -16 -8 42 -17 -16 -25 -16 -42 // V 0 -17 -15 -17 -13 -14 -13 -11 -15 17 3 -19 5 -13 -11 -10 -1 -38 -17 25 -16 -14 -7 -42 // B -2 -11 16 20 -28 2 13 -2 4 -14 -22 0 -18 -27 -11 1 -2 -29 -16 -16 18 9 -6 -42 // Z -3 -4 2 13 -33 21 20 -8 6 -14 -16 -3 -11 -32 -5 -6 -9 -35 -25 -14 9 21 -7 -42 // X -4 -9 -4 -8 -20 -6 -7 -9 -8 -7 -11 -8 -8 -17 -8 -3 -4 -25 -16 -7 -6 -7 -8 -42 // * -42 -42 -42 -42 -42 -42 -42 -42 -42 -42 -42 -42 -42 -42 -42 -42 -42 -42 -42 -42 -42 -42 -42 1 // PAM120_cdi = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 16, -2, -14, -2, -1, -21, 3, -13, -6, 0, -12, -14, -9, -3, 3, -6, -14, 6, 6, 0, -33, -4, -20, -3, -42}, {0, -2, 18, -28, 20, 13, -27, -2, 4, -14, 0, 0, -22, -18, 16, -11, 2, -11, 1, -2, -16, -29, -6, -16, 9, -42}, {0, -14, -28, 44, -33, -33, -29, -22, -20, -14, 0, -34, -37, -32, -23, -18, -33, -20, -2, -16, -13, -42, -20, -4, -33, -42}, {0, -2, 20, -33, 25, 17, -35, -2, -2, -16, 0, -5, -27, -21, 12, -13, 4, -16, -2, -6, -17, -39, -8, -26, 13, -42}, {0, -1, 13, -33, 17, 24, -34, -4, -3, -13, 0, -5, -22, -15, 4, -9, 12, -14, -5, -8, -13, -42, -7, -24, 20, -42}, {0, -21, -27, -29, -35, -34, 38, -26, -13, 1, 0, -33, 2, -4, -21, -26, -30, -25, -17, -20, -13, -5, -17, 22, -32, -42}, {0, 3, -2, -22, -2, -4, -26, 25, -18, -20, 0, -15, -26, -19, -2, -9, -13, -20, 3, -7, -11, -39, -9, -32, -8, -42}, {0, -13, 4, -20, -2, -3, -13, -18, 35, -19, 0, -8, -13, -19, 8, -5, 13, 4, -9, -13, -15, -17, -8, -3, 6, -42}, {0, -6, -14, -14, -16, -13, 1, -20, -19, 28, 0, -13, 6, 7, -12, -17, -16, -12, -12, -1, 17, -32, -7, -11, -14, -42}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, -12, 0, -34, -5, -5, -33, -15, -8, -13, 0, 25, -19, 2, 4, -12, 0, 12, -4, 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R -3 6 -1 -3 -4 1 -3 -4 1 -2 -4 2 -1 -5 -1 -1 -2 1 -5 -3 -2 -1 -2 -8 // N 0 -1 4 2 -4 0 1 0 2 -2 -3 1 -3 -4 -1 1 0 -4 -2 -3 3 0 -1 -8 // D 0 -3 2 5 -6 1 3 0 0 -3 -5 -1 -4 -7 -2 0 -1 -7 -5 -3 4 3 -1 -8 // C -3 -4 -4 -6 9 -6 -6 -4 -4 -3 -7 -6 -6 -5 -3 0 -3 -8 -1 -2 -5 -6 -4 -8 // Q -1 1 0 1 -6 5 2 -2 3 -3 -2 0 -1 -6 0 -1 -2 -6 -5 -3 0 4 -1 -8 // E 0 -3 1 3 -6 2 5 -1 0 -2 -4 -1 -3 -6 -2 -1 -1 -8 -5 -3 2 4 -1 -8 // G 1 -4 0 0 -4 -2 -1 5 -3 -4 -5 -3 -4 -5 -2 1 -1 -7 -6 -2 0 -1 -2 -8 // H -2 1 2 0 -4 3 0 -3 7 -3 -3 -1 -3 -2 -1 -2 -2 -3 0 -3 1 1 -1 -8 // I -1 -2 -2 -3 -3 -3 -2 -4 -3 5 1 -2 2 0 -3 -2 0 -6 -2 3 -3 -3 -1 -8 // L -3 -4 -3 -5 -7 -2 -4 -5 -3 1 5 -4 3 1 -3 -4 -2 -2 -2 1 -4 -3 -2 -8 // K -2 2 1 -1 -6 0 -1 -3 -1 -2 -4 5 0 -6 -2 -1 0 -5 -5 -4 0 0 -1 -8 // M -2 -1 -3 -4 -6 -1 -3 -4 -3 2 3 0 8 -1 -3 -2 -1 -5 -4 1 -3 -2 -1 -8 // F -4 -5 -4 -7 -5 -6 -6 -5 -2 0 1 -6 -1 7 -5 -3 -4 -1 4 -2 -5 -6 -3 -8 // P 1 -1 -1 -2 -3 0 -2 -2 -1 -3 -3 -2 -3 -5 6 1 -1 -6 -6 -2 -2 -1 -1 -8 // S 1 -1 1 0 0 -1 -1 1 -2 -2 -4 -1 -2 -3 1 3 2 -2 -3 -2 0 -1 -1 -8 // T 1 -2 0 -1 -3 -2 -1 -1 -2 0 -2 0 -1 -4 -1 2 4 -6 -3 0 0 -2 -1 -8 // W -6 1 -4 -7 -8 -6 -8 -7 -3 -6 -2 -5 -5 -1 -6 -2 -6 12 -1 -7 -5 -7 -5 -8 // Y -4 -5 -2 -5 -1 -5 -5 -6 0 -2 -2 -5 -4 4 -6 -3 -3 -1 8 -3 -3 -5 -3 -8 // V 0 -3 -3 -3 -2 -3 -3 -2 -3 3 1 -4 1 -2 -2 -2 0 -7 -3 5 -3 -3 -1 -8 // B 0 -2 3 4 -5 0 2 0 1 -3 -4 0 -3 -5 -2 0 0 -5 -3 -3 3 2 -1 -8 // Z 0 -1 0 3 -6 4 4 -1 1 -3 -3 0 -2 -6 -1 -1 -2 -7 -5 -3 2 4 -1 -8 // X -1 -2 -1 -1 -4 -1 -1 -2 -1 -1 -2 -1 -1 -3 -1 -1 -1 -5 -3 -1 -1 -1 -1 -8 // * -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 1 // PAM130 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 3, 0, -3, 0, 0, -4, 1, -2, -1, 0, -2, -3, -2, 0, 1, -1, -3, 1, 1, 0, -6, -1, -4, 0, -8}, {0, 0, 3, -5, 4, 2, -5, 0, 1, -3, 0, 0, -4, -3, 3, -2, 0, -2, 0, 0, -3, -5, -1, -3, 2, -8}, {0, -3, -5, 9, -6, -6, -5, -4, -4, -3, 0, -6, -7, -6, -4, -3, -6, -4, 0, -3, -2, -8, -4, -1, -6, -8}, {0, 0, 4, -6, 5, 3, -7, 0, 0, -3, 0, -1, -5, -4, 2, -2, 1, -3, 0, -1, -3, -7, -1, -5, 3, -8}, {0, 0, 2, -6, 3, 5, -6, -1, 0, -2, 0, -1, -4, -3, 1, -2, 2, -3, -1, -1, -3, -8, -1, -5, 4, -8}, {0, -4, -5, -5, -7, -6, 7, -5, -2, 0, 0, -6, 1, -1, -4, -5, -6, -5, -3, -4, -2, -1, -3, 4, -6, -8}, {0, 1, 0, -4, 0, -1, -5, 5, -3, -4, 0, -3, -5, -4, 0, -2, -2, -4, 1, -1, -2, -7, -2, -6, -1, -8}, {0, -2, 1, -4, 0, 0, -2, -3, 7, -3, 0, -1, -3, -3, 2, -1, 3, 1, -2, -2, -3, -3, -1, 0, 1, -8}, {0, -1, -3, -3, -3, -2, 0, -4, -3, 5, 0, -2, 1, 2, -2, -3, -3, -2, -2, 0, 3, -6, -1, -2, -3, -8}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, -2, 0, -6, -1, -1, -6, -3, -1, -2, 0, 5, -4, 0, 1, -2, 0, 2, -1, 0, -4, -5, -1, -5, 0, -8}, {0, -3, -4, -7, -5, -4, 1, -5, -3, 1, 0, -4, 5, 3, -3, -3, -2, -4, -4, -2, 1, -2, -2, -2, -3, -8}, {0, -2, -3, -6, -4, -3, -1, -4, -3, 2, 0, 0, 3, 8, -3, -3, -1, -1, -2, -1, 1, -5, -1, -4, -2, -8}, {0, 0, 3, -4, 2, 1, -4, 0, 2, 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H -2 1 2 0 -4 3 0 -3 6 -3 -2 -1 -3 -2 -1 -1 -2 -3 0 -3 1 1 -1 -8 // I -1 -2 -2 -3 -3 -3 -2 -4 -3 5 1 -2 2 0 -3 -2 0 -6 -2 3 -2 -2 -1 -8 // L -2 -4 -3 -5 -7 -2 -4 -5 -2 1 5 -3 3 1 -3 -3 -2 -2 -2 1 -4 -3 -2 -8 // K -2 3 1 -1 -6 0 -1 -3 -1 -2 -3 5 0 -6 -2 -1 0 -4 -5 -3 0 0 -1 -8 // M -2 -1 -2 -4 -6 -1 -3 -3 -3 2 3 0 7 -1 -3 -2 -1 -5 -4 1 -3 -2 -1 -8 // F -4 -5 -4 -6 -5 -5 -6 -5 -2 0 1 -6 -1 7 -5 -3 -4 -1 4 -2 -5 -6 -3 -8 // P 1 -1 -1 -2 -3 0 -1 -1 -1 -3 -3 -2 -3 -5 6 1 0 -6 -6 -2 -2 -1 -1 -8 // S 1 -1 1 0 0 -1 -1 1 -1 -2 -3 -1 -2 -3 1 3 2 -2 -3 -2 0 -1 0 -8 // T 1 -2 0 -1 -3 -2 -1 -1 -2 0 -2 0 -1 -4 0 2 4 -5 -3 0 0 -1 -1 -8 // W -6 1 -4 -7 -8 -5 -8 -7 -3 -6 -2 -4 -5 -1 -6 -2 -5 12 -1 -7 -5 -6 -5 -8 // Y -4 -5 -2 -5 -1 -5 -4 -6 0 -2 -2 -5 -4 4 -6 -3 -3 -1 8 -3 -3 -4 -3 -8 // V 0 -3 -2 -3 -2 -2 -2 -2 -3 3 1 -3 1 -2 -2 -2 0 -7 -3 5 -3 -2 -1 -8 // B 0 -2 3 4 -5 1 2 0 1 -2 -4 0 -3 -5 -2 0 0 -5 -3 -3 3 2 -1 -8 // Z 0 -1 1 3 -6 4 4 -1 1 -2 -3 0 -2 -6 -1 -1 -1 -6 -4 -2 2 4 -1 -8 // X -1 -1 -1 -1 -4 -1 -1 -1 -1 -1 -2 -1 -1 -3 -1 0 -1 -5 -3 -1 -1 -1 -1 -8 // * -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 1 // PAM140 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 3, 0, -2, 0, 0, -4, 1, -2, -1, 0, -2, -2, -2, 0, 1, -1, -2, 1, 1, 0, -6, -1, -4, 0, -8}, {0, 0, 3, -5, 4, 2, -5, 0, 1, -2, 0, 0, -4, -3, 3, -2, 1, -2, 0, 0, -3, -5, -1, -3, 2, -8}, {0, -2, -5, 9, -6, -6, -5, -4, -4, -3, 0, -6, -7, -6, -4, -3, -6, -4, 0, -3, -2, -8, -4, -1, -6, -8}, {0, 0, 4, -6, 4, 3, -6, 0, 0, -3, 0, -1, -5, -4, 2, -2, 1, -3, 0, -1, -3, -7, -1, -5, 3, -8}, {0, 0, 2, -6, 3, 4, -6, -1, 0, -2, 0, -1, -4, -3, 1, -1, 2, -2, -1, -1, -2, -8, -1, -4, 4, -8}, {0, -4, -5, -5, -6, -6, 7, -5, -2, 0, 0, -6, 1, -1, -4, -5, -5, -5, -3, -4, -2, -1, -3, 4, -6, -8}, {0, 1, 0, -4, 0, -1, -5, 5, -3, -4, 0, -3, -5, -3, 0, -1, -2, -4, 1, -1, -2, -7, -1, -6, -1, -8}, {0, -2, 1, -4, 0, 0, -2, -3, 6, -3, 0, -1, -2, -3, 2, -1, 3, 1, -1, -2, -3, -3, -1, 0, 1, -8}, {0, -1, -2, -3, -3, -2, 0, -4, -3, 5, 0, -2, 1, 2, -2, -3, -3, -2, -2, 0, 3, -6, -1, -2, -2, -8}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, -2, 0, -6, -1, -1, -6, -3, -1, -2, 0, 5, -3, 0, 1, -2, 0, 3, -1, 0, -3, -4, -1, -5, 0, -8}, {0, -2, -4, -7, -5, -4, 1, -5, -2, 1, 0, -3, 5, 3, -3, -3, -2, -4, -3, -2, 1, -2, -2, -2, -3, -8}, {0, -2, -3, -6, -4, -3, -1, -3, -3, 2, 0, 0, 3, 7, -2, -3, -1, -1, -2, -1, 1, -5, -1, -4, -2, -8}, {0, 0, 3, -4, 2, 1, -4, 0, 2, -2, 0, 1, -3, -2, 3, -1, 0, -1, 1, 0, -2, -4, -1, -2, 1, -8}, {0, 1, -2, -3, -2, -1, -5, -1, -1, -3, 0, -2, -3, -3, -1, 6, 0, -1, 1, 0, -2, -6, -1, -6, -1, -8}, {0, -1, 1, -6, 1, 2, -5, -2, 3, -3, 0, 0, -2, -1, 0, 0, 5, 1, -1, -2, -2, -5, -1, -5, 4, -8}, {0, -2, -2, -4, -3, -2, -5, -4, 1, -2, 0, 3, -4, -1, -1, -1, 1, 6, -1, -2, -3, 1, -1, -5, -1, -8}, {0, 1, 0, 0, 0, -1, -3, 1, -1, -2, 0, -1, -3, -2, 1, 1, -1, -1, 3, 2, -2, -2, 0, -3, -1, -8}, {0, 1, 0, -3, -1, -1, -4, -1, -2, 0, 0, 0, -2, -1, 0, 0, -2, -2, 2, 4, 0, -5, -1, -3, -1, -8}, {0, 0, -3, -2, -3, -2, -2, -2, -3, 3, 0, -3, 1, 1, -2, -2, -2, -3, -2, 0, 5, -7, -1, -3, -2, -8}, {0, -6, -5, -8, -7, -8, -1, -7, -3, -6, 0, -4, -2, -5, -4, -6, -5, 1, -2, -5, -7, 12, -5, -1, -6, -8}, {0, -1, -1, -4, -1, -1, -3, -1, -1, -1, 0, -1, -2, -1, -1, -1, -1, -1, 0, -1, -1, -5, -1, -3, -1, -8}, {0, -4, -3, -1, -5, -4, 4, -6, 0, -2, 0, -5, -2, -4, -2, -6, -5, -5, -3, -3, -3, -1, -3, 8, -4, -8}, {0, 0, 2, -6, 3, 4, -6, -1, 1, -2, 0, 0, -3, -2, 1, -1, 4, -1, -1, -1, -2, -6, -1, -4, 4, -8}, {0, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, 0, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, 1}, } // # // # This matrix was produced by "pam" Version 1.0.6 [28-Jul-93] // # // # PAM 150 substitution matrix, scale = ln(2)/2 = 0.346574 // # // # Expected score = -1.25, Entropy = 0.754 bits // # // # Lowest score = -7, Highest score = 12 // # // A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * // A 3 -2 0 0 -2 -1 0 1 -2 -1 -2 -2 -1 -4 1 1 1 -6 -3 0 0 0 -1 -7 // R -2 6 -1 -2 -4 1 -2 -3 1 -2 -3 3 -1 -4 -1 -1 -2 1 -4 -3 -2 0 -1 -7 // N 0 -1 3 2 -4 0 1 0 2 -2 -3 1 -2 -4 -1 1 0 -4 -2 -2 3 1 -1 -7 // D 0 -2 2 4 -6 1 3 0 0 -3 -5 -1 -3 -6 -2 0 -1 -7 -4 -3 3 2 -1 -7 // C -2 -4 -4 -6 9 -6 -6 -4 -3 -2 -6 -6 -5 -5 -3 0 -3 -7 0 -2 -5 -6 -3 -7 // Q -1 1 0 1 -6 5 2 -2 3 -3 -2 0 -1 -5 0 -1 -1 -5 -4 -2 1 4 -1 -7 // E 0 -2 1 3 -6 2 4 -1 0 -2 -4 -1 -2 -6 -1 -1 -1 -7 -4 -2 2 4 -1 -7 // G 1 -3 0 0 -4 -2 -1 4 -3 -3 -4 -2 -3 -5 -1 1 -1 -7 -5 -2 0 -1 -1 -7 // H -2 1 2 0 -3 3 0 -3 6 -3 -2 -1 -3 -2 -1 -1 -2 -3 0 -3 1 1 -1 -7 // I -1 -2 -2 -3 -2 -3 -2 -3 -3 5 1 -2 2 0 -3 -2 0 -5 -2 3 -2 -2 -1 -7 // L -2 -3 -3 -5 -6 -2 -4 -4 -2 1 5 -3 3 1 -3 -3 -2 -2 -2 1 -4 -3 -2 -7 // K -2 3 1 -1 -6 0 -1 -2 -1 -2 -3 4 0 -6 -2 -1 0 -4 -4 -3 0 0 -1 -7 // M -1 -1 -2 -3 -5 -1 -2 -3 -3 2 3 0 7 -1 -3 -2 -1 -5 -3 1 -3 -2 -1 -7 // F -4 -4 -4 -6 -5 -5 -6 -5 -2 0 1 -6 -1 7 -5 -3 -3 -1 5 -2 -5 -5 -3 -7 // P 1 -1 -1 -2 -3 0 -1 -1 -1 -3 -3 -2 -3 -5 6 1 0 -6 -5 -2 -2 -1 -1 -7 // S 1 -1 1 0 0 -1 -1 1 -1 -2 -3 -1 -2 -3 1 2 1 -2 -3 -1 0 -1 0 -7 // T 1 -2 0 -1 -3 -1 -1 -1 -2 0 -2 0 -1 -3 0 1 4 -5 -3 0 0 -1 -1 -7 // W -6 1 -4 -7 -7 -5 -7 -7 -3 -5 -2 -4 -5 -1 -6 -2 -5 12 -1 -6 -5 -6 -4 -7 // Y -3 -4 -2 -4 0 -4 -4 -5 0 -2 -2 -4 -3 5 -5 -3 -3 -1 8 -3 -3 -4 -3 -7 // V 0 -3 -2 -3 -2 -2 -2 -2 -3 3 1 -3 1 -2 -2 -1 0 -6 -3 4 -2 -2 -1 -7 // B 0 -2 3 3 -5 1 2 0 1 -2 -4 0 -3 -5 -2 0 0 -5 -3 -2 3 2 -1 -7 // Z 0 0 1 2 -6 4 4 -1 1 -2 -3 0 -2 -5 -1 -1 -1 -6 -4 -2 2 4 -1 -7 // X -1 -1 -1 -1 -3 -1 -1 -1 -1 -1 -2 -1 -1 -3 -1 0 -1 -4 -3 -1 -1 -1 -1 -7 // * -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 1 // PAM150 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 3, 0, -2, 0, 0, -4, 1, -2, -1, 0, -2, -2, -1, 0, 1, -1, -2, 1, 1, 0, -6, -1, -3, 0, -7}, {0, 0, 3, -5, 3, 2, -5, 0, 1, -2, 0, 0, -4, -3, 3, -2, 1, -2, 0, 0, -2, -5, -1, -3, 2, -7}, {0, -2, -5, 9, -6, -6, -5, -4, -3, -2, 0, -6, -6, -5, -4, -3, -6, -4, 0, -3, -2, -7, -3, 0, -6, -7}, {0, 0, 3, -6, 4, 3, -6, 0, 0, -3, 0, -1, -5, -3, 2, -2, 1, -2, 0, -1, -3, -7, -1, -4, 2, -7}, {0, 0, 2, -6, 3, 4, -6, -1, 0, -2, 0, -1, -4, -2, 1, -1, 2, -2, -1, -1, -2, -7, -1, -4, 4, -7}, {0, -4, -5, -5, -6, -6, 7, -5, -2, 0, 0, -6, 1, -1, -4, -5, -5, -4, -3, -3, -2, -1, -3, 5, -5, -7}, {0, 1, 0, -4, 0, -1, -5, 4, -3, -3, 0, -2, -4, -3, 0, -1, -2, -3, 1, -1, -2, -7, -1, -5, -1, -7}, {0, -2, 1, -3, 0, 0, -2, -3, 6, -3, 0, -1, -2, -3, 2, -1, 3, 1, -1, -2, -3, -3, -1, 0, 1, -7}, {0, -1, -2, -2, -3, -2, 0, -3, -3, 5, 0, -2, 1, 2, -2, -3, -3, -2, -2, 0, 3, -5, -1, -2, -2, -7}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, -2, 0, -6, -1, -1, -6, -2, -1, -2, 0, 4, -3, 0, 1, -2, 0, 3, -1, 0, -3, -4, -1, -4, 0, -7}, {0, -2, -4, -6, -5, -4, 1, -4, -2, 1, 0, -3, 5, 3, -3, -3, -2, -3, -3, -2, 1, -2, -2, -2, -3, -7}, {0, -1, -3, -5, -3, -2, -1, -3, -3, 2, 0, 0, 3, 7, -2, -3, -1, -1, -2, -1, 1, -5, -1, -3, -2, -7}, {0, 0, 3, -4, 2, 1, -4, 0, 2, -2, 0, 1, -3, -2, 3, -1, 0, -1, 1, 0, -2, -4, -1, -2, 1, -7}, {0, 1, -2, -3, -2, -1, -5, -1, -1, -3, 0, -2, -3, -3, -1, 6, 0, -1, 1, 0, -2, -6, -1, -5, -1, -7}, {0, -1, 1, -6, 1, 2, -5, -2, 3, -3, 0, 0, -2, -1, 0, 0, 5, 1, -1, -1, -2, -5, -1, -4, 4, -7}, {0, -2, -2, -4, -2, -2, -4, -3, 1, -2, 0, 3, -3, -1, -1, -1, 1, 6, -1, -2, -3, 1, -1, -4, 0, -7}, {0, 1, 0, 0, 0, -1, -3, 1, -1, -2, 0, -1, -3, -2, 1, 1, -1, -1, 2, 1, -1, -2, 0, -3, -1, -7}, {0, 1, 0, -3, -1, -1, -3, -1, -2, 0, 0, 0, -2, -1, 0, 0, -1, -2, 1, 4, 0, -5, -1, -3, -1, -7}, {0, 0, -2, -2, -3, -2, -2, -2, -3, 3, 0, -3, 1, 1, -2, -2, -2, -3, -1, 0, 4, -6, -1, -3, -2, -7}, {0, -6, -5, -7, -7, -7, -1, -7, -3, -5, 0, -4, -2, -5, -4, -6, -5, 1, -2, -5, -6, 12, -4, -1, -6, -7}, {0, -1, -1, -3, -1, -1, -3, -1, -1, -1, 0, -1, -2, -1, -1, -1, -1, -1, 0, -1, -1, -4, -1, -3, -1, -7}, {0, -3, -3, 0, -4, -4, 5, -5, 0, -2, 0, -4, -2, -3, -2, -5, -4, -4, -3, -3, -3, -1, -3, 8, -4, -7}, {0, 0, 2, -6, 2, 4, -5, -1, 1, -2, 0, 0, -3, -2, 1, -1, 4, 0, -1, -1, -2, -6, -1, -4, 4, -7}, {0, -7, -7, -7, -7, -7, -7, -7, -7, -7, 0, -7, -7, -7, -7, -7, -7, -7, -7, -7, -7, -7, -7, -7, -7, 1}, } // # // # This matrix was produced by "pam" Version 1.0.6 [28-Jul-93] // # // # PAM 160 substitution matrix, scale = ln(2)/2 = 0.346574 // # // # Expected score = -1.14, Entropy = 0.694 bits // # // # Lowest score = -7, Highest score = 12 // # // A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * // A 2 -2 0 0 -2 -1 0 1 -2 -1 -2 -2 -1 -3 1 1 1 -5 -3 0 0 0 0 -7 // R -2 6 -1 -2 -3 1 -2 -3 1 -2 -3 3 -1 -4 -1 -1 -1 1 -4 -3 -1 0 -1 -7 // N 0 -1 3 2 -4 0 1 0 2 -2 -3 1 -2 -3 -1 1 0 -4 -2 -2 2 1 0 -7 // D 0 -2 2 4 -5 1 3 0 0 -3 -4 0 -3 -6 -2 0 -1 -6 -4 -3 3 2 -1 -7 // C -2 -3 -4 -5 9 -5 -5 -3 -3 -2 -6 -5 -5 -5 -3 0 -2 -7 0 -2 -4 -5 -3 -7 // Q -1 1 0 1 -5 5 2 -2 2 -2 -2 0 -1 -5 0 -1 -1 -5 -4 -2 1 3 -1 -7 // E 0 -2 1 3 -5 2 4 0 0 -2 -3 -1 -2 -5 -1 0 -1 -7 -4 -2 2 3 -1 -7 // G 1 -3 0 0 -3 -2 0 4 -3 -3 -4 -2 -3 -4 -1 1 -1 -7 -5 -2 0 -1 -1 -7 // H -2 1 2 0 -3 2 0 -3 6 -3 -2 -1 -3 -2 -1 -1 -2 -3 0 -2 1 1 -1 -7 // I -1 -2 -2 -3 -2 -2 -2 -3 -3 5 2 -2 2 0 -2 -2 0 -5 -2 3 -2 -2 -1 -7 // L -2 -3 -3 -4 -6 -2 -3 -4 -2 2 5 -3 3 1 -3 -3 -2 -2 -2 1 -4 -3 -2 -7 // K -2 3 1 0 -5 0 -1 -2 -1 -2 -3 4 0 -5 -2 -1 0 -4 -4 -3 0 0 -1 -7 // M -1 -1 -2 -3 -5 -1 -2 -3 -3 2 3 0 7 0 -2 -2 -1 -4 -3 1 -3 -2 -1 -7 // F -3 -4 -3 -6 -5 -5 -5 -4 -2 0 1 -5 0 7 -4 -3 -3 -1 5 -2 -4 -5 -3 -7 // P 1 -1 -1 -2 -3 0 -1 -1 -1 -2 -3 -2 -2 -4 5 1 0 -5 -5 -2 -1 -1 -1 -7 // S 1 -1 1 0 0 -1 0 1 -1 -2 -3 -1 -2 -3 1 2 1 -2 -3 -1 0 -1 0 -7 // T 1 -1 0 -1 -2 -1 -1 -1 -2 0 -2 0 -1 -3 0 1 3 -5 -3 0 0 -1 0 -7 // W -5 1 -4 -6 -7 -5 -7 -7 -3 -5 -2 -4 -4 -1 -5 -2 -5 12 -1 -6 -5 -6 -4 -7 // Y -3 -4 -2 -4 0 -4 -4 -5 0 -2 -2 -4 -3 5 -5 -3 -3 -1 8 -3 -3 -4 -3 -7 // V 0 -3 -2 -3 -2 -2 -2 -2 -2 3 1 -3 1 -2 -2 -1 0 -6 -3 4 -2 -2 -1 -7 // B 0 -1 2 3 -4 1 2 0 1 -2 -4 0 -3 -4 -1 0 0 -5 -3 -2 3 2 -1 -7 // Z 0 0 1 2 -5 3 3 -1 1 -2 -3 0 -2 -5 -1 -1 -1 -6 -4 -2 2 3 -1 -7 // X 0 -1 0 -1 -3 -1 -1 -1 -1 -1 -2 -1 -1 -3 -1 0 0 -4 -3 -1 -1 -1 -1 -7 // * -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 1 // PAM160 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 2, 0, -2, 0, 0, -3, 1, -2, -1, 0, -2, -2, -1, 0, 1, -1, -2, 1, 1, 0, -5, 0, -3, 0, -7}, {0, 0, 3, -4, 3, 2, -4, 0, 1, -2, 0, 0, -4, -3, 2, -1, 1, -1, 0, 0, -2, -5, -1, -3, 2, -7}, {0, -2, -4, 9, -5, -5, -5, -3, -3, -2, 0, -5, -6, -5, -4, -3, -5, -3, 0, -2, -2, -7, -3, 0, -5, -7}, {0, 0, 3, -5, 4, 3, -6, 0, 0, -3, 0, 0, -4, -3, 2, -2, 1, -2, 0, -1, -3, -6, -1, -4, 2, -7}, {0, 0, 2, -5, 3, 4, -5, 0, 0, -2, 0, -1, -3, -2, 1, -1, 2, -2, 0, -1, -2, -7, -1, -4, 3, -7}, {0, -3, -4, -5, -6, -5, 7, -4, -2, 0, 0, -5, 1, 0, -3, -4, -5, -4, -3, -3, -2, -1, -3, 5, -5, -7}, {0, 1, 0, -3, 0, 0, -4, 4, -3, -3, 0, -2, -4, -3, 0, -1, -2, -3, 1, -1, -2, -7, -1, -5, -1, -7}, {0, -2, 1, -3, 0, 0, -2, -3, 6, -3, 0, -1, -2, -3, 2, -1, 2, 1, -1, -2, -2, -3, -1, 0, 1, -7}, {0, -1, -2, -2, -3, -2, 0, -3, -3, 5, 0, -2, 2, 2, -2, -2, -2, -2, -2, 0, 3, -5, -1, -2, -2, -7}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, -2, 0, -5, 0, -1, -5, -2, -1, -2, 0, 4, -3, 0, 1, -2, 0, 3, -1, 0, -3, -4, -1, -4, 0, -7}, {0, -2, -4, -6, -4, -3, 1, -4, -2, 2, 0, -3, 5, 3, -3, -3, -2, -3, -3, -2, 1, -2, -2, -2, -3, -7}, {0, -1, -3, -5, -3, -2, 0, -3, -3, 2, 0, 0, 3, 7, -2, -2, -1, -1, -2, -1, 1, -4, -1, -3, -2, -7}, {0, 0, 2, -4, 2, 1, -3, 0, 2, -2, 0, 1, -3, -2, 3, -1, 0, -1, 1, 0, -2, -4, 0, -2, 1, -7}, {0, 1, -1, -3, -2, -1, -4, -1, -1, -2, 0, -2, -3, -2, -1, 5, 0, -1, 1, 0, -2, -5, -1, -5, -1, -7}, {0, -1, 1, -5, 1, 2, -5, -2, 2, -2, 0, 0, -2, -1, 0, 0, 5, 1, -1, -1, -2, -5, -1, -4, 3, -7}, {0, -2, -1, -3, -2, -2, -4, -3, 1, -2, 0, 3, -3, -1, -1, -1, 1, 6, -1, -1, -3, 1, -1, -4, 0, -7}, {0, 1, 0, 0, 0, 0, -3, 1, -1, -2, 0, -1, -3, -2, 1, 1, -1, -1, 2, 1, -1, -2, 0, -3, -1, -7}, {0, 1, 0, -2, -1, -1, -3, -1, -2, 0, 0, 0, -2, -1, 0, 0, -1, -1, 1, 3, 0, -5, 0, -3, -1, -7}, {0, 0, -2, -2, -3, -2, -2, -2, -2, 3, 0, -3, 1, 1, -2, -2, -2, -3, -1, 0, 4, -6, -1, -3, -2, -7}, {0, -5, -5, -7, -6, -7, -1, -7, -3, -5, 0, -4, -2, -4, -4, -5, -5, 1, -2, -5, -6, 12, -4, -1, -6, -7}, {0, 0, -1, -3, -1, -1, -3, -1, -1, -1, 0, -1, -2, -1, 0, -1, -1, -1, 0, 0, -1, -4, -1, -3, -1, -7}, {0, -3, -3, 0, -4, -4, 5, -5, 0, -2, 0, -4, -2, -3, -2, -5, -4, -4, -3, -3, -3, -1, -3, 8, -4, -7}, {0, 0, 2, -5, 2, 3, -5, -1, 1, -2, 0, 0, -3, -2, 1, -1, 3, 0, -1, -1, -2, -6, -1, -4, 3, -7}, {0, -7, -7, -7, -7, -7, -7, -7, -7, -7, 0, -7, -7, -7, -7, -7, -7, -7, -7, -7, -7, -7, -7, -7, -7, 1}, } // # // # This matrix was produced by "pam" Version 1.0.6 [28-Jul-93] // # // # PAM 160 substitution matrix, scale = 0.0693200 // # // # Expected score = -5.73, Entropy = 0.694 bits // # // # Lowest score = -35, Highest score = 60 // # // A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * // A 12 -10 -1 -1 -11 -4 0 4 -9 -4 -10 -8 -7 -17 4 5 6 -27 -17 0 -1 -1 -2 -35 // R -10 28 -3 -11 -17 4 -9 -15 5 -10 -16 13 -3 -21 -3 -3 -7 6 -21 -14 -7 -2 -6 -35 // N -1 -3 14 10 -18 1 5 0 8 -9 -15 4 -11 -17 -5 4 2 -19 -9 -11 12 3 -2 -35 // D -1 -11 10 20 -26 5 16 0 1 -13 -21 -2 -15 -28 -8 -1 -3 -32 -21 -13 16 12 -5 -35 // C -11 -17 -18 -26 43 -27 -27 -17 -16 -11 -30 -27 -26 -23 -15 -1 -12 -35 -2 -10 -22 -27 -16 -35 // Q -4 4 1 5 -27 23 11 -9 12 -12 -8 1 -5 -24 0 -5 -6 -24 -21 -11 3 17 -4 -35 // E 0 -9 5 16 -27 11 20 -2 0 -10 -17 -3 -12 -27 -6 -2 -5 -34 -20 -10 12 17 -5 -35 // G 4 -15 0 0 -17 -9 -2 22 -13 -15 -21 -11 -15 -22 -6 3 -3 -33 -26 -8 0 -5 -6 -35 // H -9 5 8 1 -16 12 0 -13 30 -14 -11 -4 -14 -10 -3 -6 -9 -14 -1 -12 4 7 -5 -35 // I -4 -10 -9 -13 -11 -12 -10 -15 -14 23 8 -10 8 2 -12 -9 0 -26 -8 16 -11 -11 -5 -35 // L -10 -16 -15 -21 -30 -8 -17 -21 -11 8 25 -15 14 4 -13 -15 -10 -10 -8 5 -18 -13 -8 -35 // K -8 13 4 -2 -27 1 -3 -11 -4 -10 -15 22 2 -26 -8 -3 -1 -19 -21 -14 1 -1 -6 -35 // M -7 -3 -11 -15 -26 -5 -12 -15 -14 8 14 2 34 -2 -12 -9 -4 -22 -16 6 -13 -8 -5 -35 // F -17 -21 -17 -28 -23 -24 -27 -22 -10 2 4 -26 -2 35 -22 -15 -16 -3 23 -9 -22 -26 -13 -35 // P 4 -3 -5 -8 -15 0 -6 -6 -3 -12 -13 -8 -12 -22 27 3 -1 -27 -25 -8 -7 -3 -5 -35 // S 5 -3 4 -1 -1 -5 -2 3 -6 -9 -15 -3 -9 -15 3 11 7 -11 -13 -7 2 -4 -2 -35 // T 6 -7 2 -3 -12 -6 -5 -3 -9 0 -10 -1 -4 -16 -1 7 16 -25 -13 0 -1 -6 -2 -35 // W -27 6 -19 -32 -35 -24 -34 -33 -14 -26 -10 -19 -22 -3 -27 -11 -25 60 -5 -31 -24 -29 -20 -35 // Y -17 -21 -9 -21 -2 -21 -20 -26 -1 -8 -8 -21 -16 23 -25 -13 -13 -5 39 -14 -14 -20 -13 -35 // V 0 -14 -11 -13 -10 -11 -10 -8 -12 16 5 -14 6 -9 -8 -7 0 -31 -14 21 -12 -10 -5 -35 // B -1 -7 12 16 -22 3 12 0 4 -11 -18 1 -13 -22 -7 2 -1 -24 -14 -12 15 9 -4 -35 // Z -1 -2 3 12 -27 17 17 -5 7 -11 -13 -1 -8 -26 -3 -4 -6 -29 -20 -10 9 17 -4 -35 // X -2 -6 -2 -5 -16 -4 -5 -6 -5 -5 -8 -6 -5 -13 -5 -2 -2 -20 -13 -5 -4 -4 -6 -35 // * -35 -35 -35 -35 -35 -35 -35 -35 -35 -35 -35 -35 -35 -35 -35 -35 -35 -35 -35 -35 -35 -35 -35 1 // PAM160_cdi = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 12, -1, -11, -1, 0, -17, 4, -9, -4, 0, -8, -10, -7, -1, 4, -4, -10, 5, 6, 0, -27, -2, -17, -1, -35}, {0, -1, 15, -22, 16, 12, -22, 0, 4, -11, 0, 1, -18, -13, 12, -7, 3, -7, 2, -1, -12, -24, -4, -14, 9, -35}, {0, -11, -22, 43, -26, -27, -23, -17, -16, -11, 0, -27, -30, -26, -18, -15, -27, -17, -1, -12, -10, -35, -16, -2, -27, -35}, {0, -1, 16, -26, 20, 16, -28, 0, 1, -13, 0, -2, -21, -15, 10, -8, 5, -11, -1, -3, -13, -32, -5, -21, 12, -35}, {0, 0, 12, -27, 16, 20, -27, -2, 0, -10, 0, -3, -17, -12, 5, -6, 11, -9, -2, -5, -10, -34, -5, -20, 17, -35}, {0, -17, -22, -23, -28, -27, 35, -22, -10, 2, 0, -26, 4, -2, -17, -22, -24, -21, -15, -16, -9, -3, -13, 23, -26, -35}, {0, 4, 0, -17, 0, -2, -22, 22, -13, -15, 0, -11, -21, -15, 0, -6, -9, -15, 3, -3, -8, -33, -6, -26, -5, -35}, {0, -9, 4, -16, 1, 0, -10, -13, 30, -14, 0, -4, -11, -14, 8, -3, 12, 5, -6, -9, -12, -14, -5, -1, 7, -35}, {0, -4, -11, -11, -13, -10, 2, -15, -14, 23, 0, -10, 8, 8, -9, -12, -12, -10, -9, 0, 16, -26, -5, -8, -11, -35}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, -8, 1, -27, -2, -3, -26, -11, -4, -10, 0, 22, -15, 2, 4, -8, 1, 13, -3, -1, -14, -19, -6, -21, -1, -35}, {0, -10, -18, -30, -21, -17, 4, -21, -11, 8, 0, -15, 25, 14, -15, -13, -8, -16, -15, -10, 5, -10, -8, -8, -13, -35}, {0, -7, -13, -26, -15, -12, -2, -15, -14, 8, 0, 2, 14, 34, -11, -12, -5, -3, -9, -4, 6, -22, -5, -16, -8, -35}, {0, -1, 12, -18, 10, 5, -17, 0, 8, -9, 0, 4, -15, -11, 14, -5, 1, -3, 4, 2, -11, -19, -2, -9, 3, -35}, {0, 4, -7, -15, -8, -6, -22, -6, -3, -12, 0, -8, -13, -12, -5, 27, 0, -3, 3, -1, -8, -27, -5, -25, -3, -35}, {0, -4, 3, -27, 5, 11, -24, -9, 12, -12, 0, 1, -8, -5, 1, 0, 23, 4, -5, -6, -11, -24, -4, -21, 17, -35}, {0, -10, -7, -17, -11, -9, -21, -15, 5, -10, 0, 13, -16, -3, -3, -3, 4, 28, -3, -7, -14, 6, -6, -21, -2, -35}, {0, 5, 2, -1, -1, -2, -15, 3, -6, -9, 0, -3, -15, -9, 4, 3, -5, -3, 11, 7, -7, -11, -2, -13, -4, -35}, {0, 6, -1, -12, -3, -5, -16, -3, -9, 0, 0, -1, -10, -4, 2, -1, -6, -7, 7, 16, 0, -25, -2, -13, -6, -35}, {0, 0, -12, -10, -13, -10, -9, -8, -12, 16, 0, -14, 5, 6, -11, -8, -11, -14, -7, 0, 21, -31, -5, -14, -10, -35}, {0, -27, -24, -35, -32, -34, -3, -33, -14, -26, 0, -19, -10, -22, -19, -27, -24, 6, -11, -25, -31, 60, -20, -5, -29, -35}, {0, -2, -4, -16, -5, -5, -13, -6, -5, -5, 0, -6, -8, -5, -2, -5, -4, -6, -2, -2, -5, -20, -6, -13, -4, -35}, {0, -17, -14, -2, -21, -20, 23, -26, -1, -8, 0, -21, -8, -16, -9, -25, -21, -21, -13, -13, -14, -5, -13, 39, -20, -35}, {0, -1, 9, -27, 12, 17, -26, -5, 7, -11, 0, -1, -13, -8, 3, -3, 17, -2, -4, -6, -10, -29, -4, -20, 17, -35}, {0, -35, -35, -35, -35, -35, -35, -35, -35, -35, 0, -35, -35, -35, -35, -35, -35, -35, -35, -35, -35, -35, -35, -35, -35, 1}, } // # // # This matrix was produced by "pam" Version 1.0.6 [28-Jul-93] // # // # PAM 170 substitution matrix, scale = ln(2)/3 = 0.231049 // # // # Expected score = -1.57, Entropy = 0.640 bits // # // # Lowest score = -10, Highest score = 18 // # // A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * // A 3 -3 0 0 -3 -1 0 1 -3 -1 -3 -2 -2 -5 1 2 2 -8 -5 0 0 0 -1 -10 // R -3 8 -1 -3 -5 1 -2 -4 2 -3 -4 4 -1 -6 -1 -1 -2 2 -6 -4 -2 0 -2 -10 // N 0 -1 4 3 -5 0 2 0 2 -3 -4 1 -3 -5 -1 1 0 -5 -3 -3 3 1 -1 -10 // D 0 -3 3 6 -7 2 5 0 0 -4 -6 -1 -4 -8 -2 0 -1 -9 -6 -4 5 4 -1 -10 // C -3 -5 -5 -7 13 -8 -8 -5 -5 -3 -9 -8 -7 -6 -4 0 -3 -10 0 -3 -6 -8 -4 -10 // Q -1 1 0 2 -8 6 3 -2 4 -3 -2 0 -1 -7 0 -1 -2 -7 -6 -3 1 5 -1 -10 // E 0 -2 2 5 -8 3 6 0 0 -3 -5 -1 -3 -8 -1 -1 -1 -10 -6 -3 3 5 -1 -10 // G 1 -4 0 0 -5 -2 0 6 -4 -4 -6 -3 -4 -6 -2 1 -1 -9 -7 -2 0 -1 -2 -10 // H -3 2 2 0 -5 4 0 -4 9 -4 -3 -1 -4 -3 -1 -2 -2 -4 0 -3 1 2 -1 -10 // I -1 -3 -3 -4 -3 -3 -3 -4 -4 7 2 -3 2 1 -3 -2 0 -7 -2 5 -3 -3 -1 -10 // L -3 -4 -4 -6 -9 -2 -5 -6 -3 2 7 -4 4 1 -4 -4 -3 -3 -2 2 -5 -4 -2 -10 // K -2 4 1 -1 -8 0 -1 -3 -1 -3 -4 6 1 -8 -2 -1 0 -5 -6 -4 0 0 -2 -10 // M -2 -1 -3 -4 -7 -1 -3 -4 -4 2 4 1 10 0 -3 -2 -1 -6 -4 2 -4 -2 -1 -10 // F -5 -6 -5 -8 -6 -7 -8 -6 -3 1 1 -8 0 10 -6 -4 -5 -1 7 -2 -6 -7 -4 -10 // P 1 -1 -1 -2 -4 0 -1 -2 -1 -3 -4 -2 -3 -6 8 1 0 -8 -7 -2 -2 -1 -1 -10 // S 2 -1 1 0 0 -1 -1 1 -2 -2 -4 -1 -2 -4 1 3 2 -3 -4 -2 1 -1 0 -10 // T 2 -2 0 -1 -3 -2 -1 -1 -2 0 -3 0 -1 -5 0 2 5 -7 -4 0 0 -1 -1 -10 // W -8 2 -5 -9 -10 -7 -10 -9 -4 -7 -3 -5 -6 -1 -8 -3 -7 18 -1 -9 -7 -8 -6 -10 // Y -5 -6 -3 -6 0 -6 -6 -7 0 -2 -2 -6 -4 7 -7 -4 -4 -1 12 -4 -4 -6 -4 -10 // V 0 -4 -3 -4 -3 -3 -3 -2 -3 5 2 -4 2 -2 -2 -2 0 -9 -4 6 -3 -3 -1 -10 // B 0 -2 3 5 -6 1 3 0 1 -3 -5 0 -4 -6 -2 1 0 -7 -4 -3 4 3 -1 -10 // Z 0 0 1 4 -8 5 5 -1 2 -3 -4 0 -2 -7 -1 -1 -1 -8 -6 -3 3 5 -1 -10 // X -1 -2 -1 -1 -4 -1 -1 -2 -1 -1 -2 -2 -1 -4 -1 0 -1 -6 -4 -1 -1 -1 -2 -10 // * -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 1 // PAM170 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 3, 0, -3, 0, 0, -5, 1, -3, -1, 0, -2, -3, -2, 0, 1, -1, -3, 2, 2, 0, -8, -1, -5, 0, -10}, {0, 0, 4, -6, 5, 3, -6, 0, 1, -3, 0, 0, -5, -4, 3, -2, 1, -2, 1, 0, -3, -7, -1, -4, 3, -10}, {0, -3, -6, 13, -7, -8, -6, -5, -5, -3, 0, -8, -9, -7, -5, -4, -8, -5, 0, -3, -3, -10, -4, 0, -8, -10}, {0, 0, 5, -7, 6, 5, -8, 0, 0, -4, 0, -1, -6, -4, 3, -2, 2, -3, 0, -1, -4, -9, -1, -6, 4, -10}, {0, 0, 3, -8, 5, 6, -8, 0, 0, -3, 0, -1, -5, -3, 2, -1, 3, -2, -1, -1, -3, -10, -1, -6, 5, -10}, {0, -5, -6, -6, -8, -8, 10, -6, -3, 1, 0, -8, 1, 0, -5, -6, -7, -6, -4, -5, -2, -1, -4, 7, -7, -10}, {0, 1, 0, -5, 0, 0, -6, 6, -4, -4, 0, -3, -6, -4, 0, -2, -2, -4, 1, -1, -2, -9, -2, -7, -1, -10}, {0, -3, 1, -5, 0, 0, -3, -4, 9, -4, 0, -1, -3, -4, 2, -1, 4, 2, -2, -2, -3, -4, -1, 0, 2, -10}, {0, -1, -3, -3, -4, -3, 1, -4, -4, 7, 0, -3, 2, 2, -3, -3, -3, -3, -2, 0, 5, -7, -1, -2, -3, -10}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, -2, 0, -8, -1, -1, -8, -3, -1, -3, 0, 6, -4, 1, 1, -2, 0, 4, -1, 0, -4, -5, -2, -6, 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-2 -6 0 -6 -6 -7 0 -2 -2 -6 -4 7 -7 -4 -4 -1 11 -4 -4 -6 -3 -10 // V 0 -4 -3 -3 -3 -3 -3 -2 -3 5 2 -4 2 -2 -2 -2 0 -8 -4 6 -3 -3 -1 -10 // B 0 -2 3 4 -6 1 3 0 1 -3 -5 0 -3 -6 -2 1 0 -7 -4 -3 4 3 -1 -10 // Z 0 0 1 3 -7 5 5 -1 2 -3 -3 0 -2 -7 -1 -1 -1 -8 -6 -3 3 5 -1 -10 // X -1 -2 -1 -1 -4 -1 -1 -2 -1 -1 -2 -1 -1 -3 -1 0 -1 -6 -3 -1 -1 -1 -1 -10 // * -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 1 // PAM180 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 3, 0, -3, 0, 0, -5, 1, -2, -1, 0, -2, -3, -2, 0, 1, -1, -3, 1, 2, 0, -8, -1, -5, 0, -10}, {0, 0, 4, -6, 4, 3, -6, 0, 1, -3, 0, 0, -5, -3, 3, -2, 1, -2, 1, 0, -3, -7, -1, -4, 3, -10}, {0, -3, -6, 13, -7, -7, -6, -5, -4, -3, 0, -7, -8, -7, -5, -4, -7, -5, 0, -3, -3, -10, -4, 0, -7, -10}, {0, 0, 4, -7, 5, 4, -8, 0, 0, -3, 0, 0, -6, -4, 3, -2, 2, -3, 0, -1, -3, -9, -1, -6, 3, -10}, {0, 0, 3, -7, 4, 5, -7, 0, 0, -3, 0, -1, -5, -3, 2, -1, 3, -2, -1, 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-7, 2, 3, -6, -2, 4, -3, 0, 0, -2, -1, 0, 0, 6, 1, -1, -2, -3, -6, -1, -6, 5, -10}, {0, -3, -2, -5, -3, -2, -6, -4, 2, -3, 0, 4, -4, -1, -1, -1, 1, 8, -1, -2, -4, 2, -2, -6, 0, -10}, {0, 1, 1, 0, 0, -1, -4, 1, -2, -2, 0, -1, -4, -2, 1, 1, -1, -1, 3, 2, -2, -3, 0, -4, -1, -10}, {0, 2, 0, -3, -1, -1, -4, -1, -2, 0, 0, 0, -3, -1, 0, 0, -2, -2, 2, 4, 0, -7, -1, -4, -1, -10}, {0, 0, -3, -3, -3, -3, -2, -2, -3, 5, 0, -4, 2, 2, -3, -2, -3, -4, -2, 0, 6, -8, -1, -4, -3, -10}, {0, -8, -7, -10, -9, -9, 0, -9, -4, -7, 0, -5, -3, -6, -5, -7, -6, 2, -3, -7, -8, 18, -6, -1, -8, -10}, {0, -1, -1, -4, -1, -1, -3, -2, -1, -1, 0, -1, -2, -1, -1, -1, -1, -2, 0, -1, -1, -6, -1, -3, -1, -10}, {0, -5, -4, 0, -6, -6, 7, -7, 0, -2, 0, -6, -2, -4, -2, -7, -6, -6, -4, -4, -4, -1, -3, 11, -6, -10}, {0, 0, 3, -7, 3, 5, -7, -1, 2, -3, 0, 0, -3, -2, 1, -1, 5, 0, -1, -1, -3, -8, -1, -6, 5, -10}, {0, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, 0, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, 1}, } // # // # This matrix was produced by "pam" Version 1.0.6 [28-Jul-93] // # // # PAM 190 substitution matrix, scale = ln(2)/3 = 0.231049 // # // # Expected score = -1.35, Entropy = 0.547 bits // # // # Lowest score = -9, Highest score = 18 // # // A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * // A 3 -2 0 0 -3 -1 0 1 -2 -1 -3 -2 -2 -5 1 1 2 -7 -4 0 0 0 0 -9 // R -2 8 -1 -2 -5 1 -2 -4 2 -3 -4 4 -1 -6 0 -1 -2 2 -5 -3 -1 0 -1 -9 // N 0 -1 3 3 -5 1 2 0 2 -2 -4 1 -3 -4 -1 1 0 -5 -2 -3 3 1 -1 -9 // D 0 -2 3 5 -7 2 4 0 0 -3 -5 0 -4 -7 -2 0 -1 -8 -5 -3 4 3 -1 -9 // C -3 -5 -5 -7 13 -7 -7 -4 -4 -3 -8 -7 -7 -6 -4 0 -3 -9 0 -3 -6 -7 -4 -9 // Q -1 1 1 2 -7 6 3 -2 3 -3 -2 1 -1 -6 0 -1 -1 -6 -5 -3 1 4 -1 -9 // E 0 -2 2 4 -7 3 5 0 0 -3 -4 -1 -3 -7 -1 0 -1 -9 -5 -3 3 4 -1 -9 // G 1 -4 0 0 -4 -2 0 6 -3 -4 -5 -3 -4 -6 -1 1 -1 -9 -7 -2 0 -1 -1 -9 // H -2 2 2 0 -4 3 0 -3 8 -3 -3 -1 -3 -2 -1 -1 -2 -3 0 -3 1 2 -1 -9 // I -1 -3 -2 -3 -3 -3 -3 -4 -3 6 2 -3 2 1 -3 -2 0 -7 -2 4 -3 -3 -1 -9 // L -3 -4 -4 -5 -8 -2 -4 -5 -3 2 7 -4 4 2 -3 -4 -2 -3 -2 2 -5 -3 -2 -9 // K -2 4 1 0 -7 1 -1 -3 -1 -3 -4 6 1 -7 -2 0 0 -5 -6 -3 0 0 -1 -9 // M -2 -1 -3 -4 -7 -1 -3 -4 -3 2 4 1 9 0 -3 -2 -1 -6 -4 2 -3 -2 -1 -9 // F -5 -6 -4 -7 -6 -6 -7 -6 -2 1 2 -7 0 10 -6 -4 -4 0 7 -2 -6 -7 -3 -9 // P 1 0 -1 -2 -4 0 -1 -1 -1 -3 -3 -2 -3 -6 7 1 0 -7 -6 -2 -1 -1 -1 -9 // S 1 -1 1 0 0 -1 0 1 -1 -2 -4 0 -2 -4 1 3 2 -3 -4 -2 1 -1 0 -9 // T 2 -2 0 -1 -3 -1 -1 -1 -2 0 -2 0 -1 -4 0 2 4 -6 -3 0 0 -1 0 -9 // W -7 2 -5 -8 -9 -6 -9 -9 -3 -7 -3 -5 -6 0 -7 -3 -6 18 -1 -8 -6 -7 -5 -9 // Y -4 -5 -2 -5 0 -5 -5 -7 0 -2 -2 -6 -4 7 -6 -4 -3 -1 11 -3 -4 -5 -3 -9 // V 0 -3 -3 -3 -3 -3 -3 -2 -3 4 2 -3 2 -2 -2 -2 0 -8 -3 6 -3 -3 -1 -9 // B 0 -1 3 4 -6 1 3 0 1 -3 -5 0 -3 -6 -1 1 0 -6 -4 -3 4 2 -1 -9 // Z 0 0 1 3 -7 4 4 -1 2 -3 -3 0 -2 -7 -1 -1 -1 -7 -5 -3 2 4 -1 -9 // X 0 -1 -1 -1 -4 -1 -1 -1 -1 -1 -2 -1 -1 -3 -1 0 0 -5 -3 -1 -1 -1 -1 -9 // * -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 1 // PAM190 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 3, 0, -3, 0, 0, -5, 1, -2, -1, 0, -2, -3, -2, 0, 1, -1, -2, 1, 2, 0, -7, 0, -4, 0, -9}, {0, 0, 4, -6, 4, 3, -6, 0, 1, -3, 0, 0, -5, -3, 3, -1, 1, -1, 1, 0, -3, -6, -1, -4, 2, -9}, {0, -3, -6, 13, -7, -7, -6, -4, -4, -3, 0, -7, -8, -7, -5, -4, -7, -5, 0, -3, -3, -9, -4, 0, -7, -9}, {0, 0, 4, -7, 5, 4, -7, 0, 0, -3, 0, 0, -5, -4, 3, -2, 2, -2, 0, -1, -3, -8, -1, -5, 3, -9}, {0, 0, 3, -7, 4, 5, -7, 0, 0, -3, 0, -1, -4, -3, 2, -1, 3, -2, 0, -1, -3, -9, -1, -5, 4, -9}, {0, -5, -6, -6, -7, -7, 10, -6, -2, 1, 0, -7, 2, 0, -4, -6, -6, -6, -4, -4, -2, 0, -3, 7, -7, -9}, {0, 1, 0, -4, 0, 0, -6, 6, -3, -4, 0, -3, -5, -4, 0, -1, -2, -4, 1, -1, -2, -9, -1, -7, -1, -9}, {0, -2, 1, -4, 0, 0, -2, -3, 8, -3, 0, -1, -3, -3, 2, -1, 3, 2, -1, -2, -3, -3, -1, 0, 2, -9}, {0, -1, -3, -3, -3, -3, 1, -4, -3, 6, 0, -3, 2, 2, -2, -3, -3, -3, -2, 0, 4, -7, -1, -2, -3, -9}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 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-4 -4 -19 // D -4 -12 1 8 -16 -4 2 -4 -5 -9 -15 -6 -13 -17 -9 -5 -6 -17 -13 -9 6 0 -7 -19 // C -8 -9 -13 -16 10 -16 -16 -11 -8 -7 -17 -16 -16 -15 -9 -4 -9 -18 -5 -7 -14 -16 -11 -19 // Q -5 -2 -5 -4 -16 9 0 -8 0 -9 -6 -4 -5 -15 -4 -6 -7 -15 -14 -8 -4 7 -6 -19 // E -3 -11 -3 2 -16 0 8 -5 -6 -6 -10 -5 -8 -16 -7 -5 -7 -19 -9 -8 0 6 -6 -19 // G -3 -11 -4 -4 -11 -8 -5 7 -10 -13 -12 -8 -10 -10 -7 -3 -7 -17 -16 -7 -4 -6 -6 -19 // H -8 -3 -1 -5 -8 0 -6 -10 9 -11 -7 -8 -13 -7 -5 -7 -8 -8 -4 -7 -2 -2 -6 -19 // I -6 -6 -6 -9 -7 -9 -6 -13 -11 9 -2 -7 -2 -3 -10 -8 -3 -16 -7 1 -7 -7 -6 -19 // L -7 -10 -8 -15 -17 -6 -10 -12 -7 -2 7 -9 0 -4 -8 -9 -8 -7 -8 -3 -10 -8 -7 -19 // K -8 -1 -2 -6 -16 -4 -5 -8 -8 -7 -9 7 -3 -16 -8 -5 -4 -14 -10 -10 -3 -5 -6 -19 // M -6 -5 -11 -13 -16 -5 -8 -10 -13 -2 0 -3 11 -5 -9 -6 -5 -15 -13 -2 -12 -6 -6 -19 // F -9 -10 -10 -17 -15 -15 -16 -10 -7 -3 -4 -16 -5 9 -11 -7 -10 -6 1 -9 -12 -16 -9 -19 // P -2 -5 -7 -9 -9 -4 -7 -7 -5 -10 -8 -8 -9 -11 8 -3 -5 -16 -16 -7 -8 -5 -6 -19 // S -1 -4 -1 -5 -4 -6 -5 -3 -7 -8 -9 -5 -6 -7 -3 7 0 -6 -8 -8 -2 -6 -4 -19 // T -1 -8 -3 -6 -9 -7 -7 -7 -8 -3 -8 -4 -5 -10 -5 0 7 -15 -7 -4 -4 -7 -5 -19 // W -16 -3 -9 -17 -18 -15 -19 -17 -8 -16 -7 -14 -15 -6 -16 -6 -15 13 -6 -18 -11 -17 -13 -19 // Y -9 -11 -5 -13 -5 -14 -9 -16 -4 -7 -8 -10 -13 1 -16 -8 -7 -6 10 -8 -7 -11 -9 -19 // V -3 -9 -9 -9 -7 -8 -8 -7 -7 1 -3 -10 -2 -9 -7 -8 -4 -18 -8 7 -9 -8 -6 -19 // B -5 -9 6 6 -14 -4 0 -4 -2 -7 -10 -3 -12 -12 -8 -2 -4 -11 -7 -9 6 -1 -6 -19 // Z -4 -5 -4 0 -16 7 6 -6 -2 -7 -8 -5 -6 -16 -5 -6 -7 -17 -11 -8 -1 6 -6 -19 // X -4 -7 -4 -7 -11 -6 -6 -6 -6 -6 -7 -6 -6 -9 -6 -4 -5 -13 -9 -6 -6 -6 -6 -19 // * -19 -19 -19 -19 -19 -19 -19 -19 -19 -19 -19 -19 -19 -19 -19 -19 -19 -19 -19 -19 -19 -19 -19 1 // PAM20 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 6, -5, -8, -4, -3, -9, -3, -8, -6, 0, -8, -7, -6, -5, -2, -5, -8, -1, -1, -3, -16, -4, -9, -4, -19}, {0, -5, 6, -14, 6, 0, -12, -4, -2, -7, 0, -3, -10, -12, 6, -8, -4, -9, -2, -4, -9, -11, -6, -7, -1, -19}, {0, -8, -14, 10, -16, -16, -15, -11, -8, -7, 0, -16, -17, -16, -13, -9, -16, -9, -4, -9, -7, -18, -11, -5, -16, -19}, {0, -4, 6, -16, 8, 2, -17, -4, -5, -9, 0, -6, -15, -13, 1, -9, -4, -12, -5, -6, -9, -17, -7, -13, 0, -19}, {0, -3, 0, -16, 2, 8, -16, -5, -6, -6, 0, -5, -10, -8, -3, -7, 0, -11, -5, -7, -8, -19, -6, -9, 6, -19}, {0, -9, -12, -15, -17, -16, 9, -10, -7, -3, 0, -16, -4, -5, -10, -11, -15, -10, -7, -10, -9, -6, -9, 1, -16, -19}, {0, -3, -4, -11, -4, -5, -10, 7, -10, -13, 0, -8, -12, -10, -4, -7, -8, -11, -3, -7, -7, -17, -6, -16, -6, -19}, {0, -8, -2, -8, -5, -6, -7, -10, 9, -11, 0, -8, -7, -13, -1, -5, 0, -3, -7, -8, -7, -8, -6, -4, -2, -19}, {0, -6, -7, -7, -9, -6, -3, -13, -11, 9, 0, -7, -2, -2, -6, -10, -9, -6, -8, -3, 1, -16, -6, -7, -7, -19}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, -8, -3, -16, -6, -5, -16, -8, -8, -7, 0, 7, -9, -3, -2, -8, -4, -1, -5, -4, -10, -14, -6, -10, -5, -19}, {0, -7, -10, -17, -15, -10, -4, -12, -7, -2, 0, -9, 7, 0, -8, -8, -6, -10, -9, -8, -3, -7, -7, -8, -8, -19}, {0, -6, -12, -16, -13, -8, -5, -10, -13, -2, 0, -3, 0, 11, -11, -9, -5, -5, -6, -5, -2, -15, -6, -13, -6, -19}, {0, -5, 6, -13, 1, -3, -10, -4, -1, -6, 0, -2, -8, -11, 8, -7, -5, -7, -1, -3, -9, -9, -4, -5, -4, -19}, {0, -2, -8, -9, -9, -7, -11, -7, -5, -10, 0, -8, -8, -9, -7, 8, -4, -5, -3, -5, -7, -16, -6, -16, -5, -19}, {0, -5, -4, -16, -4, 0, -15, -8, 0, -9, 0, -4, -6, -5, -5, -4, 9, -2, -6, -7, -8, -15, -6, -14, 7, -19}, {0, -8, -9, -9, -12, -11, -10, -11, -3, -6, 0, -1, -10, -5, -7, -5, -2, 9, -4, -8, -9, -3, -7, -11, -5, -19}, {0, -1, -2, -4, -5, -5, -7, -3, -7, -8, 0, -5, -9, -6, -1, -3, -6, -4, 7, 0, -8, -6, -4, -8, -6, -19}, {0, -1, -4, -9, -6, -7, -10, -7, -8, -3, 0, -4, -8, -5, -3, -5, -7, -8, 0, 7, -4, -15, -5, -7, -7, -19}, {0, -3, -9, -7, -9, -8, -9, -7, -7, 1, 0, -10, -3, -2, -9, -7, -8, -9, -8, -4, 7, -18, -6, -8, -8, -19}, {0, -16, -11, -18, -17, -19, -6, -17, -8, -16, 0, -14, -7, -15, -9, -16, -15, -3, -6, -15, -18, 13, -13, -6, -17, -19}, {0, -4, -6, -11, -7, -6, -9, -6, -6, -6, 0, -6, -7, -6, -4, -6, -6, -7, -4, -5, -6, -13, -6, -9, -6, -19}, {0, -9, -7, -5, -13, -9, 1, -16, -4, -7, 0, -10, -8, -13, -5, -16, -14, -11, -8, -7, -8, -6, -9, 10, -11, -19}, {0, -4, -1, -16, 0, 6, -16, -6, -2, -7, 0, -5, -8, -6, -4, -5, 7, -5, -6, -7, -8, -17, -6, -11, 6, -19}, {0, -19, -19, -19, -19, -19, -19, -19, -19, -19, 0, -19, -19, -19, -19, -19, -19, -19, -19, -19, -19, -19, -19, -19, -19, 1}, } // # // # This matrix was produced by "pam" Version 1.0.6 [28-Jul-93] // # // # PAM 200 substitution matrix, scale = ln(2)/3 = 0.231049 // # // # Expected score = -1.23, Entropy = 0.507 bits // # // # Lowest score = -9, Highest score = 18 // # // A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * // A 3 -2 0 0 -3 -1 0 1 -2 -1 -2 -2 -2 -4 1 1 1 -7 -4 0 0 0 0 -9 // R -2 7 0 -2 -4 1 -2 -4 2 -2 -4 4 -1 -5 0 -1 -1 2 -5 -3 -1 0 -1 -9 // N 0 0 3 3 -5 1 2 0 2 -2 -4 1 -2 -4 -1 1 0 -5 -2 -2 3 1 0 -9 // D 0 -2 3 5 -6 2 4 0 0 -3 -5 0 -4 -7 -2 0 0 -8 -5 -3 4 3 -1 -9 // C -3 -4 -5 -6 12 -7 -7 -4 -4 -3 -7 -7 -6 -6 -4 0 -3 -9 0 -2 -5 -7 -4 -9 // Q -1 1 1 2 -7 5 3 -2 3 -3 -2 1 -1 -6 0 -1 -1 -6 -5 -3 1 4 -1 -9 // E 0 -2 2 4 -7 3 5 0 0 -3 -4 0 -3 -7 -1 0 -1 -9 -5 -2 3 4 -1 -9 // G 1 -4 0 0 -4 -2 0 6 -3 -3 -5 -2 -4 -6 -1 1 0 -8 -6 -2 0 -1 -1 -9 // H -2 2 2 0 -4 3 0 -3 8 -3 -3 -1 -3 -2 -1 -1 -2 -3 0 -3 1 2 -1 -9 // I -1 -2 -2 -3 -3 -3 -3 -3 -3 6 2 -2 2 1 -3 -2 0 -6 -2 4 -3 -3 -1 -9 // L -2 -4 -4 -5 -7 -2 -4 -5 -3 2 7 -4 4 2 -3 -4 -2 -2 -2 2 -4 -3 -2 -9 // K -2 4 1 0 -7 1 0 -2 -1 -2 -4 6 1 -7 -2 0 0 -4 -5 -3 0 0 -1 -9 // M -2 -1 -2 -4 -6 -1 -3 -4 -3 2 4 1 8 0 -3 -2 -1 -5 -3 2 -3 -2 -1 -9 // F -4 -5 -4 -7 -6 -6 -7 -6 -2 1 2 -7 0 10 -6 -4 -4 0 7 -2 -6 -6 -3 -9 // P 1 0 -1 -2 -4 0 -1 -1 -1 -3 -3 -2 -3 -6 7 1 0 -7 -6 -2 -1 -1 -1 -9 // S 1 -1 1 0 0 -1 0 1 -1 -2 -4 0 -2 -4 1 2 2 -3 -3 -1 1 -1 0 -9 // T 1 -1 0 0 -3 -1 -1 0 -2 0 -2 0 -1 -4 0 2 4 -6 -3 0 0 -1 0 -9 // W -7 2 -5 -8 -9 -6 -9 -8 -3 -6 -2 -4 -5 0 -7 -3 -6 18 -1 -8 -6 -7 -5 -9 // Y -4 -5 -2 -5 0 -5 -5 -6 0 -2 -2 -5 -3 7 -6 -3 -3 -1 11 -3 -4 -5 -3 -9 // V 0 -3 -2 -3 -2 -3 -2 -2 -3 4 2 -3 2 -2 -2 -1 0 -8 -3 5 -3 -2 -1 -9 // B 0 -1 3 4 -5 1 3 0 1 -3 -4 0 -3 -6 -1 1 0 -6 -4 -3 3 2 -1 -9 // Z 0 0 1 3 -7 4 4 -1 2 -3 -3 0 -2 -6 -1 -1 -1 -7 -5 -2 2 4 -1 -9 // X 0 -1 0 -1 -4 -1 -1 -1 -1 -1 -2 -1 -1 -3 -1 0 0 -5 -3 -1 -1 -1 -1 -9 // * -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 1 // PAM200 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 3, 0, -3, 0, 0, -4, 1, -2, -1, 0, -2, -2, -2, 0, 1, -1, -2, 1, 1, 0, -7, 0, -4, 0, -9}, {0, 0, 3, -5, 4, 3, -6, 0, 1, -3, 0, 0, -4, -3, 3, -1, 1, -1, 1, 0, -3, -6, -1, -4, 2, -9}, {0, -3, -5, 12, -6, -7, -6, -4, -4, -3, 0, -7, -7, -6, -5, -4, -7, -4, 0, -3, -2, -9, -4, 0, -7, -9}, {0, 0, 4, -6, 5, 4, -7, 0, 0, -3, 0, 0, -5, -4, 3, -2, 2, -2, 0, 0, -3, -8, -1, -5, 3, -9}, {0, 0, 3, -7, 4, 5, -7, 0, 0, -3, 0, 0, -4, -3, 2, -1, 3, -2, 0, -1, -2, -9, -1, -5, 4, -9}, {0, -4, -6, -6, -7, -7, 10, -6, -2, 1, 0, -7, 2, 0, -4, -6, -6, -5, -4, -4, -2, 0, -3, 7, -6, -9}, {0, 1, 0, -4, 0, 0, -6, 6, -3, -3, 0, -2, -5, -4, 0, -1, -2, -4, 1, 0, -2, -8, -1, -6, -1, -9}, {0, -2, 1, -4, 0, 0, -2, -3, 8, -3, 0, -1, -3, -3, 2, -1, 3, 2, -1, -2, -3, -3, -1, 0, 2, -9}, {0, -1, -3, -3, -3, -3, 1, -3, -3, 6, 0, -2, 2, 2, -2, -3, -3, -2, -2, 0, 4, -6, -1, -2, -3, -9}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, -2, 0, -7, 0, 0, -7, -2, -1, -2, 0, 6, -4, 1, 1, -2, 1, 4, 0, 0, -3, -4, -1, -5, 0, -9}, {0, -2, -4, -7, -5, -4, 2, -5, -3, 2, 0, -4, 7, 4, -4, -3, -2, -4, -4, -2, 2, -2, -2, -2, -3, -9}, {0, -2, -3, -6, -4, -3, 0, -4, -3, 2, 0, 1, 4, 8, -2, -3, -1, -1, -2, -1, 2, -5, -1, -3, -2, -9}, {0, 0, 3, -5, 3, 2, -4, 0, 2, -2, 0, 1, -4, -2, 3, -1, 1, 0, 1, 0, -2, -5, 0, -2, 1, -9}, {0, 1, -1, -4, -2, -1, -6, -1, -1, -3, 0, -2, -3, -3, -1, 7, 0, 0, 1, 0, -2, -7, -1, -6, -1, -9}, {0, -1, 1, -7, 2, 3, -6, -2, 3, -3, 0, 1, -2, -1, 1, 0, 5, 1, -1, -1, -3, -6, -1, -5, 4, -9}, {0, -2, -1, -4, -2, -2, -5, -4, 2, -2, 0, 4, -4, -1, 0, 0, 1, 7, -1, -1, -3, 2, -1, -5, 0, -9}, {0, 1, 1, 0, 0, 0, -4, 1, -1, -2, 0, 0, -4, -2, 1, 1, -1, -1, 2, 2, -1, -3, 0, -3, -1, -9}, {0, 1, 0, -3, 0, -1, -4, 0, -2, 0, 0, 0, -2, -1, 0, 0, -1, -1, 2, 4, 0, -6, 0, -3, -1, -9}, {0, 0, -3, -2, -3, -2, -2, -2, -3, 4, 0, -3, 2, 2, -2, -2, -3, -3, -1, 0, 5, -8, -1, -3, -2, -9}, {0, -7, -6, -9, -8, -9, 0, -8, -3, -6, 0, -4, -2, -5, -5, -7, -6, 2, -3, -6, -8, 18, -5, -1, -7, -9}, {0, 0, -1, -4, -1, -1, -3, -1, -1, -1, 0, -1, -2, -1, 0, -1, -1, -1, 0, 0, -1, -5, -1, -3, -1, -9}, {0, -4, -4, 0, -5, -5, 7, -6, 0, -2, 0, -5, -2, -3, -2, -6, -5, -5, -3, -3, -3, -1, -3, 11, -5, -9}, {0, 0, 2, -7, 3, 4, -6, -1, 2, -3, 0, 0, -3, -2, 1, -1, 4, 0, -1, -1, -2, -7, -1, -5, 4, -9}, {0, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, 0, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, 1}, } // # // # This matrix was produced by "pam" Version 1.0.6 [28-Jul-93] // # // # PAM 200 substitution matrix, scale = 0.0693200 // # // # Expected score = -4.12, Entropy = 0.507 bits // # // # Lowest score = -30, Highest score = 59 // # // A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * // A 9 -7 0 0 -9 -3 1 4 -7 -3 -8 -6 -5 -14 4 5 5 -23 -14 1 0 -1 -1 -30 // R -7 24 -1 -7 -15 4 -6 -12 5 -8 -13 12 -2 -18 -1 -2 -5 7 -17 -11 -4 -1 -4 -30 // N 0 -1 10 9 -15 2 5 1 7 -8 -12 4 -8 -14 -3 3 2 -16 -8 -8 9 4 -2 -30 // D 0 -7 9 16 -21 6 14 1 2 -10 -17 -1 -12 -23 -5 0 -2 -27 -17 -10 13 11 -4 -30 // C -9 -15 -15 -21 41 -22 -22 -14 -14 -9 -25 -22 -22 -18 -12 -1 -10 -30 0 -8 -18 -22 -13 -30 // Q -3 4 2 6 -22 18 10 -6 11 -9 -7 2 -4 -19 0 -3 -4 -20 -17 -8 4 14 -3 -30 // E 1 -6 5 14 -22 10 16 0 1 -9 -14 -1 -9 -22 -4 -1 -3 -28 -17 -8 10 14 -3 -30 // G 4 -12 1 1 -14 -6 0 19 -10 -12 -17 -8 -12 -19 -3 4 -1 -28 -22 -6 1 -3 -4 -30 // H -7 5 7 2 -14 11 1 -10 26 -11 -9 -2 -10 -8 -2 -4 -6 -11 -1 -10 4 7 -3 -30 // I -3 -8 -8 -10 -9 -9 -9 -12 -11 19 8 -8 8 3 -9 -6 0 -21 -5 14 -9 -9 -3 -30 // L -8 -13 -12 -17 -25 -7 -14 -17 -9 8 22 -12 13 5 -11 -12 -8 -8 -5 6 -15 -11 -6 -30 // K -6 12 4 -1 -22 2 -1 -8 -2 -8 -12 19 2 -22 -6 -1 -1 -15 -18 -11 1 0 -4 -30 // M -5 -2 -8 -12 -22 -4 -9 -12 -10 8 13 2 28 -1 -9 -7 -3 -18 -12 6 -10 -7 -3 -30 // F -14 -18 -14 -23 -18 -19 -22 -19 -8 3 5 -22 -1 33 -18 -13 -13 -1 23 -6 -18 -21 -10 -30 // P 4 -1 -3 -5 -12 0 -4 -3 -2 -9 -11 -6 -9 -18 23 3 0 -23 -20 -6 -4 -2 -3 -30 // S 5 -2 3 0 -1 -3 -1 4 -4 -6 -12 -1 -7 -13 3 8 6 -9 -11 -5 2 -2 -1 -30 // T 5 -5 2 -2 -10 -4 -3 -1 -6 0 -8 -1 -3 -13 0 6 12 -21 -11 1 0 -3 -1 -30 // W -23 7 -16 -27 -30 -20 -28 -28 -11 -21 -8 -15 -18 -1 -23 -9 -21 59 -2 -26 -21 -24 -17 -30 // Y -14 -17 -8 -17 0 -17 -17 -22 -1 -5 -5 -18 -12 23 -20 -11 -11 -2 37 -11 -12 -17 -10 -30 // V 1 -11 -8 -10 -8 -8 -8 -6 -10 14 6 -11 6 -6 -6 -5 1 -26 -11 18 -9 -8 -3 -30 // B 0 -4 9 13 -18 4 10 1 4 -9 -15 1 -10 -18 -4 2 0 -21 -12 -9 12 8 -3 -30 // Z -1 -1 4 11 -22 14 14 -3 7 -9 -11 0 -7 -21 -2 -2 -3 -24 -17 -8 8 14 -3 -30 // X -1 -4 -2 -4 -13 -3 -3 -4 -3 -3 -6 -4 -3 -10 -3 -1 -1 -17 -10 -3 -3 -3 -4 -30 // * -30 -30 -30 -30 -30 -30 -30 -30 -30 -30 -30 -30 -30 -30 -30 -30 -30 -30 -30 -30 -30 -30 -30 1 // PAM200_cdi = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 9, 0, -9, 0, 1, -14, 4, -7, -3, 0, -6, -8, -5, 0, 4, -3, -7, 5, 5, 1, -23, -1, -14, -1, -30}, {0, 0, 12, -18, 13, 10, -18, 1, 4, -9, 0, 1, -15, -10, 9, -4, 4, -4, 2, 0, -9, -21, -3, -12, 8, -30}, {0, -9, -18, 41, -21, -22, -18, -14, -14, -9, 0, -22, -25, -22, -15, -12, -22, -15, -1, -10, -8, -30, -13, 0, -22, -30}, {0, 0, 13, -21, 16, 14, -23, 1, 2, -10, 0, -1, -17, -12, 9, -5, 6, -7, 0, -2, -10, -27, -4, -17, 11, -30}, {0, 1, 10, -22, 14, 16, -22, 0, 1, -9, 0, -1, -14, -9, 5, -4, 10, -6, -1, -3, -8, -28, -3, -17, 14, -30}, {0, -14, -18, -18, -23, -22, 33, -19, -8, 3, 0, -22, 5, -1, -14, -18, -19, -18, -13, -13, -6, -1, -10, 23, -21, -30}, {0, 4, 1, -14, 1, 0, -19, 19, -10, -12, 0, -8, -17, -12, 1, -3, -6, -12, 4, -1, -6, -28, -4, -22, -3, -30}, {0, -7, 4, -14, 2, 1, -8, -10, 26, -11, 0, -2, -9, -10, 7, -2, 11, 5, -4, -6, -10, -11, -3, -1, 7, -30}, {0, -3, -9, -9, -10, -9, 3, -12, -11, 19, 0, -8, 8, 8, -8, -9, -9, -8, -6, 0, 14, -21, -3, -5, -9, -30}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, -6, 1, -22, -1, -1, -22, -8, -2, -8, 0, 19, -12, 2, 4, -6, 2, 12, -1, -1, -11, -15, -4, -18, 0, -30}, {0, -8, -15, -25, -17, -14, 5, -17, -9, 8, 0, -12, 22, 13, -12, -11, -7, -13, -12, -8, 6, -8, -6, -5, -11, -30}, {0, -5, -10, -22, -12, -9, -1, -12, -10, 8, 0, 2, 13, 28, -8, -9, -4, -2, -7, -3, 6, -18, -3, -12, -7, -30}, {0, 0, 9, -15, 9, 5, -14, 1, 7, -8, 0, 4, -12, -8, 10, -3, 2, -1, 3, 2, -8, -16, -2, -8, 4, -30}, {0, 4, -4, -12, -5, -4, -18, -3, -2, -9, 0, -6, -11, -9, -3, 23, 0, -1, 3, 0, -6, -23, -3, -20, -2, -30}, {0, -3, 4, -22, 6, 10, -19, -6, 11, -9, 0, 2, -7, -4, 2, 0, 18, 4, -3, -4, -8, -20, -3, -17, 14, -30}, {0, -7, -4, -15, -7, -6, -18, -12, 5, -8, 0, 12, -13, -2, -1, -1, 4, 24, -2, -5, -11, 7, -4, -17, -1, -30}, {0, 5, 2, -1, 0, -1, -13, 4, -4, -6, 0, -1, -12, -7, 3, 3, -3, -2, 8, 6, -5, -9, -1, -11, -2, -30}, {0, 5, 0, -10, -2, -3, -13, -1, -6, 0, 0, -1, -8, -3, 2, 0, -4, -5, 6, 12, 1, -21, -1, -11, -3, -30}, {0, 1, -9, -8, -10, -8, -6, -6, -10, 14, 0, -11, 6, 6, -8, -6, -8, -11, -5, 1, 18, -26, -3, -11, -8, -30}, {0, -23, -21, -30, -27, -28, -1, -28, -11, -21, 0, -15, -8, -18, -16, -23, -20, 7, -9, -21, -26, 59, -17, -2, -24, -30}, {0, -1, -3, -13, -4, -3, -10, -4, -3, -3, 0, -4, -6, -3, -2, -3, -3, -4, -1, -1, -3, -17, -4, -10, -3, -30}, {0, -14, -12, 0, -17, -17, 23, -22, -1, -5, 0, -18, -5, -12, -8, -20, -17, -17, -11, -11, -11, -2, -10, 37, -17, -30}, {0, -1, 8, -22, 11, 14, -21, -3, 7, -9, 0, 0, -11, -7, 4, -2, 14, -1, -2, -3, -8, -24, -3, -17, 14, -30}, {0, -30, -30, -30, -30, -30, -30, -30, -30, -30, 0, -30, -30, -30, -30, -30, -30, -30, -30, -30, -30, -30, -30, -30, -30, 1}, } // # // # This matrix was produced by "pam" Version 1.0.6 [28-Jul-93] // # // # PAM 210 substitution matrix, scale = ln(2)/3 = 0.231049 // # // # Expected score = -1.12, Entropy = 0.470 bits // # // # Lowest score = -9, Highest score = 18 // # // A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * // A 2 -2 0 0 -2 -1 0 1 -2 -1 -2 -2 -1 -4 1 1 1 -7 -4 0 0 0 0 -9 // R -2 7 0 -2 -4 1 -2 -3 2 -2 -4 4 -1 -5 0 0 -1 2 -5 -3 -1 0 -1 -9 // N 0 0 3 2 -4 1 2 0 2 -2 -3 1 -2 -4 -1 1 0 -5 -2 -2 3 1 0 -9 // D 0 -2 2 5 -6 2 4 0 1 -3 -5 0 -3 -7 -1 0 0 -8 -5 -3 4 3 -1 -9 // C -2 -4 -4 -6 12 -6 -6 -4 -4 -3 -7 -6 -6 -5 -3 0 -3 -9 0 -2 -5 -6 -4 -9 // Q -1 1 1 2 -6 5 3 -2 3 -3 -2 1 -1 -6 0 -1 -1 -6 -5 -2 1 4 -1 -9 // E 0 -2 2 4 -6 3 5 0 0 -2 -4 0 -3 -6 -1 0 -1 -8 -5 -2 3 4 -1 -9 // G 1 -3 0 0 -4 -2 0 5 -3 -3 -5 -2 -3 -5 -1 1 0 -8 -6 -2 0 -1 -1 -9 // H -2 2 2 1 -4 3 0 -3 8 -3 -2 0 -3 -2 0 -1 -2 -3 0 -3 1 2 -1 -9 // I -1 -2 -2 -3 -3 -3 -2 -3 -3 5 2 -2 2 1 -3 -2 0 -6 -1 4 -3 -3 -1 -9 // L -2 -4 -3 -5 -7 -2 -4 -5 -2 2 7 -3 4 2 -3 -3 -2 -2 -1 2 -4 -3 -2 -9 // K -2 4 1 0 -6 1 0 -2 0 -2 -3 5 1 -6 -2 0 0 -4 -5 -3 0 0 -1 -9 // M -1 -1 -2 -3 -6 -1 -3 -3 -3 2 4 1 8 0 -3 -2 -1 -5 -3 2 -3 -2 -1 -9 // F -4 -5 -4 -7 -5 -6 -6 -5 -2 1 2 -6 0 10 -5 -4 -4 0 7 -2 -5 -6 -3 -9 // P 1 0 -1 -1 -3 0 -1 -1 0 -3 -3 -2 -3 -5 7 1 0 -7 -6 -2 -1 0 -1 -9 // S 1 0 1 0 0 -1 0 1 -1 -2 -3 0 -2 -4 1 2 2 -3 -3 -1 1 0 0 -9 // T 1 -1 0 0 -3 -1 -1 0 -2 0 -2 0 -1 -4 0 2 3 -6 -3 0 0 -1 0 -9 // W -7 2 -5 -8 -9 -6 -8 -8 -3 -6 -2 -4 -5 0 -7 -3 -6 18 -1 -7 -6 -7 -5 -9 // Y -4 -5 -2 -5 0 -5 -5 -6 0 -1 -1 -5 -3 7 -6 -3 -3 -1 11 -3 -4 -5 -3 -9 // V 0 -3 -2 -3 -2 -2 -2 -2 -3 4 2 -3 2 -2 -2 -1 0 -7 -3 5 -2 -2 -1 -9 // B 0 -1 3 4 -5 1 3 0 1 -3 -4 0 -3 -5 -1 1 0 -6 -4 -2 3 2 -1 -9 // Z 0 0 1 3 -6 4 4 -1 2 -3 -3 0 -2 -6 0 0 -1 -7 -5 -2 2 4 -1 -9 // X 0 -1 0 -1 -4 -1 -1 -1 -1 -1 -2 -1 -1 -3 -1 0 0 -5 -3 -1 -1 -1 -1 -9 // * -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 1 // PAM210 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 2, 0, -2, 0, 0, -4, 1, -2, -1, 0, -2, -2, -1, 0, 1, -1, -2, 1, 1, 0, -7, 0, -4, 0, -9}, {0, 0, 3, -5, 4, 3, -5, 0, 1, -3, 0, 0, -4, -3, 3, -1, 1, -1, 1, 0, -2, -6, -1, -4, 2, -9}, {0, -2, -5, 12, -6, -6, -5, -4, -4, -3, 0, -6, -7, -6, -4, -3, -6, -4, 0, -3, -2, -9, -4, 0, -6, -9}, {0, 0, 4, -6, 5, 4, -7, 0, 1, -3, 0, 0, -5, -3, 2, -1, 2, -2, 0, 0, -3, -8, -1, -5, 3, -9}, {0, 0, 3, -6, 4, 5, -6, 0, 0, -2, 0, 0, -4, -3, 2, -1, 3, -2, 0, -1, -2, -8, -1, -5, 4, -9}, {0, -4, -5, -5, -7, -6, 10, -5, -2, 1, 0, -6, 2, 0, -4, -5, -6, -5, -4, -4, -2, 0, -3, 7, -6, -9}, {0, 1, 0, -4, 0, 0, -5, 5, -3, -3, 0, -2, -5, -3, 0, -1, -2, -3, 1, 0, -2, -8, -1, -6, -1, -9}, {0, -2, 1, -4, 1, 0, -2, -3, 8, -3, 0, 0, -2, -3, 2, 0, 3, 2, -1, -2, -3, -3, -1, 0, 2, -9}, {0, -1, -3, -3, -3, -2, 1, -3, -3, 5, 0, -2, 2, 2, -2, -3, -3, -2, -2, 0, 4, -6, -1, -1, -3, -9}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 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ln(2)/3 = 0.231049 // # // # Expected score = -0.991, Entropy = 0.407 bits // # // # Lowest score = -8, Highest score = 17 // # // A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * // A 2 -2 0 0 -2 -1 0 1 -2 -1 -2 -1 -1 -4 1 1 1 -6 -4 0 0 0 0 -8 // R -2 7 0 -2 -4 1 -1 -3 2 -2 -3 4 -1 -5 0 0 -1 2 -5 -3 -1 0 -1 -8 // N 0 0 2 2 -4 1 1 0 2 -2 -3 1 -2 -4 -1 1 0 -4 -2 -2 2 1 0 -8 // D 0 -2 2 4 -6 2 4 1 1 -3 -4 0 -3 -6 -1 0 0 -7 -5 -2 3 3 -1 -8 // C -2 -4 -4 -6 12 -6 -6 -4 -4 -2 -7 -6 -6 -5 -3 0 -2 -8 0 -2 -5 -6 -3 -8 // Q -1 1 1 2 -6 5 3 -1 3 -2 -2 1 -1 -5 0 -1 -1 -5 -4 -2 1 4 -1 -8 // E 0 -1 1 4 -6 3 4 0 1 -2 -4 0 -2 -6 -1 0 -1 -8 -5 -2 3 4 -1 -8 // G 1 -3 0 1 -4 -1 0 5 -2 -3 -4 -2 -3 -5 -1 1 0 -7 -6 -2 0 -1 -1 -8 // H -2 2 2 1 -4 3 1 -2 7 -3 -2 0 -2 -2 0 -1 -2 -3 0 -2 1 2 -1 -8 // I -1 -2 -2 -3 -2 -2 -2 -3 -3 5 2 -2 2 1 -2 -2 0 -6 -1 4 -2 -2 -1 -8 // L -2 -3 -3 -4 -7 -2 -4 -4 -2 2 6 -3 4 2 -3 -3 -2 -2 -1 2 -4 -3 -2 -8 // K -1 4 1 0 -6 1 0 -2 0 -2 -3 5 0 -6 -1 0 0 -4 -5 -3 1 0 -1 -8 // M -1 -1 -2 -3 -6 -1 -2 -3 -2 2 4 0 7 0 -2 -2 -1 -5 -3 2 -2 -2 -1 -8 // F -4 -5 -4 -6 -5 -5 -6 -5 -2 1 2 -6 0 9 -5 -3 -3 0 7 -1 -5 -6 -3 -8 // P 1 0 -1 -1 -3 0 -1 -1 0 -2 -3 -1 -2 -5 6 1 0 -6 -5 -1 -1 0 -1 -8 // S 1 0 1 0 0 -1 0 1 -1 -2 -3 0 -2 -3 1 2 2 -3 -3 -1 0 0 0 -8 // T 1 -1 0 0 -2 -1 -1 0 -2 0 -2 0 -1 -3 0 2 3 -6 -3 0 0 -1 0 -8 // W -6 2 -4 -7 -8 -5 -8 -7 -3 -6 -2 -4 -5 0 -6 -3 -6 17 0 -7 -6 -6 -4 -8 // Y -4 -5 -2 -5 0 -4 -5 -6 0 -1 -1 -5 -3 7 -5 -3 -3 0 10 -3 -3 -5 -3 -8 // V 0 -3 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 4 2 -3 2 -1 -1 -1 0 -7 -3 5 -2 -2 -1 -8 // B 0 -1 2 3 -5 1 3 0 1 -2 -4 1 -2 -5 -1 0 0 -6 -3 -2 3 2 -1 -8 // Z 0 0 1 3 -6 4 4 -1 2 -2 -3 0 -2 -6 0 0 -1 -6 -5 -2 2 4 -1 -8 // X 0 -1 0 -1 -3 -1 -1 -1 -1 -1 -2 -1 -1 -3 -1 0 0 -4 -3 -1 -1 -1 -1 -8 // * -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 1 // PAM230 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 2, 0, -2, 0, 0, -4, 1, -2, -1, 0, -1, -2, -1, 0, 1, -1, -2, 1, 1, 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-1 -8 // E 0 -1 1 4 -6 3 4 0 1 -2 -3 0 -2 -6 -1 0 0 -7 -4 -2 3 3 -1 -8 // G 1 -3 0 1 -4 -1 0 5 -2 -3 -4 -2 -3 -5 -1 1 0 -7 -5 -1 0 0 -1 -8 // H -1 2 2 1 -4 3 1 -2 7 -3 -2 0 -2 -2 0 -1 -1 -3 0 -2 1 2 -1 -8 // I -1 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -3 -3 5 2 -2 2 1 -2 -1 0 -5 -1 4 -2 -2 -1 -8 // L -2 -3 -3 -4 -6 -2 -3 -4 -2 2 6 -3 4 2 -3 -3 -2 -2 -1 2 -4 -3 -1 -8 // K -1 3 1 0 -6 1 0 -2 0 -2 -3 5 0 -5 -1 0 0 -4 -5 -3 1 0 -1 -8 // M -1 0 -2 -3 -5 -1 -2 -3 -2 2 4 0 7 0 -2 -2 -1 -4 -3 2 -2 -2 -1 -8 // F -4 -5 -4 -6 -5 -5 -6 -5 -2 1 2 -5 0 9 -5 -3 -3 0 7 -1 -5 -5 -2 -8 // P 1 0 -1 -1 -3 0 -1 -1 0 -2 -3 -1 -2 -5 6 1 0 -6 -5 -1 -1 0 -1 -8 // S 1 0 1 0 0 -1 0 1 -1 -1 -3 0 -2 -3 1 2 1 -3 -3 -1 0 0 0 -8 // T 1 -1 0 0 -2 -1 0 0 -1 0 -2 0 -1 -3 0 1 3 -5 -3 0 0 -1 0 -8 // W -6 2 -4 -7 -8 -5 -7 -7 -3 -5 -2 -4 -4 0 -6 -3 -5 17 0 -6 -5 -6 -4 -8 // Y -4 -4 -2 -4 0 -4 -4 -5 0 -1 -1 -5 -3 7 -5 -3 -3 0 10 -3 -3 -4 -2 -8 // V 0 -3 -2 -2 -2 -2 -2 -1 -2 4 2 -3 2 -1 -1 -1 0 -6 -3 4 -2 -2 -1 -8 // B 0 -1 2 3 -5 1 3 0 1 -2 -4 1 -2 -5 -1 0 0 -5 -3 -2 3 2 -1 -8 // Z 0 0 1 3 -6 3 3 0 2 -2 -3 0 -2 -5 0 0 -1 -6 -4 -2 2 3 -1 -8 // X 0 -1 0 -1 -3 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 0 -4 -2 -1 -1 -1 -1 -8 // * -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 1 // PAM240 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 2, 0, -2, 0, 0, -4, 1, -1, -1, 0, -1, -2, -1, 0, 1, 0, -2, 1, 1, 0, -6, 0, -4, 0, -8}, {0, 0, 3, -5, 3, 3, -5, 0, 1, -2, 0, 1, -4, -2, 2, -1, 1, -1, 0, 0, -2, -5, -1, -3, 2, -8}, {0, -2, -5, 12, -5, -6, -5, -4, -4, -2, 0, -6, -6, -5, -4, -3, -6, -4, 0, -2, -2, -8, -3, 0, -6, -8}, {0, 0, 3, -5, 4, 4, -6, 1, 1, -2, 0, 0, -4, -3, 2, -1, 2, -1, 0, 0, -2, -7, -1, -4, 3, -8}, {0, 0, 3, -6, 4, 4, -6, 0, 1, -2, 0, 0, -3, -2, 1, -1, 3, -1, 0, 0, -2, -7, -1, -4, 3, -8}, {0, -4, -5, -5, -6, -6, 9, -5, -2, 1, 0, -5, 2, 0, -4, -5, -5, -5, -3, -3, -1, 0, -2, 7, -5, -8}, {0, 1, 0, -4, 1, 0, -5, 5, -2, -3, 0, -2, -4, -3, 0, -1, -1, -3, 1, 0, -1, -7, -1, -5, 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V B Z X * // A 2 -2 0 0 -2 0 0 1 -1 -1 -2 -1 -1 -3 1 1 1 -6 -3 0 0 0 0 -8 // R -2 6 0 -1 -4 1 -1 -3 2 -2 -3 3 0 -4 0 0 -1 2 -4 -2 -1 0 -1 -8 // N 0 0 2 2 -4 1 1 0 2 -2 -3 1 -2 -3 0 1 0 -4 -2 -2 2 1 0 -8 // D 0 -1 2 4 -5 2 3 1 1 -2 -4 0 -3 -6 -1 0 0 -7 -4 -2 3 3 -1 -8 // C -2 -4 -4 -5 12 -5 -5 -3 -3 -2 -6 -5 -5 -4 -3 0 -2 -8 0 -2 -4 -5 -3 -8 // Q 0 1 1 2 -5 4 2 -1 3 -2 -2 1 -1 -5 0 -1 -1 -5 -4 -2 1 3 -1 -8 // E 0 -1 1 3 -5 2 4 0 1 -2 -3 0 -2 -5 -1 0 0 -7 -4 -2 3 3 -1 -8 // G 1 -3 0 1 -3 -1 0 5 -2 -3 -4 -2 -3 -5 0 1 0 -7 -5 -1 0 0 -1 -8 // H -1 2 2 1 -3 3 1 -2 6 -2 -2 0 -2 -2 0 -1 -1 -3 0 -2 1 2 -1 -8 // I -1 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -3 -2 5 2 -2 2 1 -2 -1 0 -5 -1 4 -2 -2 -1 -8 // L -2 -3 -3 -4 -6 -2 -3 -4 -2 2 6 -3 4 2 -3 -3 -2 -2 -1 2 -3 -3 -1 -8 // K -1 3 1 0 -5 1 0 -2 0 -2 -3 5 0 -5 -1 0 0 -3 -4 -2 1 0 -1 -8 // M -1 0 -2 -3 -5 -1 -2 -3 -2 2 4 0 6 0 -2 -2 -1 -4 -2 2 -2 -2 -1 -8 // F -3 -4 -3 -6 -4 -5 -5 -5 -2 1 2 -5 0 9 -5 -3 -3 0 7 -1 -4 -5 -2 -8 // P 1 0 0 -1 -3 0 -1 0 0 -2 -3 -1 -2 -5 6 1 0 -6 -5 -1 -1 0 -1 -8 // S 1 0 1 0 0 -1 0 1 -1 -1 -3 0 -2 -3 1 2 1 -2 -3 -1 0 0 0 -8 // T 1 -1 0 0 -2 -1 0 0 -1 0 -2 0 -1 -3 0 1 3 -5 -3 0 0 -1 0 -8 // W -6 2 -4 -7 -8 -5 -7 -7 -3 -5 -2 -3 -4 0 -6 -2 -5 17 0 -6 -5 -6 -4 -8 // Y -3 -4 -2 -4 0 -4 -4 -5 0 -1 -1 -4 -2 7 -5 -3 -3 0 10 -2 -3 -4 -2 -8 // V 0 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -1 -2 4 2 -2 2 -1 -1 -1 0 -6 -2 4 -2 -2 -1 -8 // B 0 -1 2 3 -4 1 3 0 1 -2 -3 1 -2 -4 -1 0 0 -5 -3 -2 3 2 -1 -8 // Z 0 0 1 3 -5 3 3 0 2 -2 -3 0 -2 -5 0 0 -1 -6 -4 -2 2 3 -1 -8 // X 0 -1 0 -1 -3 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 0 -4 -2 -1 -1 -1 -1 -8 // * -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 1 // PAM250 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 2, 0, -2, 0, 0, -3, 1, -1, -1, 0, -1, -2, -1, 0, 1, 0, -2, 1, 1, 0, -6, 0, -3, 0, -8}, {0, 0, 3, -4, 3, 3, -4, 0, 1, -2, 0, 1, -3, -2, 2, -1, 1, -1, 0, 0, -2, -5, -1, -3, 2, -8}, {0, -2, -4, 12, -5, -5, -4, -3, -3, -2, 0, -5, -6, -5, -4, -3, -5, -4, 0, -2, -2, -8, -3, 0, -5, -8}, {0, 0, 3, -5, 4, 3, -6, 1, 1, -2, 0, 0, -4, -3, 2, -1, 2, -1, 0, 0, -2, -7, -1, -4, 3, -8}, {0, 0, 3, -5, 3, 4, -5, 0, 1, -2, 0, 0, -3, -2, 1, -1, 2, -1, 0, 0, -2, -7, -1, -4, 3, -8}, {0, -3, -4, -4, -6, -5, 9, -5, -2, 1, 0, -5, 2, 0, -3, -5, -5, -4, -3, -3, -1, 0, -2, 7, -5, -8}, {0, 1, 0, -3, 1, 0, -5, 5, -2, -3, 0, -2, -4, -3, 0, 0, -1, -3, 1, 0, -1, -7, -1, -5, 0, -8}, {0, -1, 1, -3, 1, 1, -2, -2, 6, -2, 0, 0, -2, -2, 2, 0, 3, 2, -1, -1, -2, -3, -1, 0, 2, -8}, {0, -1, -2, -2, -2, -2, 1, -3, -2, 5, 0, -2, 2, 2, -2, -2, -2, -2, -1, 0, 4, -5, -1, -1, -2, -8}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, -1, 1, -5, 0, 0, -5, -2, 0, -2, 0, 5, -3, 0, 1, -1, 1, 3, 0, 0, -2, -3, -1, -4, 0, -8}, {0, -2, -3, -6, -4, -3, 2, -4, -2, 2, 0, -3, 6, 4, -3, -3, -2, -3, -3, -2, 2, -2, -1, -1, -3, -8}, {0, -1, -2, -5, -3, -2, 0, -3, -2, 2, 0, 0, 4, 6, -2, -2, -1, 0, -2, -1, 2, -4, -1, -2, -2, -8}, {0, 0, 2, -4, 2, 1, -3, 0, 2, -2, 0, 1, -3, -2, 2, 0, 1, 0, 1, 0, -2, -4, 0, -2, 1, -8}, {0, 1, -1, -3, -1, -1, -5, 0, 0, -2, 0, -1, -3, -2, 0, 6, 0, 0, 1, 0, -1, -6, -1, -5, 0, -8}, {0, 0, 1, -5, 2, 2, -5, -1, 3, -2, 0, 1, -2, -1, 1, 0, 4, 1, -1, -1, -2, -5, -1, -4, 3, -8}, {0, -2, -1, -4, -1, -1, -4, -3, 2, -2, 0, 3, -3, 0, 0, 0, 1, 6, 0, -1, -2, 2, -1, -4, 0, -8}, {0, 1, 0, 0, 0, 0, -3, 1, -1, -1, 0, 0, -3, -2, 1, 1, -1, 0, 2, 1, -1, -2, 0, -3, 0, -8}, {0, 1, 0, -2, 0, 0, -3, 0, -1, 0, 0, 0, -2, -1, 0, 0, -1, -1, 1, 3, 0, -5, 0, -3, -1, -8}, {0, 0, -2, -2, -2, -2, -1, -1, -2, 4, 0, -2, 2, 2, -2, -1, -2, -2, -1, 0, 4, -6, -1, -2, -2, -8}, {0, -6, -5, -8, -7, -7, 0, -7, -3, -5, 0, -3, -2, -4, -4, -6, -5, 2, -2, -5, -6, 17, -4, 0, -6, -8}, {0, 0, -1, -3, -1, -1, -2, -1, -1, -1, 0, -1, -1, -1, 0, -1, -1, -1, 0, 0, -1, -4, -1, -2, -1, -8}, {0, -3, -3, 0, -4, -4, 7, -5, 0, -1, 0, -4, -1, -2, -2, -5, -4, -4, -3, -3, -2, 0, -2, 10, -4, -8}, {0, 0, 2, -5, 3, 3, -5, 0, 2, -2, 0, 0, -3, -2, 1, 0, 3, 0, 0, -1, -2, -6, -1, -4, 3, -8}, {0, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, 0, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, 1}, } // # // # This matrix was produced by "pam" Version 1.0.6 [28-Jul-93] // # // # PAM 250 substitution matrix, scale = 0.0693200 // # // # Expected score = -2.81, Entropy = 0.354 bits // # // # Lowest score = -26, Highest score = 57 // # // A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * // A 6 -5 1 1 -7 -1 1 4 -4 -2 -6 -4 -4 -12 4 4 4 -19 -12 1 1 0 -1 -26 // R -5 20 0 -4 -12 4 -4 -8 5 -7 -10 11 -1 -15 -1 -1 -3 7 -14 -8 -2 0 -3 -26 // N 1 0 7 7 -12 3 5 1 5 -6 -10 3 -6 -12 -2 2 1 -13 -7 -6 7 4 -1 -26 // D 1 -4 7 13 -17 5 11 2 2 -8 -13 0 -9 -19 -3 1 0 -22 -14 -7 10 9 -2 -26 // C -7 -12 -12 -17 40 -18 -18 -11 -11 -8 -20 -18 -17 -14 -9 0 -7 -26 1 -6 -15 -18 -10 -26 // Q -1 4 3 5 -18 13 8 -4 10 -7 -6 2 -3 -15 1 -2 -3 -16 -13 -6 4 11 -2 -26 // E 1 -4 5 11 -18 8 13 1 2 -7 -11 0 -7 -18 -2 0 -1 -23 -14 -6 9 11 -2 -26 // G 4 -8 1 2 -11 -4 1 16 -7 -8 -13 -6 -9 -16 -2 4 0 -23 -17 -4 2 -1 -3 -26 // H -4 5 5 2 -11 10 2 -7 22 -8 -7 0 -7 -6 -1 -3 -4 -9 0 -7 4 6 -2 -26 // I -2 -7 -6 -8 -8 -7 -7 -8 -8 15 8 -6 7 3 -7 -5 0 -17 -3 12 -7 -7 -2 -26 // L -6 -10 -10 -13 -20 -6 -11 -13 -7 8 20 -9 12 6 -8 -9 -6 -6 -3 6 -11 -9 -4 -26 // K -4 11 3 0 -18 2 0 -6 0 -6 -9 15 1 -17 -4 -1 0 -12 -15 -8 2 1 -3 -26 // M -4 -1 -6 -9 -17 -3 -7 -9 -7 7 12 1 21 1 -7 -5 -2 -14 -8 6 -7 -5 -2 -26 // F -12 -15 -12 -19 -14 -15 -18 -16 -6 3 6 -17 1 30 -15 -11 -10 1 23 -4 -15 -17 -8 -26 // P 4 -1 -2 -3 -9 1 -2 -2 -1 -7 -8 -4 -7 -15 19 3 1 -19 -16 -4 -2 -1 -2 -26 // S 4 -1 2 1 0 -2 0 4 -3 -5 -9 -1 -5 -11 3 5 4 -8 -9 -3 2 -1 -1 -26 // T 4 -3 1 0 -7 -3 -1 0 -4 0 -6 0 -2 -10 1 4 9 -17 -9 1 0 -2 -1 -26 // W -19 7 -13 -22 -26 -16 -23 -23 -9 -17 -6 -12 -14 1 -19 -8 -17 57 0 -21 -18 -19 -13 -26 // Y -12 -14 -7 -14 1 -13 -14 -17 0 -3 -3 -15 -8 23 -16 -9 -9 0 34 -8 -10 -14 -8 -26 // V 1 -8 -6 -7 -6 -6 -6 -4 -7 12 6 -8 6 -4 -4 -3 1 -21 -8 14 -6 -6 -2 -26 // B 1 -2 7 10 -15 4 9 2 4 -7 -11 2 -7 -15 -2 2 0 -18 -10 -6 9 7 -2 -26 // Z 0 0 4 9 -18 11 11 -1 6 -7 -9 1 -5 -17 -1 -1 -2 -19 -14 -6 7 11 -2 -26 // X -1 -3 -1 -2 -10 -2 -2 -3 -2 -2 -4 -3 -2 -8 -2 -1 -1 -13 -8 -2 -2 -2 -3 -26 // * -26 -26 -26 -26 -26 -26 -26 -26 -26 -26 -26 -26 -26 -26 -26 -26 -26 -26 -26 -26 -26 -26 -26 1 // PAM250_cdi = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 6, 1, -7, 1, 1, -12, 4, -4, -2, 0, -4, -6, -4, 1, 4, -1, -5, 4, 4, 1, -19, -1, -12, 0, -26}, {0, 1, 9, -15, 10, 9, -15, 2, 4, -7, 0, 2, -11, -7, 7, -2, 4, -2, 2, 0, -6, -18, -2, -10, 7, -26}, {0, -7, -15, 40, -17, -18, -14, -11, -11, -8, 0, -18, -20, -17, -12, -9, -18, -12, 0, -7, -6, -26, -10, 1, -18, -26}, {0, 1, 10, -17, 13, 11, -19, 2, 2, -8, 0, 0, -13, -9, 7, -3, 5, -4, 1, 0, -7, -22, -2, -14, 9, -26}, {0, 1, 9, -18, 11, 13, -18, 1, 2, -7, 0, 0, -11, -7, 5, -2, 8, -4, 0, -1, -6, -23, -2, -14, 11, -26}, {0, -12, -15, -14, -19, -18, 30, -16, -6, 3, 0, -17, 6, 1, -12, -15, -15, -15, -11, -10, -4, 1, -8, 23, -17, -26}, {0, 4, 2, -11, 2, 1, -16, 16, -7, -8, 0, -6, -13, -9, 1, -2, -4, -8, 4, 0, -4, -23, -3, -17, -1, -26}, {0, -4, 4, -11, 2, 2, -6, -7, 22, -8, 0, 0, -7, -7, 5, -1, 10, 5, -3, -4, -7, -9, -2, 0, 6, -26}, {0, -2, -7, -8, -8, -7, 3, -8, -8, 15, 0, -6, 8, 7, -6, -7, -7, -7, -5, 0, 12, -17, -2, -3, -7, -26}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, -4, 2, -18, 0, 0, -17, -6, 0, -6, 0, 15, -9, 1, 3, -4, 2, 11, -1, 0, -8, -12, -3, -15, 1, -26}, {0, -6, -11, -20, -13, -11, 6, -13, -7, 8, 0, -9, 20, 12, -10, -8, -6, -10, -9, -6, 6, -6, -4, -3, -9, -26}, {0, -4, -7, -17, -9, -7, 1, -9, -7, 7, 0, 1, 12, 21, -6, -7, -3, -1, -5, -2, 6, -14, -2, -8, -5, -26}, {0, 1, 7, -12, 7, 5, -12, 1, 5, -6, 0, 3, -10, -6, 7, -2, 3, 0, 2, 1, -6, -13, -1, -7, 4, -26}, {0, 4, -2, -9, -3, -2, -15, -2, -1, -7, 0, -4, -8, -7, -2, 19, 1, -1, 3, 1, -4, -19, -2, -16, -1, -26}, {0, -1, 4, -18, 5, 8, -15, -4, 10, -7, 0, 2, -6, -3, 3, 1, 13, 4, -2, -3, -6, -16, -2, -13, 11, -26}, {0, -5, -2, -12, -4, -4, -15, -8, 5, -7, 0, 11, -10, -1, 0, -1, 4, 20, -1, -3, -8, 7, -3, -14, 0, -26}, {0, 4, 2, 0, 1, 0, -11, 4, -3, -5, 0, -1, -9, -5, 2, 3, -2, -1, 5, 4, -3, -8, -1, -9, -1, -26}, {0, 4, 0, -7, 0, -1, -10, 0, -4, 0, 0, 0, -6, -2, 1, 1, -3, -3, 4, 9, 1, -17, -1, -9, -2, -26}, {0, 1, -6, -6, -7, -6, -4, -4, -7, 12, 0, -8, 6, 6, -6, -4, -6, -8, -3, 1, 14, -21, -2, -8, -6, -26}, {0, -19, -18, -26, -22, -23, 1, -23, -9, -17, 0, -12, -6, -14, -13, -19, -16, 7, -8, -17, -21, 57, -13, 0, -19, -26}, {0, -1, -2, -10, -2, -2, -8, -3, -2, -2, 0, -3, -4, -2, -1, -2, -2, -3, -1, -1, -2, -13, -3, -8, -2, -26}, {0, -12, -10, 1, -14, -14, 23, -17, 0, -3, 0, -15, -3, -8, -7, -16, -13, -14, -9, -9, -8, 0, -8, 34, -14, -26}, {0, 0, 7, -18, 9, 11, -17, -1, 6, -7, 0, 1, -9, -5, 4, -1, 11, 0, -1, -2, -6, -19, -2, -14, 11, -26}, {0, -26, -26, -26, -26, -26, -26, -26, -26, -26, 0, -26, -26, -26, -26, -26, -26, -26, -26, -26, -26, -26, -26, -26, -26, 1}, } // # // # This matrix was produced by "pam" Version 1.0.6 [28-Jul-93] // # // # PAM 260 substitution matrix, scale = ln(2)/3 = 0.231049 // # // # Expected score = -0.794, Entropy = 0.330 bits // # // # Lowest score = -7, Highest score = 17 // # // A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * // A 2 -1 0 0 -2 0 0 1 -1 0 -2 -1 -1 -3 1 1 1 -6 -3 0 0 0 0 -7 // R -1 6 0 -1 -4 1 -1 -2 2 -2 -3 3 0 -4 0 0 -1 2 -4 -2 -1 0 -1 -7 // N 0 0 2 2 -3 1 1 0 2 -2 -3 1 -2 -3 0 1 0 -4 -2 -2 2 1 0 -7 // D 0 -1 2 4 -5 2 3 1 1 -2 -4 0 -2 -5 -1 0 0 -6 -4 -2 3 3 -1 -7 // C -2 -4 -3 -5 12 -5 -5 -3 -3 -2 -6 -5 -5 -4 -3 0 -2 -7 0 -2 -4 -5 -3 -7 // Q 0 1 1 2 -5 4 2 -1 3 -2 -2 1 -1 -4 0 0 -1 -5 -4 -2 1 3 0 -7 // E 0 -1 1 3 -5 2 4 0 1 -2 -3 0 -2 -5 0 0 0 -7 -4 -2 3 3 -1 -7 // G 1 -2 0 1 -3 -1 0 5 -2 -2 -4 -2 -3 -5 0 1 0 -7 -5 -1 1 0 -1 -7 // H -1 2 2 1 -3 3 1 -2 6 -2 -2 0 -2 -2 0 -1 -1 -3 0 -2 1 2 -1 -7 // I 0 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 4 2 -2 2 1 -2 -1 0 -5 -1 4 -2 -2 -1 -7 // L -2 -3 -3 -4 -6 -2 -3 -4 -2 2 6 -3 4 2 -2 -3 -2 -2 -1 2 -3 -2 -1 -7 // K -1 3 1 0 -5 1 0 -2 0 -2 -3 4 0 -5 -1 0 0 -3 -4 -2 1 0 -1 -7 // M -1 0 -2 -2 -5 -1 -2 -3 -2 2 4 0 6 0 -2 -1 -1 -4 -2 2 -2 -2 -1 -7 // F -3 -4 -3 -5 -4 -4 -5 -5 -2 1 2 -5 0 9 -4 -3 -3 0 7 -1 -4 -5 -2 -7 // P 1 0 0 -1 -3 0 0 0 0 -2 -2 -1 -2 -4 6 1 0 -5 -5 -1 -1 0 -1 -7 // S 1 0 1 0 0 0 0 1 -1 -1 -3 0 -1 -3 1 1 1 -2 -3 -1 0 0 0 -7 // T 1 -1 0 0 -2 -1 0 0 -1 0 -2 0 -1 -3 0 1 2 -5 -3 0 0 0 0 -7 // W -6 2 -4 -6 -7 -5 -7 -7 -3 -5 -2 -3 -4 0 -5 -2 -5 17 0 -6 -5 -6 -4 -7 // Y -3 -4 -2 -4 0 -4 -4 -5 0 -1 -1 -4 -2 7 -5 -3 -3 0 10 -2 -3 -4 -2 -7 // V 0 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -1 -2 4 2 -2 2 -1 -1 -1 0 -6 -2 4 -2 -2 -1 -7 // B 0 -1 2 3 -4 1 3 1 1 -2 -3 1 -2 -4 -1 0 0 -5 -3 -2 3 2 0 -7 // Z 0 0 1 3 -5 3 3 0 2 -2 -2 0 -2 -5 0 0 0 -6 -4 -2 2 3 -1 -7 // X 0 -1 0 -1 -3 0 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 0 -4 -2 -1 0 -1 -1 -7 // * -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 1 // PAM260 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 2, 0, -2, 0, 0, -3, 1, -1, 0, 0, -1, -2, -1, 0, 1, 0, -1, 1, 1, 0, -6, 0, -3, 0, -7}, {0, 0, 3, -4, 3, 3, -4, 1, 1, -2, 0, 1, -3, -2, 2, -1, 1, -1, 0, 0, -2, -5, 0, -3, 2, -7}, {0, -2, -4, 12, -5, -5, -4, -3, -3, -2, 0, -5, -6, -5, -3, -3, -5, -4, 0, -2, -2, -7, -3, 0, -5, -7}, {0, 0, 3, -5, 4, 3, -5, 1, 1, -2, 0, 0, -4, -2, 2, -1, 2, -1, 0, 0, -2, -6, -1, -4, 3, -7}, {0, 0, 3, -5, 3, 4, -5, 0, 1, -2, 0, 0, -3, -2, 1, 0, 2, -1, 0, 0, -2, -7, -1, -4, 3, -7}, {0, -3, -4, -4, -5, -5, 9, -5, -2, 1, 0, -5, 2, 0, -3, -4, -4, -4, -3, -3, -1, 0, -2, 7, -5, -7}, {0, 1, 1, -3, 1, 0, -5, 5, -2, -2, 0, -2, -4, -3, 0, 0, -1, -2, 1, 0, -1, -7, -1, -5, 0, -7}, {0, -1, 1, -3, 1, 1, -2, -2, 6, -2, 0, 0, -2, -2, 2, 0, 3, 2, -1, -1, -2, -3, -1, 0, 2, -7}, {0, 0, -2, -2, -2, -2, 1, -2, -2, 4, 0, -2, 2, 2, -2, -2, -2, -2, -1, 0, 4, -5, -1, -1, -2, -7}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, -1, 1, -5, 0, 0, -5, -2, 0, -2, 0, 4, -3, 0, 1, -1, 1, 3, 0, 0, -2, -3, -1, -4, 0, -7}, {0, -2, -3, -6, -4, -3, 2, -4, -2, 2, 0, -3, 6, 4, -3, -2, -2, -3, -3, -2, 2, -2, -1, -1, -2, -7}, {0, -1, -2, -5, -2, -2, 0, -3, -2, 2, 0, 0, 4, 6, -2, -2, -1, 0, -1, -1, 2, -4, -1, -2, -2, -7}, {0, 0, 2, -3, 2, 1, -3, 0, 2, -2, 0, 1, -3, -2, 2, 0, 1, 0, 1, 0, -2, -4, 0, -2, 1, -7}, {0, 1, -1, -3, -1, 0, -4, 0, 0, -2, 0, -1, -2, -2, 0, 6, 0, 0, 1, 0, -1, -5, -1, -5, 0, -7}, {0, 0, 1, -5, 2, 2, -4, -1, 3, -2, 0, 1, -2, -1, 1, 0, 4, 1, 0, -1, -2, -5, 0, -4, 3, -7}, {0, -1, -1, -4, -1, -1, -4, -2, 2, -2, 0, 3, -3, 0, 0, 0, 1, 6, 0, -1, -2, 2, -1, -4, 0, -7}, {0, 1, 0, 0, 0, 0, -3, 1, -1, -1, 0, 0, -3, -1, 1, 1, 0, 0, 1, 1, -1, -2, 0, -3, 0, -7}, {0, 1, 0, -2, 0, 0, -3, 0, -1, 0, 0, 0, -2, -1, 0, 0, -1, -1, 1, 2, 0, -5, 0, -3, 0, -7}, {0, 0, -2, -2, -2, -2, -1, -1, -2, 4, 0, -2, 2, 2, -2, -1, -2, -2, -1, 0, 4, -6, -1, -2, -2, -7}, {0, -6, -5, -7, -6, -7, 0, -7, -3, -5, 0, -3, -2, -4, -4, -5, -5, 2, -2, -5, -6, 17, -4, 0, -6, -7}, {0, 0, 0, -3, -1, -1, -2, -1, -1, -1, 0, -1, -1, -1, 0, -1, 0, -1, 0, 0, -1, -4, -1, -2, -1, -7}, {0, -3, -3, 0, -4, -4, 7, -5, 0, -1, 0, -4, -1, -2, -2, -5, -4, -4, -3, -3, -2, 0, -2, 10, -4, -7}, {0, 0, 2, -5, 3, 3, -5, 0, 2, -2, 0, 0, -2, -2, 1, 0, 3, 0, 0, 0, -2, -6, -1, -4, 3, -7}, {0, -7, -7, -7, -7, -7, -7, -7, -7, -7, 0, -7, -7, -7, -7, -7, -7, -7, -7, -7, -7, -7, -7, -7, -7, 1}, } // # // # This matrix was produced by "pam" Version 1.0.6 [28-Jul-93] // # // # PAM 270 substitution matrix, scale = ln(2)/4 = 0.173287 // # // # Expected score = -0.969, Entropy = 0.309 bits // # // # Lowest score = -10, Highest score = 23 // # // A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * // A 2 -2 0 0 -2 0 0 2 -2 -1 -2 -1 -1 -4 1 1 1 -7 -4 0 0 0 0 -10 // R -2 8 0 -1 -5 2 -1 -3 2 -2 -4 4 -1 -5 0 0 -1 3 -5 -3 -1 0 -1 -10 // N 0 0 2 2 -4 1 2 1 2 -2 -3 1 -2 -4 0 1 1 -5 -3 -2 2 2 0 -10 // D 0 -1 2 5 -6 2 4 1 1 -3 -5 0 -3 -7 -1 0 0 -8 -5 -3 4 3 -1 -10 // C -2 -5 -4 -6 16 -7 -6 -4 -4 -3 -7 -7 -6 -5 -3 0 -3 -10 1 -2 -5 -7 -4 -10 // Q 0 2 1 2 -7 5 3 -1 4 -2 -2 1 -1 -6 0 -1 -1 -6 -5 -2 2 4 -1 -10 // E 0 -1 2 4 -6 3 5 0 1 -2 -4 0 -3 -7 -1 0 0 -9 -5 -2 3 4 -1 -10 // G 2 -3 1 1 -4 -1 0 6 -2 -3 -5 -2 -3 -6 0 1 0 -9 -6 -2 1 0 -1 -10 // H -2 2 2 1 -4 4 1 -2 8 -3 -3 0 -3 -2 0 -1 -1 -3 0 -3 1 2 -1 -10 // I -1 -2 -2 -3 -3 -2 -2 -3 -3 5 3 -2 3 1 -2 -2 0 -6 -1 5 -3 -2 -1 -10 // L -2 -4 -3 -5 -7 -2 -4 -5 -3 3 8 -3 5 2 -3 -3 -2 -2 -1 2 -4 -3 -2 -10 // K -1 4 1 0 -7 1 0 -2 0 -2 -3 6 0 -6 -1 0 0 -4 -5 -3 1 0 -1 -10 // M -1 -1 -2 -3 -6 -1 -3 -3 -3 3 5 0 8 0 -2 -2 -1 -5 -3 2 -3 -2 -1 -10 // F -4 -5 -4 -7 -5 -6 -7 -6 -2 1 2 -6 0 12 -6 -4 -4 1 9 -1 -6 -6 -3 -10 // P 1 0 0 -1 -3 0 -1 0 0 -2 -3 -1 -2 -6 7 1 0 -7 -6 -1 -1 0 -1 -10 // S 1 0 1 0 0 -1 0 1 -1 -2 -3 0 -2 -4 1 2 2 -3 -4 -1 1 0 0 -10 // T 1 -1 1 0 -3 -1 0 0 -1 0 -2 0 -1 -4 0 2 3 -6 -3 0 0 -1 0 -10 // W -7 3 -5 -8 -10 -6 -9 -9 -3 -6 -2 -4 -5 1 -7 -3 -6 23 0 -8 -7 -7 -5 -10 // Y -4 -5 -3 -5 1 -5 -5 -6 0 -1 -1 -5 -3 9 -6 -4 -3 0 13 -3 -4 -5 -3 -10 // V 0 -3 -2 -3 -2 -2 -2 -2 -3 5 2 -3 2 -1 -1 -1 0 -8 -3 5 -2 -2 -1 -10 // B 0 -1 2 4 -5 2 3 1 1 -3 -4 1 -3 -6 -1 1 0 -7 -4 -2 3 3 -1 -10 // Z 0 0 2 3 -7 4 4 0 2 -2 -3 0 -2 -6 0 0 -1 -7 -5 -2 3 4 -1 -10 // X 0 -1 0 -1 -4 -1 -1 -1 -1 -1 -2 -1 -1 -3 -1 0 0 -5 -3 -1 -1 -1 -1 -10 // * -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 1 // PAM270 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 2, 0, -2, 0, 0, -4, 2, -2, -1, 0, -1, -2, -1, 0, 1, 0, -2, 1, 1, 0, -7, 0, -4, 0, -10}, {0, 0, 3, -5, 4, 3, -6, 1, 1, -3, 0, 1, -4, -3, 2, -1, 2, -1, 1, 0, -2, -7, -1, -4, 3, -10}, {0, -2, -5, 16, -6, -6, -5, -4, -4, -3, 0, -7, -7, -6, -4, -3, -7, -5, 0, -3, -2, -10, -4, 1, -7, -10}, {0, 0, 4, -6, 5, 4, -7, 1, 1, -3, 0, 0, -5, -3, 2, -1, 2, -1, 0, 0, -3, -8, -1, -5, 3, -10}, {0, 0, 3, -6, 4, 5, -7, 0, 1, -2, 0, 0, -4, -3, 2, -1, 3, -1, 0, 0, -2, -9, -1, -5, 4, -10}, {0, -4, -6, -5, -7, -7, 12, -6, -2, 1, 0, -6, 2, 0, -4, -6, -6, -5, -4, -4, -1, 1, -3, 9, -6, -10}, {0, 2, 1, -4, 1, 0, -6, 6, -2, -3, 0, -2, -5, -3, 1, 0, -1, -3, 1, 0, -2, -9, -1, -6, 0, -10}, {0, -2, 1, -4, 1, 1, -2, -2, 8, -3, 0, 0, -3, -3, 2, 0, 4, 2, -1, -1, -3, -3, -1, 0, 2, -10}, {0, -1, -3, -3, -3, -2, 1, -3, -3, 5, 0, -2, 3, 3, -2, -2, -2, -2, -2, 0, 5, -6, -1, -1, -2, -10}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, -1, 1, -7, 0, 0, -6, -2, 0, -2, 0, 6, -3, 0, 1, -1, 1, 4, 0, 0, -3, -4, -1, -5, 0, -10}, {0, -2, -4, -7, -5, -4, 2, -5, -3, 3, 0, -3, 8, 5, -3, -3, -2, -4, -3, -2, 2, -2, -2, -1, -3, -10}, {0, -1, -3, -6, -3, -3, 0, -3, -3, 3, 0, 0, 5, 8, -2, -2, -1, -1, -2, -1, 2, -5, -1, -3, -2, -10}, {0, 0, 2, -4, 2, 2, -4, 1, 2, -2, 0, 1, -3, -2, 2, 0, 1, 0, 1, 1, -2, -5, 0, -3, 2, -10}, {0, 1, -1, -3, -1, -1, -6, 0, 0, -2, 0, -1, -3, -2, 0, 7, 0, 0, 1, 0, -1, -7, -1, -6, 0, -10}, {0, 0, 2, -7, 2, 3, -6, -1, 4, -2, 0, 1, -2, -1, 1, 0, 5, 2, -1, -1, -2, -6, -1, -5, 4, -10}, {0, -2, -1, -5, -1, -1, -5, -3, 2, -2, 0, 4, -4, -1, 0, 0, 2, 8, 0, -1, -3, 3, -1, -5, 0, -10}, {0, 1, 1, 0, 0, 0, -4, 1, -1, -2, 0, 0, -3, -2, 1, 1, -1, 0, 2, 2, -1, -3, 0, -4, 0, -10}, {0, 1, 0, -3, 0, 0, -4, 0, -1, 0, 0, 0, -2, -1, 1, 0, -1, -1, 2, 3, 0, -6, 0, -3, -1, -10}, {0, 0, -2, -2, -3, -2, -1, -2, -3, 5, 0, -3, 2, 2, -2, -1, -2, -3, -1, 0, 5, -8, -1, -3, -2, -10}, {0, -7, -7, -10, -8, -9, 1, -9, -3, -6, 0, -4, -2, -5, -5, -7, -6, 3, -3, -6, -8, 23, -5, 0, -7, -10}, {0, 0, -1, -4, -1, -1, -3, -1, -1, -1, 0, -1, -2, -1, 0, -1, -1, -1, 0, 0, -1, -5, -1, -3, -1, -10}, {0, -4, -4, 1, -5, -5, 9, -6, 0, -1, 0, -5, -1, -3, -3, -6, -5, -5, -4, -3, -3, 0, -3, 13, -5, -10}, {0, 0, 3, -7, 3, 4, -6, 0, 2, -2, 0, 0, -3, -2, 2, 0, 4, 0, 0, -1, -2, -7, -1, -5, 4, -10}, {0, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, 0, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, 1}, } // # // # This matrix was produced by "pam" Version 1.0.6 [28-Jul-93] // # // # PAM 280 substitution matrix, scale = ln(2)/4 = 0.173287 // # // # Expected score = -0.916, Entropy = 0.289 bits // # // # Lowest score = -9, Highest score = 22 // # // A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * // A 2 -2 0 0 -2 0 0 2 -1 -1 -2 -1 -1 -4 1 1 1 -7 -4 0 0 0 0 -9 // R -2 7 0 -1 -4 2 -1 -3 2 -2 -3 4 0 -5 0 0 -1 3 -5 -3 -1 0 -1 -9 // N 0 0 2 2 -4 1 2 1 2 -2 -3 1 -2 -4 0 1 1 -5 -3 -2 2 1 0 -9 // D 0 -1 2 4 -6 2 4 1 1 -3 -5 0 -3 -7 -1 0 0 -8 -5 -2 4 3 -1 -9 // C -2 -4 -4 -6 15 -6 -6 -4 -4 -3 -7 -6 -6 -5 -3 0 -3 -9 1 -2 -5 -6 -3 -9 // Q 0 2 1 2 -6 4 3 -1 3 -2 -2 1 -1 -5 0 0 -1 -6 -5 -2 2 4 -1 -9 // E 0 -1 2 4 -6 3 4 0 1 -2 -4 0 -2 -6 0 0 0 -8 -5 -2 3 4 -1 -9 // G 2 -3 1 1 -4 -1 0 6 -2 -3 -5 -2 -3 -6 0 1 0 -8 -6 -1 1 0 -1 -9 // H -1 2 2 1 -4 3 1 -2 8 -3 -2 0 -2 -2 0 -1 -1 -3 0 -3 1 2 -1 -9 // I -1 -2 -2 -3 -3 -2 -2 -3 -3 5 3 -2 3 1 -2 -2 0 -6 -1 4 -2 -2 -1 -9 // L -2 -3 -3 -5 -7 -2 -4 -5 -2 3 7 -3 5 2 -3 -3 -2 -2 -1 2 -4 -3 -1 -9 // K -1 4 1 0 -6 1 0 -2 0 -2 -3 6 0 -6 -1 0 0 -4 -5 -3 1 1 -1 -9 // M -1 0 -2 -3 -6 -1 -2 -3 -2 3 5 0 7 0 -2 -2 -1 -5 -3 2 -2 -2 -1 -9 // F -4 -5 -4 -7 -5 -5 -6 -6 -2 1 2 -6 0 11 -5 -4 -4 1 9 -1 -5 -6 -3 -9 // P 1 0 0 -1 -3 0 0 0 0 -2 -3 -1 -2 -5 7 1 1 -7 -6 -1 -1 0 -1 -9 // S 1 0 1 0 0 0 0 1 -1 -2 -3 0 -2 -4 1 2 1 -3 -3 -1 1 0 0 -9 // T 1 -1 1 0 -3 -1 0 0 -1 0 -2 0 -1 -4 1 1 3 -6 -3 0 0 0 0 -9 // W -7 3 -5 -8 -9 -6 -8 -8 -3 -6 -2 -4 -5 1 -7 -3 -6 22 0 -7 -6 -7 -5 -9 // Y -4 -5 -3 -5 1 -5 -5 -6 0 -1 -1 -5 -3 9 -6 -3 -3 0 13 -3 -4 -5 -3 -9 // V 0 -3 -2 -2 -2 -2 -2 -1 -3 4 2 -3 2 -1 -1 -1 0 -7 -3 5 -2 -2 -1 -9 // B 0 -1 2 4 -5 2 3 1 1 -2 -4 1 -2 -5 -1 1 0 -6 -4 -2 3 2 -1 -9 // Z 0 0 1 3 -6 4 4 0 2 -2 -3 1 -2 -6 0 0 0 -7 -5 -2 2 4 -1 -9 // X 0 -1 0 -1 -3 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -3 -1 0 0 -5 -3 -1 -1 -1 -1 -9 // * -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 1 // PAM280 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 2, 0, -2, 0, 0, -4, 2, -1, -1, 0, -1, -2, -1, 0, 1, 0, -2, 1, 1, 0, -7, 0, -4, 0, -9}, {0, 0, 3, -5, 4, 3, -5, 1, 1, -2, 0, 1, -4, -2, 2, -1, 2, -1, 1, 0, -2, -6, -1, -4, 2, -9}, {0, -2, -5, 15, -6, -6, -5, -4, -4, -3, 0, -6, -7, -6, -4, -3, -6, -4, 0, -3, -2, -9, -3, 1, -6, -9}, {0, 0, 4, -6, 4, 4, -7, 1, 1, -3, 0, 0, -5, -3, 2, -1, 2, -1, 0, 0, -2, -8, -1, -5, 3, -9}, {0, 0, 3, -6, 4, 4, -6, 0, 1, -2, 0, 0, -4, -2, 2, 0, 3, -1, 0, 0, -2, -8, -1, -5, 4, -9}, {0, -4, -5, -5, -7, -6, 11, -6, -2, 1, 0, -6, 2, 0, -4, -5, -5, -5, -4, -4, -1, 1, -3, 9, -6, -9}, {0, 2, 1, -4, 1, 0, -6, 6, -2, -3, 0, -2, -5, -3, 1, 0, -1, -3, 1, 0, -1, -8, -1, -6, 0, -9}, {0, -1, 1, -4, 1, 1, -2, -2, 8, -3, 0, 0, -2, -2, 2, 0, 3, 2, -1, -1, -3, -3, -1, 0, 2, -9}, {0, -1, -2, -3, -3, -2, 1, -3, -3, 5, 0, -2, 3, 3, -2, -2, -2, -2, -2, 0, 4, -6, -1, -1, -2, -9}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, -1, 1, -6, 0, 0, -6, -2, 0, -2, 0, 6, -3, 0, 1, -1, 1, 4, 0, 0, -3, -4, -1, -5, 1, -9}, {0, -2, -4, -7, -5, -4, 2, -5, -2, 3, 0, -3, 7, 5, -3, -3, -2, -3, -3, -2, 2, -2, -1, -1, -3, -9}, {0, -1, -2, -6, -3, -2, 0, -3, -2, 3, 0, 0, 5, 7, -2, -2, -1, 0, -2, -1, 2, -5, -1, -3, -2, -9}, {0, 0, 2, -4, 2, 2, -4, 1, 2, -2, 0, 1, -3, -2, 2, 0, 1, 0, 1, 1, -2, -5, 0, -3, 1, -9}, {0, 1, -1, -3, -1, 0, -5, 0, 0, -2, 0, -1, -3, -2, 0, 7, 0, 0, 1, 1, -1, -7, -1, -6, 0, -9}, {0, 0, 2, -6, 2, 3, -5, -1, 3, -2, 0, 1, -2, -1, 1, 0, 4, 2, 0, -1, -2, -6, -1, -5, 4, -9}, {0, -2, -1, -4, -1, -1, -5, -3, 2, -2, 0, 4, -3, 0, 0, 0, 2, 7, 0, -1, -3, 3, -1, -5, 0, -9}, {0, 1, 1, 0, 0, 0, -4, 1, -1, -2, 0, 0, -3, -2, 1, 1, 0, 0, 2, 1, -1, -3, 0, -3, 0, -9}, {0, 1, 0, -3, 0, 0, -4, 0, -1, 0, 0, 0, -2, -1, 1, 1, -1, -1, 1, 3, 0, -6, 0, -3, 0, -9}, {0, 0, -2, -2, -2, -2, -1, -1, -3, 4, 0, -3, 2, 2, -2, -1, -2, -3, -1, 0, 5, -7, -1, -3, -2, -9}, {0, -7, -6, -9, -8, -8, 1, -8, -3, -6, 0, -4, -2, -5, -5, -7, -6, 3, -3, -6, -7, 22, -5, 0, -7, -9}, {0, 0, -1, -3, -1, -1, -3, -1, -1, -1, 0, -1, -1, -1, 0, -1, -1, -1, 0, 0, -1, -5, -1, -3, -1, -9}, {0, -4, -4, 1, -5, -5, 9, -6, 0, -1, 0, -5, -1, -3, -3, -6, 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4 -1 -9 // X 0 -1 0 -1 -3 0 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -3 -1 0 0 -5 -2 -1 0 -1 -1 -9 // * -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 1 // PAM290 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 2, 0, -2, 0, 0, -4, 2, -1, -1, 0, -1, -2, -1, 0, 1, 0, -2, 1, 1, 0, -7, 0, -4, 0, -9}, {0, 0, 3, -5, 3, 3, -5, 1, 1, -2, 0, 1, -4, -2, 2, -1, 2, 0, 1, 0, -2, -6, 0, -4, 2, -9}, {0, -2, -5, 15, -6, -6, -5, -4, -4, -3, 0, -6, -7, -6, -4, -3, -6, -4, 0, -2, -2, -9, -3, 1, -6, -9}, {0, 0, 3, -6, 4, 4, -6, 1, 1, -3, 0, 0, -4, -3, 2, -1, 2, -1, 0, 0, -2, -8, -1, -5, 3, -9}, {0, 0, 3, -6, 4, 4, -6, 0, 1, -2, 0, 0, -4, -2, 2, 0, 3, -1, 0, 0, -2, -8, -1, -5, 4, -9}, {0, -4, -5, -5, -6, -6, 11, -6, -2, 1, 0, -6, 3, 0, -4, -5, -5, -5, -4, -3, -1, 1, -3, 9, -6, -9}, {0, 2, 1, -4, 1, 0, -6, 5, -2, -3, 0, -2, -4, -3, 1, 0, -1, -3, 1, 0, -1, -8, -1, -6, 0, -9}, {0, -1, 1, -4, 1, 1, -2, -2, 7, -3, 0, 0, -2, -2, 2, 0, 3, 2, -1, -1, -2, -3, -1, 0, 2, -9}, {0, -1, -2, -3, -3, -2, 1, -3, -3, 5, 0, -2, 3, 3, -2, -2, -2, -2, -1, 0, 4, -6, -1, -1, -2, -9}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, -1, 1, -6, 0, 0, -6, -2, 0, -2, 0, 5, -3, 0, 1, -1, 1, 4, 0, 0, -3, -4, -1, -5, 1, -9}, {0, -2, -4, -7, -4, -4, 3, -4, -2, 3, 0, -3, 7, 5, -3, -3, -2, -3, -3, -2, 2, -2, -1, -1, -3, -9}, {0, -1, -2, -6, -3, -2, 0, -3, -2, 3, 0, 0, 5, 7, -2, -2, -1, 0, -2, -1, 2, -5, -1, -2, -2, -9}, {0, 0, 2, -4, 2, 2, -4, 1, 2, -2, 0, 1, -3, -2, 2, 0, 1, 0, 1, 1, -2, -5, 0, -3, 1, -9}, {0, 1, -1, -3, -1, 0, -5, 0, 0, -2, 0, -1, -3, -2, 0, 7, 0, 0, 1, 1, -1, -6, -1, -6, 0, -9}, {0, 0, 2, -6, 2, 3, -5, -1, 3, -2, 0, 1, -2, -1, 1, 0, 4, 2, 0, -1, -2, -5, 0, -5, 3, -9}, {0, -2, 0, -4, -1, -1, -5, -3, 2, -2, 0, 4, -3, 0, 0, 0, 2, 7, 0, -1, -3, 3, -1, -5, 0, -9}, {0, 1, 1, 0, 0, 0, -4, 1, -1, -1, 0, 0, -3, -2, 1, 1, 0, 0, 2, 1, -1, -3, 0, -3, 0, -9}, {0, 1, 0, -2, 0, 0, -3, 0, -1, 0, 0, 0, -2, -1, 1, 1, -1, -1, 1, 3, 0, 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-8 -2 -9 -9 -2 -5 -8 0 -4 -9 -4 -3 -6 -2 -10 -8 -7 -4 -6 -17 // N -4 -6 8 2 -11 -3 -2 -3 0 -5 -7 -1 -9 -9 -6 0 -2 -8 -4 -8 6 -3 -3 -17 // D -3 -10 2 8 -14 -2 2 -3 -4 -7 -12 -4 -11 -15 -8 -4 -5 -15 -11 -8 6 1 -5 -17 // C -6 -8 -11 -14 10 -14 -14 -9 -7 -6 -15 -14 -13 -13 -8 -3 -8 -15 -4 -6 -12 -14 -9 -17 // Q -4 -2 -3 -2 -14 8 1 -7 1 -8 -5 -3 -4 -13 -3 -5 -5 -13 -12 -7 -3 6 -5 -17 // E -2 -9 -2 2 -14 1 8 -4 -5 -5 -9 -4 -7 -14 -5 -4 -6 -17 -8 -6 1 6 -5 -17 // G -2 -9 -3 -3 -9 -7 -4 6 -9 -11 -10 -7 -8 -9 -6 -2 -6 -15 -14 -5 -3 -5 -5 -17 // H -7 -2 0 -4 -7 1 -5 -9 9 -9 -6 -6 -10 -6 -4 -6 -7 -7 -3 -6 -1 -1 -5 -17 // I -5 -5 -5 -7 -6 -8 -5 -11 -9 8 -1 -6 -1 -2 -8 -7 -2 -14 -6 2 -6 -6 -5 -17 // L -6 -8 -7 -12 -15 -5 -9 -10 -6 -1 7 -8 1 -3 -7 -8 -7 -6 -7 -2 -9 -7 -6 -17 // K -7 0 -1 -4 -14 -3 -4 -7 -6 -6 -8 7 -2 -14 -6 -4 -3 -12 -9 -9 -2 -4 -5 -17 // M -5 -4 -9 -11 -13 -4 -7 -8 -10 -1 1 -2 11 -4 -8 -5 -4 -13 -11 -1 -10 -5 -5 -17 // F -8 -9 -9 -15 -13 -13 -14 -9 -6 -2 -3 -14 -4 9 -10 -6 -9 -4 2 -8 -10 -13 -8 -17 // P -2 -4 -6 -8 -8 -3 -5 -6 -4 -8 -7 -6 -8 -10 8 -2 -4 -14 -13 -6 -7 -4 -5 -17 // S 0 -3 0 -4 -3 -5 -4 -2 -6 -7 -8 -4 -5 -6 -2 6 0 -5 -7 -6 -1 -5 -3 -17 // T -1 -6 -2 -5 -8 -5 -6 -6 -7 -2 -7 -3 -4 -9 -4 0 7 -13 -6 -3 -3 -6 -4 -17 // W -13 -2 -8 -15 -15 -13 -17 -15 -7 -14 -6 -12 -13 -4 -14 -5 -13 13 -5 -15 -10 -14 -11 -17 // Y -8 -10 -4 -11 -4 -12 -8 -14 -3 -6 -7 -9 -11 2 -13 -7 -6 -5 10 -7 -6 -9 -7 -17 // V -2 -8 -8 -8 -6 -7 -6 -5 -6 2 -2 -9 -1 -8 -6 -6 -3 -15 -7 7 -8 -6 -5 -17 // B -3 -7 6 6 -12 -3 1 -3 -1 -6 -9 -2 -10 -10 -7 -1 -3 -10 -6 -8 6 0 -5 -17 // Z -3 -4 -3 1 -14 6 6 -5 -1 -6 -7 -4 -5 -13 -4 -5 -6 -14 -9 -6 0 6 -5 -17 // X -3 -6 -3 -5 -9 -5 -5 -5 -5 -5 -6 -5 -5 -8 -5 -3 -4 -11 -7 -5 -5 -5 -5 -17 // * -17 -17 -17 -17 -17 -17 -17 -17 -17 -17 -17 -17 -17 -17 -17 -17 -17 -17 -17 -17 -17 -17 -17 1 // PAM30 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 6, -3, -6, -3, -2, -8, -2, -7, -5, 0, -7, -6, -5, -4, -2, -4, 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-5 -3 0 0 -1 -9 // N 0 0 2 2 -4 1 2 1 2 -2 -3 1 -2 -4 0 1 0 -5 -2 -2 2 1 0 -9 // D 0 -1 2 4 -6 2 4 1 1 -2 -4 0 -3 -6 -1 0 0 -7 -5 -2 3 3 -1 -9 // C -2 -4 -4 -6 15 -6 -6 -4 -4 -3 -7 -6 -6 -5 -3 0 -2 -9 1 -2 -5 -6 -3 -9 // Q 0 2 1 2 -6 4 3 -1 3 -2 -2 1 -1 -5 0 0 -1 -5 -4 -2 2 3 0 -9 // E 0 -1 2 4 -6 3 4 0 1 -2 -4 0 -2 -6 0 0 0 -8 -5 -2 3 3 -1 -9 // G 2 -2 1 1 -4 -1 0 5 -2 -3 -4 -2 -3 -5 0 1 0 -8 -6 -1 1 0 -1 -9 // H -1 2 2 1 -4 3 1 -2 7 -2 -2 0 -2 -2 0 -1 -1 -3 0 -2 1 2 0 -9 // I 0 -2 -2 -2 -3 -2 -2 -3 -2 5 3 -2 3 1 -2 -1 0 -6 -1 4 -2 -2 -1 -9 // L -2 -3 -3 -4 -7 -2 -4 -4 -2 3 7 -3 4 3 -3 -3 -2 -2 0 2 -4 -3 -1 -9 // K -1 4 1 0 -6 1 0 -2 0 -2 -3 5 0 -6 -1 0 0 -4 -5 -2 1 1 -1 -9 // M -1 0 -2 -3 -6 -1 -2 -3 -2 3 4 0 6 1 -2 -2 -1 -5 -2 2 -2 -2 -1 -9 // F -4 -5 -4 -6 -5 -5 -6 -5 -2 1 3 -6 1 11 -5 -4 -3 1 9 -1 -5 -5 -2 -9 // P 1 0 0 -1 -3 0 0 0 0 -2 -3 -1 -2 -5 6 1 1 -6 -5 -1 0 0 -1 -9 // S 1 0 1 0 0 0 0 1 -1 -1 -3 0 -2 -4 1 1 1 -3 -3 -1 1 0 0 -9 // T 1 -1 0 0 -2 -1 0 0 -1 0 -2 0 -1 -3 1 1 2 -6 -3 0 0 0 0 -9 // W -6 3 -5 -7 -9 -5 -8 -8 -3 -6 -2 -4 -5 1 -6 -3 -6 22 0 -7 -6 -6 -4 -9 // Y -4 -5 -2 -5 1 -4 -5 -6 0 -1 0 -5 -2 9 -5 -3 -3 0 12 -3 -4 -5 -2 -9 // V 0 -3 -2 -2 -2 -2 -2 -1 -2 4 2 -2 2 -1 -1 -1 0 -7 -3 5 -2 -2 0 -9 // B 0 0 2 3 -5 2 3 1 1 -2 -4 1 -2 -5 0 1 0 -6 -4 -2 3 2 0 -9 // Z 0 0 1 3 -6 3 3 0 2 -2 -3 1 -2 -5 0 0 0 -6 -5 -2 2 3 -1 -9 // X 0 -1 0 -1 -3 0 -1 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 0 -4 -2 0 0 -1 -1 -9 // * -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 1 // PAM300 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 2, 0, -2, 0, 0, -4, 2, -1, 0, 0, -1, -2, -1, 0, 1, 0, -1, 1, 1, 0, -6, 0, -4, 0, -9}, {0, 0, 3, -5, 3, 3, -5, 1, 1, -2, 0, 1, -4, -2, 2, 0, 2, 0, 1, 0, -2, -6, 0, -4, 2, -9}, {0, -2, -5, 15, -6, -6, -5, -4, -4, -3, 0, -6, -7, -6, -4, -3, -6, -4, 0, -2, -2, -9, -3, 1, -6, -9}, {0, 0, 3, -6, 4, 4, -6, 1, 1, -2, 0, 0, -4, -3, 2, -1, 2, -1, 0, 0, -2, -7, -1, -5, 3, -9}, {0, 0, 3, -6, 4, 4, -6, 0, 1, -2, 0, 0, -4, -2, 2, 0, 3, -1, 0, 0, -2, -8, -1, -5, 3, -9}, {0, -4, -5, -5, -6, -6, 11, -5, -2, 1, 0, -6, 3, 1, -4, -5, -5, -5, -4, -3, -1, 1, -2, 9, -5, -9}, {0, 2, 1, -4, 1, 0, -5, 5, -2, -3, 0, -2, -4, -3, 1, 0, -1, -2, 1, 0, -1, -8, -1, -6, 0, -9}, {0, -1, 1, -4, 1, 1, -2, -2, 7, -2, 0, 0, -2, -2, 2, 0, 3, 2, -1, -1, -2, -3, 0, 0, 2, -9}, {0, 0, -2, -3, -2, -2, 1, -3, -2, 5, 0, -2, 3, 3, -2, -2, -2, -2, -1, 0, 4, -6, -1, -1, -2, -9}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, -1, 1, -6, 0, 0, -6, -2, 0, -2, 0, 5, -3, 0, 1, -1, 1, 4, 0, 0, -2, -4, -1, -5, 1, -9}, {0, -2, -4, -7, -4, -4, 3, -4, -2, 3, 0, -3, 7, 4, -3, -3, -2, -3, -3, -2, 2, -2, -1, 0, -3, -9}, {0, -1, -2, -6, -3, -2, 1, -3, -2, 3, 0, 0, 4, 6, -2, -2, -1, 0, -2, -1, 2, -5, -1, -2, -2, -9}, {0, 0, 2, -4, 2, 2, -4, 1, 2, -2, 0, 1, -3, -2, 2, 0, 1, 0, 1, 0, -2, -5, 0, -2, 1, -9}, {0, 1, 0, -3, -1, 0, -5, 0, 0, -2, 0, -1, -3, -2, 0, 6, 0, 0, 1, 1, -1, -6, -1, -5, 0, -9}, {0, 0, 2, -6, 2, 3, -5, -1, 3, -2, 0, 1, -2, -1, 1, 0, 4, 2, 0, -1, -2, -5, 0, -4, 3, -9}, {0, -1, 0, -4, -1, -1, -5, -2, 2, -2, 0, 4, -3, 0, 0, 0, 2, 7, 0, -1, -3, 3, -1, -5, 0, -9}, {0, 1, 1, 0, 0, 0, -4, 1, -1, -1, 0, 0, -3, -2, 1, 1, 0, 0, 1, 1, -1, -3, 0, -3, 0, -9}, {0, 1, 0, -2, 0, 0, -3, 0, -1, 0, 0, 0, -2, -1, 0, 1, -1, -1, 1, 2, 0, -6, 0, -3, 0, -9}, {0, 0, -2, -2, -2, -2, -1, -1, -2, 4, 0, -2, 2, 2, -2, -1, -2, -3, -1, 0, 5, -7, 0, -3, -2, -9}, {0, -6, -6, -9, -7, -8, 1, -8, -3, -6, 0, -4, -2, -5, -5, -6, -5, 3, -3, -6, -7, 22, -4, 0, -6, -9}, {0, 0, 0, -3, -1, -1, -2, -1, 0, -1, 0, -1, -1, -1, 0, -1, 0, -1, 0, 0, 0, -4, -1, -2, -1, -9}, {0, -4, -4, 1, -5, -5, 9, -6, 0, -1, 0, -5, 0, -2, -2, -5, -4, -5, -3, -3, -3, 0, -2, 12, -5, -9}, {0, 0, 2, -6, 3, 3, -5, 0, 2, -2, 0, 1, -3, -2, 1, 0, 3, 0, 0, 0, -2, -6, -1, -5, 3, -9}, {0, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, 0, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, 1}, } // # // # This matrix was produced by "pam" Version 1.0.6 [28-Jul-93] // # // # PAM 310 substitution matrix, scale = ln(2)/4 = 0.173287 // # // # Expected score = -0.779, Entropy = 0.238 bits // # // # Lowest score = -9, Highest score = 22 // # // A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * // A 2 -1 0 0 -2 0 0 1 -1 0 -2 -1 -1 -4 1 1 1 -6 -4 0 0 0 0 -9 // R -1 6 0 -1 -4 1 -1 -2 2 -2 -3 4 0 -5 0 0 -1 3 -4 -2 0 0 -1 -9 // N 0 0 2 2 -4 1 2 1 2 -2 -3 1 -2 -4 0 1 0 -4 -2 -2 2 1 0 -9 // D 0 -1 2 4 -5 2 4 1 1 -2 -4 0 -2 -6 -1 0 0 -7 -5 -2 3 3 -1 -9 // C -2 -4 -4 -5 15 -6 -6 -3 -4 -2 -6 -6 -6 -4 -3 0 -2 -9 1 -2 -5 -6 -3 -9 // Q 0 1 1 2 -6 4 3 -1 3 -2 -2 1 -1 -5 0 0 -1 -5 -4 -2 2 3 0 -9 // E 0 -1 2 4 -6 3 4 1 1 -2 -3 0 -2 -6 0 0 0 -7 -5 -2 3 3 -1 -9 // G 1 -2 1 1 -3 -1 1 5 -2 -2 -4 -1 -3 -5 0 1 0 -8 -6 -1 1 0 -1 -9 // H -1 2 2 1 -4 3 1 -2 7 -2 -2 0 -2 -2 0 -1 -1 -3 0 -2 1 2 0 -9 // I 0 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 4 3 -2 3 1 -2 -1 0 -5 -1 4 -2 -2 -1 -9 // L -2 -3 -3 -4 -6 -2 -3 -4 -2 3 7 -3 4 3 -3 -3 -2 -2 0 2 -3 -3 -1 -9 // K -1 4 1 0 -6 1 0 -1 0 -2 -3 5 0 -5 -1 0 0 -3 -5 -2 1 1 -1 -9 // M -1 0 -2 -2 -6 -1 -2 -3 -2 3 4 0 6 1 -2 -2 -1 -4 -2 2 -2 -2 -1 -9 // F -4 -5 -4 -6 -4 -5 -6 -5 -2 1 3 -5 1 11 -5 -4 -3 1 9 -1 -5 -5 -2 -9 // P 1 0 0 -1 -3 0 0 0 0 -2 -3 -1 -2 -5 6 1 1 -6 -5 -1 0 0 0 -9 // S 1 0 1 0 0 0 0 1 -1 -1 -3 0 -2 -4 1 1 1 -3 -3 -1 1 0 0 -9 // T 1 -1 0 0 -2 -1 0 0 -1 0 -2 0 -1 -3 1 1 2 -6 -3 0 0 0 0 -9 // W -6 3 -4 -7 -9 -5 -7 -8 -3 -5 -2 -3 -4 1 -6 -3 -6 22 0 -7 -6 -6 -4 -9 // Y -4 -4 -2 -5 1 -4 -5 -6 0 -1 0 -5 -2 9 -5 -3 -3 0 12 -2 -4 -4 -2 -9 // V 0 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -1 -2 4 2 -2 2 -1 -1 -1 0 -7 -2 4 -2 -2 0 -9 // B 0 0 2 3 -5 2 3 1 1 -2 -3 1 -2 -5 0 1 0 -6 -4 -2 3 2 0 -9 // Z 0 0 1 3 -6 3 3 0 2 -2 -3 1 -2 -5 0 0 0 -6 -4 -2 2 3 0 -9 // X 0 -1 0 -1 -3 0 -1 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 0 0 0 -4 -2 0 0 0 -1 -9 // * -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 1 // PAM310 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 2, 0, -2, 0, 0, -4, 1, -1, 0, 0, -1, -2, -1, 0, 1, 0, -1, 1, 1, 0, -6, 0, -4, 0, -9}, {0, 0, 3, -5, 3, 3, -5, 1, 1, -2, 0, 1, -3, -2, 2, 0, 2, 0, 1, 0, -2, -6, 0, -4, 2, -9}, {0, -2, -5, 15, -5, -6, -4, -3, -4, -2, 0, -6, -6, -6, -4, -3, -6, -4, 0, -2, -2, -9, -3, 1, -6, -9}, {0, 0, 3, -5, 4, 4, -6, 1, 1, -2, 0, 0, -4, -2, 2, -1, 2, -1, 0, 0, -2, -7, -1, -5, 3, -9}, {0, 0, 3, -6, 4, 4, -6, 1, 1, -2, 0, 0, -3, -2, 2, 0, 3, -1, 0, 0, -2, -7, -1, -5, 3, -9}, {0, -4, -5, -4, -6, -6, 11, -5, -2, 1, 0, -5, 3, 1, -4, -5, -5, -5, -4, -3, -1, 1, -2, 9, -5, -9}, {0, 1, 1, -3, 1, 1, -5, 5, -2, -2, 0, -1, -4, -3, 1, 0, -1, -2, 1, 0, -1, -8, -1, -6, 0, -9}, {0, -1, 1, -4, 1, 1, -2, -2, 7, -2, 0, 0, -2, -2, 2, 0, 3, 2, -1, -1, -2, -3, 0, 0, 2, -9}, {0, 0, -2, -2, -2, -2, 1, -2, -2, 4, 0, -2, 3, 3, -2, -2, -2, -2, -1, 0, 4, -5, -1, -1, -2, -9}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, -1, 1, -6, 0, 0, -5, -1, 0, -2, 0, 5, -3, 0, 1, -1, 1, 4, 0, 0, -2, -3, -1, -5, 1, -9}, {0, -2, -3, -6, -4, -3, 3, -4, -2, 3, 0, -3, 7, 4, -3, -3, -2, -3, -3, -2, 2, -2, -1, 0, -3, -9}, {0, -1, -2, -6, -2, -2, 1, -3, -2, 3, 0, 0, 4, 6, -2, -2, -1, 0, -2, -1, 2, -4, -1, -2, -2, -9}, {0, 0, 2, -4, 2, 2, -4, 1, 2, -2, 0, 1, -3, -2, 2, 0, 1, 0, 1, 0, -2, -4, 0, -2, 1, -9}, {0, 1, 0, -3, -1, 0, -5, 0, 0, -2, 0, -1, -3, -2, 0, 6, 0, 0, 1, 1, -1, -6, 0, -5, 0, -9}, {0, 0, 2, -6, 2, 3, -5, -1, 3, -2, 0, 1, -2, -1, 1, 0, 4, 1, 0, -1, -2, -5, 0, -4, 3, -9}, {0, -1, 0, -4, -1, -1, -5, -2, 2, -2, 0, 4, -3, 0, 0, 0, 1, 6, 0, -1, -2, 3, -1, -4, 0, -9}, {0, 1, 1, 0, 0, 0, -4, 1, -1, -1, 0, 0, -3, -2, 1, 1, 0, 0, 1, 1, -1, -3, 0, -3, 0, -9}, {0, 1, 0, -2, 0, 0, -3, 0, -1, 0, 0, 0, -2, -1, 0, 1, -1, -1, 1, 2, 0, -6, 0, -3, 0, -9}, {0, 0, -2, -2, -2, -2, -1, -1, -2, 4, 0, -2, 2, 2, -2, -1, -2, -2, -1, 0, 4, -7, 0, -2, -2, -9}, {0, -6, -6, -9, -7, -7, 1, -8, -3, -5, 0, -3, -2, -4, -4, -6, -5, 3, -3, -6, -7, 22, -4, 0, -6, -9}, {0, 0, 0, -3, -1, -1, -2, -1, 0, -1, 0, -1, -1, -1, 0, 0, 0, -1, 0, 0, 0, -4, -1, -2, 0, -9}, {0, -4, -4, 1, -5, -5, 9, -6, 0, -1, 0, -5, 0, -2, -2, -5, -4, -4, -3, -3, -2, 0, -2, 12, -4, -9}, {0, 0, 2, -6, 3, 3, -5, 0, 2, -2, 0, 1, -3, -2, 1, 0, 3, 0, 0, 0, -2, -6, 0, -4, 3, -9}, {0, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, 0, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, 1}, } // # // # This matrix was produced by "pam" Version 1.0.6 [28-Jul-93] // # // # PAM 320 substitution matrix, scale = ln(2)/4 = 0.173287 // # // # Expected score = -0.741, Entropy = 0.224 bits // # // # Lowest score = -8, Highest score = 22 // # // A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * // A 1 -1 0 1 -2 0 0 1 -1 0 -2 -1 -1 -4 1 1 1 -6 -4 0 0 0 0 -8 // R -1 6 0 -1 -4 1 -1 -2 2 -2 -3 4 0 -5 0 0 -1 3 -4 -2 0 0 -1 -8 // N 0 0 2 2 -4 1 2 1 2 -2 -3 1 -2 -4 0 1 0 -4 -2 -2 2 1 0 -8 // D 1 -1 2 4 -5 2 3 1 1 -2 -4 0 -2 -6 0 0 0 -7 -5 -2 3 3 -1 -8 // C -2 -4 -4 -5 15 -5 -5 -3 -4 -2 -6 -6 -5 -4 -3 0 -2 -8 1 -2 -4 -5 -3 -8 // Q 0 1 1 2 -5 4 2 -1 3 -2 -2 1 -1 -5 0 0 0 -5 -4 -2 2 3 0 -8 // E 0 -1 2 3 -5 2 4 1 1 -2 -3 0 -2 -5 0 0 0 -7 -5 -2 3 3 0 -8 // G 1 -2 1 1 -3 -1 1 5 -2 -2 -4 -1 -3 -5 0 1 0 -7 -5 -1 1 0 -1 -8 // H -1 2 2 1 -4 3 1 -2 6 -2 -2 0 -2 -2 0 -1 -1 -3 0 -2 1 2 0 -8 // I 0 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 4 3 -2 2 1 -2 -1 0 -5 -1 4 -2 -2 0 -8 // L -2 -3 -3 -4 -6 -2 -3 -4 -2 3 7 -3 4 3 -2 -3 -2 -2 0 2 -3 -3 -1 -8 // K -1 4 1 0 -6 1 0 -1 0 -2 -3 5 0 -5 -1 0 0 -3 -5 -2 1 1 -1 -8 // M -1 0 -2 -2 -5 -1 -2 -3 -2 2 4 0 6 1 -2 -1 -1 -4 -2 2 -2 -2 0 -8 // F -4 -5 -4 -6 -4 -5 -5 -5 -2 1 3 -5 1 11 -5 -3 -3 1 9 -1 -5 -5 -2 -8 // P 1 0 0 0 -3 0 0 0 0 -2 -2 -1 -2 -5 6 1 1 -6 -5 -1 0 0 0 -8 // S 1 0 1 0 0 0 0 1 -1 -1 -3 0 -1 -3 1 1 1 -3 -3 -1 1 0 0 -8 // T 1 -1 0 0 -2 0 0 0 -1 0 -2 0 -1 -3 1 1 2 -5 -3 0 0 0 0 -8 // W -6 3 -4 -7 -8 -5 -7 -7 -3 -5 -2 -3 -4 1 -6 -3 -5 22 1 -6 -6 -6 -4 -8 // Y -4 -4 -2 -5 1 -4 -5 -5 0 -1 0 -5 -2 9 -5 -3 -3 1 12 -2 -3 -4 -2 -8 // V 0 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -1 -2 4 2 -2 2 -1 -1 -1 0 -6 -2 4 -2 -2 0 -8 // B 0 0 2 3 -4 2 3 1 1 -2 -3 1 -2 -5 0 1 0 -6 -3 -2 2 2 0 -8 // Z 0 0 1 3 -5 3 3 0 2 -2 -3 1 -2 -5 0 0 0 -6 -4 -2 2 3 0 -8 // X 0 -1 0 -1 -3 0 0 -1 0 0 -1 -1 0 -2 0 0 0 -4 -2 0 0 0 -1 -8 // * -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 1 // PAM320 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 1, 0, -2, 1, 0, -4, 1, -1, 0, 0, -1, -2, -1, 0, 1, 0, -1, 1, 1, 0, -6, 0, -4, 0, -8}, {0, 0, 2, -4, 3, 3, -5, 1, 1, -2, 0, 1, -3, -2, 2, 0, 2, 0, 1, 0, -2, -6, 0, -3, 2, -8}, {0, -2, -4, 15, -5, -5, -4, -3, -4, -2, 0, -6, -6, -5, -4, -3, -5, -4, 0, -2, -2, -8, -3, 1, -5, -8}, {0, 1, 3, -5, 4, 3, -6, 1, 1, -2, 0, 0, -4, -2, 2, 0, 2, -1, 0, 0, -2, -7, -1, -5, 3, -8}, {0, 0, 3, -5, 3, 4, -5, 1, 1, -2, 0, 0, -3, -2, 2, 0, 2, -1, 0, 0, -2, -7, 0, -5, 3, -8}, {0, -4, -5, -4, -6, -5, 11, -5, -2, 1, 0, -5, 3, 1, -4, -5, -5, -5, -3, -3, -1, 1, -2, 9, -5, -8}, {0, 1, 1, -3, 1, 1, -5, 5, -2, -2, 0, -1, -4, -3, 1, 0, -1, -2, 1, 0, -1, -7, -1, -5, 0, -8}, {0, -1, 1, -4, 1, 1, -2, -2, 6, -2, 0, 0, -2, -2, 2, 0, 3, 2, -1, -1, -2, -3, 0, 0, 2, -8}, {0, 0, -2, -2, -2, -2, 1, -2, -2, 4, 0, -2, 3, 2, -2, -2, -2, -2, -1, 0, 4, -5, 0, -1, -2, -8}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, -1, 1, -6, 0, 0, -5, -1, 0, -2, 0, 5, -3, 0, 1, -1, 1, 4, 0, 0, -2, -3, -1, -5, 1, -8}, {0, -2, -3, -6, -4, -3, 3, -4, -2, 3, 0, -3, 7, 4, -3, -2, -2, -3, -3, -2, 2, -2, -1, 0, -3, -8}, {0, -1, -2, -5, -2, -2, 1, -3, -2, 2, 0, 0, 4, 6, -2, -2, -1, 0, -1, -1, 2, -4, 0, -2, -2, -8}, {0, 0, 2, -4, 2, 2, -4, 1, 2, -2, 0, 1, -3, -2, 2, 0, 1, 0, 1, 0, -2, -4, 0, -2, 1, -8}, {0, 1, 0, -3, 0, 0, -5, 0, 0, -2, 0, -1, -2, -2, 0, 6, 0, 0, 1, 1, -1, -6, 0, -5, 0, -8}, {0, 0, 2, -5, 2, 2, -5, -1, 3, -2, 0, 1, -2, -1, 1, 0, 4, 1, 0, 0, -2, -5, 0, -4, 3, -8}, {0, -1, 0, -4, -1, -1, -5, -2, 2, -2, 0, 4, -3, 0, 0, 0, 1, 6, 0, -1, -2, 3, -1, -4, 0, -8}, {0, 1, 1, 0, 0, 0, -3, 1, -1, -1, 0, 0, -3, -1, 1, 1, 0, 0, 1, 1, -1, -3, 0, -3, 0, -8}, {0, 1, 0, -2, 0, 0, -3, 0, -1, 0, 0, 0, -2, -1, 0, 1, 0, -1, 1, 2, 0, -5, 0, -3, 0, -8}, {0, 0, -2, -2, -2, -2, -1, -1, -2, 4, 0, -2, 2, 2, -2, -1, -2, -2, -1, 0, 4, -6, 0, -2, -2, -8}, {0, -6, -6, -8, -7, -7, 1, -7, -3, -5, 0, -3, -2, -4, -4, -6, -5, 3, -3, -5, -6, 22, -4, 1, -6, -8}, {0, 0, 0, -3, -1, 0, -2, -1, 0, 0, 0, -1, -1, 0, 0, 0, 0, -1, 0, 0, 0, -4, -1, -2, 0, -8}, {0, -4, -3, 1, -5, -5, 9, -5, 0, -1, 0, -5, 0, -2, -2, -5, -4, -4, -3, -3, -2, 1, -2, 12, -4, -8}, {0, 0, 2, -5, 3, 3, -5, 0, 2, -2, 0, 1, -3, -2, 1, 0, 3, 0, 0, 0, -2, -6, 0, -4, 3, -8}, {0, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, 0, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, 1}, } // # // # This matrix was produced by "pam" Version 1.0.6 [28-Jul-93] // # // # PAM 330 substitution matrix, scale = ln(2)/4 = 0.173287 // # // # Expected score = -0.693, Entropy = 0.210 bits // # // # Lowest score = -8, Highest score = 22 // # // A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * // A 1 -1 0 1 -2 0 0 1 -1 0 -2 -1 -1 -3 1 1 1 -6 -3 0 0 0 0 -8 // R -1 6 0 -1 -4 1 -1 -2 2 -2 -3 4 0 -4 0 0 -1 3 -4 -2 0 0 -1 -8 // N 0 0 2 2 -4 1 2 1 1 -2 -3 1 -1 -3 0 1 0 -4 -2 -1 2 1 0 -8 // D 1 -1 2 3 -5 2 3 1 1 -2 -4 0 -2 -5 0 0 0 -7 -4 -2 3 3 0 -8 // C -2 -4 -4 -5 15 -5 -5 -3 -3 -2 -6 -5 -5 -4 -3 0 -2 -8 1 -2 -4 -5 -3 -8 // Q 0 1 1 2 -5 3 2 -1 3 -2 -2 1 -1 -4 0 0 0 -5 -4 -2 1 3 0 -8 // E 0 -1 2 3 -5 2 3 1 1 -2 -3 0 -2 -5 0 0 0 -7 -4 -2 2 3 0 -8 // G 1 -2 1 1 -3 -1 1 5 -2 -2 -4 -1 -2 -5 0 1 0 -7 -5 -1 1 0 -1 -8 // H -1 2 1 1 -3 3 1 -2 6 -2 -2 0 -2 -2 0 -1 -1 -3 0 -2 1 2 0 -8 // I 0 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 4 3 -2 2 1 -2 -1 0 -5 0 4 -2 -2 0 -8 // L -2 -3 -3 -4 -6 -2 -3 -4 -2 3 6 -3 4 3 -2 -3 -1 -2 0 2 -3 -2 -1 -8 // K -1 4 1 0 -5 1 0 -1 0 -2 -3 5 0 -5 -1 0 0 -3 -4 -2 1 1 -1 -8 // M -1 0 -1 -2 -5 -1 -2 -2 -2 2 4 0 5 1 -2 -1 0 -4 -2 2 -2 -1 0 -8 // F -3 -4 -3 -5 -4 -4 -5 -5 -2 1 3 -5 1 10 -5 -3 -3 1 9 -1 -4 -5 -2 -8 // P 1 0 0 0 -3 0 0 0 0 -2 -2 -1 -2 -5 6 1 1 -6 -5 -1 0 0 0 -8 // S 1 0 1 0 0 0 0 1 -1 -1 -3 0 -1 -3 1 1 1 -3 -3 -1 1 0 0 -8 // T 1 -1 0 0 -2 0 0 0 -1 0 -1 0 0 -3 1 1 2 -5 -3 0 0 0 0 -8 // W -6 3 -4 -7 -8 -5 -7 -7 -3 -5 -2 -3 -4 1 -6 -3 -5 22 1 -6 -5 -6 -4 -8 // Y -3 -4 -2 -4 1 -4 -4 -5 0 0 0 -4 -2 9 -5 -3 -3 1 12 -2 -3 -4 -2 -8 // V 0 -2 -1 -2 -2 -2 -2 -1 -2 4 2 -2 2 -1 -1 -1 0 -6 -2 4 -2 -2 0 -8 // B 0 0 2 3 -4 1 2 1 1 -2 -3 1 -2 -4 0 1 0 -5 -3 -2 2 2 0 -8 // Z 0 0 1 3 -5 3 3 0 2 -2 -2 1 -1 -5 0 0 0 -6 -4 -2 2 3 0 -8 // X 0 -1 0 0 -3 0 0 -1 0 0 -1 -1 0 -2 0 0 0 -4 -2 0 0 0 -1 -8 // * -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 1 // PAM330 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 1, 0, -2, 1, 0, -3, 1, -1, 0, 0, -1, -2, -1, 0, 1, 0, -1, 1, 1, 0, -6, 0, -3, 0, -8}, {0, 0, 2, -4, 3, 2, -4, 1, 1, -2, 0, 1, -3, -2, 2, 0, 1, 0, 1, 0, -2, -5, 0, -3, 2, -8}, {0, -2, -4, 15, -5, -5, -4, -3, -3, -2, 0, -5, -6, -5, -4, -3, -5, -4, 0, -2, -2, -8, -3, 1, -5, -8}, {0, 1, 3, -5, 3, 3, -5, 1, 1, -2, 0, 0, -4, -2, 2, 0, 2, -1, 0, 0, -2, -7, 0, -4, 3, -8}, {0, 0, 2, -5, 3, 3, -5, 1, 1, -2, 0, 0, -3, -2, 2, 0, 2, -1, 0, 0, -2, -7, 0, -4, 3, -8}, {0, -3, -4, -4, -5, -5, 10, -5, -2, 1, 0, -5, 3, 1, -3, -5, -4, -4, -3, -3, -1, 1, -2, 9, -5, -8}, {0, 1, 1, -3, 1, 1, -5, 5, -2, -2, 0, -1, -4, -2, 1, 0, -1, -2, 1, 0, -1, -7, -1, -5, 0, -8}, {0, -1, 1, -3, 1, 1, -2, -2, 6, -2, 0, 0, -2, -2, 1, 0, 3, 2, -1, -1, -2, -3, 0, 0, 2, -8}, {0, 0, -2, -2, -2, -2, 1, -2, -2, 4, 0, -2, 3, 2, -2, -2, -2, -2, -1, 0, 4, -5, 0, 0, -2, -8}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, -1, 1, -5, 0, 0, -5, -1, 0, -2, 0, 5, -3, 0, 1, -1, 1, 4, 0, 0, -2, -3, -1, -4, 1, -8}, {0, -2, -3, -6, -4, -3, 3, -4, -2, 3, 0, -3, 6, 4, -3, -2, -2, -3, -3, -1, 2, -2, -1, 0, -2, -8}, {0, -1, -2, -5, -2, -2, 1, -2, -2, 2, 0, 0, 4, 5, -1, -2, -1, 0, -1, 0, 2, -4, 0, -2, -1, -8}, {0, 0, 2, -4, 2, 2, -3, 1, 1, -2, 0, 1, -3, -1, 2, 0, 1, 0, 1, 0, -1, -4, 0, -2, 1, -8}, {0, 1, 0, -3, 0, 0, -5, 0, 0, -2, 0, -1, -2, -2, 0, 6, 0, 0, 1, 1, -1, -6, 0, -5, 0, -8}, {0, 0, 1, -5, 2, 2, -4, -1, 3, -2, 0, 1, -2, -1, 1, 0, 3, 1, 0, 0, -2, -5, 0, -4, 3, -8}, {0, -1, 0, -4, -1, -1, -4, -2, 2, -2, 0, 4, -3, 0, 0, 0, 1, 6, 0, -1, -2, 3, -1, -4, 0, -8}, {0, 1, 1, 0, 0, 0, -3, 1, -1, -1, 0, 0, -3, -1, 1, 1, 0, 0, 1, 1, -1, -3, 0, -3, 0, -8}, {0, 1, 0, -2, 0, 0, -3, 0, -1, 0, 0, 0, -1, 0, 0, 1, 0, -1, 1, 2, 0, -5, 0, -3, 0, -8}, {0, 0, -2, -2, -2, -2, -1, -1, -2, 4, 0, -2, 2, 2, -1, -1, -2, -2, -1, 0, 4, -6, 0, -2, -2, -8}, {0, -6, -5, -8, -7, -7, 1, -7, -3, -5, 0, -3, -2, -4, -4, -6, -5, 3, -3, -5, -6, 22, -4, 1, -6, -8}, {0, 0, 0, -3, 0, 0, -2, -1, 0, 0, 0, -1, -1, 0, 0, 0, 0, -1, 0, 0, 0, -4, -1, -2, 0, -8}, {0, -3, -3, 1, -4, -4, 9, -5, 0, 0, 0, -4, 0, -2, -2, -5, -4, -4, -3, -3, -2, 1, -2, 12, -4, -8}, {0, 0, 2, -5, 3, 3, -5, 0, 2, -2, 0, 1, -2, -1, 1, 0, 3, 0, 0, 0, -2, -6, 0, -4, 3, -8}, {0, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, 0, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, 1}, } // # // # This matrix was produced by "pam" Version 1.0.6 [28-Jul-93] // # // # PAM 340 substitution matrix, scale = ln(2)/4 = 0.173287 // # // # Expected score = -0.680, Entropy = 0.198 bits // # // # Lowest score = -8, Highest score = 22 // # // A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * // A 1 -1 0 1 -2 0 0 1 -1 0 -2 -1 -1 -3 1 1 1 -6 -3 0 0 0 0 -8 // R -1 6 0 -1 -4 1 0 -2 2 -2 -3 4 0 -4 0 0 0 3 -4 -2 0 0 -1 -8 // N 0 0 1 2 -3 1 1 1 1 -2 -3 1 -1 -3 0 1 0 -4 -2 -1 2 1 0 -8 // D 1 -1 2 3 -5 2 3 1 1 -2 -4 0 -2 -5 0 0 0 -7 -4 -2 3 3 0 -8 // C -2 -4 -3 -5 15 -5 -5 -3 -3 -2 -6 -5 -5 -4 -3 0 -2 -8 1 -2 -4 -5 -3 -8 // Q 0 1 1 2 -5 3 2 -1 3 -2 -2 1 -1 -4 0 0 0 -5 -4 -2 1 3 0 -8 // E 0 0 1 3 -5 2 3 1 1 -2 -3 0 -2 -5 0 0 0 -7 -4 -1 2 3 0 -8 // G 1 -2 1 1 -3 -1 1 4 -2 -2 -4 -1 -2 -5 0 1 0 -7 -5 -1 1 0 -1 -8 // H -1 2 1 1 -3 3 1 -2 6 -2 -2 0 -2 -2 0 0 -1 -2 0 -2 1 2 0 -8 // I 0 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 4 3 -2 2 1 -2 -1 0 -5 0 3 -2 -2 0 -8 // L -2 -3 -3 -4 -6 -2 -3 -4 -2 3 6 -3 4 3 -2 -2 -1 -2 0 2 -3 -2 -1 -8 // K -1 4 1 0 -5 1 0 -1 0 -2 -3 4 0 -5 -1 0 0 -3 -4 -2 1 1 0 -8 // M -1 0 -1 -2 -5 -1 -2 -2 -2 2 4 0 5 1 -2 -1 0 -4 -2 2 -2 -1 0 -8 // F -3 -4 -3 -5 -4 -4 -5 -5 -2 1 3 -5 1 10 -4 -3 -3 1 9 -1 -4 -5 -2 -8 // P 1 0 0 0 -3 0 0 0 0 -2 -2 -1 -2 -4 5 1 1 -5 -5 -1 0 0 0 -8 // S 1 0 1 0 0 0 0 1 0 -1 -2 0 -1 -3 1 1 1 -3 -3 -1 1 0 0 -8 // T 1 0 0 0 -2 0 0 0 -1 0 -1 0 0 -3 1 1 2 -5 -3 0 0 0 0 -8 // W -6 3 -4 -7 -8 -5 -7 -7 -2 -5 -2 -3 -4 1 -5 -3 -5 22 1 -6 -5 -6 -4 -8 // Y -3 -4 -2 -4 1 -4 -4 -5 0 0 0 -4 -2 9 -5 -3 -3 1 12 -2 -3 -4 -2 -8 // V 0 -2 -1 -2 -2 -2 -1 -1 -2 3 2 -2 2 -1 -1 -1 0 -6 -2 4 -2 -2 0 -8 // B 0 0 2 3 -4 1 2 1 1 -2 -3 1 -2 -4 0 1 0 -5 -3 -2 2 2 0 -8 // Z 0 0 1 3 -5 3 3 0 2 -2 -2 1 -1 -5 0 0 0 -6 -4 -2 2 3 0 -8 // X 0 -1 0 0 -3 0 0 -1 0 0 -1 0 0 -2 0 0 0 -4 -2 0 0 0 -1 -8 // * -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 1 // PAM340 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 1, 0, -2, 1, 0, -3, 1, -1, 0, 0, -1, -2, -1, 0, 1, 0, -1, 1, 1, 0, -6, 0, -3, 0, -8}, {0, 0, 2, -4, 3, 2, -4, 1, 1, -2, 0, 1, -3, -2, 2, 0, 1, 0, 1, 0, -2, -5, 0, -3, 2, -8}, {0, -2, -4, 15, -5, -5, -4, -3, -3, -2, 0, -5, -6, -5, -3, -3, -5, -4, 0, -2, -2, -8, -3, 1, -5, -8}, {0, 1, 3, -5, 3, 3, -5, 1, 1, -2, 0, 0, -4, -2, 2, 0, 2, -1, 0, 0, -2, -7, 0, -4, 3, -8}, {0, 0, 2, -5, 3, 3, -5, 1, 1, -2, 0, 0, -3, -2, 1, 0, 2, 0, 0, 0, -1, -7, 0, -4, 3, -8}, {0, -3, -4, -4, -5, -5, 10, -5, -2, 1, 0, -5, 3, 1, -3, -4, -4, -4, -3, -3, -1, 1, -2, 9, -5, -8}, {0, 1, 1, -3, 1, 1, -5, 4, -2, -2, 0, -1, -4, -2, 1, 0, -1, -2, 1, 0, -1, -7, -1, -5, 0, -8}, {0, -1, 1, -3, 1, 1, -2, -2, 6, -2, 0, 0, -2, -2, 1, 0, 3, 2, 0, -1, -2, -2, 0, 0, 2, -8}, {0, 0, -2, -2, -2, -2, 1, -2, -2, 4, 0, -2, 3, 2, -2, -2, -2, -2, -1, 0, 3, -5, 0, 0, -2, -8}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, -1, 1, -5, 0, 0, -5, -1, 0, -2, 0, 4, -3, 0, 1, -1, 1, 4, 0, 0, -2, -3, 0, -4, 1, -8}, {0, -2, -3, -6, -4, -3, 3, -4, -2, 3, 0, -3, 6, 4, -3, -2, -2, -3, -2, -1, 2, -2, -1, 0, -2, -8}, {0, -1, -2, -5, -2, -2, 1, -2, -2, 2, 0, 0, 4, 5, -1, -2, -1, 0, -1, 0, 2, -4, 0, -2, -1, -8}, {0, 0, 2, -3, 2, 1, -3, 1, 1, -2, 0, 1, -3, -1, 1, 0, 1, 0, 1, 0, -1, -4, 0, -2, 1, -8}, {0, 1, 0, -3, 0, 0, -4, 0, 0, -2, 0, -1, -2, -2, 0, 5, 0, 0, 1, 1, -1, -5, 0, -5, 0, -8}, {0, 0, 1, -5, 2, 2, -4, -1, 3, -2, 0, 1, -2, -1, 1, 0, 3, 1, 0, 0, -2, -5, 0, -4, 3, -8}, {0, -1, 0, -4, -1, 0, -4, -2, 2, -2, 0, 4, -3, 0, 0, 0, 1, 6, 0, 0, -2, 3, -1, -4, 0, -8}, {0, 1, 1, 0, 0, 0, -3, 1, 0, -1, 0, 0, -2, -1, 1, 1, 0, 0, 1, 1, -1, -3, 0, -3, 0, -8}, {0, 1, 0, -2, 0, 0, -3, 0, -1, 0, 0, 0, -1, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 2, 0, -5, 0, -3, 0, -8}, {0, 0, -2, -2, -2, -1, -1, -1, -2, 3, 0, -2, 2, 2, -1, -1, -2, -2, -1, 0, 4, -6, 0, -2, -2, -8}, {0, -6, -5, -8, -7, -7, 1, -7, -2, -5, 0, -3, -2, -4, -4, -5, -5, 3, -3, -5, -6, 22, -4, 1, -6, -8}, {0, 0, 0, -3, 0, 0, -2, -1, 0, 0, 0, 0, -1, 0, 0, 0, 0, -1, 0, 0, 0, -4, -1, -2, 0, -8}, {0, -3, -3, 1, -4, -4, 9, -5, 0, 0, 0, -4, 0, -2, -2, -5, -4, -4, -3, -3, -2, 1, -2, 12, -4, -8}, {0, 0, 2, -5, 3, 3, -5, 0, 2, -2, 0, 1, -2, -1, 1, 0, 3, 0, 0, 0, -2, -6, 0, -4, 3, -8}, {0, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, 0, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, 1}, } // # // # This matrix was produced by "pam" Version 1.0.6 [28-Jul-93] // # // # PAM 350 substitution matrix, scale = ln(2)/5 = 0.138629 // # // # Expected score = -0.701, Entropy = 0.186 bits // # // # Lowest score = -10, Highest score = 27 // # // A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * // A 2 -1 0 1 -2 0 1 2 -1 0 -2 -1 -1 -4 1 1 1 -7 -4 0 1 0 0 -10 // R -1 7 1 -1 -4 2 0 -2 2 -2 -3 4 0 -5 0 0 -1 4 -5 -3 0 1 -1 -10 // N 0 1 2 2 -4 1 2 1 2 -2 -3 1 -2 -4 0 1 1 -5 -3 -2 2 2 0 -10 // D 1 -1 2 4 -6 2 4 1 1 -2 -4 1 -3 -6 0 1 0 -8 -5 -2 3 3 -1 -10 // C -2 -4 -4 -6 18 -6 -6 -4 -4 -3 -7 -6 -6 -5 -3 0 -2 -10 1 -2 -5 -6 -3 -10 // Q 0 2 1 2 -6 4 3 -1 3 -2 -2 1 -1 -5 1 0 0 -5 -5 -2 2 3 0 -10 // E 1 0 2 4 -6 3 4 1 1 -2 -4 0 -2 -6 0 0 0 -8 -5 -2 3 3 0 -10 // G 2 -2 1 1 -4 -1 1 5 -2 -2 -4 -1 -3 -6 0 1 1 -8 -6 -1 1 0 -1 -10 // H -1 2 2 1 -4 3 1 -2 7 -2 -2 1 -2 -2 0 -1 -1 -3 0 -2 1 2 0 -10 // I 0 -2 -2 -2 -3 -2 -2 -2 -2 5 4 -2 3 2 -2 -1 0 -6 0 4 -2 -2 0 -10 // L -2 -3 -3 -4 -7 -2 -4 -4 -2 4 8 -3 5 3 -3 -3 -2 -2 0 3 -4 -3 -1 -10 // K -1 4 1 1 -6 1 0 -1 1 -2 -3 5 0 -6 -1 0 0 -4 -5 -2 1 1 -1 -10 // M -1 0 -2 -3 -6 -1 -2 -3 -2 3 5 0 6 1 -2 -2 -1 -5 -2 2 -2 -2 0 -10 // F -4 -5 -4 -6 -5 -5 -6 -6 -2 2 3 -6 1 13 -5 -4 -3 1 11 -1 -5 -6 -2 -10 // P 1 0 0 0 -3 1 0 0 0 -2 -3 -1 -2 -5 6 1 1 -7 -6 -1 0 0 0 -10 // S 1 0 1 1 0 0 0 1 -1 -1 -3 0 -2 -4 1 1 1 -3 -3 -1 1 0 0 -10 // T 1 -1 1 0 -2 0 0 1 -1 0 -2 0 -1 -3 1 1 2 -6 -3 0 0 0 0 -10 // W -7 4 -5 -8 -10 -5 -8 -8 -3 -6 -2 -4 -5 1 -7 -3 -6 27 1 -7 -6 -7 -5 -10 // Y -4 -5 -3 -5 1 -5 -5 -6 0 0 0 -5 -2 11 -6 -3 -3 1 14 -2 -4 -5 -2 -10 // V 0 -3 -2 -2 -2 -2 -2 -1 -2 4 3 -2 2 -1 -1 -1 0 -7 -2 5 -2 -2 0 -10 // B 1 0 2 3 -5 2 3 1 1 -2 -4 1 -2 -5 0 1 0 -6 -4 -2 3 2 0 -10 // Z 0 1 2 3 -6 3 3 0 2 -2 -3 1 -2 -6 0 0 0 -7 -5 -2 2 3 0 -10 // X 0 -1 0 -1 -3 0 0 -1 0 0 -1 -1 0 -2 0 0 0 -5 -2 0 0 0 -1 -10 // * -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 1 // PAM350 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 2, 1, -2, 1, 1, -4, 2, -1, 0, 0, -1, -2, -1, 0, 1, 0, -1, 1, 1, 0, -7, 0, -4, 0, -10}, {0, 1, 3, -5, 3, 3, -5, 1, 1, -2, 0, 1, -4, -2, 2, 0, 2, 0, 1, 0, -2, -6, 0, -4, 2, -10}, {0, -2, -5, 18, -6, -6, -5, -4, -4, -3, 0, -6, -7, -6, -4, -3, -6, -4, 0, -2, -2, -10, -3, 1, -6, -10}, {0, 1, 3, -6, 4, 4, -6, 1, 1, -2, 0, 1, -4, -3, 2, 0, 2, -1, 1, 0, -2, -8, -1, -5, 3, -10}, {0, 1, 3, -6, 4, 4, -6, 1, 1, -2, 0, 0, -4, -2, 2, 0, 3, 0, 0, 0, -2, -8, 0, -5, 3, -10}, {0, -4, -5, -5, -6, -6, 13, -6, -2, 2, 0, -6, 3, 1, -4, -5, -5, -5, -4, -3, -1, 1, -2, 11, -6, -10}, {0, 2, 1, -4, 1, 1, -6, 5, -2, -2, 0, -1, -4, -3, 1, 0, -1, -2, 1, 1, -1, -8, -1, -6, 0, -10}, {0, -1, 1, -4, 1, 1, -2, -2, 7, -2, 0, 1, -2, -2, 2, 0, 3, 2, -1, -1, -2, -3, 0, 0, 2, -10}, {0, 0, -2, -3, -2, -2, 2, -2, -2, 5, 0, -2, 4, 3, -2, -2, -2, -2, -1, 0, 4, -6, 0, 0, -2, -10}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, -1, 1, -6, 1, 0, -6, -1, 1, -2, 0, 5, -3, 0, 1, -1, 1, 4, 0, 0, -2, -4, -1, -5, 1, -10}, {0, -2, -4, -7, -4, -4, 3, -4, -2, 4, 0, -3, 8, 5, -3, -3, -2, -3, -3, -2, 3, -2, -1, 0, -3, -10}, {0, -1, -2, -6, -3, -2, 1, -3, -2, 3, 0, 0, 5, 6, -2, -2, -1, 0, -2, -1, 2, -5, 0, -2, -2, -10}, {0, 0, 2, -4, 2, 2, -4, 1, 2, -2, 0, 1, -3, -2, 2, 0, 1, 1, 1, 1, -2, -5, 0, -3, 2, -10}, {0, 1, 0, -3, 0, 0, -5, 0, 0, -2, 0, -1, -3, -2, 0, 6, 1, 0, 1, 1, -1, -7, 0, -6, 0, -10}, {0, 0, 2, -6, 2, 3, -5, -1, 3, -2, 0, 1, -2, -1, 1, 1, 4, 2, 0, 0, -2, -5, 0, -5, 3, -10}, {0, -1, 0, -4, -1, 0, -5, -2, 2, -2, 0, 4, -3, 0, 1, 0, 2, 7, 0, -1, -3, 4, -1, -5, 1, -10}, {0, 1, 1, 0, 1, 0, -4, 1, -1, -1, 0, 0, -3, -2, 1, 1, 0, 0, 1, 1, -1, -3, 0, -3, 0, -10}, {0, 1, 0, -2, 0, 0, -3, 1, -1, 0, 0, 0, -2, -1, 1, 1, 0, -1, 1, 2, 0, -6, 0, -3, 0, -10}, {0, 0, -2, -2, -2, -2, -1, -1, -2, 4, 0, -2, 3, 2, -2, -1, -2, -3, -1, 0, 5, -7, 0, -2, -2, -10}, {0, -7, -6, -10, -8, -8, 1, -8, -3, -6, 0, -4, -2, -5, -5, -7, -5, 4, -3, -6, -7, 27, -5, 1, -7, -10}, {0, 0, 0, -3, -1, 0, -2, -1, 0, 0, 0, -1, -1, 0, 0, 0, 0, -1, 0, 0, 0, -5, -1, -2, 0, -10}, {0, -4, -4, 1, -5, -5, 11, -6, 0, 0, 0, -5, 0, -2, -3, -6, -5, -5, -3, -3, -2, 1, -2, 14, -5, -10}, {0, 0, 2, -6, 3, 3, -6, 0, 2, -2, 0, 1, -3, -2, 2, 0, 3, 1, 0, 0, -2, -7, 0, -5, 3, -10}, {0, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, 0, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, 1}, } // # // # This matrix was produced by "pam" Version 1.0.6 [28-Jul-93] // # // # PAM 360 substitution matrix, scale = ln(2)/5 = 0.138629 // # // # Expected score = -0.697, Entropy = 0.175 bits // # // # Lowest score = -9, Highest score = 27 // # // A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * // A 1 -1 0 1 -2 0 1 2 -1 0 -2 -1 -1 -4 1 1 1 -7 -4 0 1 0 0 -9 // R -1 6 1 -1 -4 2 0 -2 2 -2 -3 4 0 -5 0 0 0 4 -5 -2 0 1 -1 -9 // N 0 1 2 2 -4 1 2 1 2 -2 -3 1 -2 -4 0 1 1 -5 -3 -2 2 2 0 -9 // D 1 -1 2 4 -6 2 4 1 1 -2 -4 1 -2 -6 0 1 0 -8 -5 -2 3 3 0 -9 // C -2 -4 -4 -6 18 -6 -6 -4 -4 -3 -7 -6 -6 -4 -3 0 -2 -9 1 -2 -5 -6 -3 -9 // Q 0 2 1 2 -6 3 3 -1 3 -2 -2 1 -1 -5 1 0 0 -5 -4 -2 2 3 0 -9 // E 1 0 2 4 -6 3 4 1 1 -2 -3 0 -2 -6 0 0 0 -8 -5 -2 3 3 0 -9 // G 2 -2 1 1 -4 -1 1 5 -2 -2 -4 -1 -3 -6 0 1 1 -8 -6 -1 1 0 -1 -9 // H -1 2 2 1 -4 3 1 -2 7 -2 -2 1 -2 -2 0 0 -1 -3 0 -2 1 2 0 -9 // I 0 -2 -2 -2 -3 -2 -2 -2 -2 4 3 -2 3 2 -2 -1 0 -6 0 4 -2 -2 0 -9 // L -2 -3 -3 -4 -7 -2 -3 -4 -2 3 7 -3 5 3 -3 -3 -2 -2 0 3 -4 -3 -1 -9 // K -1 4 1 1 -6 1 0 -1 1 -2 -3 5 0 -6 -1 0 0 -4 -5 -2 1 1 -1 -9 // M -1 0 -2 -2 -6 -1 -2 -3 -2 3 5 0 6 1 -2 -2 -1 -4 -2 2 -2 -2 0 -9 // F -4 -5 -4 -6 -4 -5 -6 -6 -2 2 3 -6 1 12 -5 -4 -3 2 11 -1 -5 -5 -2 -9 // P 1 0 0 0 -3 1 0 0 0 -2 -3 -1 -2 -5 6 1 1 -6 -5 -1 0 0 0 -9 // S 1 0 1 1 0 0 0 1 0 -1 -3 0 -2 -4 1 1 1 -3 -3 -1 1 0 0 -9 // T 1 0 1 0 -2 0 0 1 -1 0 -2 0 -1 -3 1 1 2 -6 -3 0 0 0 0 -9 // W -7 4 -5 -8 -9 -5 -8 -8 -3 -6 -2 -4 -4 2 -6 -3 -6 27 1 -7 -6 -7 -4 -9 // Y -4 -5 -3 -5 1 -4 -5 -6 0 0 0 -5 -2 11 -5 -3 -3 1 14 -2 -4 -5 -2 -9 // V 0 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -1 -2 4 3 -2 2 -1 -1 -1 0 -7 -2 4 -2 -2 0 -9 // B 1 0 2 3 -5 2 3 1 1 -2 -4 1 -2 -5 0 1 0 -6 -4 -2 2 2 0 -9 // Z 0 1 2 3 -6 3 3 0 2 -2 -3 1 -2 -5 0 0 0 -7 -5 -2 2 3 0 -9 // X 0 -1 0 0 -3 0 0 -1 0 0 -1 -1 0 -2 0 0 0 -4 -2 0 0 0 -1 -9 // * -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 1 // PAM360 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 1, 1, -2, 1, 1, -4, 2, -1, 0, 0, -1, -2, -1, 0, 1, 0, -1, 1, 1, 0, -7, 0, -4, 0, -9}, {0, 1, 2, -5, 3, 3, -5, 1, 1, -2, 0, 1, -4, -2, 2, 0, 2, 0, 1, 0, -2, -6, 0, -4, 2, -9}, {0, -2, -5, 18, -6, -6, -4, -4, -4, -3, 0, -6, -7, -6, -4, -3, -6, -4, 0, -2, -2, -9, -3, 1, -6, -9}, {0, 1, 3, -6, 4, 4, -6, 1, 1, -2, 0, 1, -4, -2, 2, 0, 2, -1, 1, 0, -2, -8, 0, -5, 3, -9}, {0, 1, 3, -6, 4, 4, -6, 1, 1, -2, 0, 0, -3, -2, 2, 0, 3, 0, 0, 0, -2, -8, 0, -5, 3, -9}, {0, -4, -5, -4, -6, -6, 12, -6, -2, 2, 0, -6, 3, 1, -4, -5, -5, -5, -4, -3, -1, 2, -2, 11, -5, -9}, {0, 2, 1, -4, 1, 1, -6, 5, -2, -2, 0, -1, -4, -3, 1, 0, -1, -2, 1, 1, -1, -8, -1, -6, 0, -9}, {0, -1, 1, -4, 1, 1, -2, -2, 7, -2, 0, 1, -2, -2, 2, 0, 3, 2, 0, -1, -2, -3, 0, 0, 2, -9}, {0, 0, -2, -3, -2, -2, 2, -2, -2, 4, 0, -2, 3, 3, -2, -2, -2, -2, -1, 0, 4, -6, 0, 0, -2, -9}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, -1, 1, -6, 1, 0, -6, -1, 1, -2, 0, 5, -3, 0, 1, -1, 1, 4, 0, 0, -2, -4, -1, -5, 1, -9}, {0, -2, -4, -7, -4, -3, 3, -4, -2, 3, 0, -3, 7, 5, -3, -3, -2, -3, -3, -2, 3, -2, -1, 0, -3, -9}, {0, -1, -2, -6, -2, -2, 1, -3, -2, 3, 0, 0, 5, 6, -2, -2, -1, 0, -2, -1, 2, -4, 0, -2, -2, -9}, {0, 0, 2, -4, 2, 2, -4, 1, 2, -2, 0, 1, -3, -2, 2, 0, 1, 1, 1, 1, -2, -5, 0, -3, 2, -9}, {0, 1, 0, -3, 0, 0, -5, 0, 0, -2, 0, -1, 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This matrix was produced by "pam" Version 1.0.6 [28-Jul-93] // # // # PAM 370 substitution matrix, scale = ln(2)/5 = 0.138629 // # // # Expected score = -0.649, Entropy = 0.165 bits // # // # Lowest score = -9, Highest score = 27 // # // A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * // A 1 -1 0 1 -2 0 1 2 -1 0 -2 -1 -1 -4 1 1 1 -7 -4 0 1 0 0 -9 // R -1 6 1 0 -4 2 0 -2 2 -2 -3 4 0 -5 0 0 0 3 -4 -2 0 1 -1 -9 // N 0 1 2 2 -4 1 2 1 2 -2 -3 1 -2 -4 0 1 0 -5 -3 -1 2 1 0 -9 // D 1 0 2 4 -5 2 3 1 1 -2 -4 1 -2 -6 0 1 0 -7 -5 -2 3 3 0 -9 // C -2 -4 -4 -5 18 -6 -6 -3 -4 -2 -6 -6 -6 -4 -3 0 -2 -9 1 -2 -5 -6 -3 -9 // Q 0 2 1 2 -6 3 2 -1 3 -2 -2 1 -1 -5 1 0 0 -5 -4 -2 2 3 0 -9 // E 1 0 2 3 -6 2 3 1 1 -2 -3 1 -2 -6 0 0 0 -8 -5 -2 3 3 0 -9 // G 2 -2 1 1 -3 -1 1 5 -2 -2 -4 -1 -3 -5 0 1 1 -8 -6 -1 1 0 -1 -9 // H -1 2 2 1 -4 3 1 -2 6 -2 -2 1 -2 -2 0 0 -1 -3 0 -2 1 2 0 -9 // I 0 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 4 3 -2 3 2 -2 -1 0 -5 0 4 -2 -2 0 -9 // L -2 -3 -3 -4 -6 -2 -3 -4 -2 3 7 -3 5 3 -3 -3 -1 -2 0 3 -3 -3 -1 -9 // K -1 4 1 1 -6 1 1 -1 1 -2 -3 5 0 -6 -1 0 0 -3 -5 -2 1 1 0 -9 // M -1 0 -2 -2 -6 -1 -2 -3 -2 3 5 0 5 1 -2 -1 0 -4 -2 2 -2 -2 0 -9 // F -4 -5 -4 -6 -4 -5 -6 -5 -2 2 3 -6 1 12 -5 -4 -3 2 11 0 -5 -5 -2 -9 // P 1 0 0 0 -3 1 0 0 0 -2 -3 -1 -2 -5 6 1 1 -6 -5 -1 0 0 0 -9 // S 1 0 1 1 0 0 0 1 0 -1 -3 0 -1 -4 1 1 1 -3 -3 -1 1 0 0 -9 // T 1 0 0 0 -2 0 0 1 -1 0 -1 0 0 -3 1 1 2 -6 -3 0 0 0 0 -9 // W -7 3 -5 -7 -9 -5 -8 -8 -3 -5 -2 -3 -4 2 -6 -3 -6 27 1 -7 -6 -6 -4 -9 // Y -4 -4 -3 -5 1 -4 -5 -6 0 0 0 -5 -2 11 -5 -3 -3 1 14 -2 -4 -5 -2 -9 // V 0 -2 -1 -2 -2 -2 -2 -1 -2 4 3 -2 2 0 -1 -1 0 -7 -2 4 -2 -2 0 -9 // B 1 0 2 3 -5 2 3 1 1 -2 -3 1 -2 -5 0 1 0 -6 -4 -2 2 2 0 -9 // Z 0 1 1 3 -6 3 3 0 2 -2 -3 1 -2 -5 0 0 0 -6 -5 -2 2 3 0 -9 // X 0 -1 0 0 -3 0 0 -1 0 0 -1 0 0 -2 0 0 0 -4 -2 0 0 0 -1 -9 // * -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 1 // PAM370 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 1, 1, -2, 1, 1, -4, 2, -1, 0, 0, -1, -2, -1, 0, 1, 0, -1, 1, 1, 0, -7, 0, -4, 0, -9}, {0, 1, 2, -5, 3, 3, -5, 1, 1, -2, 0, 1, -3, -2, 2, 0, 2, 0, 1, 0, -2, -6, 0, -4, 2, -9}, {0, -2, -5, 18, -5, -6, -4, -3, -4, -2, 0, -6, -6, -6, -4, -3, -6, -4, 0, -2, -2, -9, -3, 1, -6, -9}, {0, 1, 3, -5, 4, 3, -6, 1, 1, -2, 0, 1, -4, -2, 2, 0, 2, 0, 1, 0, -2, -7, 0, -5, 3, -9}, {0, 1, 3, -6, 3, 3, -6, 1, 1, -2, 0, 1, -3, -2, 2, 0, 2, 0, 0, 0, -2, -8, 0, -5, 3, -9}, {0, -4, -5, -4, -6, -6, 12, -5, -2, 2, 0, -6, 3, 1, -4, -5, -5, -5, -4, -3, 0, 2, -2, 11, -5, -9}, {0, 2, 1, -3, 1, 1, -5, 5, -2, -2, 0, -1, -4, -3, 1, 0, -1, -2, 1, 1, -1, -8, -1, -6, 0, -9}, {0, -1, 1, -4, 1, 1, -2, -2, 6, -2, 0, 1, -2, -2, 2, 0, 3, 2, 0, -1, -2, -3, 0, 0, 2, -9}, {0, 0, -2, -2, -2, -2, 2, -2, -2, 4, 0, -2, 3, 3, -2, -2, -2, -2, -1, 0, 4, -5, 0, 0, -2, -9}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, -1, 1, -6, 1, 1, -6, -1, 1, -2, 0, 5, -3, 0, 1, -1, 1, 4, 0, 0, -2, -3, 0, -5, 1, -9}, {0, -2, -3, -6, -4, -3, 3, -4, -2, 3, 0, -3, 7, 5, -3, -3, -2, -3, -3, -1, 3, -2, -1, 0, -3, -9}, {0, -1, -2, -6, -2, -2, 1, -3, -2, 3, 0, 0, 5, 5, -2, -2, -1, 0, -1, 0, 2, -4, 0, -2, -2, -9}, {0, 0, 2, -4, 2, 2, -4, 1, 2, -2, 0, 1, -3, -2, 2, 0, 1, 1, 1, 0, -1, -5, 0, -3, 1, -9}, {0, 1, 0, -3, 0, 0, -5, 0, 0, -2, 0, -1, -3, -2, 0, 6, 1, 0, 1, 1, -1, -6, 0, -5, 0, -9}, {0, 0, 2, -6, 2, 2, -5, -1, 3, -2, 0, 1, -2, -1, 1, 1, 3, 2, 0, 0, -2, -5, 0, -4, 3, -9}, {0, -1, 0, -4, 0, 0, -5, -2, 2, -2, 0, 4, -3, 0, 1, 0, 2, 6, 0, 0, -2, 3, -1, -4, 1, -9}, {0, 1, 1, 0, 1, 0, -4, 1, 0, -1, 0, 0, -3, -1, 1, 1, 0, 0, 1, 1, -1, -3, 0, -3, 0, -9}, {0, 1, 0, -2, 0, 0, -3, 1, -1, 0, 0, 0, -1, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 2, 0, -6, 0, -3, 0, -9}, {0, 0, -2, -2, -2, -2, 0, -1, -2, 4, 0, -2, 3, 2, -1, -1, -2, -2, -1, 0, 4, -7, 0, -2, -2, -9}, {0, -7, -6, -9, -7, -8, 2, -8, -3, -5, 0, -3, -2, -4, -5, -6, -5, 3, -3, -6, -7, 27, -4, 1, -6, -9}, {0, 0, 0, -3, 0, 0, -2, -1, 0, 0, 0, 0, -1, 0, 0, 0, 0, -1, 0, 0, 0, -4, -1, -2, 0, -9}, {0, -4, -4, 1, -5, -5, 11, -6, 0, 0, 0, -5, 0, -2, -3, -5, -4, -4, -3, -3, -2, 1, -2, 14, -5, -9}, {0, 0, 2, -6, 3, 3, -5, 0, 2, -2, 0, 1, -3, -2, 1, 0, 3, 1, 0, 0, -2, -6, 0, -5, 3, -9}, {0, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, 0, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, 1}, } // # // # This matrix was produced by "pam" Version 1.0.6 [28-Jul-93] // # // # PAM 380 substitution matrix, scale = ln(2)/5 = 0.138629 // # // # Expected score = -0.612, Entropy = 0.156 bits // # // # Lowest score = -9, Highest score = 26 // # // A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * // A 1 -1 0 1 -2 0 1 2 -1 0 -2 -1 -1 -4 1 1 1 -6 -4 0 1 0 0 -9 // R -1 6 1 0 -4 2 0 -2 2 -2 -3 4 0 -5 0 0 0 3 -4 -2 0 1 0 -9 // N 0 1 1 2 -4 1 2 1 1 -2 -3 1 -1 -4 0 1 0 -5 -3 -1 2 1 0 -9 // D 1 0 2 3 -5 2 3 1 1 -2 -4 1 -2 -6 0 1 0 -7 -5 -2 3 3 0 -9 // C -2 -4 -4 -5 17 -5 -5 -3 -4 -2 -6 -6 -5 -4 -3 0 -2 -9 1 -2 -4 -5 -3 -9 // Q 0 2 1 2 -5 3 2 -1 3 -2 -2 1 -1 -5 1 0 0 -5 -4 -2 2 3 0 -9 // E 1 0 2 3 -5 2 3 1 1 -2 -3 1 -2 -5 0 0 0 -7 -5 -2 3 3 0 -9 // G 2 -2 1 1 -3 -1 1 5 -1 -2 -4 -1 -2 -5 0 1 1 -8 -5 -1 1 0 0 -9 // H -1 2 1 1 -4 3 1 -1 6 -2 -2 1 -2 -2 0 0 -1 -3 0 -2 1 2 0 -9 // I 0 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 4 3 -2 3 2 -2 -1 0 -5 0 4 -2 -2 0 -9 // L -2 -3 -3 -4 -6 -2 -3 -4 -2 3 7 -3 4 3 -2 -3 -1 -2 0 3 -3 -3 -1 -9 // K -1 4 1 1 -6 1 1 -1 1 -2 -3 5 0 -5 0 0 0 -3 -5 -2 1 1 0 -9 // M -1 0 -1 -2 -5 -1 -2 -2 -2 3 4 0 5 1 -2 -1 0 -4 -2 2 -2 -1 0 -9 // F -4 -5 -4 -6 -4 -5 -5 -5 -2 2 3 -5 1 12 -5 -4 -3 2 10 0 -5 -5 -2 -9 // P 1 0 0 0 -3 1 0 0 0 -2 -2 0 -2 -5 5 1 1 -6 -5 -1 0 0 0 -9 // S 1 0 1 1 0 0 0 1 0 -1 -3 0 -1 -4 1 1 1 -3 -3 -1 1 0 0 -9 // T 1 0 0 0 -2 0 0 1 -1 0 -1 0 0 -3 1 1 2 -6 -3 0 0 0 0 -9 // W -6 3 -5 -7 -9 -5 -7 -8 -3 -5 -2 -3 -4 2 -6 -3 -6 26 1 -6 -6 -6 -4 -9 // Y -4 -4 -3 -5 1 -4 -5 -5 0 0 0 -5 -2 10 -5 -3 -3 1 13 -2 -4 -4 -2 -9 // V 0 -2 -1 -2 -2 -2 -2 -1 -2 4 3 -2 2 0 -1 -1 0 -6 -2 4 -2 -2 0 -9 // B 1 0 2 3 -4 2 3 1 1 -2 -3 1 -2 -5 0 1 0 -6 -4 -2 2 2 0 -9 // Z 0 1 1 3 -5 3 3 0 2 -2 -3 1 -1 -5 0 0 0 -6 -4 -2 2 3 0 -9 // X 0 0 0 0 -3 0 0 0 0 0 -1 0 0 -2 0 0 0 -4 -2 0 0 0 -1 -9 // * -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 1 // PAM380 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 1, 1, -2, 1, 1, -4, 2, -1, 0, 0, -1, -2, -1, 0, 1, 0, -1, 1, 1, 0, -6, 0, -4, 0, -9}, {0, 1, 2, -4, 3, 3, -5, 1, 1, -2, 0, 1, -3, -2, 2, 0, 2, 0, 1, 0, -2, -6, 0, -4, 2, -9}, {0, -2, -4, 17, -5, -5, -4, -3, -4, -2, 0, -6, -6, -5, -4, -3, -5, -4, 0, -2, -2, -9, -3, 1, -5, -9}, {0, 1, 3, -5, 3, 3, -6, 1, 1, -2, 0, 1, -4, -2, 2, 0, 2, 0, 1, 0, -2, -7, 0, -5, 3, -9}, {0, 1, 3, -5, 3, 3, -5, 1, 1, -2, 0, 1, -3, -2, 2, 0, 2, 0, 0, 0, -2, -7, 0, -5, 3, -9}, {0, -4, -5, -4, -6, -5, 12, -5, -2, 2, 0, -5, 3, 1, -4, -5, -5, -5, -4, -3, 0, 2, -2, 10, -5, -9}, {0, 2, 1, -3, 1, 1, -5, 5, -1, -2, 0, -1, -4, -2, 1, 0, -1, -2, 1, 1, -1, -8, 0, -5, 0, -9}, {0, -1, 1, -4, 1, 1, -2, -1, 6, -2, 0, 1, -2, -2, 1, 0, 3, 2, 0, -1, -2, -3, 0, 0, 2, -9}, {0, 0, -2, -2, -2, -2, 2, -2, -2, 4, 0, -2, 3, 3, -2, -2, -2, -2, -1, 0, 4, -5, 0, 0, -2, -9}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, -1, 1, -6, 1, 1, -5, -1, 1, -2, 0, 5, -3, 0, 1, 0, 1, 4, 0, 0, -2, -3, 0, -5, 1, -9}, {0, -2, -3, -6, -4, -3, 3, -4, -2, 3, 0, -3, 7, 4, -3, -2, -2, -3, -3, -1, 3, -2, -1, 0, -3, -9}, {0, -1, -2, -5, -2, -2, 1, -2, -2, 3, 0, 0, 4, 5, -1, -2, -1, 0, -1, 0, 2, -4, 0, -2, -1, -9}, {0, 0, 2, -4, 2, 2, -4, 1, 1, -2, 0, 1, -3, -1, 1, 0, 1, 1, 1, 0, -1, -5, 0, -3, 1, -9}, {0, 1, 0, -3, 0, 0, -5, 0, 0, -2, 0, 0, -2, -2, 0, 5, 1, 0, 1, 1, -1, -6, 0, -5, 0, -9}, {0, 0, 2, -5, 2, 2, -5, -1, 3, -2, 0, 1, -2, -1, 1, 1, 3, 2, 0, 0, -2, -5, 0, -4, 3, -9}, {0, -1, 0, -4, 0, 0, -5, -2, 2, -2, 0, 4, -3, 0, 1, 0, 2, 6, 0, 0, -2, 3, 0, -4, 1, -9}, {0, 1, 1, 0, 1, 0, -4, 1, 0, -1, 0, 0, -3, -1, 1, 1, 0, 0, 1, 1, -1, -3, 0, -3, 0, -9}, {0, 1, 0, -2, 0, 0, -3, 1, -1, 0, 0, 0, -1, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 2, 0, -6, 0, -3, 0, -9}, {0, 0, -2, -2, -2, -2, 0, -1, -2, 4, 0, -2, 3, 2, -1, -1, -2, -2, -1, 0, 4, -6, 0, -2, -2, -9}, {0, -6, -6, -9, -7, -7, 2, -8, -3, -5, 0, -3, -2, -4, -5, -6, -5, 3, -3, -6, -6, 26, -4, 1, -6, -9}, {0, 0, 0, -3, 0, 0, -2, 0, 0, 0, 0, 0, -1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, -4, -1, -2, 0, -9}, {0, -4, -4, 1, -5, -5, 10, -5, 0, 0, 0, -5, 0, -2, -3, -5, -4, -4, -3, -3, -2, 1, -2, 13, -4, -9}, {0, 0, 2, -5, 3, 3, -5, 0, 2, -2, 0, 1, -3, -1, 1, 0, 3, 1, 0, 0, -2, -6, 0, -4, 3, -9}, {0, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, 0, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, 1}, } // # // # This matrix was produced by "pam" Version 1.0.6 [28-Jul-93] // # // # PAM 390 substitution matrix, scale = ln(2)/5 = 0.138629 // # // # Expected score = -0.581, Entropy = 0.147 bits // # // # Lowest score = -9, Highest score = 26 // # // A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * // A 1 -1 0 1 -2 0 1 1 -1 0 -2 -1 -1 -3 1 1 1 -6 -4 0 1 0 0 -9 // R -1 6 1 0 -4 1 0 -2 2 -2 -3 4 0 -5 0 0 0 3 -4 -2 0 1 0 -9 // N 0 1 1 2 -4 1 2 1 1 -2 -3 1 -1 -4 0 1 0 -4 -3 -1 2 1 0 -9 // D 1 0 2 3 -5 2 3 1 1 -2 -4 1 -2 -5 0 1 0 -7 -5 -2 3 3 0 -9 // C -2 -4 -4 -5 17 -5 -5 -3 -4 -2 -6 -5 -5 -4 -3 0 -2 -9 1 -2 -4 -5 -3 -9 // Q 0 1 1 2 -5 3 2 0 3 -2 -2 1 -1 -4 0 0 0 -5 -4 -1 2 3 0 -9 // E 1 0 2 3 -5 2 3 1 1 -2 -3 1 -2 -5 0 0 0 -7 -5 -1 2 3 0 -9 // G 1 -2 1 1 -3 0 1 5 -1 -2 -4 -1 -2 -5 0 1 1 -7 -5 -1 1 0 0 -9 // H -1 2 1 1 -4 3 1 -1 6 -2 -2 1 -2 -2 0 0 -1 -3 0 -2 1 2 0 -9 // I 0 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 4 3 -2 3 2 -1 -1 0 -5 0 4 -2 -2 0 -9 // L -2 -3 -3 -4 -6 -2 -3 -4 -2 3 7 -3 4 3 -2 -2 -1 -2 0 3 -3 -2 -1 -9 // K -1 4 1 1 -5 1 1 -1 1 -2 -3 4 0 -5 0 0 0 -3 -5 -2 1 1 0 -9 // M -1 0 -1 -2 -5 -1 -2 -2 -2 3 4 0 5 1 -2 -1 0 -4 -1 2 -2 -1 0 -9 // F -3 -5 -4 -5 -4 -4 -5 -5 -2 2 3 -5 1 12 -5 -3 -3 2 10 0 -5 -5 -2 -9 // P 1 0 0 0 -3 0 0 0 0 -1 -2 0 -2 -5 5 1 1 -6 -5 -1 0 0 0 -9 // S 1 0 1 1 0 0 0 1 0 -1 -2 0 -1 -3 1 1 1 -3 -3 -1 1 0 0 -9 // T 1 0 0 0 -2 0 0 1 -1 0 -1 0 0 -3 1 1 1 -5 -3 0 0 0 0 -9 // W -6 3 -4 -7 -9 -5 -7 -7 -3 -5 -2 -3 -4 2 -6 -3 -5 26 1 -6 -6 -6 -4 -9 // Y -4 -4 -3 -5 1 -4 -5 -5 0 0 0 -5 -1 10 -5 -3 -3 1 13 -2 -4 -4 -2 -9 // V 0 -2 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -2 4 3 -2 2 0 -1 -1 0 -6 -2 4 -2 -1 0 -9 // B 1 0 2 3 -4 2 2 1 1 -2 -3 1 -2 -5 0 1 0 -6 -4 -2 2 2 0 -9 // Z 0 1 1 3 -5 3 3 0 2 -2 -2 1 -1 -5 0 0 0 -6 -4 -1 2 3 0 -9 // X 0 0 0 0 -3 0 0 0 0 0 -1 0 0 -2 0 0 0 -4 -2 0 0 0 -1 -9 // * -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 1 // PAM390 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 1, 1, -2, 1, 1, -3, 1, -1, 0, 0, -1, -2, -1, 0, 1, 0, -1, 1, 1, 0, -6, 0, -4, 0, -9}, {0, 1, 2, -4, 3, 2, -5, 1, 1, -2, 0, 1, -3, -2, 2, 0, 2, 0, 1, 0, -2, -6, 0, -4, 2, -9}, {0, -2, -4, 17, -5, -5, -4, -3, -4, -2, 0, -5, -6, -5, -4, -3, -5, -4, 0, -2, -2, -9, -3, 1, -5, -9}, {0, 1, 3, -5, 3, 3, -5, 1, 1, -2, 0, 1, -4, -2, 2, 0, 2, 0, 1, 0, -2, -7, 0, -5, 3, -9}, {0, 1, 2, -5, 3, 3, -5, 1, 1, -2, 0, 1, -3, -2, 2, 0, 2, 0, 0, 0, -1, -7, 0, 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// # Expected score = -4.27, Entropy = 2.26 bits // # // # Lowest score = -15, Highest score = 13 // # // A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * // A 6 -6 -3 -3 -6 -3 -2 -1 -6 -4 -5 -6 -4 -7 -1 0 0 -12 -7 -2 -3 -2 -3 -15 // R -6 8 -5 -9 -7 -1 -8 -8 -1 -5 -8 1 -3 -8 -3 -2 -5 -1 -9 -7 -6 -3 -5 -15 // N -3 -5 7 2 -9 -3 -1 -2 1 -4 -6 0 -7 -8 -5 0 -1 -7 -4 -7 6 -2 -3 -15 // D -3 -9 2 7 -12 -2 3 -3 -3 -6 -11 -4 -9 -13 -7 -3 -4 -13 -10 -7 6 2 -5 -15 // C -6 -7 -9 -12 9 -12 -12 -8 -7 -5 -13 -12 -12 -11 -7 -2 -7 -14 -3 -5 -11 -12 -8 -15 // Q -3 -1 -3 -2 -12 8 2 -6 1 -7 -4 -2 -3 -11 -2 -4 -5 -11 -10 -6 -2 6 -4 -15 // E -2 -8 -1 3 -12 2 7 -3 -4 -5 -8 -4 -6 -12 -5 -4 -5 -15 -8 -6 2 6 -4 -15 // G -1 -8 -2 -3 -8 -6 -3 6 -8 -9 -9 -6 -7 -8 -5 -1 -5 -13 -12 -5 -2 -4 -4 -15 // H -6 -1 1 -3 -7 1 -4 -8 9 -8 -5 -5 -9 -5 -3 -5 -6 -6 -3 -6 -1 0 -4 -15 // I -4 -5 -4 -6 -5 -7 -5 -9 -8 8 -1 -5 0 -2 -7 -6 -2 -12 -5 2 -5 -5 -4 -15 // L -5 -8 -6 -11 -13 -4 -8 -9 -5 -1 7 -7 1 -2 -6 -7 -6 -5 -6 -2 -8 -6 -5 -15 // K -6 1 0 -4 -12 -2 -4 -6 -5 -5 -7 6 -1 -12 -6 -3 -2 -10 -8 -8 -2 -3 -4 -15 // M -4 -3 -7 -9 -12 -3 -6 -7 -9 0 1 -1 11 -3 -7 -5 -3 -11 -10 -1 -8 -4 -4 -15 // F -7 -8 -8 -13 -11 -11 -12 -8 -5 -2 -2 -12 -3 9 -9 -6 -8 -4 2 -7 -9 -12 -7 -15 // P -1 -3 -5 -7 -7 -2 -5 -5 -3 -7 -6 -6 -7 -9 8 -1 -3 -12 -12 -5 -6 -3 -4 -15 // S 0 -2 0 -3 -2 -4 -4 -1 -5 -6 -7 -3 -5 -6 -1 6 1 -4 -6 -5 -1 -4 -2 -15 // T 0 -5 -1 -4 -7 -5 -5 -5 -6 -2 -6 -2 -3 -8 -3 1 7 -11 -6 -2 -2 -5 -3 -15 // W -12 -1 -7 -13 -14 -11 -15 -13 -6 -12 -5 -10 -11 -4 -12 -4 -11 13 -4 -14 -9 -13 -9 -15 // Y -7 -9 -4 -10 -3 -10 -8 -12 -3 -5 -6 -8 -10 2 -12 -6 -6 -4 10 -6 -6 -8 -7 -15 // V -2 -7 -7 -7 -5 -6 -6 -5 -6 2 -2 -8 -1 -7 -5 -5 -2 -14 -6 7 -7 -6 -4 -15 // B -3 -6 6 6 -11 -2 2 -2 -1 -5 -8 -2 -8 -9 -6 -1 -2 -9 -6 -7 6 1 -4 -15 // Z -2 -3 -2 2 -12 6 6 -4 0 -5 -6 -3 -4 -12 -3 -4 -5 -13 -8 -6 1 6 -4 -15 // X -3 -5 -3 -5 -8 -4 -4 -4 -4 -4 -5 -4 -4 -7 -4 -2 -3 -9 -7 -4 -4 -4 -4 -15 // * -15 -15 -15 -15 -15 -15 -15 -15 -15 -15 -15 -15 -15 -15 -15 -15 -15 -15 -15 -15 -15 -15 -15 1 // PAM40 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 6, -3, -6, -3, -2, -7, -1, -6, -4, 0, -6, -5, -4, -3, -1, -3, -6, 0, 0, -2, -12, -3, -7, -2, -15}, {0, -3, 6, -11, 6, 2, -9, -2, -1, -5, 0, -2, -8, -8, 6, -6, -2, -6, -1, -2, -7, -9, -4, -6, 1, -15}, {0, -6, -11, 9, -12, -12, -11, -8, -7, -5, 0, -12, -13, -12, -9, -7, -12, -7, -2, -7, -5, -14, -8, -3, -12, -15}, {0, -3, 6, -12, 7, 3, -13, -3, -3, -6, 0, -4, -11, -9, 2, -7, -2, -9, -3, -4, -7, -13, -5, -10, 2, -15}, {0, -2, 2, -12, 3, 7, -12, -3, -4, -5, 0, -4, -8, -6, -1, -5, 2, -8, -4, -5, -6, -15, -4, -8, 6, -15}, {0, -7, -9, -11, -13, -12, 9, -8, -5, -2, 0, -12, -2, -3, -8, -9, -11, -8, -6, -8, -7, -4, -7, 2, -12, -15}, {0, -1, -2, -8, -3, -3, -8, 6, -8, -9, 0, -6, -9, -7, -2, -5, -6, -8, -1, -5, -5, -13, -4, -12, -4, -15}, {0, -6, -1, -7, -3, -4, -5, -8, 9, -8, 0, -5, -5, -9, 1, -3, 1, -1, -5, -6, -6, -6, -4, -3, 0, -15}, {0, -4, 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Highest score = 26 // # // A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * // A 1 -1 0 1 -2 0 1 1 -1 0 -2 -1 -1 -3 1 1 1 -6 -3 0 1 0 0 -8 // R -1 5 1 0 -4 1 0 -2 2 -2 -3 4 0 -4 0 0 0 3 -4 -2 0 1 0 -8 // N 0 1 1 2 -3 1 2 1 1 -1 -3 1 -1 -3 0 1 0 -4 -3 -1 2 1 0 -8 // D 1 0 2 3 -5 2 3 1 1 -2 -3 1 -2 -5 0 1 0 -7 -4 -2 2 2 0 -8 // C -2 -4 -3 -5 17 -5 -5 -3 -3 -2 -6 -5 -5 -4 -2 0 -2 -8 1 -2 -4 -5 -3 -8 // Q 0 1 1 2 -5 3 2 0 3 -2 -2 1 -1 -4 0 0 0 -5 -4 -1 2 2 0 -8 // E 1 0 2 3 -5 2 3 1 1 -2 -3 1 -2 -5 0 0 0 -7 -4 -1 2 3 0 -8 // G 1 -2 1 1 -3 0 1 4 -1 -2 -3 -1 -2 -5 0 1 1 -7 -5 -1 1 0 0 -8 // H -1 2 1 1 -3 3 1 -1 5 -2 -2 1 -1 -2 0 0 -1 -2 0 -2 1 2 0 -8 // I 0 -2 -1 -2 -2 -2 -2 -2 -2 4 3 -2 2 2 -1 -1 0 -5 0 3 -2 -2 0 -8 // L -2 -3 -3 -3 -6 -2 -3 -3 -2 3 7 -2 4 3 -2 -2 -1 -2 0 3 -3 -2 -1 -8 // K -1 4 1 1 -5 1 1 -1 1 -2 -2 4 0 -5 0 0 0 -3 -4 -2 1 1 0 -8 // M -1 0 -1 -2 -5 -1 -2 -2 -1 2 4 0 5 1 -1 -1 0 -4 -1 2 -2 -1 0 -8 // F -3 -4 -3 -5 -4 -4 -5 -5 -2 2 3 -5 1 11 -4 -3 -3 2 10 0 -4 -5 -2 -8 // P 1 0 0 0 -2 0 0 0 0 -1 -2 0 -1 -4 5 1 1 -6 -5 -1 0 0 0 -8 // S 1 0 1 1 0 0 0 1 0 -1 -2 0 -1 -3 1 1 1 -3 -3 -1 1 0 0 -8 // T 1 0 0 0 -2 0 0 1 -1 0 -1 0 0 -3 1 1 1 -5 -3 0 0 0 0 -8 // W -6 3 -4 -7 -8 -5 -7 -7 -2 -5 -2 -3 -4 2 -6 -3 -5 26 1 -6 -5 -6 -4 -8 // Y -3 -4 -3 -4 1 -4 -4 -5 0 0 0 -4 -1 10 -5 -3 -3 1 13 -2 -3 -4 -2 -8 // V 0 -2 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -2 3 3 -2 2 0 -1 -1 0 -6 -2 4 -1 -1 0 -8 // B 1 0 2 2 -4 2 2 1 1 -2 -3 1 -2 -4 0 1 0 -5 -3 -1 2 2 0 -8 // Z 0 1 1 2 -5 2 3 0 2 -2 -2 1 -1 -5 0 0 0 -6 -4 -1 2 3 0 -8 // X 0 0 0 0 -3 0 0 0 0 0 -1 0 0 -2 0 0 0 -4 -2 0 0 0 -1 -8 // * -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 1 // PAM400 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 1, 1, -2, 1, 1, -3, 1, -1, 0, 0, -1, -2, -1, 0, 1, 0, -1, 1, 1, 0, -6, 0, -3, 0, -8}, {0, 1, 2, -4, 2, 2, -4, 1, 1, -2, 0, 1, -3, -2, 2, 0, 2, 0, 1, 0, -1, -5, 0, -3, 2, -8}, {0, -2, -4, 17, -5, -5, -4, -3, -3, -2, 0, -5, -6, -5, -3, -2, -5, -4, 0, -2, -2, -8, -3, 1, -5, -8}, {0, 1, 2, -5, 3, 3, -5, 1, 1, -2, 0, 1, -3, -2, 2, 0, 2, 0, 1, 0, -2, -7, 0, -4, 2, -8}, {0, 1, 2, -5, 3, 3, -5, 1, 1, -2, 0, 1, -3, -2, 2, 0, 2, 0, 0, 0, -1, -7, 0, -4, 3, -8}, {0, -3, -4, -4, -5, -5, 11, -5, -2, 2, 0, -5, 3, 1, -3, -4, -4, -4, -3, -3, 0, 2, -2, 10, -5, -8}, {0, 1, 1, -3, 1, 1, -5, 4, -1, -2, 0, -1, -3, -2, 1, 0, 0, -2, 1, 1, -1, -7, 0, -5, 0, -8}, {0, -1, 1, -3, 1, 1, -2, -1, 5, -2, 0, 1, -2, -1, 1, 0, 3, 2, 0, -1, -2, -2, 0, 0, 2, -8}, {0, 0, -2, -2, -2, -2, 2, -2, -2, 4, 0, -2, 3, 2, -1, -1, -2, -2, -1, 0, 3, -5, 0, 0, -2, -8}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, -1, 1, -5, 1, 1, -5, -1, 1, -2, 0, 4, -2, 0, 1, 0, 1, 4, 0, 0, -2, -3, 0, -4, 1, -8}, {0, -2, -3, -6, -3, -3, 3, -3, -2, 3, 0, -2, 7, 4, -3, -2, -2, -3, -2, -1, 3, -2, -1, 0, -2, -8}, {0, -1, -2, -5, -2, -2, 1, -2, -1, 2, 0, 0, 4, 5, -1, -1, -1, 0, -1, 0, 2, -4, 0, -1, -1, -8}, {0, 0, 2, -3, 2, 2, -3, 1, 1, -1, 0, 1, -3, -1, 1, 0, 1, 1, 1, 0, -1, -4, 0, -3, 1, -8}, {0, 1, 0, -2, 0, 0, -4, 0, 0, -1, 0, 0, -2, -1, 0, 5, 0, 0, 1, 1, -1, -6, 0, -5, 0, -8}, {0, 0, 2, -5, 2, 2, -4, 0, 3, -2, 0, 1, -2, -1, 1, 0, 3, 1, 0, 0, -1, -5, 0, -4, 2, -8}, {0, -1, 0, -4, 0, 0, -4, -2, 2, -2, 0, 4, -3, 0, 1, 0, 1, 5, 0, 0, -2, 3, 0, -4, 1, -8}, {0, 1, 1, 0, 1, 0, -3, 1, 0, -1, 0, 0, -2, -1, 1, 1, 0, 0, 1, 1, -1, -3, 0, -3, 0, -8}, {0, 1, 0, -2, 0, 0, -3, 1, -1, 0, 0, 0, -1, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 1, 0, -5, 0, -3, 0, -8}, {0, 0, -1, -2, -2, -1, 0, -1, -2, 3, 0, -2, 3, 2, -1, -1, -1, -2, -1, 0, 4, -6, 0, -2, -1, -8}, {0, -6, -5, -8, -7, -7, 2, -7, -2, -5, 0, -3, -2, -4, -4, -6, -5, 3, -3, -5, -6, 26, -4, 1, -6, -8}, {0, 0, 0, -3, 0, 0, -2, 0, 0, 0, 0, 0, -1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, -4, -1, -2, 0, -8}, {0, -3, -3, 1, -4, -4, 10, -5, 0, 0, 0, -4, 0, -1, -3, -5, -4, -4, -3, -3, -2, 1, -2, 13, -4, -8}, {0, 0, 2, -5, 2, 3, -5, 0, 2, -2, 0, 1, -2, -1, 1, 0, 2, 1, 0, 0, -1, -6, 0, -4, 3, -8}, {0, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, 0, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, 1}, } // # // # This matrix was produced by "pam" Version 1.0.6 [28-Jul-93] // # // # PAM 40 substitution matrix, scale = 0.0693200 // # // # Expected score = -21.3, Entropy = 2.26 bits // # // # Lowest score = -74, Highest score = 64 // # // A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * // A 28 -30 -14 -13 -28 -17 -8 -5 -31 -19 -27 -29 -20 -37 -4 1 0 -59 -34 -8 -14 -12 -13 -74 // R -30 41 -23 -43 -35 -5 -38 -41 -4 -23 -38 5 -17 -42 -15 -12 -27 -6 -45 -33 -30 -15 -23 -74 // N -14 -23 36 10 -47 -14 -7 -12 4 -22 -31 -2 -37 -38 -24 2 -6 -36 -19 -33 28 -10 -14 -74 // D -13 -43 10 37 -62 -8 15 -13 -15 -32 -54 -18 -47 -64 -33 -14 -19 -67 -49 -35 29 8 -23 -74 // C -28 -35 -47 -62 47 -61 -62 -41 -33 -27 -66 -62 -59 -56 -35 -11 -34 -70 -16 -25 -53 -62 -39 -74 // Q -17 -5 -14 -8 -61 40 8 -30 7 -33 -21 -10 -16 -57 -11 -22 -23 -56 -51 -29 -10 30 -19 -74 // E -8 -38 -7 15 -62 8 36 -17 -20 -24 -41 -18 -30 -62 -23 -18 -25 -74 -38 -28 8 29 -20 -74 // G -5 -41 -12 -13 -41 -30 -17 31 -38 -46 -47 -31 -37 -41 -26 -5 -24 -67 -60 -24 -12 -21 -22 -74 // H -31 -4 4 -15 -33 7 -20 -38 44 -39 -26 -25 -44 -25 -17 -25 -31 -32 -13 -28 -3 -2 -21 -74 // I -19 -23 -22 -32 -27 -33 -24 -46 -39 40 -3 -26 0 -8 -37 -29 -9 -60 -26 12 -26 -27 -20 -74 // L -27 -38 -31 -54 -66 -21 -41 -47 -26 -3 33 -36 6 -9 -31 -36 -29 -26 -29 -8 -39 -29 -26 -74 // K -29 5 -2 -18 -62 -10 -18 -31 -25 -26 -36 32 -5 -61 -28 -16 -12 -51 -42 -39 -9 -14 -22 -74 // M -20 -17 -37 -47 -59 -16 -30 -37 -44 0 6 -5 54 -16 -35 -23 -16 -55 -48 -3 -41 -22 -21 -74 // F -37 -42 -38 -64 -56 -57 -62 -41 -25 -8 -9 -61 -16 43 -44 -28 -38 -18 12 -33 -47 -60 -34 -74 // P -4 -15 -24 -33 -35 -11 -23 -26 -17 -37 -31 -28 -35 -44 39 -5 -17 -60 -59 -24 -28 -16 -21 -74 // S 1 -12 2 -14 -11 -22 -18 -5 -25 -29 -36 -16 -23 -28 -5 30 4 -22 -30 -26 -5 -19 -12 -74 // T 0 -27 -6 -19 -34 -23 -25 -24 -31 -9 -29 -12 -16 -38 -17 4 34 -56 -28 -10 -12 -24 -15 -74 // W -59 -6 -36 -67 -70 -56 -74 -67 -32 -60 -26 -51 -55 -18 -60 -22 -56 64 -21 -68 -45 -63 -47 -74 // Y -34 -45 -19 -49 -16 -51 -38 -60 -13 -26 -29 -42 -48 12 -59 -30 -28 -21 48 -32 -28 -42 -33 -74 // V -8 -33 -33 -35 -25 -29 -28 -24 -28 12 -8 -39 -3 -33 -24 -26 -10 -68 -32 34 -34 -28 -19 -74 // B -14 -30 28 29 -53 -10 8 -12 -3 -26 -39 -9 -41 -47 -28 -5 -12 -45 -28 -34 29 3 -19 -74 // Z -12 -15 -10 8 -62 30 29 -21 -2 -27 -29 -14 -22 -60 -16 -19 -24 -63 -42 -28 3 30 -20 -74 // X -13 -23 -14 -23 -39 -19 -20 -22 -21 -20 -26 -22 -21 -34 -21 -12 -15 -47 -33 -19 -19 -20 -21 -74 // * -74 -74 -74 -74 -74 -74 -74 -74 -74 -74 -74 -74 -74 -74 -74 -74 -74 -74 -74 -74 -74 -74 -74 1 // PAM40_cdi = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 28, -14, -28, -13, -8, -37, -5, -31, -19, 0, -29, -27, -20, -14, -4, -17, -30, 1, 0, -8, -59, -13, -34, -12, -74}, {0, -14, 29, -53, 29, 8, -47, -12, -3, -26, 0, -9, -39, -41, 28, -28, -10, -30, -5, -12, -34, -45, -19, -28, 3, -74}, {0, -28, -53, 47, -62, -62, -56, -41, -33, -27, 0, -62, -66, -59, -47, -35, -61, -35, -11, -34, -25, -70, -39, -16, -62, -74}, {0, -13, 29, -62, 37, 15, -64, -13, -15, -32, 0, -18, -54, -47, 10, -33, -8, -43, -14, -19, -35, -67, -23, -49, 8, -74}, {0, -8, 8, -62, 15, 36, -62, -17, -20, -24, 0, -18, -41, -30, -7, -23, 8, -38, -18, -25, -28, -74, -20, -38, 29, -74}, {0, -37, -47, -56, -64, -62, 43, -41, -25, -8, 0, -61, -9, -16, -38, -44, -57, -42, -28, -38, -33, -18, -34, 12, -60, -74}, {0, -5, -12, -41, -13, -17, -41, 31, -38, -46, 0, -31, -47, -37, -12, -26, -30, -41, -5, -24, -24, -67, -22, -60, -21, -74}, {0, -31, -3, -33, -15, -20, -25, -38, 44, -39, 0, -25, -26, -44, 4, -17, 7, -4, -25, -31, -28, -32, -21, -13, -2, -74}, {0, -19, -26, -27, -32, -24, -8, -46, -39, 40, 0, -26, -3, 0, -22, -37, -33, -23, -29, -9, 12, -60, -20, -26, -27, -74}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, -29, -9, -62, -18, -18, -61, -31, -25, -26, 0, 32, -36, -5, -2, -28, -10, 5, -16, -12, -39, -51, -22, -42, -14, -74}, {0, -27, -39, -66, -54, -41, -9, -47, -26, -3, 0, -36, 33, 6, -31, -31, -21, -38, -36, -29, -8, -26, -26, -29, -29, -74}, {0, -20, -41, -59, -47, -30, -16, -37, -44, 0, 0, -5, 6, 54, -37, -35, -16, -17, -23, -16, -3, -55, -21, -48, -22, -74}, {0, -14, 28, -47, 10, -7, -38, -12, 4, -22, 0, -2, -31, -37, 36, -24, -14, -23, 2, -6, -33, -36, -14, -19, -10, -74}, {0, -4, -28, -35, -33, -23, -44, -26, -17, -37, 0, -28, -31, -35, -24, 39, -11, -15, -5, -17, -24, -60, -21, -59, -16, -74}, {0, -17, -10, -61, -8, 8, -57, -30, 7, -33, 0, -10, -21, -16, -14, -11, 40, -5, -22, -23, -29, -56, -19, -51, 30, -74}, {0, -30, -30, -35, -43, -38, -42, -41, -4, -23, 0, 5, -38, -17, -23, -15, -5, 41, -12, -27, -33, -6, -23, -45, -15, -74}, {0, 1, -5, -11, -14, -18, -28, -5, -25, -29, 0, -16, -36, -23, 2, -5, -22, -12, 30, 4, -26, -22, -12, -30, -19, -74}, {0, 0, -12, -34, -19, -25, -38, -24, -31, -9, 0, -12, -29, -16, -6, -17, -23, -27, 4, 34, -10, -56, -15, -28, -24, -74}, {0, -8, -34, -25, -35, -28, -33, -24, -28, 12, 0, -39, -8, -3, -33, -24, -29, -33, -26, -10, 34, -68, -19, -32, -28, -74}, {0, -59, -45, -70, -67, -74, -18, -67, -32, -60, 0, -51, -26, -55, -36, -60, -56, -6, -22, -56, -68, 64, -47, -21, -63, -74}, {0, -13, -19, -39, -23, -20, -34, -22, -21, -20, 0, -22, -26, -21, -14, -21, -19, -23, -12, -15, -19, -47, -21, -33, -20, -74}, {0, -34, -28, -16, -49, -38, 12, -60, -13, -26, 0, -42, -29, -48, -19, -59, -51, -45, -30, -28, -32, -21, -33, 48, -42, -74}, {0, -12, 3, -62, 8, 29, -60, -21, -2, -27, 0, -14, -29, -22, -10, -16, 30, -15, -19, -24, -28, -63, -20, -42, 30, -74}, {0, -74, -74, -74, -74, -74, -74, -74, -74, -74, 0, -74, -74, -74, -74, -74, -74, -74, -74, -74, -74, -74, -74, -74, -74, 1}, } // # // # This matrix was produced by "pam" Version 1.0.6 [28-Jul-93] // # // # PAM 410 substitution matrix, scale = ln(2)/6 = 0.115525 // # // # Expected score = -0.617, Entropy = 0.131 bits // # // # Lowest score = -10, Highest score = 31 // # // A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * // A 1 -1 0 1 -2 0 1 2 -1 0 -2 -1 -1 -4 1 1 1 -7 -4 0 1 0 0 -10 // R -1 6 1 0 -4 2 0 -2 2 -2 -3 4 0 -5 0 0 0 4 -5 -2 0 1 0 -10 // N 0 1 1 2 -4 1 2 1 1 -2 -3 1 -2 -4 0 1 1 -5 -3 -1 2 2 0 -10 // D 1 0 2 3 -6 2 3 1 1 -2 -4 1 -2 -6 0 1 0 -8 -5 -2 3 3 0 -10 // C -2 -4 -4 -6 20 -6 -6 -4 -4 -3 -7 -6 -6 -4 -3 0 -2 -10 1 -2 -5 -6 -3 -10 // Q 0 2 1 2 -6 3 2 0 3 -2 -2 1 -1 -5 1 0 0 -5 -4 -2 2 3 0 -10 // E 1 0 2 3 -6 2 3 1 1 -2 -3 1 -2 -6 0 1 0 -8 -5 -2 3 3 0 -10 // G 2 -2 1 1 -4 0 1 5 -1 -2 -4 -1 -3 -6 0 1 1 -8 -6 -1 1 0 0 -10 // H -1 2 1 1 -4 3 1 -1 6 -2 -2 1 -2 -2 0 0 -1 -3 0 -2 1 2 0 -10 // I 0 -2 -2 -2 -3 -2 -2 -2 -2 4 4 -2 3 2 -2 -1 0 -6 0 4 -2 -2 0 -10 // L -2 -3 -3 -4 -7 -2 -3 -4 -2 4 8 -3 5 4 -3 -3 -1 -2 1 3 -3 -3 -1 -10 // K -1 4 1 1 -6 1 1 -1 1 -2 -3 5 0 -6 0 0 0 -3 -5 -2 1 1 0 -10 // M -1 0 -2 -2 -6 -1 -2 -3 -2 3 5 0 5 1 -2 -1 0 -4 -2 2 -2 -2 0 -10 // F -4 -5 -4 -6 -4 -5 -6 -6 -2 2 4 -6 1 14 -5 -4 -3 2 12 0 -5 -5 -2 -10 // P 1 0 0 0 -3 1 0 0 0 -2 -3 0 -2 -5 6 1 1 -7 -5 -1 0 0 0 -10 // S 1 0 1 1 0 0 1 1 0 -1 -3 0 -1 -4 1 1 1 -3 -3 -1 1 0 0 -10 // T 1 0 1 0 -2 0 0 1 -1 0 -1 0 0 -3 1 1 2 -6 -3 0 0 0 0 -10 // W -7 4 -5 -8 -10 -5 -8 -8 -3 -6 -2 -3 -4 2 -7 -3 -6 31 2 -7 -6 -7 -4 -10 // Y -4 -5 -3 -5 1 -4 -5 -6 0 0 1 -5 -2 12 -5 -3 -3 2 15 -2 -4 -5 -2 -10 // V 0 -2 -1 -2 -2 -2 -2 -1 -2 4 3 -2 2 0 -1 -1 0 -7 -2 4 -2 -2 0 -10 // B 1 0 2 3 -5 2 3 1 1 -2 -3 1 -2 -5 0 1 0 -6 -4 -2 2 2 0 -10 // Z 0 1 2 3 -6 3 3 0 2 -2 -3 1 -2 -5 0 0 0 -7 -5 -2 2 3 0 -10 // X 0 0 0 0 -3 0 0 0 0 0 -1 0 0 -2 0 0 0 -4 -2 0 0 0 -1 -10 // * -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 1 // PAM410 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 1, 1, -2, 1, 1, -4, 2, -1, 0, 0, -1, -2, -1, 0, 1, 0, -1, 1, 1, 0, -7, 0, -4, 0, -10}, {0, 1, 2, -5, 3, 3, -5, 1, 1, -2, 0, 1, -3, -2, 2, 0, 2, 0, 1, 0, -2, -6, 0, -4, 2, -10}, {0, -2, -5, 20, -6, -6, -4, -4, -4, -3, 0, -6, -7, -6, -4, -3, -6, -4, 0, -2, -2, -10, -3, 1, -6, -10}, {0, 1, 3, -6, 3, 3, -6, 1, 1, -2, 0, 1, -4, -2, 2, 0, 2, 0, 1, 0, -2, -8, 0, -5, 3, -10}, {0, 1, 3, -6, 3, 3, -6, 1, 1, -2, 0, 1, -3, -2, 2, 0, 2, 0, 1, 0, -2, -8, 0, -5, 3, -10}, {0, -4, -5, -4, -6, -6, 14, -6, -2, 2, 0, -6, 4, 1, -4, -5, -5, -5, -4, -3, 0, 2, -2, 12, -5, -10}, {0, 2, 1, -4, 1, 1, -6, 5, -1, -2, 0, -1, -4, -3, 1, 0, 0, -2, 1, 1, -1, -8, 0, -6, 0, -10}, {0, -1, 1, -4, 1, 1, -2, -1, 6, -2, 0, 1, -2, -2, 1, 0, 3, 2, 0, -1, -2, -3, 0, 0, 2, -10}, {0, 0, -2, -3, -2, -2, 2, -2, -2, 4, 0, -2, 4, 3, -2, -2, -2, -2, -1, 0, 4, -6, 0, 0, -2, -10}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, -1, 1, -6, 1, 1, -6, -1, 1, -2, 0, 5, -3, 0, 1, 0, 1, 4, 0, 0, -2, -3, 0, -5, 1, -10}, {0, -2, -3, -7, -4, -3, 4, -4, -2, 4, 0, -3, 8, 5, -3, -3, -2, -3, -3, -1, 3, -2, -1, 1, -3, -10}, {0, -1, -2, -6, -2, -2, 1, -3, -2, 3, 0, 0, 5, 5, -2, -2, -1, 0, -1, 0, 2, -4, 0, -2, -2, -10}, {0, 0, 2, -4, 2, 2, -4, 1, 1, -2, 0, 1, -3, -2, 1, 0, 1, 1, 1, 1, -1, -5, 0, -3, 2, -10}, {0, 1, 0, -3, 0, 0, -5, 0, 0, -2, 0, 0, -3, -2, 0, 6, 1, 0, 1, 1, -1, -7, 0, -5, 0, -10}, {0, 0, 2, -6, 2, 2, -5, 0, 3, -2, 0, 1, -2, -1, 1, 1, 3, 2, 0, 0, -2, -5, 0, -4, 3, -10}, {0, -1, 0, -4, 0, 0, -5, -2, 2, -2, 0, 4, -3, 0, 1, 0, 2, 6, 0, 0, -2, 4, 0, -5, 1, -10}, {0, 1, 1, 0, 1, 1, -4, 1, 0, -1, 0, 0, -3, -1, 1, 1, 0, 0, 1, 1, -1, -3, 0, -3, 0, -10}, {0, 1, 0, -2, 0, 0, -3, 1, -1, 0, 0, 0, -1, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 2, 0, -6, 0, -3, 0, -10}, {0, 0, -2, -2, -2, -2, 0, -1, -2, 4, 0, -2, 3, 2, -1, -1, -2, -2, -1, 0, 4, -7, 0, -2, -2, -10}, {0, -7, -6, -10, -8, -8, 2, -8, -3, -6, 0, -3, -2, -4, -5, -7, -5, 4, -3, -6, -7, 31, -4, 2, -7, -10}, {0, 0, 0, -3, 0, 0, -2, 0, 0, 0, 0, 0, -1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, -4, -1, -2, 0, -10}, {0, -4, -4, 1, -5, -5, 12, -6, 0, 0, 0, -5, 1, -2, -3, -5, -4, -5, -3, -3, -2, 2, -2, 15, -5, -10}, {0, 0, 2, -6, 3, 3, -5, 0, 2, -2, 0, 1, -3, -2, 2, 0, 3, 1, 0, 0, -2, -7, 0, -5, 3, -10}, {0, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, 0, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, 1}, } // # // # This matrix was produced by "pam" Version 1.0.6 [28-Jul-93] // # // # PAM 420 substitution matrix, scale = ln(2)/6 = 0.115525 // # // # Expected score = -0.599, Entropy = 0.124 bits // # // # Lowest score = -10, Highest score = 31 // # // A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * // A 1 -1 0 1 -2 0 1 2 -1 0 -2 0 -1 -4 1 1 1 -7 -4 0 1 0 0 -10 // R -1 6 1 0 -4 2 0 -2 2 -2 -3 4 0 -5 0 0 0 4 -5 -2 0 1 0 -10 // N 0 1 1 2 -4 1 2 1 1 -2 -3 1 -1 -4 0 1 0 -5 -3 -1 2 2 0 -10 // D 1 0 2 3 -5 2 3 1 1 -2 -4 1 -2 -6 0 1 0 -8 -5 -2 3 3 0 -10 // C -2 -4 -4 -5 20 -6 -6 -3 -4 -3 -7 -6 -6 -4 -3 0 -2 -10 1 -2 -5 -6 -3 -10 // Q 0 2 1 2 -6 3 2 0 3 -2 -2 1 -1 -5 1 0 0 -5 -4 -2 2 3 0 -10 // E 1 0 2 3 -6 2 3 1 1 -2 -3 1 -2 -6 0 1 0 -8 -5 -2 3 3 0 -10 // G 2 -2 1 1 -3 0 1 5 -1 -2 -4 -1 -2 -6 0 1 1 -8 -6 -1 1 0 0 -10 // H -1 2 1 1 -4 3 1 -1 6 -2 -2 1 -2 -2 0 0 -1 -3 0 -2 1 2 0 -10 // I 0 -2 -2 -2 -3 -2 -2 -2 -2 4 4 -2 3 2 -2 -1 0 -6 0 4 -2 -2 0 -10 // L -2 -3 -3 -4 -7 -2 -3 -4 -2 4 7 -3 5 4 -2 -3 -1 -2 1 3 -3 -3 -1 -10 // K 0 4 1 1 -6 1 1 -1 1 -2 -3 5 0 -6 0 0 0 -3 -5 -2 1 1 0 -10 // M -1 0 -1 -2 -6 -1 -2 -2 -2 3 5 0 5 1 -2 -1 0 -4 -1 2 -2 -1 0 -10 // F -4 -5 -4 -6 -4 -5 -6 -6 -2 2 4 -6 1 13 -5 -4 -3 2 12 0 -5 -5 -2 -10 // P 1 0 0 0 -3 1 0 0 0 -2 -2 0 -2 -5 5 1 1 -6 -5 -1 0 0 0 -10 // S 1 0 1 1 0 0 1 1 0 -1 -3 0 -1 -4 1 1 1 -3 -3 -1 1 0 0 -10 // T 1 0 0 0 -2 0 0 1 -1 0 -1 0 0 -3 1 1 1 -6 -3 0 0 0 0 -10 // W -7 4 -5 -8 -10 -5 -8 -8 -3 -6 -2 -3 -4 2 -6 -3 -6 31 2 -7 -6 -7 -4 -10 // Y -4 -5 -3 -5 1 -4 -5 -6 0 0 1 -5 -1 12 -5 -3 -3 2 15 -2 -4 -5 -2 -10 // V 0 -2 -1 -2 -2 -2 -2 -1 -2 4 3 -2 2 0 -1 -1 0 -7 -2 4 -2 -2 0 -10 // B 1 0 2 3 -5 2 3 1 1 -2 -3 1 -2 -5 0 1 0 -6 -4 -2 2 2 0 -10 // Z 0 1 2 3 -6 3 3 0 2 -2 -3 1 -1 -5 0 0 0 -7 -5 -2 2 3 0 -10 // X 0 0 0 0 -3 0 0 0 0 0 -1 0 0 -2 0 0 0 -4 -2 0 0 0 -1 -10 // * -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 1 // PAM420 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 1, 1, -2, 1, 1, -4, 2, -1, 0, 0, 0, -2, -1, 0, 1, 0, -1, 1, 1, 0, -7, 0, -4, 0, -10}, {0, 1, 2, -5, 3, 3, -5, 1, 1, -2, 0, 1, -3, -2, 2, 0, 2, 0, 1, 0, -2, -6, 0, -4, 2, -10}, {0, -2, -5, 20, -5, -6, -4, -3, -4, -3, 0, -6, -7, -6, -4, -3, -6, -4, 0, -2, -2, -10, -3, 1, -6, -10}, {0, 1, 3, -5, 3, 3, -6, 1, 1, -2, 0, 1, -4, -2, 2, 0, 2, 0, 1, 0, -2, -8, 0, -5, 3, -10}, {0, 1, 3, -6, 3, 3, -6, 1, 1, -2, 0, 1, -3, -2, 2, 0, 2, 0, 1, 0, -2, -8, 0, -5, 3, -10}, {0, -4, -5, -4, -6, -6, 13, -6, -2, 2, 0, -6, 4, 1, -4, -5, -5, -5, -4, -3, 0, 2, -2, 12, -5, -10}, {0, 2, 1, -3, 1, 1, -6, 5, -1, -2, 0, -1, -4, -2, 1, 0, 0, -2, 1, 1, -1, -8, 0, -6, 0, -10}, {0, -1, 1, -4, 1, 1, -2, -1, 6, -2, 0, 1, -2, -2, 1, 0, 3, 2, 0, -1, -2, -3, 0, 0, 2, -10}, {0, 0, -2, -3, -2, -2, 2, -2, -2, 4, 0, -2, 4, 3, -2, -2, -2, -2, -1, 0, 4, -6, 0, 0, -2, -10}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 0, 1, -6, 1, 1, -6, -1, 1, -2, 0, 5, -3, 0, 1, 0, 1, 4, 0, 0, -2, -3, 0, -5, 1, -10}, {0, -2, -3, -7, -4, -3, 4, -4, -2, 4, 0, -3, 7, 5, -3, -2, -2, -3, -3, -1, 3, -2, -1, 1, -3, -10}, {0, -1, -2, -6, -2, -2, 1, -2, -2, 3, 0, 0, 5, 5, -1, -2, -1, 0, -1, 0, 2, -4, 0, -1, -1, -10}, {0, 0, 2, -4, 2, 2, -4, 1, 1, -2, 0, 1, -3, -1, 1, 0, 1, 1, 1, 0, -1, -5, 0, -3, 2, -10}, {0, 1, 0, -3, 0, 0, -5, 0, 0, -2, 0, 0, -2, -2, 0, 5, 1, 0, 1, 1, -1, -6, 0, -5, 0, -10}, {0, 0, 2, -6, 2, 2, -5, 0, 3, -2, 0, 1, -2, -1, 1, 1, 3, 2, 0, 0, -2, -5, 0, -4, 3, -10}, {0, -1, 0, -4, 0, 0, -5, -2, 2, -2, 0, 4, -3, 0, 1, 0, 2, 6, 0, 0, -2, 4, 0, -5, 1, -10}, {0, 1, 1, 0, 1, 1, -4, 1, 0, -1, 0, 0, -3, -1, 1, 1, 0, 0, 1, 1, -1, -3, 0, -3, 0, -10}, {0, 1, 0, -2, 0, 0, -3, 1, -1, 0, 0, 0, -1, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 1, 0, -6, 0, -3, 0, -10}, {0, 0, -2, -2, -2, -2, 0, -1, -2, 4, 0, -2, 3, 2, -1, -1, -2, -2, -1, 0, 4, -7, 0, -2, -2, -10}, {0, -7, -6, -10, -8, -8, 2, -8, -3, -6, 0, -3, -2, -4, -5, -6, -5, 4, -3, -6, -7, 31, -4, 2, -7, -10}, {0, 0, 0, -3, 0, 0, -2, 0, 0, 0, 0, 0, -1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, -4, -1, -2, 0, -10}, {0, -4, -4, 1, -5, -5, 12, -6, 0, 0, 0, -5, 1, -1, -3, -5, -4, -5, -3, -3, -2, 2, -2, 15, -5, -10}, {0, 0, 2, -6, 3, 3, -5, 0, 2, -2, 0, 1, -3, -1, 2, 0, 3, 1, 0, 0, -2, -7, 0, -5, 3, -10}, {0, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, 0, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, 1}, } // # // # This matrix was produced by "pam" Version 1.0.6 [28-Jul-93] // # // # PAM 430 substitution matrix, scale = ln(2)/6 = 0.115525 // # // # Expected score = -0.543, Entropy = 0.117 bits // # // # Lowest score = -9, Highest score = 31 // # // A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * // A 1 -1 0 1 -2 0 1 2 -1 0 -2 0 -1 -4 1 1 1 -7 -4 0 1 0 0 -9 // R -1 6 1 0 -4 2 0 -2 2 -2 -3 4 0 -5 0 0 0 4 -4 -2 0 1 0 -9 // N 0 1 1 2 -4 1 2 1 1 -2 -3 1 -1 -4 0 1 0 -5 -3 -1 2 1 0 -9 // D 1 0 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= -9, Highest score = 30 // # // A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * // A 1 -1 0 1 -2 0 1 2 -1 0 -2 0 -1 -4 1 1 1 -6 -4 0 1 0 0 -9 // R -1 5 1 0 -4 2 0 -2 2 -2 -3 4 0 -5 0 0 0 4 -4 -2 0 1 0 -9 // N 0 1 1 2 -4 1 2 1 1 -2 -3 1 -1 -4 0 1 0 -5 -3 -1 2 1 0 -9 // D 1 0 2 3 -5 2 3 1 1 -2 -3 1 -2 -6 0 1 0 -7 -5 -2 2 2 0 -9 // C -2 -4 -4 -5 20 -5 -5 -3 -4 -2 -6 -5 -5 -4 -3 0 -2 -9 1 -2 -4 -5 -3 -9 // Q 0 2 1 2 -5 3 2 0 3 -2 -2 1 -1 -4 1 0 0 -5 -4 -1 2 2 0 -9 // E 1 0 2 3 -5 2 3 1 1 -2 -3 1 -2 -5 0 1 0 -7 -5 -1 2 3 0 -9 // G 2 -2 1 1 -3 0 1 4 -1 -2 -4 -1 -2 -5 0 1 1 -8 -5 -1 1 0 0 -9 // H -1 2 1 1 -4 3 1 -1 5 -2 -2 1 -1 -2 0 0 -1 -3 0 -2 1 2 0 -9 // I 0 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 4 4 -2 3 2 -1 -1 0 -5 0 3 -2 -2 0 -9 // L -2 -3 -3 -3 -6 -2 -3 -4 -2 4 7 -3 5 4 -2 -2 -1 -2 1 3 -3 -2 -1 -9 // K 0 4 1 1 -5 1 1 -1 1 -2 -3 4 0 -5 0 0 0 -3 -5 -2 1 1 0 -9 // M -1 0 -1 -2 -5 -1 -2 -2 -1 3 5 0 4 1 -1 -1 0 -4 -1 2 -2 -1 0 -9 // F -4 -5 -4 -6 -4 -4 -5 -5 -2 2 4 -5 1 13 -5 -4 -3 2 12 0 -5 -5 -2 -9 // P 1 0 0 0 -3 1 0 0 0 -1 -2 0 -1 -5 5 1 1 -6 -5 -1 0 0 0 -9 // S 1 0 1 1 0 0 1 1 0 -1 -2 0 -1 -4 1 1 1 -3 -3 -1 1 0 0 -9 // T 1 0 0 0 -2 0 0 1 -1 0 -1 0 0 -3 1 1 1 -6 -3 0 0 0 0 -9 // W -6 4 -5 -7 -9 -5 -7 -8 -3 -5 -2 -3 -4 2 -6 -3 -6 30 2 -6 -6 -6 -4 -9 // Y -4 -4 -3 -5 1 -4 -5 -5 0 0 1 -5 -1 12 -5 -3 -3 2 15 -2 -4 -4 -2 -9 // V 0 -2 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -2 3 3 -2 2 0 -1 -1 0 -6 -2 4 -1 -1 0 -9 // B 1 0 2 2 -4 2 2 1 1 -2 -3 1 -2 -5 0 1 0 -6 -4 -1 2 2 0 -9 // Z 0 1 1 2 -5 2 3 0 2 -2 -2 1 -1 -5 0 0 0 -6 -4 -1 2 3 0 -9 // X 0 0 0 0 -3 0 0 0 0 0 -1 0 0 -2 0 0 0 -4 -2 0 0 0 -1 -9 // * -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 1 // PAM440 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 1, 1, -2, 1, 1, -4, 2, -1, 0, 0, 0, -2, -1, 0, 1, 0, -1, 1, 1, 0, -6, 0, -4, 0, -9}, {0, 1, 2, -4, 2, 2, -5, 1, 1, -2, 0, 1, -3, -2, 2, 0, 2, 0, 1, 0, -1, -6, 0, -4, 2, -9}, {0, -2, -4, 20, -5, -5, -4, -3, -4, -2, 0, -5, -6, -5, -4, -3, -5, 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1, 0, 1, 1, 1, 0, -1, -5, 0, -3, 1, -9}, {0, 1, 0, -3, 0, 0, -5, 0, 0, -1, 0, 0, -2, -1, 0, 5, 1, 0, 1, 1, -1, -6, 0, -5, 0, -9}, {0, 0, 2, -5, 2, 2, -4, 0, 3, -2, 0, 1, -2, -1, 1, 1, 3, 2, 0, 0, -1, -5, 0, -4, 2, -9}, {0, -1, 0, -4, 0, 0, -5, -2, 2, -2, 0, 4, -3, 0, 1, 0, 2, 5, 0, 0, -2, 4, 0, -4, 1, -9}, {0, 1, 1, 0, 1, 1, -4, 1, 0, -1, 0, 0, -2, -1, 1, 1, 0, 0, 1, 1, -1, -3, 0, -3, 0, -9}, {0, 1, 0, -2, 0, 0, -3, 1, -1, 0, 0, 0, -1, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 1, 0, -6, 0, -3, 0, -9}, {0, 0, -1, -2, -2, -1, 0, -1, -2, 3, 0, -2, 3, 2, -1, -1, -1, -2, -1, 0, 4, -6, 0, -2, -1, -9}, {0, -6, -6, -9, -7, -7, 2, -8, -3, -5, 0, -3, -2, -4, -5, -6, -5, 4, -3, -6, -6, 30, -4, 2, -6, -9}, {0, 0, 0, -3, 0, 0, -2, 0, 0, 0, 0, 0, -1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, -4, -1, -2, 0, -9}, {0, -4, -4, 1, -5, -5, 12, -5, 0, 0, 0, -5, 1, -1, -3, -5, -4, -4, -3, -3, -2, 2, -2, 15, -4, -9}, {0, 0, 2, -5, 2, 3, -5, 0, 2, -2, 0, 1, -2, -1, 1, 0, 2, 1, 0, 0, -1, -6, 0, -4, 3, -9}, {0, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, 0, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, 1}, } // # // # This matrix was produced by "pam" Version 1.0.6 [28-Jul-93] // # // # PAM 450 substitution matrix, scale = ln(2)/6 = 0.115525 // # // # Expected score = -0.476, Entropy = 0.105 bits // # // # Lowest score = -9, Highest score = 30 // # // A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * // A 1 -1 0 1 -2 0 1 1 -1 0 -2 0 -1 -3 1 1 1 -6 -4 0 1 0 0 -9 // R -1 5 1 0 -4 2 0 -1 2 -2 -3 4 0 -4 0 0 0 4 -4 -2 0 1 0 -9 // N 0 1 1 2 -4 1 2 1 1 -1 -2 1 -1 -4 0 1 0 -4 -3 -1 1 1 0 -9 // D 1 0 2 3 -5 2 3 1 1 -2 -3 1 -2 -5 0 1 0 -7 -5 -1 2 2 0 -9 // C -2 -4 -4 -5 20 -5 -5 -3 -4 -2 -6 -5 -5 -4 -2 0 -2 -9 1 -2 -4 -5 -2 -9 // Q 0 2 1 2 -5 3 2 0 3 -1 -2 1 -1 -4 1 0 0 -5 -4 -1 2 2 0 -9 // E 1 0 2 3 -5 2 3 1 1 -2 -3 1 -2 -5 0 1 0 -7 -5 -1 2 3 0 -9 // G 1 -1 1 1 -3 0 1 4 -1 -2 -3 -1 -2 -5 0 1 1 -8 -5 -1 1 0 0 -9 // H -1 2 1 1 -4 3 1 -1 5 -2 -2 1 -1 -2 0 0 -1 -2 0 -2 1 2 0 -9 // I 0 -2 -1 -2 -2 -1 -2 -2 -2 4 3 -2 3 2 -1 -1 0 -5 0 3 -2 -2 0 -9 // L -2 -3 -2 -3 -6 -2 -3 -3 -2 3 7 -2 4 4 -2 -2 -1 -1 1 3 -3 -2 -1 -9 // K 0 4 1 1 -5 1 1 -1 1 -2 -2 4 0 -5 0 0 0 -3 -5 -2 1 1 0 -9 // M -1 0 -1 -2 -5 -1 -2 -2 -1 3 4 0 4 1 -1 -1 0 -4 -1 2 -2 -1 0 -9 // F -3 -4 -4 -5 -4 -4 -5 -5 -2 2 4 -5 1 13 -5 -3 -3 2 12 0 -4 -5 -2 -9 // P 1 0 0 0 -2 1 0 0 0 -1 -2 0 -1 -5 5 1 1 -6 -5 -1 0 0 0 -9 // S 1 0 1 1 0 0 1 1 0 -1 -2 0 -1 -3 1 1 1 -3 -3 -1 1 0 0 -9 // T 1 0 0 0 -2 0 0 1 -1 0 -1 0 0 -3 1 1 1 -5 -3 0 0 0 0 -9 // W -6 4 -4 -7 -9 -5 -7 -8 -2 -5 -1 -3 -4 2 -6 -3 -5 30 2 -6 -6 -6 -4 -9 // Y -4 -4 -3 -5 1 -4 -5 -5 0 0 1 -5 -1 12 -5 -3 -3 2 14 -2 -4 -4 -2 -9 // V 0 -2 -1 -1 -2 -1 -1 -1 -2 3 3 -2 2 0 -1 -1 0 -6 -2 3 -1 -1 0 -9 // B 1 0 1 2 -4 2 2 1 1 -2 -3 1 -2 -4 0 1 0 -6 -4 -1 2 2 0 -9 // Z 0 1 1 2 -5 2 3 0 2 -2 -2 1 -1 -5 0 0 0 -6 -4 -1 2 2 0 -9 // X 0 0 0 0 -2 0 0 0 0 0 -1 0 0 -2 0 0 0 -4 -2 0 0 0 0 -9 // * -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 1 // PAM450 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 1, 1, -2, 1, 1, -3, 1, -1, 0, 0, 0, -2, -1, 0, 1, 0, -1, 1, 1, 0, -6, 0, -4, 0, -9}, {0, 1, 2, -4, 2, 2, -4, 1, 1, -2, 0, 1, -3, -2, 1, 0, 2, 0, 1, 0, -1, -6, 0, -4, 2, -9}, {0, -2, -4, 20, -5, -5, -4, -3, -4, -2, 0, -5, -6, -5, -4, -2, -5, -4, 0, -2, -2, -9, -2, 1, -5, -9}, {0, 1, 2, -5, 3, 3, -5, 1, 1, -2, 0, 1, -3, -2, 2, 0, 2, 0, 1, 0, -1, -7, 0, -5, 2, -9}, {0, 1, 2, -5, 3, 3, -5, 1, 1, -2, 0, 1, -3, -2, 2, 0, 2, 0, 1, 0, -1, -7, 0, -5, 3, -9}, {0, -3, -4, -4, -5, -5, 13, -5, -2, 2, 0, -5, 4, 1, -4, -5, -4, -4, -3, -3, 0, 2, -2, 12, -5, -9}, {0, 1, 1, -3, 1, 1, -5, 4, -1, -2, 0, -1, -3, -2, 1, 0, 0, -1, 1, 1, -1, -8, 0, -5, 0, -9}, {0, -1, 1, -4, 1, 1, -2, -1, 5, -2, 0, 1, -2, -1, 1, 0, 3, 2, 0, -1, -2, -2, 0, 0, 2, -9}, {0, 0, -2, -2, -2, -2, 2, -2, -2, 4, 0, -2, 3, 3, -1, -1, -1, -2, -1, 0, 3, -5, 0, 0, -2, -9}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 0, 1, -5, 1, 1, -5, -1, 1, -2, 0, 4, -2, 0, 1, 0, 1, 4, 0, 0, -2, -3, 0, -5, 1, -9}, {0, -2, -3, -6, -3, -3, 4, -3, -2, 3, 0, -2, 7, 4, -2, -2, -2, -3, -2, -1, 3, -1, -1, 1, -2, -9}, {0, -1, -2, -5, -2, -2, 1, -2, -1, 3, 0, 0, 4, 4, -1, -1, -1, 0, -1, 0, 2, -4, 0, -1, -1, -9}, {0, 0, 1, -4, 2, 2, -4, 1, 1, -1, 0, 1, -2, -1, 1, 0, 1, 1, 1, 0, -1, -4, 0, -3, 1, -9}, {0, 1, 0, -2, 0, 0, -5, 0, 0, -1, 0, 0, -2, -1, 0, 5, 1, 0, 1, 1, -1, -6, 0, -5, 0, -9}, {0, 0, 2, -5, 2, 2, -4, 0, 3, -1, 0, 1, -2, -1, 1, 1, 3, 2, 0, 0, -1, -5, 0, -4, 2, -9}, {0, -1, 0, -4, 0, 0, -4, -1, 2, -2, 0, 4, -3, 0, 1, 0, 2, 5, 0, 0, -2, 4, 0, -4, 1, -9}, {0, 1, 1, 0, 1, 1, -3, 1, 0, -1, 0, 0, -2, -1, 1, 1, 0, 0, 1, 1, -1, -3, 0, -3, 0, -9}, {0, 1, 0, -2, 0, 0, -3, 1, -1, 0, 0, 0, -1, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 1, 0, -5, 0, -3, 0, -9}, {0, 0, -1, -2, -1, -1, 0, -1, -2, 3, 0, -2, 3, 2, -1, -1, -1, -2, -1, 0, 3, -6, 0, -2, -1, -9}, {0, -6, -6, -9, -7, -7, 2, -8, -2, -5, 0, -3, -1, -4, -4, -6, -5, 4, -3, -5, -6, 30, -4, 2, -6, -9}, {0, 0, 0, -2, 0, 0, -2, 0, 0, 0, 0, 0, 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0 -5 -4 -1 1 2 0 -9 // E 1 0 1 3 -5 2 3 1 1 -2 -3 1 -2 -5 0 1 0 -7 -4 -1 2 2 0 -9 // G 1 -1 1 1 -3 0 1 4 -1 -2 -3 -1 -2 -5 1 1 1 -7 -5 -1 1 0 0 -9 // H 0 2 1 1 -3 2 1 -1 5 -2 -2 1 -1 -2 0 0 0 -2 0 -2 1 2 0 -9 // I 0 -2 -1 -2 -2 -1 -2 -2 -2 3 3 -2 2 2 -1 -1 0 -5 0 3 -2 -2 0 -9 // L -1 -2 -2 -3 -6 -2 -3 -3 -2 3 7 -2 4 3 -2 -2 -1 -1 1 3 -3 -2 -1 -9 // K 0 4 1 1 -5 1 1 -1 1 -2 -2 4 0 -5 0 0 0 -3 -4 -2 1 1 0 -9 // M -1 0 -1 -2 -5 -1 -2 -2 -1 2 4 0 4 1 -1 -1 0 -4 -1 2 -2 -1 0 -9 // F -3 -4 -3 -5 -3 -4 -5 -5 -2 2 3 -5 1 12 -4 -3 -3 2 11 0 -4 -5 -2 -9 // P 1 0 0 0 -2 1 0 1 0 -1 -2 0 -1 -4 4 1 1 -6 -5 -1 0 0 0 -9 // S 1 0 1 1 0 0 1 1 0 -1 -2 0 -1 -3 1 1 1 -3 -3 -1 1 0 0 -9 // T 1 0 0 0 -2 0 0 1 0 0 -1 0 0 -3 1 1 1 -5 -3 0 0 0 0 -9 // W -6 4 -4 -7 -9 -5 -7 -7 -2 -5 -1 -3 -4 2 -6 -3 -5 30 2 -6 -6 -6 -4 -9 // Y -3 -4 -3 -4 2 -4 -4 -5 0 0 1 -4 -1 11 -5 -3 -3 2 14 -2 -4 -4 -2 -9 // V 0 -2 -1 -1 -2 -1 -1 -1 -2 3 3 -2 2 0 -1 -1 0 -6 -2 3 -1 -1 0 -9 // B 1 0 1 2 -4 1 2 1 1 -2 -3 1 -2 -4 0 1 0 -6 -4 -1 2 2 0 -9 // Z 0 1 1 2 -5 2 2 0 2 -2 -2 1 -1 -5 0 0 0 -6 -4 -1 2 2 0 -9 // X 0 0 0 0 -2 0 0 0 0 0 -1 0 0 -2 0 0 0 -4 -2 0 0 0 0 -9 // * -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 1 // PAM460 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 1, 1, -2, 1, 1, -3, 1, 0, 0, 0, 0, -1, -1, 0, 1, 0, -1, 1, 1, 0, -6, 0, -3, 0, -9}, {0, 1, 2, -4, 2, 2, -4, 1, 1, -2, 0, 1, -3, -2, 1, 0, 1, 0, 1, 0, -1, -6, 0, -4, 2, -9}, {0, -2, -4, 19, -5, -5, -3, -3, -3, -2, 0, -5, -6, -5, -3, -2, -5, -4, 0, -2, -2, -9, -2, 2, -5, -9}, {0, 1, 2, -5, 3, 3, -5, 1, 1, -2, 0, 1, -3, -2, 2, 0, 2, 0, 1, 0, -1, -7, 0, -4, 2, -9}, {0, 1, 2, -5, 3, 3, -5, 1, 1, -2, 0, 1, -3, -2, 1, 0, 2, 0, 1, 0, -1, -7, 0, -4, 2, -9}, {0, -3, -4, -3, -5, -5, 12, -5, -2, 2, 0, -5, 3, 1, -3, -4, -4, -4, -3, -3, 0, 2, -2, 11, -5, -9}, {0, 1, 1, -3, 1, 1, -5, 4, -1, -2, 0, -1, -3, -2, 1, 1, 0, -1, 1, 1, -1, -7, 0, -5, 0, -9}, {0, 0, 1, -3, 1, 1, -2, -1, 5, -2, 0, 1, -2, -1, 1, 0, 2, 2, 0, 0, -2, -2, 0, 0, 2, -9}, {0, 0, -2, -2, -2, -2, 2, -2, -2, 3, 0, -2, 3, 2, -1, -1, -1, -2, -1, 0, 3, -5, 0, 0, -2, -9}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 0, 1, -5, 1, 1, -5, -1, 1, -2, 0, 4, -2, 0, 1, 0, 1, 4, 0, 0, -2, -3, 0, -4, 1, -9}, {0, -1, -3, -6, -3, -3, 3, -3, -2, 3, 0, -2, 7, 4, -2, -2, -2, -2, -2, -1, 3, -1, -1, 1, -2, -9}, {0, -1, -2, -5, -2, -2, 1, -2, -1, 2, 0, 0, 4, 4, -1, -1, -1, 0, -1, 0, 2, -4, 0, -1, -1, -9}, {0, 0, 1, -3, 2, 1, -3, 1, 1, -1, 0, 1, -2, -1, 1, 0, 1, 1, 1, 0, -1, -4, 0, -3, 1, -9}, {0, 1, 0, -2, 0, 0, -4, 1, 0, -1, 0, 0, -2, -1, 0, 4, 1, 0, 1, 1, -1, -6, 0, -5, 0, -9}, {0, 0, 1, -5, 2, 2, -4, 0, 2, -1, 0, 1, -2, -1, 1, 1, 2, 1, 0, 0, -1, -5, 0, -4, 2, -9}, {0, -1, 0, -4, 0, 0, -4, -1, 2, -2, 0, 4, -2, 0, 1, 0, 1, 5, 0, 0, -2, 4, 0, -4, 1, -9}, {0, 1, 1, 0, 1, 1, -3, 1, 0, -1, 0, 0, -2, -1, 1, 1, 0, 0, 1, 1, -1, -3, 0, -3, 0, -9}, {0, 1, 0, -2, 0, 0, -3, 1, 0, 0, 0, 0, -1, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 1, 0, -5, 0, -3, 0, -9}, {0, 0, -1, -2, -1, -1, 0, -1, -2, 3, 0, -2, 3, 2, -1, -1, -1, -2, -1, 0, 3, -6, 0, -2, -1, -9}, {0, -6, -6, -9, -7, -7, 2, -7, -2, -5, 0, -3, -1, -4, -4, -6, -5, 4, -3, -5, -6, 30, -4, 2, -6, -9}, {0, 0, 0, -2, 0, 0, -2, 0, 0, 0, 0, 0, -1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, -4, 0, -2, 0, -9}, {0, -3, -4, 2, -4, -4, 11, -5, 0, 0, 0, -4, 1, -1, -3, -5, -4, -4, -3, -3, -2, 2, -2, 14, -4, -9}, {0, 0, 2, -5, 2, 2, -5, 0, 2, -2, 0, 1, -2, -1, 1, 0, 2, 1, 0, 0, -1, -6, 0, -4, 2, -9}, {0, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, 0, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, 1}, } // # // # This matrix was produced by "pam" Version 1.0.6 [28-Jul-93] // # // # PAM 470 substitution matrix, scale = ln(2)/7 = 0.0990210 // # // # Expected score = -0.520, Entropy = 0.0942 bits // # // # Lowest score = -10, Highest score = 35 // # // A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * // A 1 -1 1 1 -2 0 1 2 -1 0 -2 0 -1 -4 1 1 1 -7 -4 0 1 0 0 -10 // R -1 6 1 0 -4 2 0 -1 2 -2 -3 4 0 -5 0 0 0 4 -5 -2 0 1 0 -10 // N 1 1 1 2 -4 1 2 1 1 -2 -3 1 -1 -4 0 1 0 -5 -3 -1 2 1 0 -10 // D 1 0 2 3 -5 2 3 1 1 -2 -4 1 -2 -6 0 1 0 -8 -5 -2 3 3 0 -10 // C -2 -4 -4 -5 22 -6 -5 -3 -4 -2 -6 -6 -6 -4 -3 0 -2 -10 2 -2 -5 -6 -3 -10 // Q 0 2 1 2 -6 3 2 0 3 -2 -2 1 -1 -5 1 0 0 -5 -4 -1 2 2 0 -10 // E 1 0 2 3 -5 2 3 1 1 -2 -3 1 -2 -6 0 1 0 -8 -5 -1 2 3 0 -10 // G 2 -1 1 1 -3 0 1 5 -1 -2 -4 -1 -2 -6 1 1 1 -8 -6 -1 1 1 0 -10 // H -1 2 1 1 -4 3 1 -1 5 -2 -2 1 -1 -2 0 0 0 -3 0 -2 1 2 0 -10 // I 0 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 4 4 -2 3 2 -1 -1 0 -5 0 3 -2 -2 0 -10 // L -2 -3 -3 -4 -6 -2 -3 -4 -2 4 8 -3 5 4 -2 -2 -1 -2 1 3 -3 -3 -1 -10 // K 0 4 1 1 -6 1 1 -1 1 -2 -3 4 0 -5 0 0 0 -3 -5 -2 1 1 0 -10 // M -1 0 -1 -2 -6 -1 -2 -2 -1 3 5 0 4 1 -1 -1 0 -4 -1 2 -2 -1 0 -10 // F -4 -5 -4 -6 -4 -5 -6 -6 -2 2 4 -5 1 14 -5 -4 -3 3 13 0 -5 -5 -2 -10 // P 1 0 0 0 -3 1 0 1 0 -1 -2 0 -1 -5 5 1 1 -6 -5 -1 0 1 0 -10 // S 1 0 1 1 0 0 1 1 0 -1 -2 0 -1 -4 1 1 1 -4 -3 -1 1 0 0 -10 // T 1 0 0 0 -2 0 0 1 0 0 -1 0 0 -3 1 1 1 -6 -3 0 0 0 0 -10 // W -7 4 -5 -8 -10 -5 -8 -8 -3 -5 -2 -3 -4 3 -6 -4 -6 35 2 -7 -6 -7 -4 -10 // Y -4 -5 -3 -5 2 -4 -5 -6 0 0 1 -5 -1 13 -5 -3 -3 2 16 -2 -4 -5 -2 -10 // V 0 -2 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -2 3 3 -2 2 0 -1 -1 0 -7 -2 4 -1 -1 0 -10 // B 1 0 2 3 -5 2 2 1 1 -2 -3 1 -2 -5 0 1 0 -6 -4 -1 2 2 0 -10 // Z 0 1 1 3 -6 2 3 1 2 -2 -3 1 -1 -5 1 0 0 -7 -5 -1 2 3 0 -10 // X 0 0 0 0 -3 0 0 0 0 0 -1 0 0 -2 0 0 0 -4 -2 0 0 0 0 -10 // * -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 1 // PAM470 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 1, 1, -2, 1, 1, -4, 2, -1, 0, 0, 0, -2, -1, 1, 1, 0, -1, 1, 1, 0, -7, 0, -4, 0, -10}, {0, 1, 2, -5, 3, 2, -5, 1, 1, -2, 0, 1, -3, -2, 2, 0, 2, 0, 1, 0, -1, -6, 0, -4, 2, -10}, {0, -2, -5, 22, -5, -5, -4, -3, -4, -2, 0, -6, -6, -6, -4, -3, -6, -4, 0, -2, -2, -10, -3, 2, -6, -10}, {0, 1, 3, -5, 3, 3, -6, 1, 1, -2, 0, 1, -4, -2, 2, 0, 2, 0, 1, 0, -2, -8, 0, -5, 3, -10}, {0, 1, 2, -5, 3, 3, -6, 1, 1, -2, 0, 1, -3, -2, 2, 0, 2, 0, 1, 0, -1, -8, 0, -5, 3, -10}, {0, -4, -5, -4, -6, -6, 14, -6, -2, 2, 0, -5, 4, 1, -4, -5, -5, -5, -4, -3, 0, 3, -2, 13, -5, -10}, {0, 2, 1, -3, 1, 1, -6, 5, -1, -2, 0, -1, -4, -2, 1, 1, 0, -1, 1, 1, -1, -8, 0, -6, 1, -10}, {0, -1, 1, -4, 1, 1, -2, -1, 5, -2, 0, 1, -2, -1, 1, 0, 3, 2, 0, 0, -2, -3, 0, 0, 2, -10}, {0, 0, -2, -2, -2, -2, 2, -2, -2, 4, 0, -2, 4, 3, -2, -1, -2, -2, -1, 0, 3, -5, 0, 0, -2, -10}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 0, 1, -6, 1, 1, -5, -1, 1, -2, 0, 4, -3, 0, 1, 0, 1, 4, 0, 0, -2, -3, 0, -5, 1, -10}, {0, -2, -3, -6, -4, -3, 4, -4, -2, 4, 0, -3, 8, 5, -3, -2, -2, -3, -2, -1, 3, -2, -1, 1, -3, -10}, {0, -1, -2, -6, -2, -2, 1, -2, -1, 3, 0, 0, 5, 4, -1, -1, -1, 0, -1, 0, 2, -4, 0, -1, -1, -10}, {0, 1, 2, -4, 2, 2, -4, 1, 1, -2, 0, 1, -3, -1, 1, 0, 1, 1, 1, 0, -1, -5, 0, -3, 1, -10}, {0, 1, 0, -3, 0, 0, -5, 1, 0, -1, 0, 0, -2, -1, 0, 5, 1, 0, 1, 1, -1, -6, 0, -5, 1, -10}, {0, 0, 2, -6, 2, 2, -5, 0, 3, -2, 0, 1, -2, -1, 1, 1, 3, 2, 0, 0, -1, -5, 0, -4, 2, -10}, {0, -1, 0, -4, 0, 0, -5, -1, 2, -2, 0, 4, -3, 0, 1, 0, 2, 6, 0, 0, -2, 4, 0, -5, 1, -10}, {0, 1, 1, 0, 1, 1, -4, 1, 0, -1, 0, 0, -2, -1, 1, 1, 0, 0, 1, 1, -1, -4, 0, -3, 0, -10}, {0, 1, 0, -2, 0, 0, -3, 1, 0, 0, 0, 0, -1, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 1, 0, -6, 0, -3, 0, -10}, {0, 0, -1, -2, -2, -1, 0, -1, -2, 3, 0, -2, 3, 2, -1, -1, -1, -2, -1, 0, 4, -7, 0, -2, -1, -10}, {0, -7, -6, -10, -8, -8, 3, -8, -3, -5, 0, -3, -2, -4, -5, -6, -5, 4, -4, -6, -7, 35, -4, 2, -7, -10}, {0, 0, 0, -3, 0, 0, -2, 0, 0, 0, 0, 0, -1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, -4, 0, -2, 0, -10}, {0, -4, -4, 2, -5, -5, 13, -6, 0, 0, 0, -5, 1, -1, -3, -5, -4, -5, -3, -3, -2, 2, -2, 16, -5, -10}, {0, 0, 2, -6, 3, 3, -5, 1, 2, -2, 0, 1, -3, -1, 1, 1, 2, 1, 0, 0, -1, -7, 0, -5, 3, -10}, {0, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, 0, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, 1}, } // # // # This matrix was produced by "pam" Version 1.0.6 [28-Jul-93] // # // # PAM 480 substitution matrix, scale = ln(2)/7 = 0.0990210 // # // # Expected score = -0.494, Entropy = 0.0893 bits // # // # Lowest score = -10, Highest score = 35 // # // A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * // A 1 -1 1 1 -2 0 1 2 0 0 -2 0 -1 -4 1 1 1 -7 -4 0 1 0 0 -10 // R -1 5 1 0 -4 2 0 -1 2 -2 -3 4 0 -5 0 0 0 4 -4 -2 0 1 0 -10 // N 1 1 1 2 -4 1 2 1 1 -1 -3 1 -1 -4 0 1 0 -5 -3 -1 2 1 0 -10 // D 1 0 2 3 -5 2 3 1 1 -2 -3 1 -2 -6 0 1 0 -7 -5 -1 2 2 0 -10 // C -2 -4 -4 -5 22 -5 -5 -3 -4 -2 -6 -6 -5 -4 -3 0 -2 -10 2 -2 -4 -5 -3 -10 // Q 0 2 1 2 -5 3 2 0 3 -2 -2 1 -1 -5 1 0 0 -5 -4 -1 2 2 0 -10 // E 1 0 2 3 -5 2 3 1 1 -2 -3 1 -2 -5 0 1 0 -8 -5 -1 2 3 0 -10 // G 2 -1 1 1 -3 0 1 4 -1 -2 -4 -1 -2 -5 1 1 1 -8 -5 -1 1 1 0 -10 // H 0 2 1 1 -4 3 1 -1 5 -2 -2 1 -1 -2 0 0 0 -3 0 -2 1 2 0 -10 // I 0 -2 -1 -2 -2 -2 -2 -2 -2 4 4 -2 3 2 -1 -1 0 -5 0 3 -2 -2 0 -10 // L -2 -3 -3 -3 -6 -2 -3 -4 -2 4 7 -3 5 4 -2 -2 -1 -2 1 3 -3 -3 -1 -10 // K 0 4 1 1 -6 1 1 -1 1 -2 -3 4 0 -5 0 0 0 -3 -5 -2 1 1 0 -10 // M -1 0 -1 -2 -5 -1 -2 -2 -1 3 5 0 4 1 -1 -1 0 -4 -1 2 -2 -1 0 -10 // F -4 -5 -4 -6 -4 -5 -5 -5 -2 2 4 -5 1 14 -5 -4 -3 3 13 0 -5 -5 -2 -10 // P 1 0 0 0 -3 1 0 1 0 -1 -2 0 -1 -5 5 1 1 -6 -5 -1 0 1 0 -10 // S 1 0 1 1 0 0 1 1 0 -1 -2 0 -1 -4 1 1 1 -3 -3 -1 1 0 0 -10 // T 1 0 0 0 -2 0 0 1 0 0 -1 0 0 -3 1 1 1 -6 -3 0 0 0 0 -10 // W -7 4 -5 -7 -10 -5 -8 -8 -3 -5 -2 -3 -4 3 -6 -3 -6 35 2 -7 -6 -6 -4 -10 // Y -4 -4 -3 -5 2 -4 -5 -5 0 0 1 -5 -1 13 -5 -3 -3 2 16 -2 -4 -5 -2 -10 // V 0 -2 -1 -1 -2 -1 -1 -1 -2 3 3 -2 2 0 -1 -1 0 -7 -2 3 -1 -1 0 -10 // B 1 0 2 2 -4 2 2 1 1 -2 -3 1 -2 -5 0 1 0 -6 -4 -1 2 2 0 -10 // Z 0 1 1 2 -5 2 3 1 2 -2 -3 1 -1 -5 1 0 0 -6 -5 -1 2 2 0 -10 // X 0 0 0 0 -3 0 0 0 0 0 -1 0 0 -2 0 0 0 -4 -2 0 0 0 0 -10 // * -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 1 // PAM480 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 1, 1, -2, 1, 1, -4, 2, 0, 0, 0, 0, -2, -1, 1, 1, 0, -1, 1, 1, 0, -7, 0, -4, 0, -10}, {0, 1, 2, -4, 2, 2, -5, 1, 1, -2, 0, 1, -3, -2, 2, 0, 2, 0, 1, 0, -1, -6, 0, -4, 2, -10}, {0, -2, -4, 22, -5, -5, -4, -3, -4, -2, 0, -6, -6, -5, -4, -3, -5, -4, 0, -2, -2, -10, -3, 2, -5, -10}, {0, 1, 2, -5, 3, 3, -6, 1, 1, -2, 0, 1, -3, -2, 2, 0, 2, 0, 1, 0, -1, -7, 0, -5, 2, -10}, {0, 1, 2, -5, 3, 3, -5, 1, 1, -2, 0, 1, -3, -2, 2, 0, 2, 0, 1, 0, -1, -8, 0, -5, 3, -10}, {0, -4, -5, -4, -6, -5, 14, -5, -2, 2, 0, -5, 4, 1, -4, -5, -5, -5, -4, -3, 0, 3, -2, 13, -5, -10}, {0, 2, 1, -3, 1, 1, -5, 4, -1, -2, 0, -1, -4, -2, 1, 1, 0, -1, 1, 1, -1, -8, 0, -5, 1, -10}, {0, 0, 1, -4, 1, 1, -2, -1, 5, -2, 0, 1, -2, -1, 1, 0, 3, 2, 0, 0, -2, -3, 0, 0, 2, -10}, {0, 0, -2, -2, -2, -2, 2, -2, -2, 4, 0, -2, 4, 3, -1, -1, -2, -2, -1, 0, 3, -5, 0, 0, -2, -10}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 0, 1, -6, 1, 1, -5, -1, 1, -2, 0, 4, -3, 0, 1, 0, 1, 4, 0, 0, -2, -3, 0, -5, 1, -10}, {0, -2, -3, -6, -3, -3, 4, -4, -2, 4, 0, -3, 7, 5, -3, -2, -2, -3, -2, -1, 3, -2, -1, 1, -3, -10}, {0, -1, -2, -5, -2, -2, 1, -2, -1, 3, 0, 0, 5, 4, -1, -1, -1, 0, -1, 0, 2, -4, 0, -1, -1, -10}, {0, 1, 2, -4, 2, 2, -4, 1, 1, -1, 0, 1, -3, -1, 1, 0, 1, 1, 1, 0, -1, -5, 0, -3, 1, -10}, {0, 1, 0, -3, 0, 0, -5, 1, 0, -1, 0, 0, -2, -1, 0, 5, 1, 0, 1, 1, -1, -6, 0, -5, 1, -10}, {0, 0, 2, -5, 2, 2, -5, 0, 3, -2, 0, 1, -2, -1, 1, 1, 3, 2, 0, 0, -1, -5, 0, -4, 2, -10}, {0, -1, 0, -4, 0, 0, -5, -1, 2, -2, 0, 4, -3, 0, 1, 0, 2, 5, 0, 0, -2, 4, 0, -4, 1, -10}, {0, 1, 1, 0, 1, 1, -4, 1, 0, -1, 0, 0, -2, -1, 1, 1, 0, 0, 1, 1, -1, -3, 0, -3, 0, -10}, {0, 1, 0, -2, 0, 0, -3, 1, 0, 0, 0, 0, -1, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 1, 0, -6, 0, -3, 0, -10}, {0, 0, -1, -2, -1, -1, 0, -1, -2, 3, 0, -2, 3, 2, -1, -1, -1, -2, -1, 0, 3, -7, 0, -2, -1, -10}, {0, -7, -6, -10, -7, -8, 3, -8, -3, -5, 0, -3, -2, -4, -5, -6, -5, 4, -3, -6, -7, 35, -4, 2, -6, -10}, {0, 0, 0, -3, 0, 0, -2, 0, 0, 0, 0, 0, -1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, -4, 0, -2, 0, -10}, {0, -4, -4, 2, -5, -5, 13, -5, 0, 0, 0, -5, 1, -1, -3, -5, -4, -4, -3, -3, -2, 2, -2, 16, -5, -10}, {0, 0, 2, -5, 2, 3, -5, 1, 2, -2, 0, 1, -3, -1, 1, 1, 2, 1, 0, 0, -1, -6, 0, -5, 2, -10}, {0, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, 0, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, 1}, } // # // # This matrix was produced by "pam" Version 1.0.6 [28-Jul-93] // # // # PAM 490 substitution matrix, scale = ln(2)/7 = 0.0990210 // # // # Expected score = -0.431, Entropy = 0.0847 bits // # // # Lowest score = -9, Highest score = 34 // # // A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * // A 1 -1 0 1 -2 0 1 2 0 0 -1 0 -1 -3 1 1 1 -6 -4 0 1 0 0 -9 // R -1 5 1 0 -4 2 0 -1 2 -2 -3 4 0 -5 0 0 0 4 -4 -2 0 1 0 -9 // N 0 1 1 2 -4 1 2 1 1 -1 -2 1 -1 -4 0 1 0 -5 -3 -1 1 1 0 -9 // D 1 0 2 3 -5 2 3 1 1 -2 -3 1 -2 -5 0 1 0 -7 -5 -1 2 2 0 -9 // C -2 -4 -4 -5 22 -5 -5 -3 -4 -2 -6 -5 -5 -4 -3 0 -2 -9 2 -2 -4 -5 -2 -9 // Q 0 2 1 2 -5 2 2 0 2 -1 -2 1 -1 -4 1 0 0 -5 -4 -1 2 2 0 -9 // E 1 0 2 3 -5 2 3 1 1 -2 -3 1 -2 -5 0 1 0 -7 -5 -1 2 2 0 -9 // G 2 -1 1 1 -3 0 1 4 -1 -2 -3 -1 -2 -5 1 1 1 -8 -5 -1 1 1 0 -9 // H 0 2 1 1 -4 2 1 -1 5 -2 -2 1 -1 -2 0 0 0 -3 0 -2 1 2 0 -9 // I 0 -2 -1 -2 -2 -1 -2 -2 -2 3 4 -2 3 2 -1 -1 0 -5 0 3 -2 -2 0 -9 // L -1 -3 -2 -3 -6 -2 -3 -3 -2 4 7 -2 5 4 -2 -2 -1 -1 1 3 -3 -2 -1 -9 // K 0 4 1 1 -5 1 1 -1 1 -2 -2 4 0 -5 0 0 0 -3 -5 -2 1 1 0 -9 // M -1 0 -1 -2 -5 -1 -2 -2 -1 3 5 0 4 1 -1 -1 0 -4 -1 2 -2 -1 0 -9 // F -3 -5 -4 -5 -4 -4 -5 -5 -2 2 4 -5 1 14 -5 -4 -3 3 13 0 -5 -5 -2 -9 // P 1 0 0 0 -3 1 0 1 0 -1 -2 0 -1 -5 4 1 1 -6 -5 -1 0 1 0 -9 // S 1 0 1 1 0 0 1 1 0 -1 -2 0 -1 -4 1 1 1 -3 -3 -1 1 0 0 -9 // T 1 0 0 0 -2 0 0 1 0 0 -1 0 0 -3 1 1 1 -6 -3 0 0 0 0 -9 // W -6 4 -5 -7 -9 -5 -7 -8 -3 -5 -1 -3 -4 3 -6 -3 -6 34 2 -6 -6 -6 -4 -9 // Y -4 -4 -3 -5 2 -4 -5 -5 0 0 1 -5 -1 13 -5 -3 -3 2 15 -2 -4 -4 -2 -9 // V 0 -2 -1 -1 -2 -1 -1 -1 -2 3 3 -2 2 0 -1 -1 0 -6 -2 3 -1 -1 0 -9 // B 1 0 1 2 -4 2 2 1 1 -2 -3 1 -2 -5 0 1 0 -6 -4 -1 2 2 0 -9 // Z 0 1 1 2 -5 2 2 1 2 -2 -2 1 -1 -5 1 0 0 -6 -4 -1 2 2 0 -9 // X 0 0 0 0 -2 0 0 0 0 0 -1 0 0 -2 0 0 0 -4 -2 0 0 0 0 -9 // * -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 1 // PAM490 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 1, 1, -2, 1, 1, -3, 2, 0, 0, 0, 0, -1, -1, 0, 1, 0, -1, 1, 1, 0, -6, 0, -4, 0, -9}, {0, 1, 2, -4, 2, 2, -5, 1, 1, -2, 0, 1, -3, -2, 1, 0, 2, 0, 1, 0, -1, -6, 0, -4, 2, -9}, {0, -2, -4, 22, -5, -5, -4, -3, -4, -2, 0, -5, -6, -5, -4, -3, -5, -4, 0, -2, -2, -9, -2, 2, -5, -9}, {0, 1, 2, -5, 3, 3, -5, 1, 1, -2, 0, 1, -3, -2, 2, 0, 2, 0, 1, 0, -1, -7, 0, -5, 2, -9}, {0, 1, 2, -5, 3, 3, -5, 1, 1, -2, 0, 1, -3, -2, 2, 0, 2, 0, 1, 0, -1, -7, 0, -5, 2, -9}, {0, -3, -5, -4, -5, -5, 14, -5, -2, 2, 0, -5, 4, 1, -4, -5, -4, -5, -4, -3, 0, 3, -2, 13, -5, -9}, {0, 2, 1, -3, 1, 1, -5, 4, -1, -2, 0, -1, -3, -2, 1, 1, 0, -1, 1, 1, -1, -8, 0, -5, 1, -9}, {0, 0, 1, -4, 1, 1, -2, -1, 5, -2, 0, 1, -2, -1, 1, 0, 2, 2, 0, 0, -2, -3, 0, 0, 2, -9}, {0, 0, -2, -2, -2, -2, 2, -2, -2, 3, 0, -2, 4, 3, -1, -1, -1, -2, -1, 0, 3, -5, 0, 0, -2, -9}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 0, 1, -5, 1, 1, -5, -1, 1, -2, 0, 4, -2, 0, 1, 0, 1, 4, 0, 0, -2, -3, 0, -5, 1, -9}, {0, -1, -3, -6, -3, -3, 4, -3, -2, 4, 0, -2, 7, 5, -2, -2, -2, -3, -2, -1, 3, -1, -1, 1, -2, -9}, {0, -1, -2, -5, -2, -2, 1, -2, -1, 3, 0, 0, 5, 4, -1, -1, -1, 0, -1, 0, 2, -4, 0, -1, -1, -9}, {0, 0, 1, -4, 2, 2, -4, 1, 1, -1, 0, 1, -2, -1, 1, 0, 1, 1, 1, 0, -1, -5, 0, -3, 1, -9}, {0, 1, 0, -3, 0, 0, -5, 1, 0, -1, 0, 0, -2, -1, 0, 4, 1, 0, 1, 1, -1, -6, 0, -5, 1, -9}, {0, 0, 2, -5, 2, 2, -4, 0, 2, -1, 0, 1, -2, -1, 1, 1, 2, 2, 0, 0, -1, -5, 0, -4, 2, -9}, {0, -1, 0, -4, 0, 0, -5, -1, 2, -2, 0, 4, -3, 0, 1, 0, 2, 5, 0, 0, -2, 4, 0, -4, 1, -9}, {0, 1, 1, 0, 1, 1, -4, 1, 0, -1, 0, 0, -2, -1, 1, 1, 0, 0, 1, 1, -1, -3, 0, -3, 0, -9}, {0, 1, 0, -2, 0, 0, -3, 1, 0, 0, 0, 0, -1, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 1, 0, -6, 0, -3, 0, -9}, {0, 0, -1, -2, -1, -1, 0, -1, -2, 3, 0, -2, 3, 2, -1, -1, -1, -2, -1, 0, 3, -6, 0, -2, -1, -9}, {0, -6, -6, -9, -7, -7, 3, -8, -3, -5, 0, -3, -1, -4, -5, -6, -5, 4, -3, -6, -6, 34, -4, 2, -6, -9}, {0, 0, 0, -2, 0, 0, -2, 0, 0, 0, 0, 0, -1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, -4, 0, -2, 0, -9}, {0, -4, -4, 2, -5, -5, 13, -5, 0, 0, 0, -5, 1, -1, -3, -5, -4, -4, -3, -3, -2, 2, -2, 15, -4, -9}, {0, 0, 2, -5, 2, 2, -5, 1, 2, -2, 0, 1, -2, -1, 1, 1, 2, 1, 0, 0, -1, -6, 0, -4, 2, -9}, {0, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, 0, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, 1}, } // # // # This matrix was produced by "pam" Version 1.0.6 [28-Jul-93] // # // # PAM 50 substitution matrix, scale = ln(2)/2 = 0.346574 // # // # Expected score = -3.70, Entropy = 2.00 bits // # // # Lowest score = -13, Highest score = 13 // # // A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * // A 5 -5 -2 -2 -5 -3 -1 -1 -5 -3 -5 -5 -4 -7 0 0 0 -11 -6 -1 -2 -2 -2 -13 // R -5 8 -4 -7 -6 0 -7 -7 0 -4 -7 1 -3 -8 -3 -2 -5 -1 -8 -6 -5 -2 -4 -13 // N -2 -4 7 2 -8 -2 -1 -2 1 -4 -6 0 -6 -7 -4 1 -1 -7 -3 -6 5 -1 -2 -13 // D -2 -7 2 7 -11 -1 3 -2 -2 -6 -10 -3 -8 -12 -6 -2 -3 -12 -9 -6 6 2 -4 -13 // C -5 -6 -8 -11 9 -11 -11 -7 -6 -5 -12 -11 -11 -10 -6 -2 -6 -13 -3 -5 -9 -11 -7 -13 // Q -3 0 -2 -1 -11 8 2 -5 2 -6 -4 -2 -3 -10 -2 -4 -4 -10 -9 -5 -2 6 -3 -13 // E -1 -7 -1 3 -11 2 7 -3 -3 -4 -7 -3 -5 -11 -4 -3 -4 -13 -7 -5 2 6 -3 -13 // G -1 -7 -2 -2 -7 -5 -3 6 -7 -8 -9 -6 -7 -8 -4 -1 -4 -12 -11 -4 -2 -4 -4 -13 // H -5 0 1 -2 -6 2 -3 -7 9 -7 -5 -4 -8 -5 -3 -4 -5 -6 -2 -5 0 0 -4 -13 // I -3 -4 -4 -6 -5 -6 -4 -8 -7 8 0 -5 0 -1 -7 -5 -1 -11 -5 3 -5 -5 -3 -13 // L -5 -7 -6 -10 -12 -4 -7 -9 -5 0 6 -6 2 -1 -6 -7 -5 -5 -5 -1 -7 -5 -5 -13 // K -5 1 0 -3 -11 -2 -3 -6 -4 -5 -6 6 -1 -11 -5 -3 -2 -9 -8 -7 -1 -2 -4 -13 // M -4 -3 -6 -8 -11 -3 -5 -7 -8 0 2 -1 10 -3 -6 -4 -3 -10 -8 0 -7 -4 -4 -13 // F -7 -8 -7 -12 -10 -10 -11 -8 -5 -1 -1 -11 -3 9 -8 -5 -7 -3 3 -6 -9 -11 -6 -13 // P 0 -3 -4 -6 -6 -2 -4 -4 -3 -7 -6 -5 -6 -8 8 -1 -3 -11 -11 -4 -5 -3 -4 -13 // S 0 -2 1 -2 -2 -4 -3 -1 -4 -5 -7 -3 -4 -5 -1 6 1 -4 -5 -4 -1 -3 -2 -13 // T 0 -5 -1 -3 -6 -4 -4 -4 -5 -1 -5 -2 -3 -7 -3 1 6 -10 -5 -2 -2 -4 -2 -13 // W -11 -1 -7 -12 -13 -10 -13 -12 -6 -11 -5 -9 -10 -3 -11 -4 -10 13 -4 -12 -8 -11 -9 -13 // Y -6 -8 -3 -9 -3 -9 -7 -11 -2 -5 -5 -8 -8 3 -11 -5 -5 -4 9 -6 -5 -8 -6 -13 // V -1 -6 -6 -6 -5 -5 -5 -4 -5 3 -1 -7 0 -6 -4 -4 -2 -12 -6 7 -6 -5 -3 -13 // B -2 -5 5 6 -9 -2 2 -2 0 -5 -7 -1 -7 -9 -5 -1 -2 -8 -5 -6 5 1 -3 -13 // Z -2 -2 -1 2 -11 6 6 -4 0 -5 -5 -2 -4 -11 -3 -3 -4 -11 -8 -5 1 6 -3 -13 // X -2 -4 -2 -4 -7 -3 -3 -4 -4 -3 -5 -4 -4 -6 -4 -2 -2 -9 -6 -3 -3 -3 -4 -13 // * -13 -13 -13 -13 -13 -13 -13 -13 -13 -13 -13 -13 -13 -13 -13 -13 -13 -13 -13 -13 -13 -13 -13 1 // PAM50 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 5, -2, -5, -2, -1, -7, -1, -5, -3, 0, -5, -5, -4, -2, 0, -3, -5, 0, 0, -1, -11, -2, -6, -2, -13}, {0, -2, 5, -9, 6, 2, -9, -2, 0, -5, 0, -1, -7, -7, 5, -5, -2, -5, -1, -2, -6, -8, -3, -5, 1, -13}, {0, -5, -9, 9, -11, -11, -10, -7, -6, -5, 0, -11, -12, -11, -8, -6, -11, -6, -2, -6, -5, -13, -7, -3, -11, -13}, {0, -2, 6, -11, 7, 3, -12, -2, -2, -6, 0, -3, -10, -8, 2, -6, -1, -7, -2, -3, -6, -12, -4, -9, 2, -13}, {0, -1, 2, -11, 3, 7, -11, -3, -3, -4, 0, -3, -7, -5, -1, -4, 2, -7, -3, -4, -5, -13, -3, -7, 6, -13}, {0, -7, -9, -10, -12, -11, 9, -8, -5, -1, 0, -11, -1, -3, -7, -8, -10, -8, -5, -7, -6, -3, -6, 3, -11, -13}, {0, -1, -2, -7, -2, -3, -8, 6, -7, -8, 0, -6, -9, -7, -2, -4, -5, -7, -1, -4, -4, -12, -4, -11, -4, -13}, {0, -5, 0, -6, -2, -3, -5, -7, 9, -7, 0, -4, -5, -8, 1, -3, 2, 0, -4, -5, -5, -6, -4, -2, 0, -13}, {0, -3, -5, -5, -6, -4, -1, -8, -7, 8, 0, -5, 0, 0, -4, -7, -6, -4, -5, -1, 3, -11, -3, -5, -5, -13}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, -5, -1, -11, -3, -3, -11, -6, -4, -5, 0, 6, -6, -1, 0, -5, -2, 1, -3, -2, -7, -9, -4, -8, -2, -13}, {0, -5, -7, -12, -10, -7, -1, -9, -5, 0, 0, -6, 6, 2, -6, -6, -4, -7, -7, -5, -1, -5, -5, -5, -5, -13}, {0, -4, -7, -11, -8, -5, -3, -7, -8, 0, 0, -1, 2, 10, -6, -6, -3, -3, -4, -3, 0, -10, -4, -8, -4, -13}, {0, -2, 5, -8, 2, -1, -7, -2, 1, -4, 0, 0, -6, -6, 7, -4, -2, -4, 1, -1, -6, -7, -2, -3, -1, -13}, {0, 0, -5, -6, -6, -4, -8, -4, -3, -7, 0, -5, -6, -6, -4, 8, -2, -3, -1, -3, -4, -11, -4, -11, -3, -13}, {0, -3, -2, -11, -1, 2, -10, -5, 2, -6, 0, -2, -4, -3, -2, -2, 8, 0, -4, -4, -5, -10, -3, -9, 6, -13}, {0, -5, -5, -6, -7, -7, -8, -7, 0, -4, 0, 1, -7, -3, -4, -3, 0, 8, -2, -5, -6, -1, -4, -8, -2, -13}, {0, 0, -1, -2, -2, -3, -5, -1, -4, -5, 0, -3, -7, -4, 1, -1, -4, -2, 6, 1, -4, -4, -2, -5, -3, -13}, {0, 0, -2, -6, -3, -4, -7, -4, -5, -1, 0, -2, -5, -3, -1, -3, -4, -5, 1, 6, -2, -10, -2, -5, -4, -13}, {0, -1, -6, -5, -6, -5, -6, -4, -5, 3, 0, -7, -1, 0, -6, -4, -5, -6, -4, -2, 7, -12, -3, -6, -5, -13}, {0, -11, -8, -13, -12, -13, -3, -12, -6, -11, 0, -9, -5, -10, -7, -11, -10, -1, -4, -10, -12, 13, -9, -4, -11, -13}, {0, -2, -3, -7, -4, -3, -6, -4, -4, -3, 0, -4, -5, -4, -2, -4, -3, -4, -2, -2, -3, -9, -4, -6, -3, -13}, {0, -6, -5, -3, -9, -7, 3, -11, -2, -5, 0, -8, -5, -8, -3, -11, -9, -8, -5, -5, -6, -4, -6, 9, -8, -13}, {0, -2, 1, -11, 2, 6, -11, -4, 0, -5, 0, -2, -5, -4, -1, -3, 6, -2, -3, -4, -5, -11, -3, -8, 6, -13}, {0, -13, -13, -13, -13, -13, -13, -13, -13, -13, 0, -13, -13, -13, -13, -13, -13, -13, -13, -13, -13, -13, -13, -13, -13, 1}, } // # // # This matrix was produced by "pam" Version 1.0.6 [28-Jul-93] // # // # PAM 500 substitution matrix, scale = ln(2)/7 = 0.0990210 // # // # Expected score = -0.401, Entropy = 0.0803 bits // # // # Lowest score = -9, Highest score = 34 // # // A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * // A 1 -1 0 1 -2 0 1 1 0 0 -1 0 -1 -3 1 1 1 -6 -3 0 1 0 0 -9 // R -1 5 1 0 -4 2 0 -1 2 -2 -2 4 0 -4 0 0 0 4 -4 -2 0 1 0 -9 // N 0 1 1 2 -3 1 1 1 1 -1 -2 1 -1 -4 0 1 0 -5 -3 -1 1 1 0 -9 // D 1 0 2 3 -5 2 3 1 1 -2 -3 1 -2 -5 0 1 0 -7 -5 -1 2 2 0 -9 // C -2 -4 -3 -5 22 -5 -5 -3 -4 -2 -6 -5 -5 -3 -2 0 -2 -9 2 -2 -4 -5 -2 -9 // Q 0 2 1 2 -5 2 2 0 2 -1 -2 1 -1 -4 1 0 0 -5 -4 -1 2 2 0 -9 // E 1 0 1 3 -5 2 3 1 1 -2 -3 1 -1 -5 0 1 0 -7 -5 -1 2 2 0 -9 // G 1 -1 1 1 -3 0 1 4 -1 -2 -3 0 -2 -5 1 1 1 -8 -5 -1 1 1 0 -9 // H 0 2 1 1 -4 2 1 -1 4 -2 -2 1 -1 -2 0 0 0 -2 0 -2 1 2 0 -9 // I 0 -2 -1 -2 -2 -1 -2 -2 -2 3 4 -2 3 2 -1 -1 0 -5 0 3 -2 -2 0 -9 // L -1 -2 -2 -3 -6 -2 -3 -3 -2 4 7 -2 4 4 -2 -2 -1 -1 1 3 -3 -2 -1 -9 // K 0 4 1 1 -5 1 1 0 1 -2 -2 4 0 -5 0 0 0 -3 -5 -2 1 1 0 -9 // M -1 0 -1 -2 -5 -1 -1 -2 -1 3 4 0 4 1 -1 -1 0 -4 -1 2 -1 -1 0 -9 // F -3 -4 -4 -5 -3 -4 -5 -5 -2 2 4 -5 1 13 -4 -3 -3 3 13 0 -4 -5 -2 -9 // P 1 0 0 0 -2 1 0 1 0 -1 -2 0 -1 -4 4 1 1 -6 -5 -1 0 1 0 -9 // S 1 0 1 1 0 0 1 1 0 -1 -2 0 -1 -3 1 1 1 -3 -3 -1 1 0 0 -9 // T 1 0 0 0 -2 0 0 1 0 0 -1 0 0 -3 1 1 1 -6 -3 0 0 0 0 -9 // W -6 4 -5 -7 -9 -5 -7 -8 -2 -5 -1 -3 -4 3 -6 -3 -6 34 2 -6 -6 -6 -4 -9 // Y -3 -4 -3 -5 2 -4 -5 -5 0 0 1 -5 -1 13 -5 -3 -3 2 15 -1 -4 -4 -2 -9 // V 0 -2 -1 -1 -2 -1 -1 -1 -2 3 3 -2 2 0 -1 -1 0 -6 -1 3 -1 -1 0 -9 // B 1 0 1 2 -4 2 2 1 1 -2 -3 1 -1 -4 0 1 0 -6 -4 -1 2 2 0 -9 // Z 0 1 1 2 -5 2 2 1 2 -2 -2 1 -1 -5 1 0 0 -6 -4 -1 2 2 0 -9 // X 0 0 0 0 -2 0 0 0 0 0 -1 0 0 -2 0 0 0 -4 -2 0 0 0 0 -9 // * -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 1 // PAM500 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 1, 1, -2, 1, 1, -3, 1, 0, 0, 0, 0, -1, -1, 0, 1, 0, -1, 1, 1, 0, -6, 0, -3, 0, -9}, {0, 1, 2, -4, 2, 2, -4, 1, 1, -2, 0, 1, -3, -1, 1, 0, 2, 0, 1, 0, -1, -6, 0, -4, 2, -9}, {0, -2, -4, 22, -5, -5, -3, -3, -4, -2, 0, -5, -6, -5, -3, -2, -5, -4, 0, -2, -2, -9, -2, 2, -5, -9}, {0, 1, 2, -5, 3, 3, -5, 1, 1, -2, 0, 1, -3, -2, 2, 0, 2, 0, 1, 0, -1, -7, 0, -5, 2, -9}, {0, 1, 2, -5, 3, 3, -5, 1, 1, -2, 0, 1, -3, -1, 1, 0, 2, 0, 1, 0, -1, -7, 0, -5, 2, -9}, {0, -3, -4, -3, -5, -5, 13, -5, -2, 2, 0, -5, 4, 1, -4, -4, -4, -4, -3, -3, 0, 3, -2, 13, -5, -9}, {0, 1, 1, -3, 1, 1, -5, 4, -1, -2, 0, 0, -3, -2, 1, 1, 0, -1, 1, 1, -1, -8, 0, -5, 1, -9}, {0, 0, 1, -4, 1, 1, -2, -1, 4, -2, 0, 1, -2, -1, 1, 0, 2, 2, 0, 0, -2, -2, 0, 0, 2, -9}, {0, 0, -2, -2, -2, -2, 2, -2, -2, 3, 0, -2, 4, 3, -1, -1, -1, -2, -1, 0, 3, -5, 0, 0, -2, -9}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 0, 1, -5, 1, 1, -5, 0, 1, -2, 0, 4, -2, 0, 1, 0, 1, 4, 0, 0, -2, -3, 0, -5, 1, -9}, {0, -1, -3, -6, -3, -3, 4, -3, -2, 4, 0, -2, 7, 4, -2, -2, -2, -2, -2, -1, 3, -1, -1, 1, -2, -9}, {0, -1, -1, -5, -2, -1, 1, -2, -1, 3, 0, 0, 4, 4, -1, -1, -1, 0, -1, 0, 2, -4, 0, -1, -1, -9}, {0, 0, 1, -3, 2, 1, -4, 1, 1, -1, 0, 1, -2, -1, 1, 0, 1, 1, 1, 0, -1, -5, 0, -3, 1, -9}, {0, 1, 0, -2, 0, 0, -4, 1, 0, -1, 0, 0, -2, -1, 0, 4, 1, 0, 1, 1, -1, -6, 0, -5, 1, -9}, {0, 0, 2, -5, 2, 2, -4, 0, 2, -1, 0, 1, -2, -1, 1, 1, 2, 2, 0, 0, -1, -5, 0, -4, 2, -9}, {0, -1, 0, -4, 0, 0, -4, -1, 2, -2, 0, 4, -2, 0, 1, 0, 2, 5, 0, 0, -2, 4, 0, -4, 1, -9}, {0, 1, 1, 0, 1, 1, -3, 1, 0, -1, 0, 0, -2, -1, 1, 1, 0, 0, 1, 1, -1, -3, 0, -3, 0, -9}, {0, 1, 0, -2, 0, 0, -3, 1, 0, 0, 0, 0, -1, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 1, 0, -6, 0, -3, 0, -9}, {0, 0, -1, -2, -1, -1, 0, -1, -2, 3, 0, -2, 3, 2, -1, -1, -1, -2, -1, 0, 3, -6, 0, -1, -1, -9}, {0, -6, -6, -9, -7, -7, 3, -8, -2, -5, 0, -3, -1, -4, -5, -6, -5, 4, -3, -6, -6, 34, -4, 2, -6, -9}, {0, 0, 0, -2, 0, 0, -2, 0, 0, 0, 0, 0, -1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, -4, 0, -2, 0, -9}, {0, -3, -4, 2, -5, -5, 13, -5, 0, 0, 0, -5, 1, -1, -3, -5, -4, -4, -3, -3, -1, 2, -2, 15, -4, -9}, {0, 0, 2, -5, 2, 2, -5, 1, 2, -2, 0, 1, -2, -1, 1, 1, 2, 1, 0, 0, -1, -6, 0, -4, 2, -9}, {0, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, 0, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, -9, 1}, } // # // # This matrix was produced by "pam" Version 1.0.6 [28-Jul-93] // # // # PAM 60 substitution matrix, scale = ln(2)/2 = 0.346574 // # // # Expected score = -3.21, Entropy = 1.79 bits // # // # Lowest score = -12, Highest score = 13 // # // A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * // A 5 -5 -2 -2 -5 -3 -1 0 -5 -3 -4 -5 -3 -6 0 1 1 -10 -6 -1 -2 -2 -2 -12 // R -5 8 -3 -6 -6 0 -6 -7 0 -4 -6 2 -2 -7 -2 -2 -4 0 -8 -5 -5 -2 -4 -12 // N -2 -3 6 2 -7 -2 0 -1 1 -4 -5 0 -6 -6 -4 1 -1 -6 -3 -5 5 -1 -2 -12 // D -2 -6 2 7 -10 -1 3 -2 -2 -5 -9 -2 -7 -11 -5 -2 -3 -11 -8 -6 5 2 -3 -12 // C -5 -6 -7 -10 9 -10 -10 -7 -6 -4 -11 -10 -10 -9 -6 -1 -5 -12 -2 -4 -9 -10 -6 -12 // Q -3 0 -2 -1 -10 7 2 -5 2 -5 -3 -1 -2 -9 -1 -3 -4 -9 -8 -5 -1 6 -3 -12 // E -1 -6 0 3 -10 2 7 -2 -3 -4 -7 -3 -5 -10 -3 -2 -4 -12 -7 -4 2 5 -3 -12 // G 0 -7 -1 -2 -7 -5 -2 6 -6 -7 -8 -5 -6 -7 -4 0 -3 -11 -10 -4 -2 -3 -3 -12 // H -5 0 1 -2 -6 2 -3 -6 8 -6 -4 -4 -7 -4 -2 -4 -5 -5 -2 -5 0 0 -3 -12 // I -3 -4 -4 -5 -4 -5 -4 -7 -6 7 0 -4 1 -1 -6 -4 -1 -10 -4 3 -4 -4 -3 -12 // L -4 -6 -5 -9 -11 -3 -7 -8 -4 0 6 -6 2 -1 -5 -6 -5 -4 -5 -1 -7 -5 -4 -12 // K -5 2 0 -2 -10 -1 -3 -5 -4 -4 -6 6 0 -10 -4 -2 -2 -8 -7 -6 -1 -2 -3 -12 // M -3 -2 -6 -7 -10 -2 -5 -6 -7 1 2 0 10 -2 -6 -4 -2 -9 -7 0 -6 -4 -3 -12 // F -6 -7 -6 -11 -9 -9 -10 -7 -4 -1 -1 -10 -2 8 -7 -5 -6 -3 3 -5 -8 -10 -5 -12 // P 0 -2 -4 -5 -6 -1 -3 -4 -2 -6 -5 -4 -6 -7 7 0 -2 -10 -10 -4 -4 -2 -3 -12 // S 1 -2 1 -2 -1 -3 -2 0 -4 -4 -6 -2 -4 -5 0 5 1 -4 -5 -4 0 -3 -2 -12 // T 1 -4 -1 -3 -5 -4 -4 -3 -5 -1 -5 -2 -2 -6 -2 1 6 -9 -5 -1 -2 -4 -2 -12 // W -10 0 -6 -11 -12 -9 -12 -11 -5 -10 -4 -8 -9 -3 -10 -4 -9 13 -3 -11 -8 -11 -8 -12 // Y -6 -8 -3 -8 -2 -8 -7 -10 -2 -4 -5 -7 -7 3 -10 -5 -5 -3 9 -5 -5 -7 -5 -12 // V -1 -5 -5 -6 -4 -5 -4 -4 -5 3 -1 -6 0 -5 -4 -4 -1 -11 -5 6 -5 -5 -3 -12 // B -2 -5 5 5 -9 -1 2 -2 0 -4 -7 -1 -6 -8 -4 0 -2 -8 -5 -5 5 1 -3 -12 // Z -2 -2 -1 2 -10 6 5 -3 0 -4 -5 -2 -4 -10 -2 -3 -4 -11 -7 -5 1 5 -3 -12 // X -2 -4 -2 -3 -6 -3 -3 -3 -3 -3 -4 -3 -3 -5 -3 -2 -2 -8 -5 -3 -3 -3 -3 -12 // * -12 -12 -12 -12 -12 -12 -12 -12 -12 -12 -12 -12 -12 -12 -12 -12 -12 -12 -12 -12 -12 -12 -12 1 // PAM60 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 5, -2, -5, -2, -1, -6, 0, -5, -3, 0, -5, -4, -3, -2, 0, -3, -5, 1, 1, -1, -10, -2, -6, -2, -12}, {0, -2, 5, -9, 5, 2, -8, -2, 0, -4, 0, -1, -7, -6, 5, -4, -1, -5, 0, -2, -5, -8, -3, -5, 1, -12}, {0, -5, -9, 9, -10, -10, -9, -7, -6, -4, 0, -10, -11, -10, -7, -6, -10, -6, -1, -5, -4, -12, -6, -2, -10, -12}, {0, -2, 5, -10, 7, 3, -11, -2, -2, -5, 0, -2, -9, -7, 2, -5, -1, -6, -2, -3, -6, -11, -3, -8, 2, -12}, {0, -1, 2, -10, 3, 7, -10, -2, -3, -4, 0, -3, -7, -5, 0, -3, 2, -6, -2, -4, -4, -12, -3, -7, 5, -12}, {0, -6, -8, -9, -11, -10, 8, -7, -4, -1, 0, -10, -1, -2, -6, -7, -9, -7, -5, -6, -5, -3, -5, 3, -10, -12}, {0, 0, -2, -7, -2, -2, -7, 6, -6, -7, 0, -5, -8, -6, -1, -4, -5, -7, 0, -3, -4, -11, -3, -10, -3, -12}, {0, -5, 0, -6, -2, -3, -4, -6, 8, -6, 0, -4, -4, -7, 1, -2, 2, 0, -4, -5, -5, -5, -3, -2, 0, -12}, {0, -3, -4, -4, -5, -4, -1, -7, -6, 7, 0, -4, 0, 1, -4, -6, -5, -4, -4, -1, 3, -10, -3, -4, -4, -12}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, -5, -1, -10, -2, -3, -10, -5, -4, -4, 0, 6, -6, 0, 0, -4, -1, 2, -2, -2, -6, -8, -3, -7, -2, -12}, {0, -4, -7, -11, -9, -7, -1, -8, -4, 0, 0, -6, 6, 2, -5, -5, -3, -6, -6, -5, -1, -4, -4, -5, -5, -12}, {0, -3, -6, -10, -7, -5, -2, -6, -7, 1, 0, 0, 2, 10, -6, -6, -2, -2, -4, -2, 0, -9, -3, -7, -4, -12}, {0, -2, 5, -7, 2, 0, -6, -1, 1, -4, 0, 0, -5, -6, 6, -4, -2, -3, 1, -1, -5, -6, -2, -3, -1, -12}, {0, 0, -4, -6, -5, -3, -7, -4, -2, -6, 0, -4, -5, -6, -4, 7, -1, -2, 0, -2, -4, -10, -3, -10, -2, -12}, {0, -3, -1, -10, -1, 2, -9, -5, 2, -5, 0, -1, -3, -2, -2, -1, 7, 0, -3, -4, -5, -9, -3, -8, 6, -12}, {0, -5, -5, -6, -6, -6, -7, -7, 0, -4, 0, 2, -6, -2, -3, -2, 0, 8, -2, -4, -5, 0, -4, -8, -2, -12}, {0, 1, 0, -1, -2, -2, -5, 0, -4, -4, 0, -2, -6, -4, 1, 0, -3, -2, 5, 1, -4, -4, -2, -5, -3, -12}, {0, 1, -2, -5, -3, -4, -6, -3, -5, -1, 0, -2, -5, -2, -1, -2, -4, -4, 1, 6, -1, -9, -2, -5, -4, -12}, {0, -1, -5, -4, -6, -4, -5, -4, -5, 3, 0, -6, -1, 0, -5, -4, -5, -5, -4, -1, 6, -11, -3, -5, -5, -12}, {0, -10, -8, -12, -11, -12, -3, -11, -5, -10, 0, -8, -4, -9, -6, -10, -9, 0, -4, -9, -11, 13, -8, -3, -11, -12}, {0, -2, -3, -6, -3, -3, -5, -3, -3, -3, 0, -3, -4, -3, -2, -3, -3, -4, -2, -2, -3, -8, -3, -5, -3, -12}, {0, -6, -5, -2, -8, -7, 3, -10, -2, -4, 0, -7, -5, -7, -3, -10, -8, -8, -5, -5, -5, -3, -5, 9, -7, -12}, {0, -2, 1, -10, 2, 5, -10, -3, 0, -4, 0, -2, -5, -4, -1, -2, 6, -2, -3, -4, -5, -11, -3, -7, 5, -12}, {0, -12, -12, -12, -12, -12, -12, -12, -12, -12, 0, -12, -12, -12, -12, -12, -12, -12, -12, -12, -12, -12, -12, -12, -12, 1}, } // # // # This matrix was produced by "pam" Version 1.0.6 [28-Jul-93] // # // # PAM 70 substitution matrix, scale = ln(2)/2 = 0.346574 // # // # Expected score = -2.77, Entropy = 1.60 bits // # // # Lowest score = -11, Highest score = 13 // # // A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * // A 5 -4 -2 -1 -4 -2 -1 0 -4 -2 -4 -4 -3 -6 0 1 1 -9 -5 -1 -1 -1 -2 -11 // R -4 8 -3 -6 -5 0 -5 -6 0 -3 -6 2 -2 -7 -2 -1 -4 0 -7 -5 -4 -2 -3 -11 // N -2 -3 6 3 -7 -1 0 -1 1 -3 -5 0 -5 -6 -3 1 0 -6 -3 -5 5 -1 -2 -11 // D -1 -6 3 6 -9 0 3 -1 -1 -5 -8 -2 -7 -10 -4 -1 -2 -10 -7 -5 5 2 -3 -11 // C -4 -5 -7 -9 9 -9 -9 -6 -5 -4 -10 -9 -9 -8 -5 -1 -5 -11 -2 -4 -8 -9 -6 -11 // Q -2 0 -1 0 -9 7 2 -4 2 -5 -3 -1 -2 -9 -1 -3 -3 -8 -8 -4 -1 5 -2 -11 // E -1 -5 0 3 -9 2 6 -2 -2 -4 -6 -2 -4 -9 -3 -2 -3 -11 -6 -4 2 5 -3 -11 // G 0 -6 -1 -1 -6 -4 -2 6 -6 -6 -7 -5 -6 -7 -3 0 -3 -10 -9 -3 -1 -3 -3 -11 // H -4 0 1 -1 -5 2 -2 -6 8 -6 -4 -3 -6 -4 -2 -3 -4 -5 -1 -4 0 1 -3 -11 // I -2 -3 -3 -5 -4 -5 -4 -6 -6 7 1 -4 1 0 -5 -4 -1 -9 -4 3 -4 -4 -3 -11 // L -4 -6 -5 -8 -10 -3 -6 -7 -4 1 6 -5 2 -1 -5 -6 -4 -4 -4 0 -6 -4 -4 -11 // K -4 2 0 -2 -9 -1 -2 -5 -3 -4 -5 6 0 -9 -4 -2 -1 -7 -7 -6 -1 -2 -3 -11 // M -3 -2 -5 -7 -9 -2 -4 -6 -6 1 2 0 10 -2 -5 -3 -2 -8 -7 0 -6 -3 -3 -11 // F -6 -7 -6 -10 -8 -9 -9 -7 -4 0 -1 -9 -2 8 -7 -4 -6 -2 4 -5 -7 -9 -5 -11 // P 0 -2 -3 -4 -5 -1 -3 -3 -2 -5 -5 -4 -5 -7 7 0 -2 -9 -9 -3 -4 -2 -3 -11 // S 1 -1 1 -1 -1 -3 -2 0 -3 -4 -6 -2 -3 -4 0 5 2 -3 -5 -3 0 -2 -1 -11 // T 1 -4 0 -2 -5 -3 -3 -3 -4 -1 -4 -1 -2 -6 -2 2 6 -8 -4 -1 -1 -3 -2 -11 // W -9 0 -6 -10 -11 -8 -11 -10 -5 -9 -4 -7 -8 -2 -9 -3 -8 13 -3 -10 -7 -10 -7 -11 // Y -5 -7 -3 -7 -2 -8 -6 -9 -1 -4 -4 -7 -7 4 -9 -5 -4 -3 9 -5 -4 -7 -5 -11 // V -1 -5 -5 -5 -4 -4 -4 -3 -4 3 0 -6 0 -5 -3 -3 -1 -10 -5 6 -5 -4 -2 -11 // B -1 -4 5 5 -8 -1 2 -1 0 -4 -6 -1 -6 -7 -4 0 -1 -7 -4 -5 5 1 -2 -11 // Z -1 -2 -1 2 -9 5 5 -3 1 -4 -4 -2 -3 -9 -2 -2 -3 -10 -7 -4 1 5 -3 -11 // X -2 -3 -2 -3 -6 -2 -3 -3 -3 -3 -4 -3 -3 -5 -3 -1 -2 -7 -5 -2 -2 -3 -3 -11 // * -11 -11 -11 -11 -11 -11 -11 -11 -11 -11 -11 -11 -11 -11 -11 -11 -11 -11 -11 -11 -11 -11 -11 1 // PAM70 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 5, -1, -4, -1, -1, -6, 0, -4, -2, 0, -4, -4, -3, -2, 0, -2, -4, 1, 1, -1, -9, -2, -5, -1, -11}, {0, -1, 5, -8, 5, 2, -7, -1, 0, -4, 0, -1, -6, -6, 5, -4, -1, -4, 0, -1, -5, -7, -2, -4, 1, -11}, {0, -4, -8, 9, -9, -9, -8, -6, -5, -4, 0, -9, -10, -9, -7, -5, -9, -5, -1, -5, -4, -11, -6, -2, -9, -11}, {0, -1, 5, -9, 6, 3, -10, -1, -1, -5, 0, -2, -8, -7, 3, -4, 0, -6, -1, -2, -5, -10, -3, -7, 2, -11}, {0, -1, 2, -9, 3, 6, -9, -2, -2, -4, 0, -2, -6, -4, 0, -3, 2, -5, -2, -3, -4, -11, -3, -6, 5, -11}, {0, -6, -7, -8, -10, -9, 8, -7, -4, 0, 0, -9, -1, -2, -6, -7, -9, -7, -4, -6, -5, -2, -5, 4, -9, -11}, {0, 0, -1, -6, -1, -2, -7, 6, -6, -6, 0, -5, -7, -6, -1, -3, -4, -6, 0, -3, -3, -10, -3, -9, -3, -11}, {0, -4, 0, -5, -1, -2, -4, -6, 8, -6, 0, -3, -4, -6, 1, -2, 2, 0, -3, -4, -4, -5, -3, -1, 1, -11}, {0, -2, -4, -4, -5, -4, 0, -6, -6, 7, 0, -4, 1, 1, -3, -5, -5, -3, -4, -1, 3, -9, -3, -4, -4, -11}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, -4, -1, -9, -2, -2, -9, -5, -3, -4, 0, 6, -5, 0, 0, -4, -1, 2, -2, -1, -6, -7, -3, -7, -2, -11}, {0, -4, -6, -10, -8, -6, -1, -7, -4, 1, 0, -5, 6, 2, -5, -5, -3, -6, -6, -4, 0, -4, -4, -4, -4, -11}, {0, -3, -6, -9, -7, -4, -2, -6, -6, 1, 0, 0, 2, 10, -5, -5, -2, -2, -3, -2, 0, -8, -3, -7, -3, -11}, {0, -2, 5, -7, 3, 0, -6, -1, 1, -3, 0, 0, -5, -5, 6, -3, -1, -3, 1, 0, -5, -6, -2, -3, -1, -11}, {0, 0, -4, -5, -4, -3, -7, -3, -2, -5, 0, -4, -5, -5, -3, 7, -1, -2, 0, -2, -3, -9, -3, -9, -2, -11}, {0, -2, -1, -9, 0, 2, -9, -4, 2, -5, 0, -1, -3, -2, -1, -1, 7, 0, -3, -3, -4, -8, -2, -8, 5, -11}, {0, -4, -4, -5, -6, -5, -7, -6, 0, -3, 0, 2, -6, -2, -3, -2, 0, 8, -1, -4, -5, 0, -3, -7, -2, -11}, {0, 1, 0, -1, -1, -2, -4, 0, -3, -4, 0, -2, -6, -3, 1, 0, -3, -1, 5, 2, -3, -3, -1, -5, -2, -11}, {0, 1, -1, -5, -2, -3, -6, -3, -4, -1, 0, -1, -4, -2, 0, -2, -3, -4, 2, 6, -1, -8, -2, -4, -3, -11}, {0, -1, -5, -4, -5, -4, -5, -3, -4, 3, 0, -6, 0, 0, -5, -3, -4, -5, -3, -1, 6, -10, -2, -5, -4, -11}, {0, -9, -7, -11, -10, -11, -2, -10, -5, -9, 0, -7, -4, -8, -6, -9, -8, 0, -3, -8, -10, 13, -7, -3, -10, -11}, {0, -2, -2, -6, -3, -3, -5, -3, -3, -3, 0, -3, -4, -3, -2, -3, -2, -3, -1, -2, -2, -7, -3, -5, -3, -11}, {0, -5, -4, -2, -7, -6, 4, -9, -1, -4, 0, -7, -4, -7, -3, -9, -8, -7, -5, -4, -5, -3, -5, 9, -7, -11}, {0, -1, 1, -9, 2, 5, -9, -3, 1, -4, 0, -2, -4, -3, -1, -2, 5, -2, -2, -3, -4, -10, -3, -7, 5, -11}, {0, -11, -11, -11, -11, -11, -11, -11, -11, -11, 0, -11, -11, -11, -11, -11, -11, -11, -11, -11, -11, -11, -11, -11, -11, 1}, } // # // # This matrix was produced by "pam" Version 1.0.6 [28-Jul-93] // # // # PAM 80 substitution matrix, scale = ln(2)/2 = 0.346574 // # // # Expected score = -2.55, Entropy = 1.44 bits // # // # Lowest score = -11, Highest score = 13 // # // A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * // A 4 -4 -1 -1 -4 -2 -1 0 -4 -2 -4 -4 -3 -5 0 1 1 -8 -5 0 -1 -1 -1 -11 // R -4 7 -2 -5 -5 0 -4 -6 0 -3 -5 2 -2 -6 -2 -1 -3 0 -7 -5 -3 -1 -3 -11 // N -1 -2 5 3 -6 -1 0 -1 2 -3 -5 0 -4 -5 -3 1 0 -5 -3 -4 4 0 -1 -11 // D -1 -5 3 6 -9 0 4 -1 -1 -4 -7 -2 -6 -9 -4 -1 -2 -10 -7 -5 5 2 -3 -11 // C -4 -5 -6 -9 9 -9 -9 -6 -5 -4 -9 -9 -8 -8 -5 -1 -4 -10 -2 -3 -7 -9 -5 -11 // Q -2 0 -1 0 -9 7 2 -4 2 -4 -3 -1 -2 -8 -1 -3 -3 -8 -7 -4 0 5 -2 -11 // E -1 -4 0 4 -9 2 6 -2 -2 -3 -6 -2 -4 -9 -3 -2 -3 -11 -6 -4 2 5 -2 -11 // G 0 -6 -1 -1 -6 -4 -2 6 -5 -6 -7 -4 -5 -6 -3 0 -2 -10 -8 -3 -1 -2 -3 -11 // H -4 0 2 -1 -5 2 -2 -5 8 -5 -4 -3 -5 -3 -2 -3 -4 -4 -1 -4 0 1 -2 -11 // I -2 -3 -3 -4 -4 -4 -3 -6 -5 7 1 -4 1 0 -5 -4 -1 -8 -3 3 -4 -4 -2 -11 // L -4 -5 -5 -7 -9 -3 -6 -7 -4 1 6 -5 2 0 -4 -5 -4 -3 -4 0 -6 -4 -3 -11 // K -4 2 0 -2 -9 -1 -2 -4 -3 -4 -5 6 0 -9 -4 -2 -1 -7 -6 -5 -1 -1 -3 -11 // M -3 -2 -4 -6 -8 -2 -4 -5 -5 1 2 0 9 -2 -5 -3 -2 -7 -6 1 -5 -3 -2 -11 // F -5 -6 -5 -9 -8 -8 -9 -6 -3 0 0 -9 -2 8 -7 -4 -5 -2 4 -4 -7 -8 -5 -11 // P 0 -2 -3 -4 -5 -1 -3 -3 -2 -5 -4 -4 -5 -7 7 0 -2 -9 -8 -3 -3 -2 -2 -11 // S 1 -1 1 -1 -1 -3 -2 0 -3 -4 -5 -2 -3 -4 0 4 2 -3 -4 -3 0 -2 -1 -11 // T 1 -3 0 -2 -4 -3 -3 -2 -4 -1 -4 -1 -2 -5 -2 2 5 -8 -4 -1 -1 -3 -1 -11 // W -8 0 -5 -10 -10 -8 -11 -10 -4 -8 -3 -7 -7 -2 -9 -3 -8 13 -2 -10 -7 -9 -7 -11 // Y -5 -7 -3 -7 -2 -7 -6 -8 -1 -3 -4 -6 -6 4 -8 -4 -4 -2 9 -5 -4 -6 -4 -11 // V 0 -5 -4 -5 -3 -4 -4 -3 -4 3 0 -5 1 -4 -3 -3 -1 -10 -5 6 -4 -4 -2 -11 // B -1 -3 4 5 -7 0 2 -1 0 -4 -6 -1 -5 -7 -3 0 -1 -7 -4 -4 5 2 -2 -11 // Z -1 -1 0 2 -9 5 5 -2 1 -4 -4 -1 -3 -8 -2 -2 -3 -9 -6 -4 2 5 -2 -11 // X -1 -3 -1 -3 -5 -2 -2 -3 -2 -2 -3 -3 -2 -5 -2 -1 -1 -7 -4 -2 -2 -2 -3 -11 // * -11 -11 -11 -11 -11 -11 -11 -11 -11 -11 -11 -11 -11 -11 -11 -11 -11 -11 -11 -11 -11 -11 -11 1 // PAM80 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 4, -1, -4, -1, -1, -5, 0, -4, -2, 0, -4, -4, -3, -1, 0, -2, -4, 1, 1, 0, -8, -1, -5, -1, -11}, {0, -1, 5, -7, 5, 2, -7, -1, 0, -4, 0, -1, -6, -5, 4, -3, 0, -3, 0, -1, -4, -7, -2, -4, 2, -11}, {0, -4, -7, 9, -9, -9, -8, -6, -5, -4, 0, -9, -9, -8, -6, -5, -9, -5, -1, -4, -3, -10, -5, -2, -9, -11}, {0, -1, 5, -9, 6, 4, -9, -1, -1, -4, 0, -2, -7, -6, 3, -4, 0, -5, -1, -2, -5, -10, -3, -7, 2, -11}, {0, -1, 2, -9, 4, 6, -9, -2, -2, -3, 0, -2, -6, -4, 0, -3, 2, -4, -2, -3, -4, -11, -2, -6, 5, -11}, {0, -5, -7, 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2, -4, 0, -1, -3, -2, -1, -1, 7, 0, -3, -3, -4, -8, -2, -7, 5, -11}, {0, -4, -3, -5, -5, -4, -6, -6, 0, -3, 0, 2, -5, -2, -2, -2, 0, 7, -1, -3, -5, 0, -3, -7, -1, -11}, {0, 1, 0, -1, -1, -2, -4, 0, -3, -4, 0, -2, -5, -3, 1, 0, -3, -1, 4, 2, -3, -3, -1, -4, -2, -11}, {0, 1, -1, -4, -2, -3, -5, -2, -4, -1, 0, -1, -4, -2, 0, -2, -3, -3, 2, 5, -1, -8, -1, -4, -3, -11}, {0, 0, -4, -3, -5, -4, -4, -3, -4, 3, 0, -5, 0, 1, -4, -3, -4, -5, -3, -1, 6, -10, -2, -5, -4, -11}, {0, -8, -7, -10, -10, -11, -2, -10, -4, -8, 0, -7, -3, -7, -5, -9, -8, 0, -3, -8, -10, 13, -7, -2, -9, -11}, {0, -1, -2, -5, -3, -2, -5, -3, -2, -2, 0, -3, -3, -2, -1, -2, -2, -3, -1, -1, -2, -7, -3, -4, -2, -11}, {0, -5, -4, -2, -7, -6, 4, -8, -1, -3, 0, -6, -4, -6, -3, -8, -7, -7, -4, -4, -5, -2, -4, 9, -6, -11}, {0, -1, 2, -9, 2, 5, -8, -2, 1, -4, 0, -1, -4, -3, 0, -2, 5, -1, -2, -3, -4, -9, -2, -6, 5, -11}, {0, -11, -11, -11, -11, -11, -11, -11, -11, -11, 0, -11, -11, -11, -11, -11, -11, -11, -11, -11, -11, -11, -11, -11, -11, 1}, } // # // # This matrix was produced by "pam" Version 1.0.6 [28-Jul-93] // # // # PAM 80 substitution matrix, scale = 0.0693200 // # // # Expected score = -12.6, Entropy = 1.44 bits // # // # Lowest score = -53, Highest score = 63 // # // A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * // A 21 -19 -6 -6 -19 -10 -3 1 -20 -10 -18 -18 -13 -27 1 5 5 -42 -25 -2 -6 -5 -6 -53 // R -19 37 -12 -25 -26 1 -22 -28 2 -16 -26 10 -9 -31 -8 -6 -16 1 -33 -23 -17 -7 -14 -53 // N -6 -12 27 13 -31 -5 1 -5 8 -15 -23 2 -22 -27 -14 5 -1 -27 -13 -21 21 -1 -7 -53 // D -6 -25 13 30 -43 0 18 -5 -6 -22 -37 -9 -30 -45 -20 -6 -10 -49 -34 -23 24 12 -13 -53 // C -19 -26 -31 -43 46 -43 -43 -29 -24 -19 -47 -44 -42 -39 -24 -5 -22 -52 -8 -17 -36 -43 -27 -53 // Q -10 1 -5 0 -43 34 12 -19 12 -22 -14 -4 -9 -39 -4 -13 -14 -39 -35 -19 -2 25 -10 -53 // E -3 -22 1 18 -43 12 30 -9 -9 -17 -29 -10 -21 -44 -14 -9 -14 -53 -29 -18 12 24 -11 -53 // G 1 -28 -5 -5 -29 -19 -9 28 -25 -29 -34 -21 -26 -31 -15 0 -12 -49 -42 -15 -5 -12 -13 -53 // H -20 2 8 -6 -24 12 -9 -25 39 -26 -18 -14 -27 -17 -9 -14 -19 -22 -6 -19 2 4 -12 -53 // I -10 -16 -15 -22 -19 -22 -17 -29 -26 34 4 -18 5 -1 -24 -18 -3 -42 -16 16 -18 -19 -11 -53 // L -18 -26 -23 -37 -47 -14 -29 -34 -18 4 30 -25 12 -1 -22 -25 -19 -17 -19 0 -29 -20 -16 -53 // K -18 10 2 -9 -44 -4 -10 -21 -14 -18 -25 28 0 -43 -18 -8 -6 -33 -31 -26 -3 -7 -13 -53 // M -13 -9 -22 -30 -42 -9 -21 -26 -27 5 12 0 47 -8 -23 -15 -9 -37 -30 3 -26 -15 -12 -53 // F -27 -31 -27 -45 -39 -39 -44 -31 -17 -1 -1 -43 -8 41 -33 -21 -26 -10 19 -20 -34 -42 -23 -53 // P 1 -8 -14 -20 -24 -4 -14 -15 -9 -24 -22 -18 -23 -33 35 1 -8 -43 -41 -15 -17 -9 -12 -53 // S 5 -6 5 -6 -5 -13 -9 0 -14 -18 -25 -8 -15 -21 1 22 8 -15 -21 -15 0 -10 -6 -53 // T 5 -16 -1 -10 -22 -14 -14 -12 -19 -3 -19 -6 -9 -26 -8 8 27 -39 -20 -4 -5 -14 -7 -53 // W -42 1 -27 -49 -52 -39 -53 -49 -22 -42 -17 -33 -37 -10 -43 -15 -39 63 -12 -49 -35 -45 -33 -53 // Y -25 -33 -13 -34 -8 -35 -29 -42 -6 -16 -19 -31 -30 19 -41 -21 -20 -12 45 -23 -20 -31 -22 -53 // V -2 -23 -21 -23 -17 -19 -18 -15 -19 16 0 -26 3 -20 -15 -15 -4 -49 -23 29 -22 -19 -11 -53 // B -6 -17 21 24 -36 -2 12 -5 2 -18 -29 -3 -26 -34 -17 0 -5 -35 -20 -22 23 8 -10 -53 // Z -5 -7 -1 12 -43 25 24 -12 4 -19 -20 -7 -15 -42 -9 -10 -14 -45 -31 -19 8 25 -11 -53 // X -6 -14 -7 -13 -27 -10 -11 -13 -12 -11 -16 -13 -12 -23 -12 -6 -7 -33 -22 -11 -10 -11 -13 -53 // * -53 -53 -53 -53 -53 -53 -53 -53 -53 -53 -53 -53 -53 -53 -53 -53 -53 -53 -53 -53 -53 -53 -53 1 // PAM80_cdi = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 21, -6, -19, -6, -3, -27, 1, -20, -10, 0, -18, -18, -13, -6, 1, -10, -19, 5, 5, -2, -42, -6, -25, -5, -53}, {0, -6, 23, -36, 24, 12, -34, -5, 2, -18, 0, -3, -29, -26, 21, -17, -2, -17, 0, -5, -22, -35, -10, -20, 8, -53}, {0, -19, -36, 46, -43, -43, -39, -29, -24, -19, 0, -44, -47, -42, -31, -24, -43, -26, -5, -22, -17, -52, -27, -8, -43, -53}, {0, -6, 24, -43, 30, 18, -45, -5, -6, -22, 0, -9, -37, -30, 13, -20, 0, -25, -6, -10, -23, -49, -13, -34, 12, -53}, {0, -3, 12, -43, 18, 30, -44, -9, -9, -17, 0, -10, -29, -21, 1, -14, 12, -22, -9, -14, -18, -53, -11, -29, 24, -53}, {0, -27, -34, -39, -45, -44, 41, -31, -17, -1, 0, -43, -1, -8, -27, -33, -39, -31, -21, -26, -20, -10, -23, 19, -42, -53}, {0, 1, -5, -29, -5, -9, -31, 28, -25, -29, 0, -21, -34, -26, -5, -15, -19, -28, 0, -12, -15, -49, -13, -42, -12, -53}, {0, -20, 2, -24, -6, -9, -17, -25, 39, -26, 0, -14, -18, -27, 8, -9, 12, 2, -14, -19, -19, -22, -12, -6, 4, -53}, {0, -10, -18, -19, -22, -17, -1, -29, -26, 34, 0, -18, 4, 5, -15, -24, -22, -16, -18, -3, 16, -42, -11, -16, -19, -53}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, -18, -3, -44, -9, -10, -43, -21, -14, -18, 0, 28, -25, 0, 2, -18, -4, 10, -8, -6, -26, -33, -13, -31, -7, -53}, {0, -18, -29, -47, -37, -29, -1, -34, -18, 4, 0, -25, 30, 12, -23, -22, -14, -26, -25, -19, 0, -17, -16, -19, -20, -53}, {0, -13, -26, -42, -30, -21, -8, -26, -27, 5, 0, 0, 12, 47, -22, -23, -9, -9, -15, -9, 3, -37, -12, -30, -15, -53}, {0, -6, 21, -31, 13, 1, -27, -5, 8, -15, 0, 2, -23, -22, 27, -14, -5, -12, 5, -1, -21, -27, -7, -13, -1, -53}, {0, 1, -17, -24, -20, -14, -33, -15, -9, -24, 0, -18, -22, -23, -14, 35, -4, -8, 1, -8, -15, -43, -12, -41, -9, -53}, {0, -10, -2, -43, 0, 12, -39, -19, 12, -22, 0, -4, -14, -9, -5, -4, 34, 1, -13, -14, -19, -39, -10, -35, 25, -53}, {0, -19, -17, -26, -25, -22, -31, -28, 2, -16, 0, 10, -26, -9, -12, -8, 1, 37, -6, -16, -23, 1, -14, -33, -7, -53}, {0, 5, 0, -5, -6, -9, -21, 0, -14, -18, 0, -8, -25, -15, 5, 1, -13, -6, 22, 8, -15, -15, -6, -21, -10, -53}, {0, 5, -5, -22, -10, -14, -26, -12, -19, -3, 0, -6, -19, -9, -1, -8, -14, -16, 8, 27, -4, -39, -7, -20, -14, -53}, {0, -2, -22, -17, -23, -18, -20, -15, -19, 16, 0, -26, 0, 3, -21, -15, -19, -23, -15, -4, 29, -49, -11, -23, -19, -53}, {0, -42, -35, -52, -49, -53, -10, -49, -22, -42, 0, -33, -17, -37, -27, -43, -39, 1, -15, -39, -49, 63, -33, -12, -45, -53}, {0, -6, -10, -27, -13, -11, -23, -13, -12, -11, 0, -13, -16, -12, -7, -12, -10, -14, -6, -7, -11, -33, -13, -22, -11, -53}, {0, -25, -20, -8, -34, -29, 19, -42, -6, -16, 0, -31, -19, -30, -13, -41, -35, -33, -21, -20, -23, -12, -22, 45, -31, -53}, {0, -5, 8, -43, 12, 24, -42, -12, 4, -19, 0, -7, -20, -15, -1, -9, 25, -7, -10, -14, -19, -45, -11, -31, 25, -53}, {0, -53, -53, -53, -53, -53, -53, -53, -53, -53, 0, -53, -53, -53, -53, -53, -53, -53, -53, -53, -53, -53, -53, -53, -53, 1}, } // # // # This matrix was produced by "pam" Version 1.0.6 [28-Jul-93] // # // # PAM 90 substitution matrix, scale = ln(2)/2 = 0.346574 // # // # Expected score = -2.26, Entropy = 1.30 bits // # // # Lowest score = -10, Highest score = 13 // # // A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * // A 4 -4 -1 -1 -3 -2 0 0 -4 -2 -3 -3 -2 -5 0 1 1 -8 -5 0 -1 -1 -1 -10 // R -4 7 -2 -5 -5 0 -4 -5 1 -3 -5 2 -2 -6 -1 -1 -3 0 -6 -4 -3 -1 -2 -10 // N -1 -2 5 3 -6 -1 0 -1 2 -3 -4 1 -4 -5 -2 1 0 -5 -2 -4 4 0 -1 -10 // D -1 -5 3 6 -8 0 4 -1 -1 -4 -7 -2 -5 -8 -4 -1 -2 -9 -6 -4 5 3 -2 -10 // C -3 -5 -6 -8 9 -8 -8 -5 -5 -3 -9 -8 -8 -7 -5 -1 -4 -10 -1 -3 -7 -8 -5 -10 // Q -2 0 -1 0 -8 6 2 -3 2 -4 -3 -1 -2 -7 -1 -2 -3 -7 -6 -4 0 5 -2 -10 // E 0 -4 0 4 -8 2 6 -1 -1 -3 -5 -2 -4 -8 -2 -2 -2 -10 -6 -3 2 5 -2 -10 // G 0 -5 -1 -1 -5 -3 -1 5 -5 -5 -6 -4 -5 -6 -3 0 -2 -9 -8 -3 -1 -2 -2 -10 // H -4 1 2 -1 -5 2 -1 -5 8 -5 -3 -2 -5 -3 -2 -3 -3 -4 -1 -4 1 1 -2 -10 // I -2 -3 -3 -4 -3 -4 -3 -5 -5 6 1 -3 1 0 -4 -3 0 -8 -3 3 -3 -3 -2 -10 // L -3 -5 -4 -7 -9 -3 -5 -6 -3 1 6 -5 2 0 -4 -5 -3 -3 -3 0 -5 -4 -3 -10 // K -3 2 1 -2 -8 -1 -2 -4 -2 -3 -5 5 0 -8 -3 -1 -1 -6 -6 -5 0 -1 -2 -10 // M -2 -2 -4 -5 -8 -2 -4 -5 -5 1 2 0 9 -1 -4 -3 -2 -7 -6 1 -5 -3 -2 -10 // F -5 -6 -5 -8 -7 -7 -8 -6 -3 0 0 -8 -1 8 -6 -4 -5 -2 4 -4 -6 -8 -4 -10 // P 0 -1 -2 -4 -5 -1 -2 -3 -2 -4 -4 -3 -4 -6 7 0 -1 -8 -8 -3 -3 -2 -2 -10 // S 1 -1 1 -1 -1 -2 -2 0 -3 -3 -5 -1 -3 -4 0 4 2 -3 -4 -3 0 -2 -1 -10 // T 1 -3 0 -2 -4 -3 -2 -2 -3 0 -3 -1 -2 -5 -1 2 5 -7 -4 -1 -1 -2 -1 -10 // W -8 0 -5 -9 -10 -7 -10 -9 -4 -8 -3 -6 -7 -2 -8 -3 -7 13 -2 -9 -7 -8 -6 -10 // Y -5 -6 -2 -6 -1 -6 -6 -8 -1 -3 -3 -6 -6 4 -8 -4 -4 -2 9 -4 -4 -6 -4 -10 // V 0 -4 -4 -4 -3 -4 -3 -3 -4 3 0 -5 1 -4 -3 -3 -1 -9 -4 6 -4 -3 -2 -10 // B -1 -3 4 5 -7 0 2 -1 1 -3 -5 0 -5 -6 -3 0 -1 -7 -4 -4 4 2 -2 -10 // Z -1 -1 0 3 -8 5 5 -2 1 -3 -4 -1 -3 -8 -2 -2 -2 -8 -6 -3 2 5 -2 -10 // X -1 -2 -1 -2 -5 -2 -2 -2 -2 -2 -3 -2 -2 -4 -2 -1 -1 -6 -4 -2 -2 -2 -2 -10 // * -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 -10 1 // PAM90 = [][]int{ {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, 4, -1, -3, -1, 0, -5, 0, -4, -2, 0, -3, -3, -2, -1, 0, -2, -4, 1, 1, 0, -8, -1, -5, -1, -10}, {0, -1, 4, -7, 5, 2, -6, -1, 1, -3, 0, 0, -5, -5, 4, -3, 0, -3, 0, -1, -4, -7, -2, -4, 2, -10}, {0, -3, -7, 9, -8, -8, -7, -5, -5, -3, 0, -8, -9, -8, -6, -5, -8, -5, -1, -4, -3, -10, -5, -1, -8, -10}, {0, -1, 5, -8, 6, 4, -8, -1, -1, -4, 0, -2, -7, -5, 3, -4, 0, -5, -1, -2, -4, -9, -2, -6, 3, -10}, {0, 0, 2, -8, 4, 6, -8, -1, -1, -3, 0, -2, -5, -4, 0, -2, 2, -4, -2, -2, -3, -10, -2, -6, 5, -10}, {0, -5, -6, -7, -8, -8, 8, -6, -3, 0, 0, -8, 0, -1, -5, -6, -7, -6, -4, -5, -4, -2, -4, 4, -8, -10}, {0, 0, -1, -5, -1, -1, -6, 5, -5, -5, 0, -4, -6, -5, -1, -3, -3, -5, 0, -2, -3, -9, -2, -8, -2, -10}, {0, -4, 1, -5, -1, -1, -3, -5, 8, -5, 0, -2, -3, -5, 2, -2, 2, 1, -3, -3, -4, -4, -2, -1, 1, -10}, {0, -2, -3, -3, -4, -3, 0, -5, -5, 6, 0, -3, 1, 1, -3, -4, -4, -3, -3, 0, 3, -8, -2, -3, -3, -10}, {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0}, {0, -3, 0, -8, -2, -2, -8, -4, -2, -3, 0, 5, -5, 0, 1, -3, -1, 2, -1, -1, -5, -6, -2, -6, -1, -10}, {0, -3, -5, -9, -7, -5, 0, -6, -3, 1, 0, -5, 6, 2, -4, -4, -3, -5, -5, -3, 0, -3, -3, -3, -4, -10}, {0, -2, -5, -8, -5, -4, -1, -5, -5, 1, 0, 0, 2, 9, -4, -4, -2, -2, -3, -2, 1, -7, -2, -6, -3, -10}, {0, -1, 4, -6, 3, 0, -5, -1, 2, -3, 0, 1, -4, -4, 5, -2, -1, -2, 1, 0, -4, -5, -1, -2, 0, -10}, {0, 0, -3, -5, -4, -2, -6, -3, -2, -4, 0, -3, -4, -4, -2, 7, -1, -1, 0, -1, -3, -8, -2, -8, -2, -10}, {0, -2, 0, -8, 0, 2, -7, -3, 2, -4, 0, -1, -3, -2, -1, -1, 6, 0, -2, -3, -4, -7, -2, -6, 5, -10}, {0, -4, -3, -5, -5, -4, -6, -5, 1, -3, 0, 2, -5, -2, -2, -1, 0, 7, -1, -3, -4, 0, -2, -6, -1, -10}, {0, 1, 0, -1, -1, -2, -4, 0, -3, -3, 0, -1, -5, -3, 1, 0, -2, -1, 4, 2, -3, -3, -1, -4, -2, -10}, {0, 1, -1, -4, -2, -2, -5, -2, -3, 0, 0, -1, -3, -2, 0, -1, -3, -3, 2, 5, -1, -7, -1, -4, -2, -10}, {0, 0, -4, -3, -4, -3, -4, -3, -4, 3, 0, -5, 0, 1, -4, -3, -4, -4, -3, -1, 6, -9, -2, -4, -3, -10}, {0, -8, -7, -10, -9, -10, -2, -9, -4, -8, 0, -6, -3, -7, -5, -8, -7, 0, -3, -7, -9, 13, -6, -2, -8, -10}, {0, -1, -2, -5, -2, -2, -4, -2, -2, -2, 0, -2, -3, -2, -1, -2, -2, -2, -1, -1, -2, -6, -2, -4, -2, -10}, {0, -5, -4, -1, -6, -6, 4, -8, -1, -3, 0, -6, -3, -6, -2, -8, -6, -6, -4, -4, -4, -2, -4, 9, -6, -10}, {0, -1, 2, -8, 3, 5, -8, -2, 1, -3, 0, -1, -4, -3, 0, -2, 5, -1, -2, -2, -3, -8, -2, -6, 5, -10}, {0, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, 0, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, -10, 1}, } )
All alignment scoring matrices are organised to allow direct lookup using alphabets defined in biogo/alphabet. Gap penalties are set to zero for all matrices and the I/L single letter amino acid code, "J", is included but not defined for all the protein scoring matrices.
Functions ¶
Types ¶
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